基因總覽
SLC2A7(solute carrier family 2 member 7)是蛋白質編碼基因,產物屬於 major facilitator superfamily,並歸入 sugar transporter family 的 glucose transporter subfamily。其蛋白質長 512 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,形成多次穿越膜的膜蛋白架構。現有資料將它描述為可能的糖轉運蛋白;至於在生理情境下主要運送何種底物,仍有討論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000400906 ★ | 9,002,973–9,026,423 | 12 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC2A7 的蛋白質可運輸 glucose 與 fructose,因此具有糖類跨膜運輸功能。雖然它可能是糖轉運蛋白,但其生理性底物仍有討論;目前資料支持它能運輸這兩種糖,並未確定哪一種是其生理環境中的主要底物。
底物選擇具有明確差異:除 glucose 與 fructose 外,資料指出 SLC2A7 不運輸 galactose、2-deoxy-d-glucose 或 xylose。這些結果界定了已觀察到的運輸範圍,但不能據此推定其他未測試糖類的運輸能力。
對 glucose 與 fructose 的活性紀錄分別以 D-glucose(out) = D-glucose(in) 及 D-fructose(out) = D-fructose(in) 表示,支持兩種糖都可由 SLC2A7 介導跨膜運輸。來源未進一步交代運輸方向如何受濃度或細胞狀態影響,因此不宜延伸推論其運輸機制或生理作用情境。
Promoter 與基因調控
>SLC2A7 ENST00000400906 GRCh38 chr1:9026323-9027423 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TACAACAAACCCCCGTGGCACGAGTTTACCTATGTAACAAACCTTCACATATACCCTGAACCTAAAATAA AAGTTAAAAAAAAAAAAAAAGCCAGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAAGCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG GCAGGCGGATCACTAGAGGTCAGGAGTTCTAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTA AAAACACACAAAAAAAGGCTGGGTACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG GGCAGATCATGAAGTCAGGAGATCCAGGCCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAT ACAAAAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCAGGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGG AGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGC GACAAAGCGAGACTCCACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGGGTGTGGCGGCACGTGCCT ATAATCCCGGCTACTTGGGAAGCTAAGGCAGGAGAATAGCTTGAGCCCAGGAAGCCGAGGTTGCAGTGAG CTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGGAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAGAGGCAT ACATGGAAAAATGACACAGAAAAAGCATCCTAGATCCAGGTCACAGCCTCACTGGGTCTCTGAAAGTCCT CATTTCTGCGGACCAATGTCAGGCAATGTTTTTTCTCTCTCCTTGGTGCAACTAGGGAGCTTTCGGCTTG GGGCTTGGTGGGTGCAAAGACGAAATTCGTGCTGTGTATGATTTGTGCACTGGCAACGTGTGTCTTATCA ACATTTCCAAGGAGAATTTGCTCCTGGGGAAAGTCAGCAGGGTCCAGAGAGCAAAAGGATCATAAAGCCA GGTAGGCCCAGGGGAGAAACAGCCGGTCTTTAGGTGGCTGGCGCAGAGCAGGTGTCACTTGGGAGGTAGA GCACACCTGTTCTCCCACCTGAACAAGGATGGAGAACAAAGAGGCGGGAAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_545BGR · CTCF_binding_site · 9024861–9024882 · regulatory
ENSR1_B3RDC · enhancer · 9029114–9029746 · regulatory
· motif · 9024863–9024879 · motif
· motif · 9029178–9029187 · motif
· motif · 9029178–9029187 · motif
SLC2A7 的表現量在 fructose 存在時會增加;目前資料未提供此變化的幅度或其他調控條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:512 aa
SLC2A7 蛋白質長 512 個胺基酸,含多段螺旋型跨膜區段,並在膜兩側具有胞質與細胞外區域。序列註解將其 C 端 491–512 位胺基酸標示為無序區。該蛋白質屬於 major facilitator superfamily 的 sugar transporter family,並歸入 glucose transporter subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC2A7 被註記為細胞膜上的多次跨膜蛋白,也定位於細胞頂端膜。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC2A7 可能是糖轉運蛋白,但其生理性底物仍有討論。資料指出它能運輸 glucose 與 fructose,卻不運輸 galactose、2-deoxy-d-glucose 或 xylose;這些結果界定了已報告的底物範圍,並未確定其生理環境中的主要底物。 | 含實驗來源 | 證據與來源Probable sugar transporter. Even if its physiological substrate is subject to discussion, it is able to transport glucose and fructose. Does not transport galactose, 2-deoxy-d-glucose and xylose PMID 15033637 ↗ · PMID 16186102 ↗ · PMID 28083649 ↗ · PMID 29548810 ↗ |
| 分子活性 | D-glucose(out) = D-glucose(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | D-fructose(out) = D-fructose(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC2A7 被註記為位於細胞膜及細胞頂端膜的多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 16186102 ↗ · PMID 28083649 ↗ · PMID 29548810 ↗ |
| 調控 | SLC2A7 的表現量會在 fructose 存在時增加;此敘述未提供變化幅度或其他條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCCGGTCTTTAGGTGGCTGGCGCAGAGCAGGTGTCACTT40GGGAGGTAGAGCACACCTGTTCTCCCACCTGAACAAGGAT80GGAGAACAAAGAGGCGGGAACCCCTCCACCCATTCCATCC120AGGGAGGGGCGGCTCCAGCCGACGCTGTTGCTGGCGACAC160TGAGCGCGGCCTTTGGCTCAGCCTTCCAGTACGGCTACAA200CCTCTCTGTGGTCAACACGCCGCACAAGGTCTTCAAGTCA240TTTTACAACGAAACCTACTTTGAGCGACACGCAACATTCA280TGGACGGGAAGCTCATGCTGCTTCTATGGTCTTGCACCGT320CTCCATGTTTCCTCTGGGCGGCCTGTTGGGGTCATTGCTC360GTGGGCCTGCTGGTTGATAGCTGCGGCAGAAAGGGGACCC400TGCTGATCAACAACATCTTTGCCATCATCCCCGCCATCCT440GATGGGAGTCAGCAAAGTGGCCAAGGCTTTTGAGCTGATC480GTCTTTTCCCGAGTGGTGCTGGGAGTCTGTGCAGGCATCT520CCTACAGCGCCCTTCCCATGTACCTGGGAGAACTGGCCCC560CAAGAACCTGAGAGGCATGGTGGGAACAATGACCGAGGTT600TTCGTCATCGTTGGAGTCTTCCTAGCACAGATCTTCAGCC640TCCAGGCCATCTTGGGCAACCCGGCAGGCTGGCCGGTGCT680TCTGGCGCTCACAGGGGTGCCCGCCCTGCTGCAGCTGCTG720ACCCTGCCCTTCTTCCCCGAAAGCCCCCGCTACTCCCTGA760TTCAGAAAGGAGATGAAGCCACAGCGCGACAAGCTCTGAG800GAGGCTGAGAGGCCACACGGACATGGAGGCCGAGCTGGAG840GACATGCGTGCGGAGGCCCGGGCCGAGCGCGCCGAGGGCC880ACCTGTCTGTGCTGCACCTCTGTGCCCTGCGGTCCCTGCG920CTGGCAGCTCCTCTCCATCATCGTGCTCATGGCCGGCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。