演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC28A2CNT2

solute carrier family 28 member 2

SLC28A2 是多次穿膜的 concentrative nucleoside transporter 家族蛋白,依賴鈉離子運輸核苷,對嘌呤核苷及 uridine 具有選擇性。

Homo sapiens15q21.1UniProt O43868
OFFICIAL SYMBOL
SLC28A2
CHROMOSOME
15
UNIPROT
O43868
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC28A2(solute carrier family 28 member 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 concentrative nucleoside transporter(CNT)家族。其蛋白質具有多次穿越細胞膜的結構,長度為 658 個胺基酸,N 端前段含有無序區域。這類膜蛋白以鈉離子依賴的方式運輸核苷;SLC28A2 的運輸選擇性偏向嘌呤核苷與 uridine。它在腎臟及其他組織的核苷攝取與回收中具有重要角色。

Official symbol
SLC28A2
Gene name
solute carrier family 28 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11002
UniProt
O43868
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CNT2SPNT1HCNT2HsT17153

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegSLC28A2pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:45,252,227–45,277,846
Gene span
25,620 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000347644 ★45,252,234–45,277,84618
ENST0000095971945,252,227–45,277,84618
ENST0000095972045,252,227–45,277,84617
ENST0000112073845,252,227–45,277,84616
ENST0000113315145,252,227–45,277,84618
ENST0000056043845,252,234–45,264,6836

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC28A2 是鈉離子依賴的核苷運輸蛋白,具有 nucleoside transport system cif 或 N1 subtype(N1/cif)的運輸特性。它偏好嘌呤核苷與 uridine,將細胞外核苷與鈉離子共同運入細胞;已列出的運輸底物包括 adenosine、inosine、guanosine 和 uridine。這些反應顯示其運輸方向由細胞外至細胞內,且鈉離子與核苷一同移動。

在生物學功能上,SLC28A2 對腎臟及其他組織中特定嘌呤核苷的攝取與回收具有重要作用。核苷回收可使細胞取得核苷作為再利用的來源;來源指出其參與此過程,但未進一步說明不同組織中的具體作用方式或各底物的相對貢獻。

在睪丸中,SLC28A2 可能參與調節有機化合物跨越血睪屏障的運輸。此項功能屬於可能的作用,來源未將其表述為已確立的機制,也未指出具體運送哪些有機化合物。因此,較明確的功能證據集中於鈉離子依賴的核苷運輸,以及腎臟和其他組織的嘌呤核苷攝取與回收;睪丸屏障相關角色則仍應保留為推測。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45252234 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC28A2 ENST00000347644 GRCh38 chr15:45251234-45252334 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTGAGATTACAAGCCTGCACCACCATGCCCGGATAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCGCC
ATGTTGGCCAGGGTGGTCTCGAGCGCCTGACCTCAAATGATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAGTGTGCTGG
GATTACAAGCGTGATTCACCGCGCTCGACCTGCAAAGCCTTTCTTGACACATCCGTCTTTCCTCACTGAT
CTGTTCGTTTTTTGATGGCAGAGACCTTGTCTCACTCATTTTTATGTCCTCACACGGAAAACGGTGGCTG
GCTAATAGTGGTTACTCAATAAGTATTTGTTGAATGGATTAATAAAATAATTCCTAGCAGTCATTTGGCA
TGGAATCATGTACAGTCGTGCTGTTTATTGTTTTCTAGGGCATGTCTTTCCAGCACAAAATGATGGTAAA
TTTTCTGGGTGCAGAGACGGCTCTTACTGTATTTTACAGGCTACCCAGTGCCTAGTCCAGTGGTGGGTAA
TGCTTACAGGAATGTACCTGTTAGAAGTTCTTACAGAATTCTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCTGACAGGGT
CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCACAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCAGAGGC
TCAAGGGATCCTTCCACCTCCGCCTGCCGAGTAACTGGAACCACAGTCGTGTGCCACCGCGCCCAGCTAA
TTTTTGTATTTGTTGTAGAGATGTGGTTTCGCCATGTTATCCTGGCTGGTCTCAAGCGATCCGCCCGTCT
CGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACGGGCGGGCGCCACCTCTGCATAAGTCTTAGGCCTGCAAAACAGTC
TTAAAAACATATAATATTTAACTTGAGAGGTGCAGTCCTCCTCTACATTGAGGGCAGGCTCAGCGAAGGA
GGGCCCAAGACATAAAACTAACCAATGGCAGGAAAGCCCCCATGCCCCACCCAAGCTGCCCCTCCTCCCT
CGCAGCTGAGCTTTTCTTTCAGTCCTTCACTGAGGAGCCAGAGGGAATCAATTCCACAAGCTGGGGTAAG
TAAAGGTGTTTGGGGGAGGGCAGGTGCCTAATTTACAAATTTTTAAAGAGA
SLC28A2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC28A2_1 ↗15:45,252,234正股45,252,185–45,252,244

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_5DMDGL · CTCF_binding_site · 45253205–45253226 · regulatory

ENSR15_83BWXD · open_chromatin_region · 45253434–45253664 · regulatory

ENSR15_9MXZL · enhancer · 45254815–45255076 · regulatory

· motif · 45253207–45253223 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:658 aa

1 aa658 aa功能區域跨膜區
依 O43868 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC28A2 蛋白質長 658 個胺基酸,屬於 concentrative nucleoside transporter(CNT)家族。序列註解標示 14 段螺旋型跨膜區域;N 端第 1 至 55 個胺基酸則被註解為無序區域。

跨膜區Helical80–100 aa
跨膜區Helical104–123 aa
跨膜區Helical148–166 aa
跨膜區Helical172–192 aa
跨膜區Helical200–220 aa
跨膜區Helical233–253 aa
跨膜區Helical260–280 aa
跨膜區Helical295–314 aa
跨膜區Helical336–355 aa
跨膜區Helical362–381 aa
跨膜區Helical423–443 aa
跨膜區Helical454–474 aa
跨膜區Helical529–549 aa
跨膜區Helical567–587 aa
功能區域Disordered1–55 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O43868…

AlphaFold · O43868

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Apicolateral cell membrane

SLC28A2 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜;在睪丸中,來源特別指出其位於 Sertoli 細胞與血管內皮細胞的頂端外側膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CNT2SLC28A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC28A2 是鈉離子依賴、對嘌呤核苷具選擇性的運輸蛋白,具有 N1/cif 核苷運輸系統的特性,也可運輸 uridine。它在腎臟及其他組織中特定嘌呤核苷的攝取與回收中具有重要作用;此外,可能參與調節有機化合物跨越睪丸血睪屏障的運輸。含實驗來源
證據與來源

Sodium-dependent and purine-selective transporter. Exhibits the transport characteristics of the nucleoside transport system cif or N1 subtype (N1/cif) (selective for purine nucleosides and uridine). Plays a critical role in specific uptake and salvage of purine nucleosides in kidney and other tissues. May contribute to regulate the transport of organic compounds in testes across the blood-testis-barrier (Probable)

PMID 10087507 ↗ · PMID 21795683 ↗ · PMID 9435697 ↗ · PMID 35307651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性adenosine(out) + Na(+)(out) = adenosine(in) + Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

adenosine(out) + Na(+)(out) = adenosine(in) + Na(+)(in)

PMID 10087507 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性inosine(out) + Na(+)(out) = inosine(in) + Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

inosine(out) + Na(+)(out) = inosine(in) + Na(+)(in)

PMID 10087507 ↗ · PMID 9435697 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性guanosine(out) + Na(+)(out) = guanosine(in) + Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

guanosine(out) + Na(+)(out) = guanosine(in) + Na(+)(in)

PMID 10087507 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性uridine(out) + Na(+)(out) = uridine(in) + Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

uridine(out) + Na(+)(out) = uridine(in) + Na(+)(in)

PMID 10087507 ↗ · PMID 21795683 ↗ · PMID 9435697 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC28A2 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜;在睪丸中,位於 Sertoli 細胞與血管內皮細胞的頂端外側膜。含實驗來源
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Apicolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the apicolateral membranes of Sertoli cells and vascular endothelial cells in testis

PMID 9435697 ↗ · PMID 35307651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000347644 · 4,371 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCTTCACTGAGGAGCCAGAGGGAATCAATTCCACAAG40
41CTGGGTTGAGGAGAACAGGAGATGGAGAAAGCAAGTGGAA80
81GACAGTCCATTGCTCTGTCCACAGTGGAGACTGGCACAGT120
121GAACCCGGGGCTGGAGCTCATGGAAAAAGAAGTAGAGCCT160
161GAGGGAAGCAAGAGGACTGACGCACAAGGACACAGCCTGG200
201GGGATGGACTGGGCCCTTCCACTTACCAGAGGAGGAGTCG240
241GTGGCCTTTCAGCAAAGCAAGAAGTTTCTGCAAAACACAC280
281GCCAGCTTGTTCAAGAAGATCCTGTTGGGCCTGTTGTGTT320
321TGGCCTATGCTGCCTATCTCCTGGCAGCTTGCATCTTGAA360
361TTTCCAGAGGGCACTGGCCTTGTTTGTCATCACCTGCTTG400
401GTGATCTTTGTCCTGGTTCACTCGTTTTTGAAAAAGCTCC440
441TGGGCAAAAAATTAACAAGATGTCTGAAGCCCTTTGAAAA480
481CTCCCGCCTGAGGCTTTGGACGAAATGGGTGTTTGCAGGA520
521GTCTCCTTGGTTGGCCTTATACTGTGGTTGGCTTTAGACA560
561CAGCCCAAAGGCCAGAGCAGCTGATCCCCTTTGCAGGAAT600
601CTGCATGTTCATCCTTATCCTCTTTGCCTGCTCCAAACAC640
641CACAGCGCAGTGTCCTGGAGGACAGTGTTTTCGGGCCTAG680
681GTCTTCAATTTGTCTTTGGGATCTTGGTCATCAGAACTGA720
721TCTTGGATATACTGTATTTCAGTGGCTGGGAGAGCAGGTC760
761CAGATTTTCCTGAACTACACTGTGGCCGGCTCCAGTTTTG800
801TCTTTGGGGATACACTGGTCAAGGATGTCTTTGCTTTTCA840
841GGCCTTACCAATCATCATTTTCTTTGGATGTGTGGTGTCC880
881ATTCTCTACTACCTGGGCCTTGTGCAATGGGTAGTTCAGA920
921AGGTCGCCTGGTTTTTACAAATCACTATGGGCACCACTGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。