基因總覽
SLC2A11(solute carrier family 2 member 11)是蛋白質編碼基因,產物為葡萄糖轉運蛋白,屬於主要促進因子超家族(major facilitator superfamily)中的糖類轉運蛋白家族,並歸於葡萄糖轉運蛋白亞家族。其蛋白質長 496 個胺基酸,包含多段跨膜螺旋,並以細胞質側與細胞外側區段交錯排列的方式構成多次穿膜蛋白。這些家族與結構資訊界定了 SLC2A11 產物的基本性質;其葡萄糖轉運作用則見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000316185 ★ | 23,857,875–23,886,312 | 12 |
| ENST00000345044 | 23,856,703–23,886,309 | 12 |
| ENST00000403208 | 23,856,703–23,870,182 | 4 |
| ENST00000405847 | 23,856,703–23,877,328 | 5 |
| ENST00000398356 | 23,856,872–23,885,536 | 13 |
| ENST00000611880 | 23,857,000–23,886,112 | 11 |
| ENST00000947066 | 23,857,701–23,886,307 | 12 |
| ENST00001050018 | 23,857,722–23,886,307 | 7 |
| ENST00001113382 | 23,857,856–23,875,310 | 4 |
| ENST00000947067 | 23,857,863–23,885,534 | 12 |
| ENST00001122036 | 23,857,875–23,880,791 | 7 |
| ENST00000947068 | 23,857,905–23,885,536 | 11 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC2A11 的產物被註記為促進性葡萄糖轉運蛋白,作用方向為將 D-glucose 從細胞外運送至細胞內。此功能描述指向跨膜轉運,而不是在來源所列之外推論其他底物或轉運方式。
相關活性註記以反應式表示 D-glucose(out) = D-glucose(in),呈現葡萄糖由細胞外側轉至細胞內側的方向。來源支持其參與葡萄糖進入細胞的轉運功能,但未提供轉運速率、調控條件、組織分布或其他生理效應的資訊,因此不宜據此延伸推定其在特定細胞或生理情境中的作用。
Promoter 與基因調控
>SLC2A11 ENST00000316185 GRCh38 chr22:23856875-23857975 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACCTGCCTCTCACGCAATGGATCCCCTGGCGGCAACCCGAGACCGGTTCTCCTACCCGCATTCCGCCAAG TCTCTCGCTCTGCCCAGGACGCACAGATGAGAGCGCTCCGAAGACTGGTGGGTCTATCTTTCGGTCTTTC CTAATTTTCCCGTCCTCTGGGGAAAGGTCGGGGATACCTGAACCAAAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGG GGTGTAGGTGGGGCGTGCATAGATGTGCACAACCAAGGGCTTGGCCCTCCGGAGAACGCCCAGGGGCAGT GGCCTCCGAGGTTCTGGCGGCCGGCAGTGGCGACCGGCGCAGGGAATCGCGCAGGGTTGCGGCTGAGGTC AGACCAGCGAGAGACAGAGACCCGCAGACATTTAGTCCAGAGACTGTAGCAAAGGAGGGGGACGAGGGGC CAGAGCCGGAATTTCGGGGGAGGACTTGGGAGCGCGGCGACCAGAGTCGCTTGCTGGCACTTGCGAGGGC GAATGCAGGGGCTTGGCCGAGATGACCTTGGACCAGAGCTCCCTTCCGGCCTGCAGAGATGAGCTTGGGG CTTAGCCGAGTAAGGAGTGAGCGGCTTTTCAGCCTCAGTGCTGCGGCAGAGGCGGATGGAGGATGAACTG GAGCCGTCCTTACGGCCTCGGACGCAGGTGAGCTCCCAGCGGCGGCGACAAACCCCGCGGCGGTGACCCC AAACCCCCCCCCCGCGGCGGCGACTCCCCCCCAACACGCTGGGGCGAACTCCCCAGCACCCCCAGCCCTT CTTAAAAACGCTGAGTCCGCGCATGCGCCTCAGGCGCCCTCCGCGACACTCTAGCGGCTCTGCGCTTCAC TGCGCCTGAGCTTGAGTCTCAGGCCTTAGTCCCGGCCATCGTTTAGCGTTGCGCGAACCCTCAGCTGGTG CGGCCGCTCTCAATACCCACTGCGCTTGCGCTACAGCTTCGTCTCGACGGGTTTGCTCCTCTCAAACGCT CACTGCGCGTGCGCTAGCGCCTCTTTCACCACTGGGCGCTGCGCGCTGCCCTTCCCTCCGCGCACAGGCT GCCGGCTCACCGCTTGCTAATGGCAGCCGGGGTCTCCCTGGGACAGCAAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC2A11_2 ↗ | 22:23,856,934 | 正股 | 23,856,885–23,856,944 |
| SLC2A11_1 ↗ | 22:23,857,875 | 正股 | 23,857,826–23,857,885 |
| SLC2A11_3 ↗ | 22:23,877,815 | 正股 | 23,877,766–23,877,825 |
| SLC2A11_4 ↗ | 22:23,885,776 | 正股 | 23,885,727–23,885,786 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9CGN2 · promoter · 23856597–23857010 · regulatory
ENSR22_B6PSK · enhancer · 23857011–23857802 · regulatory
ENSR22_73DTP8 · promoter · 23857803–23857885 · regulatory
ENSR22_B6PSP · enhancer · 23857886–23858673 · regulatory
ENSR22_57LHTQ · CTCF_binding_site · 23858004–23858025 · regulatory
ENSR22_8NXDC · enhancer · 23858981–23859178 · regulatory
ENSR22_9CGPK · open_chromatin_region · 23862023–23862518 · regulatory
ENSR22_57LJLK · CTCF_binding_site · 23862284–23862305 · regulatory
ENSR22_57LJM7 · CTCF_binding_site · 23862421–23862442 · regulatory
· motif · 23853966–23853982 · motif
· motif · 23856714–23856729 · motif
· motif · 23856826–23856843 · motif
· motif · 23857160–23857177 · motif
· motif · 23857219–23857226 · motif
· motif · 23857405–23857414 · motif
· motif · 23857648–23857659 · motif
· motif · 23857652–23857666 · motif
· motif · 23857652–23857666 · motif
· motif · 23857662–23857673 · motif
· motif · 23857662–23857673 · motif
· motif · 23857805–23857816 · motif
· motif · 23857805–23857816 · motif
· motif · 23857858–23857869 · motif
· motif · 23857858–23857869 · motif
· motif · 23858006–23858022 · motif
· motif · 23858094–23858105 · motif
· motif · 23858094–23858105 · motif
· motif · 23862033–23862046 · motif
· motif · 23862286–23862302 · motif
· motif · 23862423–23862439 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:496 aa
SLC2A11 蛋白質長 496 個胺基酸,具有 12 段跨膜螺旋;螺旋之間分布於細胞質側或細胞外側的區段,蛋白質兩端也位於細胞質側。它屬於 major facilitator superfamily 的糖類轉運蛋白家族,並歸入葡萄糖轉運蛋白亞家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC2A11 位於細胞膜,並註記為多次穿膜蛋白。 來源沒有提供其定位隨條件改變的資訊,也未列出異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC2A11 的產物是促進性葡萄糖轉運蛋白,來源將其功能描述為促進葡萄糖跨膜運輸。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | D-glucose(out) = D-glucose(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC2A11 蛋白質定位於細胞膜,並具有多次穿膜蛋白的特徵。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTTCACCACTGGGCGCTGCGCGCTGCCCTTCCCTCCG40CGCACAGGCTGCCGGCTCACCGCTTGCTAATGGCAGCCGG80GGTCTCCCTGGGACAGCAAGACCTCCGCTCAGGCCCCTCT120TTCGAATGCTCCACGCCCTCCTGCGATCTAGAATGATTCA160GGGCAGGATCCTGCTCCTGACCATCTGCGCTGCCGGCATT200GGTGGGACTTTTCAGTTTGGCTATAACCTCTCTATCATCA240ATGCCCCGACCTTGCACATTCAGGAATTCACCAATGAGAC280ATGGCAGGCGCGTACTGGAGAGCCACTGCCCGATCACCTA320GTCCTGCTTATGTGGTCCCTCATCGTGTCTCTGTATCCCC360TGGGAGGCCTCTTTGGAGCACTGCTTGCAGGTCCCTTGGC400CATCACGCTGGGAAGGAAGAAGTCCCTCCTGGTGAATAAC440ATCTTTGTGGTGTCAGCAGCAATCCTGTTTGGATTCAGCC480GCAAAGCAGGCTCCTTTGAGATGATCATGCTGGGAAGACT520GCTCGTGGGAGTCAATGCAGGTGTGAGCATGAACATCCAG560CCCATGTACCTGGGGGAGAGCGCCCCTAAGGAGCTCCGAG600GAGCTGTGGCCATGAGCTCAGCCATCTTTACGGCTCTGGG640GATCGTGATGGGACAGGTGGTCGGACTCAGGGAGCTCCTA680GGTGGCCCTCAGGCCTGGCCCCTGCTGCTGGCCAGCTGCC720TGGTGCCCGGGGCGCTCCAGCTCGCCTCCCTGCCTCTGCT760CCCTGAAAGCCCGCGCTACCTCCTCATTGACTGTGGAGAC800ACCGAGGCCTGCCTGGCAGCACTACGGCGGCTCCGGGGCT840CCGGGGACTTGGCAGGGGAGCTGGAGGAGCTGGAGGAGGA880GCGCGCTGCCTGCCAGGGCTGCCGTGCCCGGCGCCCATGG920GAGCTGTTCCAGCATCGGGCCCTGAGGAGACAGGTGACAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。