演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC26A7SUT2

solute carrier family 26 member 7

SLC26A7 編碼 SLC26A/SulP transporter 家族的多次穿膜蛋白,可運送多種陰離子,並參與甲狀腺中的碘離子運輸。

Homo sapiens8q21.3UniProt Q8TE54
OFFICIAL SYMBOL
SLC26A7
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q8TE54
PDB / ALPHAFOLD
9IKV
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC26A7(solute carrier family 26 member 7)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。這是一種多次穿膜蛋白,具有跨膜區段與位於細胞質側的 STAS 結構域;蛋白質特徵資料亦註記其末端含有膜定位區域。其基本角色是參與陰離子運輸,所涉及的離子種類包括氯離子、硫酸根與草酸根等。SLC26A7 的膜運輸功能也與特定組織中的生理作用相關,例如甲狀腺對碘離子的運輸。其跨膜結構與陰離子運輸功能,構成理解此蛋白質的基本特徵;更具體的運輸方式與功能條件如下文所述。

Official symbol
SLC26A7
Gene name
solute carrier family 26 member 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14467
UniProt
Q8TE54
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SUT2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q21.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSLC26A7pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:91,209,494–91,398,155
Gene span
188,662 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000276609 ★91,249,319–91,398,15519
ENST0000052286291,209,495–91,318,3596
ENST0000052371991,209,500–91,398,15520
ENST0000061707891,218,888–91,398,15518
ENST0000061723391,218,888–91,398,15519
ENST0000090653591,219,942–91,398,15519
ENST0000090653691,228,019–91,398,15519
ENST0000030953691,249,259–91,394,71819
ENST0000090653791,249,259–91,398,15519
ENST0000090653891,249,259–91,398,15519
ENST0000100344291,249,259–91,398,15518
ENST0000112739391,249,259–91,250,0702

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC26A7 可作為陰離子通道,介導氯離子、硫酸根及草酸根的運輸。資料亦記載其可運送溴離子、碘離子、硝酸根、葡萄糖酸根、硫氰酸根與碳酸氫根;這些額外底物的相關描述屬於相似性推定。碳酸氫根通透性較弱,且在 pH 高於 7 時增加,因此不宜將其描述為在所有條件下均具有相同程度的運輸能力。

除了通道作用,研究也顯示 SLC26A7 具有氯離子與碳酸氫根交換活性:碳酸氫根向外運輸時伴隨氯離子向內運輸。這項交換作用與其陰離子通道功能並列,顯示其運輸模式不只限於單一方向的離子通道活動。

在視網膜色素上皮細胞中,SLC26A7 被描述為可介導硫氰酸根運輸;此項資訊為相似性推定。在甲狀腺中,它則介導碘離子運輸,並對甲狀腺激素合成及甲狀腺功能維持具有重要作用。上述組織相關功能說明,陰離子運輸可連結至特定生理過程;其中甲狀腺碘離子運輸與甲狀腺激素生成直接相關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 91249319 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC26A7 ENST00000276609 GRCh38 chr8:91248319-91249419 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAGAGCAACTCTTCACTTTAATTTAAAAACAAAGGGAAAAAGTGCAGCAGGAGGGATCCAAGTACTTTGT
TATTATAAAGGCTTCCAGAAATCAGATTTCTATTCTCCAAACAAATGGGCATTAAAAAGGACTCAGCAAA
CTATATACATGGTATTCTTTTCCTTGGCTACACAATTTTAGTTAGTATGTTGCCTTTTTGGTTTAATTCC
AATGGCACAGTTCATAGATTTAAGTTTTTCTTTTTCTTTTGGAGGCTAAGCAAAATGATCATAAAATAAA
AATCTTTGACAGTCTGTTCTATTATAAAATGTAACACCCCTTATTAAAAAGAGAACACCTACCCCCAAAA
GTTATACAAAAAGAAGGCAGCACCATAAAAAAAGCTAAGGATACTTCAAACAATAGTTTGAACCATATAA
CATTCCTCAGTAAATTTCAGTTACAGTAGAATGAATTATAGGACTTAGAGAAACCATCAGAGAAAACTGA
ATGAACAGTTTCAGAGACAGGGAAGATCTCCTGTCACAAATATGTGCTCATTGTGATACTTATTCTCTTA
GCCCATGAGATGAAATTTCAGTTTGTTTATGAGAACTAGTTACTCCTTTCCCAGACTGGGCAGTAGCTAT
CTGAATGTTTCTGTATGAATGAAAACCTCATCTGCCAGGGAATAAAAATGGTAAGGACCTTTAGCAATGC
CCTGTTATGTTTCTGAATTTTGTAGAACTGGCAGTCATCTGATAATGTTGAAAATATATAGCTCTCAAAG
AAATAGGGCTGGATTCTCTGAATATATTTTGCACAATAGATCCCTCTGGCAGTTTTATGATTTTGCACAG
CTTGTAGAGAGAGACTGGACTAGCTGGATATTTCCTGGTTTCATTAGCATAGCCCAGCCCACTTCCAACA
CACGCCCAGAACTACCTCATTAACCATTGGGATTGCAGCCAAAAACATAAGACTACAGTGAATATAAGGG
GAATTACTGGCGAGAGAGCTGTAGACCAACTTAACACTGAACCCATTACTTTTCCAAGACCAGAAAAAAA
TATTACATGAACAGGAACTACTTCTCCTTCAGATAAGAATTCAAGGTTTTA
SLC26A7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC26A7_1 ↗8:91,249,319正股91,249,270–91,249,329

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_93C7W4 · promoter · 91248860–91249329 · regulatory

ENSR8_84NFTP · enhancer · 91253397–91253552 · regulatory

· motif · 91245426–91245435 · motif

· motif · 91245426–91245435 · motif

SLC26A7 的表現受環境條件影響:高滲透壓會使其上調,酸性 pH 則使其下調。來源未提供更細的反應幅度或作用機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:656 aa

1 aa656 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q8TE54 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC26A7 蛋白質長 656 個胺基酸,屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。其序列包含多段跨膜螺旋,並在細胞質側具有 STAS 結構域;資料另註記 C 端有膜定位區域。這些結構註解描述其多次穿膜架構及相關區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–75 aa
跨膜區Helical76–96 aa
拓樸區域Extracellular97–144 aa
跨膜區Helical145–165 aa
拓樸區域Cytoplasmic166–166 aa
跨膜區Helical167–187 aa
拓樸區域Extracellular188–202 aa
跨膜區Helical203–223 aa
拓樸區域Cytoplasmic224–227 aa
跨膜區Helical228–248 aa
拓樸區域Extracellular249–254 aa
跨膜區Helical255–275 aa
拓樸區域Cytoplasmic276–306 aa
跨膜區Helical307–327 aa
拓樸區域Extracellular328–343 aa
跨膜區Helical344–364 aa
拓樸區域Cytoplasmic365–383 aa
跨膜區Helical384–404 aa
跨膜區Helical405–425 aa
拓樸區域Extracellular426–448 aa
跨膜區Helical449–469 aa
拓樸區域Cytoplasmic470–656 aa
結構域STAS492–641 aa
功能區域Membrane targeting641–656 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9IKV…

PDB · 9IKV

EM · 3.10 A · A/B=1-656

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Basolateral cell membrane;Recycling endosome membrane;Apical cell membrane;Lateral cell membrane

SLC26A7 位於細胞膜及 recycling endosome 膜,並見於腎髓質集合管細胞與分泌酸的胃壁細胞之 recycling endosome。 高滲透壓或鉀缺乏時,蛋白質會被導向基底外側膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SUT2SLC26A7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC26A7 的致病變異曾在甲狀腺激素生成異常及先天性甲狀腺腫性甲狀腺功能低下患者中被發現。這項資料呈現變異與患者疾病的關聯,未提供足以進一步描述其因果機制的內容。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

14 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 14 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC26A7 可作為陰離子通道,運輸氯離子、硫酸根與草酸根;溴離子、碘離子、硝酸根、葡萄糖酸根、硫氰酸根及碳酸氫根的運輸則依相似性推定。碳酸氫根通透性偏弱,且在 pH 高於 7 時增加。它也具有氯離子與碳酸氫根交換活性,並在甲狀腺參與碘運輸及甲狀腺激素合成。含實驗來源
證據與來源

Acts as an anion channel mediating the transport of chloride, sulfate and oxalate ions. Mediates the transport of bromide, iodide, nitrate, gluconate, thiocyanate and bicarbonate ions (By similarity). Its permeability towards bicarbonate is weak and increases when pH is above 7 (By similarity). Mediates thiocyanate transport in retinal pigment epithelium cells (By similarity). Mediates iodide transport in the thyroid gland, playing an important role in the synthesis of thyroid hormones and the maintenance of thyroid function. Although it is an anion channel, according to and it has been shown to exhibit chloride-bicarbonate exchanger activity

PMID 11834742 ↗ · PMID 12736153 ↗ · PMID 31372509 ↗ · PMID 32119864 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 11834742 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性iodide(out) = iodide(in)含實驗來源
證據與來源

iodide(out) = iodide(in)

PMID 31372509 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性bromide(in) = bromide(out)推論支持
證據與來源

bromide(in) = bromide(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性oxalate(in) = oxalate(out)含實驗來源
證據與來源

oxalate(in) = oxalate(out)

PMID 11834742 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性nitrate(in) = nitrate(out)推論支持
證據與來源

nitrate(in) = nitrate(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性sulfate(in) = sulfate(out)含實驗來源
證據與來源

sulfate(in) = sulfate(out)

PMID 11834742 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thiocyanate(in) = thiocyanate(out)推論支持
證據與來源

thiocyanate(in) = thiocyanate(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-gluconate(in) = D-gluconate(out)推論支持
證據與來源

D-gluconate(in) = D-gluconate(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate(in) = hydrogencarbonate(out)推論支持
證據與來源

hydrogencarbonate(in) = hydrogencarbonate(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)

PMID 12736153 ↗ · PMID 32119864 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC26A7 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜及 recycling endosome 膜;在腎髓質集合管細胞與分泌酸的胃壁細胞中,也見於 recycling endosome。高滲透壓或鉀缺乏時,蛋白質會被導向基底外側膜。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Lateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Expressed in the cytoplasm in recycling endosomes of medullary collecting duct cells and in acid-secreting gastric parietal cells. Targeted to the basolateral membrane in hypertonicity and potassium depletion

PMID 16524946 ↗ · PMID 30333321 ↗ · PMID 32119864 ↗ · PMID 31372509 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控SLC26A7 的表現受到環境條件調節:高滲透壓會使其上調,酸性 pH 則使其下調。此項敘述未提供調控幅度或具體分子機制。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by hyperosmolarity and down-regulated by acidic pH

PMID 32119864 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SLC26A7 的致病變異曾在甲狀腺激素生成異常及先天性甲狀腺腫性甲狀腺功能低下患者中被發現。此處記載的是患者中的變異與疾病關聯,並未進一步說明其致病機制。含實驗來源
證據與來源

Disease-causing variants in SLC26A7 have been found in patients with thyroid dyshormonogenesis and congenital goitrous hypothyroidism

PMID 30333321 ↗ · PMID 31372509 ↗ · PMID 32486989 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 14 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000276609 · 5,237 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTAGACCAACTTAACACTGAACCCATTACTTTTCCAAGAC40
41CAGAAAAAAATATTACATGAACAGGAACTACTTCTCCTTC80
81AGATAAGAATTCAAGCTTTGACATTGTAAACCACAGACGA120
121ATTGGAGCTTGGCATTGAAAGGAGGTGTTCTGCAATGATT160
161TTTTTTCTTGTTTAGAGAAGTTTACTTCTACAAGAAGAAA200
201TCTGAAAAATGACAGGAGCAAAGAGGAAAAAGAAAAGCAT240
241GCTTTGGAGCAAGATGCATACCCCCCAGTGTGAAGACATT280
281ATACAGTGGTGTAGAAGGCGACTGCCCATTTTGGATTGGG320
321CACCACATTACAATCTGAAAGAAAACTTGCTTCCAGACAC360
361TGTGTCTGGGATAATGTTGGCAGTTCAACAGGTGACCCAA400
401GGATTGGCCTTTGCTGTTCTCTCATCTGTGCACCCAGTGT440
441TTGGTTTATATGGGTCTCTGTTTCCTGCCATAATTTATGC480
481CATATTTGGAATGGGACATCATGTTGCCACAGGCACCTTT520
521GCCTTGACATCCTTAATATCAGCCAACGCCGTGGAACGGA560
561TTGTCCCTCAGAACATGCAGAATCTCACCACACAGAGTAA600
601CACAAGCGTGCTGGGCTTATCCGACTTTGAAATGCAAAGG640
641ATCCACGTTGCTGCAGCAGTTTCCTTCTTGGGAGGTGTGA680
681TTCAGGTGGCCATGTTTGTGCTGCAACTGGGCAGTGCCAC720
721ATTTGTGGTCACAGAGCCTGTGATCAGCGCAATGACAACT760
761GGGGCTGCCACCCATGTGGTGACTTCACAAGTCAAATATC800
801TCTTGGGAATGAAAATGCCATATATATCCGGACCACTTGG840
841ATTCTTTTATATTTATGCATATGTTTTTGAAAACATCAAG880
881TCTGTGCGACTGGAAGCATTGCTTTTATCCTTGCTGAGCA920
921TTGTGGTCCTTGTTCTTGTTAAAGAGCTGAATGAACAGTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。