演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC26A8TAT1

solute carrier family 26 member 8

SLC26A8 是 SLC26A/SulP transporter 家族的多次跨膜陰離子交換蛋白,可交換硫酸根、草酸根與氯離子,並與精子相關功能及 CFTR 活性有關。

Homo sapiens6p21.31UniProt Q96RN1
OFFICIAL SYMBOL
SLC26A8
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q96RN1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC26A8(solute carrier family 26 member 8)是蛋白質編碼基因,產物屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。其蛋白質為多次跨膜膜蛋白,具有多段跨膜螺旋,並包含 STAS domain;較長的細胞質區段還有與 RACGAP1 互作的區域。這些結構特徵構成其膜轉運蛋白的基本架構。SLC26A8 的主要角色與陰離子跨膜交換及精子生物學相關;來源亦記載其與 CFTR 的功能關係。

Official symbol
SLC26A8
Gene name
solute carrier family 26 member 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14468
UniProt
Q96RN1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TAT1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.31
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSLC26A8pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:35,943,516–36,028,767
Gene span
85,252 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000490799 ★35,943,516–36,024,64120
ENST0000039460235,943,516–36,024,49318
ENST0000035557435,943,516–36,024,58820
ENST0000095066535,943,516–36,028,76717
ENST0000048066336,012,249–36,024,8684

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC26A8 是陰離子反向轉運蛋白,可跨膜交換硫酸根與氯離子,也可交換草酸根與氯離子。這些轉運方向分別包括硫酸根外排、氯離子內流,以及草酸根內流、氯離子外流,顯示其能介導不同陰離子之間的交換。

SLC26A8 也會刺激 CFTR 的陰離子轉運活性。來源指出,兩者可能共同調節氯離子與碳酸氫根離子的通量,並涉及精子運動及精子獲能期間 ADCY10/PKA pathway 的活化;這項合作關係標示為 By similarity,因此屬於相似性推定,不能視為已確立的機制。

依相似性推定,SLC26A8 可能參與精子尾部的分化與運動,進而與男性生育能力相關。來源未進一步說明此作用的具體分子步驟,因此其功能意義宜限定在精子尾部發育、運動及生育能力的可能關聯,不延伸推論其他生理角色。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 36024641 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC26A8 ENST00000490799 GRCh38 chr6:36024541-36025641 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATGAGGGATGGGGTTGGGGGGATCAAGGGAATGAGGGAATGGTTACAAAGGGTGAGGAGGAAGCTTGG
AAGTAGGAATCCTCAGAAATGCACATTTTTATCCTACAAATTGGGATGATGAGGTGAGGGTGAATGAAAG
GGTAAAGATAAAGTAAGCAGTATATTCATACACTCATTCAACCAATGTGTATTAAATGCCTACTAGGTGT
CAAACACTTGCAGTTTAAAAGTGATTAAAAACTACAGTTGCTGCCGGTGTGGAGCTTACAATCAATGGGA
GGGCAATCATTCAACAAAAATTAATTGAATACTTCCTATGTCCACCACACTGCTGTAGGCACTGATAATA
AAACAGTTAATGAAAGGGATAAAAGTCCTTGCCCTCATAGGGGTAAGATGATTTACAAAAAGGAATACAT
AAAGTGCATTATAAGGTAGACATTAACACAGTCATCAAACAAACAAGTGTAAAACTGTAACTGGGCCAAG
CAGGAATACAAGGTGGAGTGAGAGACAGTGCTAGGGACAGGGATAGGGTGGGAGGAGGGTAAAGGGAGTG
AGTGCAGATGGCATGTCTGCATCCAGAGCAGATCTGGGCAGGAGGGTGTCATTCAGTGGGGAGAGCCGGG
TTTGTGGGGCAGACAGCCTATGGTTGGAGACCTGGGTGACCCTCCTAGCCTCCATTTCTTTTTACCTCTT
CTGACCTGAGGAAGGCTTAAGTCTTCCGGAGACGTTAGTGAATTACCGTCTGTGCAGTACACATGTGACA
CATGTGCACTGCTGTATGTTCAGGACACGAGGCCTGGCACCAAATAGGCCCTCGATCAAGAATAGCAAAA
CCTCGGAGAGAGAAGGAGCCTTGGTATACAGGTTTACCAAATACCAAGGGGATCCCACGACTCAGGTATG
AGGAGGGCGACCCAGGTACCACTTTCCTGGCTCCCTAGCCCAGCTGCTCATGCTCCTCTTCCTCGTCCCC
TCCCCCACTCTCATCTCCTCAGCCCGCCCGGAACGCCCGCGGGCTAGGCCACAACGGCTCGGGAACCGCC
GCCGGTATCCGCGTCCGCAGCGCCGCCAGCCAGGCGAGAGCCGTGTGGGAT
SLC26A8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC26A8_2 ↗6:36,024,574負股36,024,564–36,024,623
SLC26A8_1 ↗6:36,028,754負股36,028,744–36,028,803

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_9JB3N · enhancer · 36024138–36024482 · regulatory

ENSR6_9JB3R · promoter · 36024483–36024774 · regulatory

ENSR6_9JB45 · enhancer · 36025643–36025903 · regulatory

ENSR6_9JB48 · enhancer · 36026078–36026375 · regulatory

ENSR6_B963C · promoter · 36027262–36028168 · regulatory

ENSR6_C5KJ9 · enhancer · 36028169–36029932 · regulatory

· motif · 36027087–36027097 · motif

· motif · 36027585–36027607 · motif

· motif · 36027585–36027607 · motif

· motif · 36027605–36027618 · motif

· motif · 36027689–36027699 · motif

· motif · 36027706–36027721 · motif

· motif · 36027775–36027789 · motif

· motif · 36028029–36028038 · motif

SLC26A8 會受到 tunicamycin 抑制;tunicamycin 是 N-glycosylation 的抑制劑。來源未提供更詳細的調控步驟或此效應發生的其他條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:970 aa

1 aa970 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q96RN1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC26A8 蛋白質長 970 個胺基酸,屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。序列註解顯示其含有多段跨膜螺旋,並有 STAS domain(位於第 543–795 位胺基酸)。C 端第 664–970 位胺基酸區域註記與 RACGAP1 互作;第 858–970 位則被註記為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–95 aa
跨膜區Helical96–116 aa
拓樸區域Extracellular117–119 aa
跨膜區Helical120–140 aa
拓樸區域Cytoplasmic141–146 aa
跨膜區Helical147–167 aa
拓樸區域Extracellular168–202 aa
跨膜區Helical203–223 aa
拓樸區域Cytoplasmic224–232 aa
跨膜區Helical233–253 aa
拓樸區域Extracellular254–270 aa
跨膜區Helical271–291 aa
拓樸區域Cytoplasmic292–307 aa
跨膜區Helical308–328 aa
拓樸區域Extracellular329–355 aa
跨膜區Helical356–376 aa
拓樸區域Cytoplasmic377–392 aa
跨膜區Helical393–413 aa
拓樸區域Extracellular414–429 aa
跨膜區Helical430–450 aa
拓樸區域Cytoplasmic451–452 aa
跨膜區Helical453–473 aa
拓樸區域Extracellular474–497 aa
跨膜區Helical498–518 aa
拓樸區域Cytoplasmic519–970 aa
結構域STAS543–795 aa
功能區域Interaction with RACGAP1664–970 aa
功能區域Disordered858–970 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96RN1…

AlphaFold · Q96RN1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

SLC26A8 是多次跨膜膜蛋白,在人類精子中位於 annulus 及精子頭部的 equatorial segment。 來源未描述其定位隨條件或時間改變的情形。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TAT1SLC26A8CFTRRACGAP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC26A8 與 RACGAP1 有互作關係。它也與 CFTR 互作,並能刺激 CFTR 的陰離子轉運活性;來源未進一步界定這些互作是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC26A8 的變異與 Spermatogenic failure 3(SPGF3)相關。此疾病以原發性不孕、精子形態異常,以及中度至重度 asthenozoospermia 為特徵;後者指進行性運動精子的比例異常偏低。來源將疾病描述為由影響 SLC26A8 的變異所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC26A8 是陰離子反向轉運蛋白,可跨膜交換硫酸根與氯離子,也可交換草酸根與氯離子,並能刺激 CFTR 的陰離子轉運活性。兩者可能共同調節精子運動及獲能時所需的氯離子與碳酸氫根通量,以促進 ADCY10/PKA pathway 活化;此部分為相似性推定。SLC26A8 也可能參與精子尾部分化與運動,進而影響男性生育能力,同樣屬相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Antiporter that mediates the exchange of sulfate and oxalate against chloride ions across a membrane. Stimulates anion transport activity of CFTR. May cooperate with CFTR in the regulation of chloride and bicarbonate ions fluxes required for activation of the ADCY10/PKA pathway during sperm motility and sperm capacitation (By similarity). May play a role in sperm tail differentiation and motility and hence male fertility (By similarity)

PMID 11278976 ↗ · PMID 11834742 ↗ · PMID 22121115 ↗ · PMID 23582645 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性sulfate(out) + chloride(in) = sulfate(in) + chloride(out)含實驗來源
證據與來源

sulfate(out) + chloride(in) = sulfate(in) + chloride(out)

PMID 11278976 ↗ · PMID 11834742 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in)推論支持
證據與來源

oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in)

PMID 11834742 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC26A8 與 RACGAP1 有互作,亦與 CFTR 互作;與 CFTR 的互作伴隨陰離子轉運活性受到刺激。來源未說明是否形成特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RACGAP1. Interacts with CFTR; stimulates anion transport activity of CFTR

PMID 11278976 ↗ · PMID 22121115 ↗ · PMID 23582645 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC26A8 是多次跨膜膜蛋白。在人類精子中,它位於 annulus,以及精子頭部的 equatorial segment;來源未提供定位改變的條件或動態資訊。含實驗來源
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Located at both the annulus and the equatorial segment of the human sperm head

PMID 11278976 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控Tunicamycin 是 N-glycosylation 的抑制劑,並會抑制 SLC26A8。來源未提供更詳細的調控機制或其他作用條件。含實驗來源
證據與來源

Repressed by tunicamycin, an inhibitor of N-glycosylation

PMID 11278976 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Spermatogenic failure 3(SPGF3)是一種與影響 SLC26A8 的基因變異相關的疾病,特徵包括原發性不孕、精子形態異常及中度至重度 asthenozoospermia;此處的 asthenozoospermia 指進行性運動精子的比例異常偏低。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure 3 SPGF3 A disorder characterized by primary infertility, sperm morphologic abnormalities, and moderate to severe asthenozoospermia, condition in which the percentage of progressively motile sperm is abnormally low. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 606766

PMID 23582645 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000490799 · 3,437 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCCGCCCGGAACGCCCGCGGGCTAGGCCACAACGGCTC40
41GGGAACCGCCGCCGGTATCCGCGTCCGCAGCGCCGCCAGC80
81CAGGCGAGAGCCGTGTGGGATCCCAGCGCCCGCACTCCCG120
121CCCCCGCCAAGGAGCCAGGAATGGCACAACTAGAGAGGAG160
161CGCCATCTCTGGCTTCAGCTCTAAGTCCAGGCGAAACTCA200
201TTCGCATATGATGTTAAGCGTGAAGTATACAATGAGGAGA240
241CCTTTCAACAGGAACACAAAAGGAAGGCCTCCTCTTCTGG280
281GAACATGAACATCAACATCACCACCTTCAGACACCACGTC320
321CAGTGCCGCTGCTCATGGCACAGGTTCCTACGATGCGTGC360
361TTACAATCTTTCCCTTCCTAGAATGGATGTGTATGTATCG400
401ATTAAAGGATTGGCTTCTGGGAGACTTACTTGCTGGTATA440
441AGTGTTGGCCTTGTGCAAGTTCCCCAAGGCCTGACACTTA480
481GTTTGCTGGCAAGGCAACTGATTCCTCCTCTCAACATCGC520
521TTATGCAGCTTTCTGTTCTTCGGTAATCTATGTAATTTTT560
561GGATCGTGTCATCAAATGTCCATTGGTTCCTTCTTCCTGG600
601TGAGTGCTCTGCTGATCAACGTTCTGAAAGTGAGCCCATT640
641CAACAACGGTCAACTGGTCATGGGATCTTTCGTCAAGAAT680
681GAGTTTTCGGCCCCCTCCTACCTTATGGGCTATAATAAAT720
721CCTTGAGTGTGGTGGCAACCACAACTTTTCTGACTGGGAT760
761TATTCAGCTAATAATGGGCGTATTGGGTTTGGGCTTCATT800
801GCCACTTACCTTCCGGAGTCTGCAATGAGTGCTTACCTGG840
841CTGCTGTGGCACTTCATATCATGCTGTCCCAGCTGACTTT880
881CATCTTTGGGATTATGATTAGTTTCCATGCCGGTCCCATC920
921TCCTTCTTCTATGACATAATTAATTACTGTGTAGCTCTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。