基因總覽
SLC2A5(solute carrier family 2 member 5)是蛋白質編碼基因,產物為 Fructose transporter,也稱 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 5。此蛋白屬於 major facilitator superfamily,歸在 Sugar transporter family 的 glucose transporter subfamily。蛋白質長501個胺基酸,含12段跨膜螺旋,並具有交替位於細胞質側與細胞外側的區段,符合多次穿膜轉運蛋白的構造特徵。其主要角色是運輸果糖;在小腸果糖吸收中具有重要作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377424 ★ | 9,035,106–9,069,635 | 12 |
| ENST00000941832 | 9,035,106–9,085,250 | 13 |
| ENST00000941833 | 9,035,106–9,069,824 | 13 |
| ENST00000941834 | 9,035,106–9,069,655 | 11 |
| ENST00001144072 | 9,035,106–9,069,655 | 12 |
| ENST00000377414 | 9,040,080–9,069,655 | 5 |
| ENST00000484798 | 9,041,785–9,071,727 | 6 |
| ENST00000474145 | 9,041,785–9,072,265 | 6 |
| ENST00000479813 | 9,041,785–9,073,122 | 7 |
| ENST00000486632 | 9,041,785–9,088,478 | 7 |
| ENST00000487835 | 9,041,858–9,088,457 | 7 |
| ENST00000464985 | 9,047,611–9,088,443 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC2A5 的蛋白產物 Fructose transporter 主要介導果糖運輸,反應方向可描述為 D-fructose 由細胞外側進入細胞內側。對其他單醣也具有轉運活性,但活性低;因此其功能偏向果糖運輸,而非廣泛有效地運輸其他單醣。它也能介導 2-deoxyglucose 的攝取,不過效率偏低。
在小腸中,SLC2A5 對果糖攝取屬必要因子。這項作用將其轉運功能連結至膳食果糖的吸收,但相關必要性屬於序列相似性推論,應與直接實驗證據區分。
另有序列相似性資料指出,SLC2A5 參與膳食果糖反應中的鹽分吸收與血壓調節;高果糖攝取引起高血壓的發展也被描述為需要此蛋白。這些生理作用同樣是 By similarity 的推論,來源未提供具體作用機制,因此不宜據此進一步推定其如何連結果糖運輸、鹽分處理與血壓變化。
Promoter 與基因調控
>SLC2A5 ENST00000377424 GRCh38 chr1:9069535-9070635 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTGTGGGACTTGTGAGACTTTGGATTTTGGCCACTTGCGCTGGTGTGCCCTGTGGCAGCTGAATGAGTG CCAAACATGGGGGGCTGACAGTGGCCTGGCCTTGAGATGGCCGGACCCGGACCAGCAGGTGTGACTCATT TTCCCTGCCCTGCCTGGAAAGGGGTTCGAGGTATTTACCACCTTCCCAGTAGTGATGAATACACAGAAAG TAACATCCCTAGGTCATTCTGAGCTCCTTAAAATGGAAAATAAGAGGCCGGACACGATGGCTCACGCCTG TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCC AACATGGCAAAACCCCGTGTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCCGAGCGTGGTAGTGCACGCCTGTAATC CCAGCTACTCAGGAGGTGGAAGCAGGAGAATCGCTTGAACTCGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGA TCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAACAGAAAATGAGAAACTTTCCCCAAACAGTATTACACGGTGACTTGGGCAAAACTGACTCTCCACCAA GAGACACTTGACTGTAGTTTTCCTGGCAGGGAGAGCATCTTTGAGGTCTCTAGTGGCCCAATCTGTTGCC CTCAGATTACCTGGTGTCATGTAGGGTGGAGGACAGCTGTTGTTTGCCATGCGTTCCTGACAGAAATAAC CCTTCCAGTCATTCACCATGAGCCTGACTGGTAGAGACTTTAGCAATGGGGAAATACCGTAGACTGTTCC ATCAGGACAATGCTGGGCCTGCAGTCCCCAGGGGGCACCCACTTACTTAGCCAAACCCCAGACGTTTCAT TTAAAAGCAGAAGTGAAAGGAAGACCAGGTTCCTGAAAGGGTTATTCTGACTTAATCTGGCTATAAAAAT GCTATTGGCTGTTATTTGGCATGGCCAAAGTGCACCCAGAATGTCTTCTCTCTCCATTCAGTGCACGCGT TACTTTGGCTAAAAGGAGGTGAGCGGCACTCTGCCCTTCCAGAGCAAGCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC2A5_1 ↗ | 1:9,069,635 | 負股 | 9,069,625–9,069,684 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_B3RKF · enhancer · 9064277–9064811 · regulatory
ENSR1_95L64 · enhancer · 9065196–9065552 · regulatory
ENSR1_B3RKS · enhancer · 9067036–9067850 · regulatory
ENSR1_B3RL4 · enhancer · 9068971–9069593 · regulatory
ENSR1_95L7D · promoter · 9069594–9070090 · regulatory
· motif · 9064807–9064818 · motif
· motif · 9067253–9067264 · motif
· motif · 9067256–9067269 · motif
· motif · 9067256–9067269 · motif
· motif · 9068879–9068891 · motif
· motif · 9069711–9069724 · motif
· motif · 9069759–9069772 · motif
· motif · 9069759–9069772 · motif
· motif · 9069760–9069773 · motif
· motif · 9069760–9069773 · motif
· motif · 9069893–9069906 · motif
· motif · 9070252–9070263 · motif
在 Caco-2 細胞中,SLC2A5 的調控與 forskolin 有關;來源未進一步說明調控方向或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:501 aa
Fructose transporter 長501個胺基酸,具有12段跨膜螺旋。依序列註解,蛋白質兩端及多個區段位於細胞質側,另有短區段位於細胞外側;其中第214至277位胺基酸形成較長的細胞質區段。此蛋白屬於 major facilitator superfamily 的 Sugar transporter family,並歸於 glucose transporter subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
在空腸絨毛,SLC2A5 位於頂端膜,也可見於絨毛細胞的側向質膜。 其運送至細胞膜依賴 RAB11A。 來源亦記載細胞膜與肌膜定位,但未提供更多條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- ARL13BQ3SXY8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ATP6V0BQ99437 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COMTP21964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EVI2BP34910-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCRL3Q96P31-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MGST3O14880 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTERF3Q96E29 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAGE1O75459 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCN3BQ9NY72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM130Q8N3G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM237Q96Q45-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC2A5 主要運輸果糖,對其他單醣的轉運活性較低,也能以低效率介導 2-deoxyglucose 攝取。序列相似性資料指出,它對小腸果糖吸收不可或缺,並參與膳食果糖反應中的鹽分吸收與血壓調節;高果糖攝取引起高血壓的發展也被描述為需要此蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a fructose transporter that has only low activity with other monosaccharides. Can mediate the uptake of 2-deoxyglucose, but with low efficiency. Essential for fructose uptake in the small intestine (By similarity). Plays a role in the regulation of salt uptake and blood pressure in response to dietary fructose (By similarity). Required for the development of high blood pressure in response to high dietary fructose intake (By similarity) PMID 16186102 ↗ · PMID 1695905 ↗ · PMID 17710649 ↗ · PMID 28083649 ↗ · PMID 29548810 ↗ · PMID 8333543 ↗ |
| 分子活性 | D-fructose(out) = D-fructose(in) | 含實驗來源 | 證據與來源D-fructose(out) = D-fructose(in) PMID 17710649 ↗ · PMID 28083649 ↗ · PMID 29548810 ↗ · PMID 8333543 ↗ |
| 細胞定位 | SLC2A5 是多次穿膜蛋白,定位於空腸絨毛的頂端膜,也可出現在絨毛細胞的側向質膜;運送至細胞膜依賴 RAB11A。來源另記載細胞膜與肌膜定位,但未說明相關條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane, sarcolemma; Localized on the apical membrane of jejunum villi, but also on lateral plasma membranes of the villi. Transport to the cell membrane is dependent on RAB11A PMID 1695905 ↗ · PMID 28083649 ↗ · PMID 7619085 ↗ · PMID 8333543 ↗ |
| 調控 | 在 Caco-2 細胞中,SLC2A5 的調控與 forskolin 有關;此敘述未指出調控的方向或具體機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATGGCCAAAGTGCACCCAGAATGTCTTCTCTCTCCATTCA40GTGCACGCGTTACTTTGGCTAAAAGGAGGTGAGCGGCACT80CTGCCCTTCCAGAGCAAGCATGGAGCAACAGGATCAGAGC120ATGAAGGAAGGGAGGCTGACGCTTGTGCTTGCCCTGGCAA160CCCTGATAGCTGCCTTTGGGTCATCCTTCCAGTATGGGTA200CAACGTGGCTGCTGTCAACTCCCCAGCACTGCTCATGCAA240CAATTTTACAATGAGACTTACTATGGTAGGACCGGTGAAT280TCATGGAAGACTTCCCCTTGACGTTGCTGTGGTCTGTAAC320CGTGTCCATGTTTCCATTTGGAGGGTTTATCGGATCCCTC360CTGGTCGGCCCCTTGGTGAATAAATTTGGCAGAAAAGGGG400CCTTGCTGTTCAACAACATATTTTCTATCGTGCCTGCGAT440CTTAATGGGATGCAGCAGAGTCGCCACATCATTTGAGCTT480ATCATTATTTCCAGACTTTTGGTGGGAATATGTGCAGGTG520TATCTTCCAACGTGGTCCCCATGTACTTAGGGGAGCTGGC560CCCTAAAAACCTGCGGGGGGCTCTCGGGGTGGTGCCCCAG600CTCTTCATCACTGTTGGCATCCTTGTGGCCCAGATCTTTG640GTCTTCGGAATCTCCTTGCAAACGTAGATGGCTGGCCGAT680CCTGCTGGGGCTGACCGGGGTCCCCGCGGCGCTGCAGCTC720CTTCTGCTGCCCTTCTTCCCCGAGAGCCCCAGGTACCTGC760TGATTCAGAAGAAAGACGAAGCGGCCGCCAAGAAAGCCCT800ACAGACGCTGCGCGGCTGGGACTCTGTGGACAGGGAGGTG840GCCGAGATCCGGCAGGAGGATGAGGCAGAGAAGGCCGCGG880GCTTCATCTCCGTGCTGAAGCTGTTCCGGATGCGCTCGCT920GCGCTGGCAGCTGCTGTCCATCATCGTCCTCATGGGCGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。