基因總覽
SLC2A6(solute carrier family 2 member 6)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 major facilitator superfamily,並歸於 sugar transporter 家族的 glucose transporter 次家族。蛋白質長 507 個胺基酸,具有多次穿膜的結構;序列註解預測其包含 12 段跨膜螺旋。這些資料界定了 SLC2A6 蛋白的家族歸屬與基本結構,至於其可能的運輸及細胞功能,另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371899 ★ | 133,471,094–133,479,099 | 10 |
| ENST00001114537 | 133,462,053–133,479,148 | 10 |
| ENST00001110150 | 133,467,051–133,479,148 | 9 |
| ENST00000917278 | 133,471,088–133,479,148 | 9 |
| ENST00000917281 | 133,471,089–133,479,148 | 9 |
| ENST00001068648 | 133,471,093–133,479,148 | 10 |
| ENST00000888406 | 133,471,094–133,479,148 | 9 |
| ENST00000917277 | 133,471,094–133,479,148 | 9 |
| ENST00000917279 | 133,471,094–133,479,148 | 10 |
| ENST00000917280 | 133,471,094–133,479,148 | 10 |
| ENST00001136164 | 133,471,094–133,479,148 | 10 |
| ENST00000371897 | 133,471,095–133,479,148 | 9 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC2A6 被註記為可能的糖類運輸蛋白,但其作用並非運輸 glucose。現有資料指出,這項蛋白在巨噬細胞中可能具有調節糖解作用的角色;因此,不能僅由其家族分類推定它會運送 glucose,也不應把「可能的糖類運輸蛋白」解讀為已確認的 glucose transporter 活性。
資料將 SLC2A6 與巨噬細胞糖解作用的調節相連結,但未進一步說明它如何影響糖解途徑、涉及哪些分子步驟,或改變糖解作用的方向與幅度。故目前可支持的功能描述限於其可能參與調節,不能據此補述特定酵素、底物運輸機制或代謝後果。
這項功能註記同時保留兩項重要限制:其一,糖類運輸功能仍以「可能」描述;其二,來源明確指出它不運輸 glucose。這些資訊支持將 SLC2A6 視為巨噬細胞糖解作用的可能調節因子,而不是已證實運輸 glucose 的蛋白質。
Promoter 與基因調控
>SLC2A6 ENST00000371899 GRCh38 chr9:133478999-133480099 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCAAAATAGGCACATGAGGAAAAGACTGGAAGAGGCTAAAACGCCATCAAGGTCAGGCTGACGGGAGAT GGATGTGATTTTATTGTTCTATTATGGTTGTATTTCAATCATAATAAAAGGGAATTCTAACTTTTAAAAA TGCTTTACCATGTTAATAGCTAAAATGGGAAATGACCCAAATACTCAGCAACAAAGGCTCCGTTTAAAAG CGTGTGTGGCACGTCCATCCAACAGAGCAGGGCGTGATTCCGTCCTCTTCCCGAAAAGGCCCAAAGGGAG AGGTGGAACTGCTGTGGGATTTTTTGAGGACGGTCTTCCCGGGAATTTTCCATTTCTGCTTTTCTTATTT TTCAATGTTATCTTACTACCTGGGTTACGTGTCACGAGCTCAGGTTATTTCTACCACCAGAGCCTGGGGT GGAGGATACAGACCTCGCCCACTGGAGCTGCCCACAGCGCCTCGCCGGCCCCTCCTGCCTCCTTCGTCCC GCACATCCGCTGCTGCCCTGACACACCCCGATTCCCTGGTGCCAGGGAGAGCCAGGGCAGAGGTGGCCCT GAGACGCCACGCGACGGGGAGGGCTAGAGCGTAAGGAGGAGCGAGGTGCGCATTCGCTGTGACCCTGGCG CTCGGCTTCGCCTCTCTGGGCCTCGGTTTCCACCCCGCGGGAGCGAGTACGACAGGGGCTGCGCGCATTG CCGCAGTCACGCCTGCAAGAGCCGGGCCGGGTGAGCCGCTTCCGGCGCTCCGCGGGGGCCCCGGACGATC CAGCAGGGGCTCCGCCCTGGGACCCCCATCCTGTCTTGGGGCGTGACCTTCGGGGGCGCACGCGGTGCCG GCCGCGCCCGGGGAAGCCGGGTCCGCATCCGAGCATCAGGACAGCCTGCGGCCGCCCCATTGGCCGGCGT GTCTCTGCAGGGCCGTCCCACAGCCAATAGCGGCCAAGGGGCGGAGCCTGGCCGGTGCCCTCGGAGCTGC TGGCCCCGGGCGGCTGCTCCAGTCTGAGCGCCCTCCGCTCGCCCCGAGAGAGACCCGGCCATGCAGGAGC CGCTGCTGGGAGCCGAGGGCCCGGACTACGACACCTTCCCCGAGAAGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC2A6_1 ↗ | 9:133,479,099 | 負股 | 133,479,089–133,479,148 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_536DMMZ · CTCF_binding_site · 133475025–133475046 · regulatory
ENSR9_536DMNN · CTCF_binding_site · 133475177–133475198 · regulatory
ENSR9_536DN77 · CTCF_binding_site · 133478099–133478120 · regulatory
ENSR9_93XZGH · promoter · 133479086–133479589 · regulatory
· motif · 133475027–133475043 · motif
· motif · 133475179–133475195 · motif
· motif · 133476750–133476759 · motif
· motif · 133476774–133476783 · motif
· motif · 133478029–133478038 · motif
· motif · 133478066–133478079 · motif
· motif · 133478101–133478117 · motif
· motif · 133478250–133478265 · motif
· motif · 133478373–133478390 · motif
· motif · 133478569–133478582 · motif
· motif · 133478569–133478582 · motif
· motif · 133478694–133478706 · motif
· motif · 133478937–133478952 · motif
· motif · 133479143–133479153 · motif
· motif · 133479278–133479290 · motif
· motif · 133479282–133479298 · motif
· motif · 133479283–133479293 · motif
· motif · 133479354–133479363 · motif
· motif · 133479544–133479557 · motif
調控資料標示 lipopolysaccharide (LPS) 與 SLC2A6 有關;來源未提供調控方向或更具體的作用條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:507 aa
SLC2A6 蛋白長 507 個胺基酸,屬於 major facilitator superfamily 的 sugar transporter 家族,並歸入 glucose transporter 次家族。序列註解預測其含有 12 段跨膜螺旋;N 端另標示一段無序區,以及一個 dileucine internalization motif。這些結構特徵來自序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC2A6 被註記為多次穿膜蛋白,定位於 lysosome membrane。 來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TMEM14BQ9NUH8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC2A6 被描述為可能的糖類運輸蛋白,並可能在巨噬細胞中調節糖解作用;不過,來源明確指出它不運輸 glucose,因此其運輸功能不能直接等同於葡萄糖運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源Probable sugar transporter that acts as a regulator of glycolysis in macrophages (Probable). Does not transport glucose PMID 30431159 ↗ |
| 細胞定位 | SLC2A6 被註記為多次穿膜蛋白,定位於 lysosome membrane;此資料未說明定位變動的條件,也未提供異構型間的定位差異。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | SLC2A6 的調控註記與 lipopolysaccharide (LPS) 有關,但此項資訊未指出 LPS 對其表現或調控造成的方向,也未描述更細的條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCTGAGCGCCCTCCGCTCGCCCCGAGAGAGACCCGGCC40ATGCAGGAGCCGCTGCTGGGAGCCGAGGGCCCGGACTACG80ACACCTTCCCCGAGAAGCCGCCCCCGTCGCCAGGGGACAG120GGCGCGGGTCGGGACCCTGCAGAACAAAAGGGTGTTCCTG160GCCACCTTCGCCGCAGTGCTCGGCAATTTCAGCTTTGGGT200ATGCCCTGGTCTACACATCCCCTGTCATCCCAGCCCTGGA240GCGCTCCTTGGATCCTGACCTGCATCTGACCAAATCCCAG280GCATCCTGGTTTGGGTCCGTGTTCACCCTGGGAGCAGCGG320CCGGAGGCCTGAGTGCCATGATCCTCAACGACCTCCTGGG360CCGGAAGCTGAGCATCATGTTCTCAGCTGTGCCGTCGGCG400GCCGGCTATGCGCTCATGGCGGGTGCGCACGGCCTCTGGA440TGCTGCTGCTCGGAAGGACGCTGACGGGCTTCGCCGGGGG480GCTCACAGCTGCCTGCATCCCGGTGTACGTGTCTGAGATT520GCTCCCCCAGGCGTTCGTGGGGCTCTGGGGGCCACACCCC560AGCTCATGGCAGTGTTCGGATCCCTGTCCCTCTACGCCCT600TGGCCTCCTGCTGCCGTGGCGCTGGCTGGCTGTGGCCGGG640GAGGCGCCTGTGCTCATCATGATCCTGCTGCTCAGCTTCA680TGCCCAACTCGCCGCGCTTCCTGCTCTCTCGGGGCAGGGA720CGAAGAGGCCCTGCGGGCGCTGGCCTGGCTGCGTGGGACG760GACGTCGATGTCCACTGGGAGTTCGAGCAGATCCAGGACA800ACGTCCGGAGACAGAGCAGCCGAGTATCGTGGGCTGAGGC840ACGGGCCCCACACGTGTGCCGGCCCATCACCGTGGCCTTG880CTGATGCGCCTCCTGCAGCAGCTGACGGGCATCACGCCCA920TCCTGGTCTACCTGCAGTCCATCTTCGACAGCACCGCTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。