演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC29A2DER12

solute carrier family 29 member 2

SLC29A2 編碼 SLC29A/ENT 家族的多次穿膜蛋白,可促進核苷與核鹼基跨膜運輸,並參與維持細胞內相關分子的平衡。

Homo sapiens11q13.2UniProt Q14542
OFFICIAL SYMBOL
SLC29A2
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q14542
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC29A2 的正式名稱為 solute carrier family 29 member 2,編碼 SLC29A/ENT transporter 家族的膜蛋白。其蛋白質長 456 個胺基酸,具有多個穿膜螺旋,是多次穿膜轉運蛋白。此家族成員的基本特性是促進核苷及核鹼基跨膜移動;SLC29A2 所涉及的分子種類與細胞情境,詳見功能段落。另有資料將一種腺苷或胸苷轉運蛋白描述為非功能性,且不表現在細胞膜上;來源未提供足以判定其與此處所述蛋白形式關係的資訊。

Official symbol
SLC29A2
Gene name
solute carrier family 29 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11004
UniProt
Q14542
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DER12ENT2HNP36

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSLC29A2pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:66,360,101–66,372,476
Gene span
12,376 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000357440 ★66,362,521–66,371,76012
ENST0000054455466,362,520–66,372,21413
ENST0000054603466,362,520–66,372,21413
ENST0000087364166,362,520–66,372,47614
ENST0000093262266,362,520–66,372,21411
ENST0000093262366,362,520–66,371,93310
ENST0000093262466,362,520–66,371,93311
ENST0000093262566,362,520–66,371,93311
ENST0000093262666,362,520–66,371,9334
ENST0000093262766,362,520–66,371,93311
ENST0000093262866,362,520–66,371,93312
ENST0000094471866,362,520–66,372,21411

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC29A2 是雙向促進型轉運蛋白,運輸不依賴 Na(+) 且屬被動運輸。它可依條件促進底物進入或離開細胞,涵蓋 inosine、adenosine、uridine、thymidine、cytidine 與 guanosine 等核苷,也運輸 purine 核鹼基 hypoxanthine、adenine、guanine,以及 pyrimidine 核鹼基 thymine、uracil。這些運輸作用有助於維持細胞內核苷與核鹼基的平衡。

其運輸底物還包括 nicotinamide,並可運輸 urate。Nicotinamide 的攝取被描述為支持其恆定性並調節其生物活性;來源未進一步說明相關調節途徑。不同底物可呈現流入或流出方向,例如 uridine 可雙向運輸,而 hypoxanthine 的雙向移動亦見於特定細胞情境,因此不宜將其功能簡化為只負責攝取或只負責外排。

在腎臟細胞中,SLC29A2 參與基底外側膜的核苷運輸,使核苷代謝物得以被肝臟吸收。在睪丸,SLC29A2 介導核苷進入 Sertoli cells,並調節核苷跨越 blood-testis barrier 的運輸。這些例子顯示其作用與特定細胞膜區域及組織中的物質移動有關。

另有相似性推定指出,在骨骼肌微血管內皮細胞中,SLC29A2 介導 hypoxanthine 的流入與流出,控制細胞內可供 xanthine oxidase 產生 ROS 的 hypoxanthine 數量。此項功能標示為 By similarity,屬推定資訊。另有資料將腺苷或胸苷轉運描述為非功能性,並指出其不表現在細胞膜上;來源未交代這項描述所指的蛋白形式,因此不能據此概括所有 SLC29A2 的運輸功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 66371760 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC29A2 ENST00000357440 GRCh38 chr11:66371660-66372760 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTGTAATAGCAACATTTTGGGAGGCCGATGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCCT
GGTCAAAAGATGAGTTCGAGACTAGACTGGCCACCTCTTCAGTAGAGCTGGTGAAGCCCCGTTTCTACTA
AAAATACAAAAATTAACCGGACGTGGTGGCATGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCCTGAGGCTGAGGCACC
AGAATCGCTTGAACCTGCCTGGGAGGGGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACGCCACTGCACTTCCGCCT
GGGCGACAGAGCGACACTCAGTCTCAAAAAAACTAGTTTGTGTTTTGGAGCCTCTCACTTCTCCAGCGTC
CCCGATACGCCCGGGGATTGCAGAGAACCCACACCTATTCGTAGATTATGAGAGTAGGAGCAAATTAATG
ATTTATAGTCTTTTCAAATTTTTTTTTTTAACAGAAAAAGAGTAGGGAGTTGAAAGTAATGCTGTTTTTT
TCCAGGCACTCCCGGGGACCCAGCGCGGCGAAGCCCGCCAGGATCGCGGGCGACCTGTGGCAGCTCTGGT
TCCCCCGCCCGGGCCCGGCTCGGGTTACGCTCTGGGCGGGGACTCCGCAGCGGCTCCCTAGTTAGGGGGC
GCCCCGGTGGGTTCCAGCTTTAGGGGTCGCAGGAGCGGCTCTGGCATCACCTCGGAGCTGACGAAGCGGG
AAGAGCCCCGCACCAGTGCTGCCCCTACAGAGCTCTCGGCGGGGGGTGGAGGTGAGGTTACACCTCGTCC
CTACCCCCGCCTTCCCCTCCGCCGCAGGGATCCGGGACCCGCCCCCGCGGAGAGGACGGGGGGCTGCGGG
GAGGGGCTGTGCGGGGAGCGGGCGGGTTCCGCAGGCCCCTAGGTGGGGCGGGGCCCGAGCCAGAGTCGAG
TCCCTGAGGCGGGTGGGGGAAGGAGAGACGGGTGGCGCGACCCTCTGTCCCCGCCTCGGGGCGGAGCCCA
GGTCCCAGCCTGCGGAGCGCGAGACACGCCGAAATCCGCCCGAGGCTACCTGTGCGACTCCAGCCGCCCT
GCACCGGAATCTGGGGAGACCCGCCCCCCGCCCCACCGGTCTGCGGCCCTC
SLC29A2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC29A2_3 ↗11:66,371,618負股66,371,608–66,371,667
SLC29A2_1 ↗11:66,371,747負股66,371,737–66,371,796
SLC29A2_2 ↗11:66,372,109負股66,372,099–66,372,158
SLC29A2_4 ↗11:66,372,446負股66,372,436–66,372,495

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_C8KS5 · enhancer · 66369778–66371749 · regulatory

ENSR11_5KLHHR · CTCF_binding_site · 66371126–66371147 · regulatory

ENSR11_BH6MG · promoter · 66371750–66372704 · regulatory

ENSR11_5KLHN9 · CTCF_binding_site · 66372098–66372119 · regulatory

ENSR11_9ZCB9 · enhancer · 66373318–66373604 · regulatory

· motif · 66371128–66371144 · motif

· motif · 66371134–66371146 · motif

· motif · 66371136–66371143 · motif

· motif · 66371334–66371345 · motif

· motif · 66371363–66371376 · motif

· motif · 66371523–66371536 · motif

· motif · 66371614–66371629 · motif

· motif · 66371648–66371661 · motif

· motif · 66371676–66371686 · motif

· motif · 66371683–66371693 · motif

· motif · 66371799–66371814 · motif

· motif · 66371867–66371877 · motif

· motif · 66371893–66371903 · motif

· motif · 66371914–66371924 · motif

· motif · 66371945–66371955 · motif

· motif · 66372009–66372019 · motif

· motif · 66372100–66372116 · motif

· motif · 66372201–66372214 · motif

· motif · 66372480–66372491 · motif

· motif · 66372480–66372491 · motif

· motif · 66372482–66372491 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:456 aa

1 aa456 aa跨膜區
依 Q14542 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC29A2 蛋白長 456 個胺基酸,屬 SLC29A/ENT transporter 家族。序列註解預測其含有 11 段螺旋型穿膜區,分布於蛋白序列不同位置;這些區段共同構成多次穿膜蛋白的結構特徵。

跨膜區Helical13–33 aa
跨膜區Helical70–90 aa
跨膜區Helical99–119 aa
跨膜區Helical124–144 aa
跨膜區Helical162–182 aa
跨膜區Helical193–213 aa
跨膜區Helical291–311 aa
跨膜區Helical324–344 aa
跨膜區Helical360–380 aa
跨膜區Helical386–406 aa
跨膜區Helical432–452 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q14542…

AlphaFold · Q14542

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Apical cell membrane;Basolateral cell membrane;Cell membrane

SLC29A2 被定位於細胞膜,並有頂端與基底外側膜的定位紀錄;在 Sertoli cells 中則定位於頂端膜。 這些資料顯示其膜區域定位依細胞情境而異,並與其在腎臟細胞及 Sertoli cells 中的核苷運輸情境相符。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DER12SLC29A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

16 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 16 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC29A2 是不依賴 Na(+) 的被動雙向促進型轉運蛋白,可運輸多種核苷、purine 與 pyrimidine 核鹼基,也可運輸 nicotinamide 和 urate,協助維持相關分子平衡。它在腎臟細胞基底外側膜及 Sertoli cells 頂端膜參與核苷運輸;骨骼肌微血管內皮細胞中 hypoxanthine 與 ROS 的關聯則屬相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Bidirectional uniporter involved in the facilitative transport of nucleosides and nucleobases, and contributes to maintaining their cellular homeostasis. Functions as a Na(+)-independent, passive transporter. Involved in the transport of nucleosides such as inosine, adenosine, uridine, thymidine, cytidine and guanosine. Also able to transport purine nucleobases (hypoxanthine, adenine, guanine) and pyrimidine nucleobases (thymine, uracil). Also mediates nicotinamide uptake supporting homeostasis and modulating its biological activities. Can also transport urate. Involved in nucleoside transport at basolateral membrane of kidney cells, allowing liver absorption of nucleoside metabolites. Mediates apical nucleoside uptake into Sertoli cells, thereby regulating the transport of nucleosides in testis across the blood-testis-barrier. Mediates both the influx and efflux of hypoxanthine in skeletal muscle microvascular endothelial cells to control the amount of intracellular hypoxanthine available for xanthine oxidase-mediated ROS production (By similarity)

PMID 10722669 ↗ · PMID 12527552 ↗ · PMID 12590919 ↗ · PMID 16214850 ↗ · PMID 21795683 ↗ · PMID 23639800 ↗ · PMID 39885119 ↗ · PMID 40367900 ↗ · PMID 9396714 ↗ · PMID 9478986 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能另有資料將腺苷或胸苷轉運蛋白描述為非功能性,並指出該蛋白不表現在細胞膜上;來源未說明這項描述所指的蛋白形式。含實驗來源
證據與來源

Non functional nucleoside transporter protein for adenosine or thymidine transport. Does not express on cell membrane

PMID 12527552 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性inosine(in) = inosine(out)含實驗來源
證據與來源

inosine(in) = inosine(out)

PMID 10722669 ↗ · PMID 12527552 ↗ · PMID 16214850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性adenosine(in) = adenosine(out)含實驗來源
證據與來源

adenosine(in) = adenosine(out)

PMID 10722669 ↗ · PMID 12527552 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性uridine(out) = uridine(in)含實驗來源
證據與來源

uridine(out) = uridine(in)

PMID 10722669 ↗ · PMID 12590919 ↗ · PMID 16214850 ↗ · PMID 21795683 ↗ · PMID 9396714 ↗ · PMID 9478986 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thymidine(in) = thymidine(out)含實驗來源
證據與來源

thymidine(in) = thymidine(out)

PMID 12527552 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hypoxanthine(out) = hypoxanthine(in)含實驗來源
證據與來源

hypoxanthine(out) = hypoxanthine(in)

PMID 16214850 ↗ · PMID 21795683 ↗

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分子活性adenine(out) = adenine(in)含實驗來源
證據與來源

adenine(out) = adenine(in)

PMID 21795683 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性cytidine(in) = cytidine(out)含實驗來源
證據與來源

cytidine(in) = cytidine(out)

PMID 10722669 ↗ · PMID 12590919 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thymine(out) = thymine(in)含實驗來源
證據與來源

thymine(out) = thymine(in)

PMID 21795683 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性uracil(in) = uracil(out)含實驗來源
證據與來源

uracil(in) = uracil(out)

PMID 21795683 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性guanine(out) = guanine(in)含實驗來源
證據與來源

guanine(out) = guanine(in)

PMID 21795683 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性guanosine(in) = guanosine(out)含實驗來源
證據與來源

guanosine(in) = guanosine(out)

PMID 16214850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性urate(out) = urate(in)含實驗來源
證據與來源

urate(out) = urate(in)

PMID 40367900 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性nicotinamide(out) = nicotinamide(in)含實驗來源
證據與來源

nicotinamide(out) = nicotinamide(in)

PMID 39885119 ↗

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細胞定位SLC29A2 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜;資料另記錄其位於頂端膜與基底外側膜,並特別指出在 Sertoli cells 中定位於頂端膜。含實驗來源
證據與來源

Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the apical membrane of Sertoli cells

PMID 23639800 ↗ · PMID 12527552 ↗ · PMID 40367900 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 16 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000357440 · 2,455 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGACACGCCGAAATCCGCCCGAGGCTACCTGTGCGACTC40
41CAGCCGCCCTGCACCGGAATCTGGGGAGACCCGCCCCCCG80
81CCCCACCGGTCTGCGGCCCTCCGCCCCAGCGCAGGTGCAG120
121GTGCGGCTTCTCTGCCCCTTTCACCCCAGGCGCATCCGCC160
161GCGGCGGCCATGGCGCGAGGAGACGCCCCGCGGGACAGCT200
201ACCACCTGGTCGGGATCAGCTTCTTCATCCTGGGGCTGGG240
241CACCCTCCTTCCCTGGAACTTCTTCATCACCGCCATCCCG280
281TACTTCCAGGCGCGACTGGCCGGGGCCGGCAACAGCACAG320
321CCAGGATCCTGAGCACCAACCACACGGGTCCCGAGGATGC360
361CTTCAACTTCAACAATTGGGTGACGCTGCTGTCCCAGCTG400
401CCCCTGCTGCTCTTCACCCTCCTCAACTCCTTCCTGTACC440
441AGTGCGTCCCGGAGACGGTGCGCATTCTGGGCAGCCTGCT480
481GGCCATACTGCTGCTCTTTGCCCTGACAGCAGCGCTGGTC520
521AAGGTGGACATGAGCCCCGGACCCTTCTTCTCCATCACCA560
561TGGCCTCCGTCTGCTTCATCAACTCCTTCAGTGCAGTCCT600
601ACAGGGCAGCCTCTTCGGGCAGCTGGGCACCATGCCCTCC640
641ACCTACAGCACCCTCTTCCTCAGCGGCCAGGGCCTGGCTG680
681GGATCTTTGCTGCCCTTGCCATGCTCCTGTCCATGGCCAG720
721TGGCGTGGACGCCGAGACCTCTGCCCTGGGGTACTTTATC760
761ACGCCCTGTGTGGGCATCCTCATGTCCATCGTGTGTTACC800
801TGAGCCTGCCTCACCTGAAGTTTGCCCGCTACTACCTGGC840
841CAATAAATCATCCCAGGCCCAAGCTCAGGAGCTGGAGACC880
881AAAGCTGAGCTCCTCCAGTCTGATGAGAACGGGATTCCCA920
921GTAGTCCCCAGAAAGTAGCTCTGACCCTGGATCTTGACCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。