演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC26A9

solute carrier family 26 member 9

SLC26A9 是 SLC26A/SulP transporter 家族的多次跨膜離子轉運蛋白,主要作為氯離子通道,也可交換氯離子與碳酸氫根離子。

Homo sapiens1q32.1UniProt Q7LBE3
OFFICIAL SYMBOL
SLC26A9
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q7LBE3
PDB / ALPHAFOLD
7CH1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC26A9 的正式名稱為 solute carrier family 26 member 9,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸入 SLC26A/SulP transporter 家族。這是一種多次跨膜蛋白,具有多段跨膜螺旋;其大型細胞質區段包含 STAS 結構域,另有一段被註記為無序區域。這些特徵構成此膜蛋白的基本架構。SLC26A9 的產物具有離子轉運功能,能以通道或交換器方式運作;具體的離子移動方式與條件見功能說明。

Official symbol
SLC26A9
Gene name
solute carrier family 26 member 9
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14469
UniProt
Q7LBE3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q32.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSLC26A9pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:205,913,048–205,943,460
Gene span
30,413 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367135 ★205,913,052–205,943,45621
ENST00000340781205,913,048–205,936,03821
ENST00000367134205,913,048–205,943,46022
ENST00000865095205,913,048–205,936,03820
ENST00001145566205,913,052–205,943,46021

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC26A9 產物可兼具離子通道與陰離子交換器功能;來源指出它主要作為氯離子通道。在通道模式下,氯離子可沿膜兩側移動,運輸過程不與其他離子的移動相耦聯。其機制採交替開放方式:可飽和的結合位點會輪流朝向膜的一側或另一側,使氯離子得以穿越細胞膜。

此通道功能可用氯離子在細胞膜兩側的移動描述:氯離子可由細胞內移向細胞外,也可反向移動。來源將其描述為未耦聯的氯離子運輸,並未指出此處必須伴隨另一種離子的交換。

除了通道作用,SLC26A9 也能進行氯離子與碳酸氫根離子的交換。此交換器對 DIDS 與硫代硫酸鹽敏感,能在細胞膜兩側交換這兩種陰離子;反應描述涵蓋碳酸氫根向細胞外移動、氯離子向細胞內移動的方向。這與通道模式中單獨運送氯離子的方式不同。

因此,SLC26A9 可透過兩種方式參與陰離子跨膜運輸:主要以通道形式運送氯離子,另可交換氯離子與碳酸氫根離子。這些資料界定了其轉運功能與作用方式,但未提供足以延伸至特定組織或生理情境的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 205943456 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC26A9 ENST00000367135 GRCh38 chr1:205943356-205944456 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCAAAGAATGGGCACCTGGTGTCGGGTAGTGACTCTCCCTCCCAGGAAGTAAATTAAGAAACTCCCCTA
CCCACCCTCCCAGCCCCTGTCCACAATTGCTTTCTGAGGTCCTTCCGTAGCACTCAATGGGCCTGGGATG
GGCAGCTCTGCTGGCAGCAGCCGGAGCAGTGCCATGACCCAGGGAGACATTAATTCCTAGAAGCGGCAGA
GGGCTGTGACTGGAGATTTGCTAGCCTTCAGGTCGCCTCTCATATAATTGTTCTAAGTCCAGTTTCTTGA
GCTCTTTTATCAGATTCTAAACCCCTGTGTTCTCTTTGCACACTACCTGAGGGGCCAGGAATAATTTCCC
CCATTGCACTGATGGATAGACCAAGGCACAGAGCTCACAAGCAACTTAACATTGGGGACAGAACTGGGAA
CCAGGTCTCCACCACAAACCAAAACCGCCTAAAGGCTCCCAGGGCCTCCCAGACATGGTTCTTCCCCTTC
CTCAGGGGTGTTCAGAGGACTACTGTCTTCCCACCCCCTAGATCTCCAATCTTCAAAGCAAGCATCCCCA
AGAGCACACCCCTCAGGTGGCCTCAATAGCTCCCATTGTCCAAGAGGCTCTTTGGCCTGACCCCCAGCCC
CATAAGCAGCAGGACAGCAAGCTCAGAGGAGCTTGTCCTGCCTTGTCCCCCTCCTCTGCCTCGTCCCCCT
CCTCCAGGGCCGCCTTGGGGGAGCCGGTGGGGCAGGAGCCCCGCTGAATGTGACCTATTGTCTTCGGGGT
GGATTTAGGAAGTGCCAAGCTCCCATCACACAGCCCTGCTCCCCAGGTAAAACAAAAAAAGGGCTGTTCA
TTTGGGACCTTTTCCCCCTTATCTCCTTTTCCTATCTCCTCAGGCTTAGCTATGGTGTAGTGTTCAAAAC
CACTTCCCCTCTGAGCCAATCAGAAGCCGGGGCTCACCCCGTGGCCCTGAGGAAAAGTTATTTATAAACG
CCTCCCTGGATTATTTGAGCAGAGCCCTTTCACACACCTCAGGAACACCTTTCGGCTGCCCGCTCCCCAG
ACACACCTGCAGCCCTGCCCAGCCGGCTTTGCTCACCCACTGGTAAGCCCC
SLC26A9 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC26A9_2 ↗1:205,935,906負股205,935,896–205,935,955
SLC26A9_1 ↗1:205,943,456負股205,943,446–205,943,505

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_952Q24 · enhancer · 205939626–205940102 · regulatory

ENSR1_952Q47 · enhancer · 205947032–205947348 · regulatory

· motif · 205945894–205945908 · motif

· motif · 205945894–205945908 · motif

· motif · 205945901–205945912 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:791 aa

1 aa791 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q7LBE3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC26A9 蛋白長 791 個胺基酸,包含多段跨膜螺旋,並具有大型細胞質區段。其 STAS 結構域位於第 519–737 個胺基酸;第 602–650 位則被註記為無序區域。蛋白質屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。

拓樸區域Cytoplasmic1–70 aa
跨膜區Helical71–96 aa
拓樸區域Extracellular97–99 aa
跨膜區Helical100–117 aa
拓樸區域Cytoplasmic118–128 aa
跨膜區Helical129–142 aa
拓樸區域Extracellular143–171 aa
跨膜區Helical172–190 aa
拓樸區域Cytoplasmic191–202 aa
跨膜區Helical203–224 aa
拓樸區域Extracellular225–235 aa
拓樸區域Extracellular245–254 aa
跨膜區Helical255–273 aa
拓樸區域Cytoplasmic274–281 aa
跨膜區Helical282–297 aa
拓樸區域Extracellular298–327 aa
跨膜區Helical328–348 aa
拓樸區域Cytoplasmic349–366 aa
跨膜區Helical367–382 aa
拓樸區域Extracellular383–390 aa
跨膜區Helical391–400 aa
拓樸區域Cytoplasmic401–404 aa
跨膜區Helical405–423 aa
拓樸區域Extracellular424–428 aa
跨膜區Helical429–450 aa
拓樸區域Cytoplasmic451–464 aa
跨膜區Helical465–476 aa
拓樸區域Extracellular477–477 aa
跨膜區Helical478–489 aa
拓樸區域Cytoplasmic490–791 aa
結構域STAS519–737 aa
功能區域Disordered602–650 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7CH1…

PDB · 7CH1

EM · 2.60 A · A/B=1-791

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Endomembrane system

SLC26A9 位於細胞膜及內膜系統。 WNK1、WNK2、WNK3 或 WNK4 會抑制其定位至細胞膜;此抑制作用不依賴激酶活性。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLC26A9SLC26A9GOPC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC26A9 可形成同源二聚體。此資料支持其亞基組成為兩個相同蛋白質,但未提供其他結合夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC26A9 是離子轉運蛋白,可作為離子通道或陰離子交換器,且主要以氯離子通道方式運作。通道以交替開放機制運送氯離子,結合位點輪流朝向膜的兩側;此外,該蛋白也能以對 DIDS 與硫代硫酸鹽敏感的方式,交換細胞膜兩側的氯離子與碳酸氫根離子。含實驗來源
證據與來源

Ion transporter that can act both as an ion channel and anion exchanger. Mainly acts as a chloride channel, which mediate uncoupled chloride anion transport in an alternate-access mechanism where a saturable binding site is alternately exposed to either one or the other side of the membrane. Also acts as a DIDS- and thiosulfate- sensitive anion exchanger the exchange of chloride for bicarbonate ions across the cell membrane

PMID 11834742 ↗ · PMID 15800055 ↗ · PMID 17673510 ↗ · PMID 26801567 ↗ · PMID 32818062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 17673510 ↗ · PMID 26801567 ↗ · PMID 32818062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)

PMID 15800055 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer含實驗來源
證據與來源

Homodimer

PMID 32818062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC26A9 是多次跨膜蛋白,位於細胞膜及內膜系統。WNK1、WNK2、WNK3 或 WNK4 會抑制 SLC26A9 定位至細胞膜;此抑制機制不依賴激酶活性。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endomembrane system / Multi-pass membrane protein; Localization to the cell membrane is inhibited by WNK kinases (WNK1, WNK2, WNK3 or WNK4) in a kinase-independent mechanism

PMID 17673510 ↗ · PMID 26801567 ↗ · PMID 32818062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367135 · 4,791 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCCCTTTCACACACCTCAGGAACACCTTTCGGCTGCC40
41CGCTCCCCAGACACACCTGCAGCCCTGCCCAGCCGGCTTT80
81GCTCACCCACTGCTTGTAAATGCCCCAGATATGAGCCAGC120
121CCAGGCCCCGCTACGTGGTAGACAGAGCCGCATACTCCCT160
161TACCCTCTTCGACGATGAGTTTGAGAAGAAGGACCGGACA200
201TACCCAGTGGGAGAGAAACTTCGCAATGCCTTCAGATGTT240
241CCTCAGCCAAGATCAAAGCTGTGGTGTTTGGGCTGCTGCC280
281TGTGCTCTCCTGGCTCCCCAAGTACAAGATTAAAGACTAC320
321ATCATTCCTGACCTGCTCGGTGGACTCAGCGGGGGATCCA360
361TCCAGGTCCCACAAGGCATGGCATTTGCTCTGCTGGCCAA400
401CCTTCCTGCAGTCAATGGCCTCTACTCCTCCTTCTTCCCC440
441CTCCTGACCTACTTCTTCCTGGGGGGTGTTCACCAGATGG480
481TGCCAGGTACCTTTGCCGTTATCAGCATCCTGGTGGGTAA520
521CATCTGTCTGCAGCTGGCCCCAGAGTCGAAATTCCAGGTC560
561TTCAACAATGCCACCAATGAGAGCTATGTGGACACAGCAG600
601CCATGGAGGCTGAGAGGCTGCACGTGTCAGCTACGCTAGC640
641CTGCCTCACCGCCATCATCCAGATGGGTCTGGGCTTCATG680
681CAGTTTGGCTTTGTGGCCATCTACCTCTCCGAGTCCTTCA720
721TCCGGGGCTTCATGACGGCCGCCGGCCTGCAGATCCTGAT760
761TTCGGTGCTCAAGTACATCTTCGGACTGACCATCCCCTCC800
801TACACAGGCCCAGGGTCCATCGTCTTTACCTTCATTGACA840
841TTTGCAAAAACCTCCCCCACACCAACATCGCCTCGCTCAT880
881CTTCGCTCTCATCAGCGGTGCCTTCCTGGTGCTGGTGAAG920
921GAGCTCAATGCTCGCTACATGCACAAGATTCGCTTCCCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。