基因總覽
solute carrier family 26 member 6（SLC26A6）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 SLC26A/SulP transporter 家族，為多次穿膜的陰離子運輸蛋白。它廣泛分布於上皮細胞，常見於細胞頂端膜，並具有胞質內的 C 端區域。蛋白質具有 STAS 結構域；其膜內與胞質區域共同構成跨膜蛋白的基本架構。SLC26A6 的主要角色是交換不同陰離子，並參與上皮組織的酸鹼平衡。具體運輸方式及其在各組織中的生理作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395550 ★ | 48,625,723–48,635,461 | 21 |
| ENST00000420764 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
| ENST00000358747 | 48,625,718–48,633,846 | 20 |
| ENST00000383733 | 48,625,718–48,635,493 | 20 |
| ENST00000337000 | 48,625,718–48,635,493 | 19 |
| ENST00000455886 | 48,625,718–48,635,493 | 20 |
| ENST00000880552 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
| ENST00000880553 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
| ENST00000880554 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
| ENST00000880555 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
| ENST00000880556 | 48,625,718–48,635,493 | 20 |
| ENST00000911461 | 48,625,718–48,635,493 | 21 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC26A6 是對 DIDS 敏感的無機與有機陰離子運輸蛋白，可運輸氯離子、碳酸氫根、甲酸根、氫氧根、硫酸根及草酸根，並以不同陰離子配對進行交換，包括氯離子與碳酸氫根、草酸根、甲酸根之間，以及草酸根與甲酸根或硫酸根之間的交換。這些運輸作用使其成為上皮細胞 pH 緩衝與酸鹼恆定的一部分。
在小腸，SLC26A6 位於刷狀緣，參與腸腔氯離子吸收與碳酸氫根分泌，也介入十二指腸上段絨毛上皮的細胞內 pH 調節。此作用發生於質子偶聯胜肽吸收期間，可能是藉由提供碳酸氫根輸入途徑。它亦促進腸道氯離子吸收及草酸根分泌，並參與十二指腸跨細胞硫酸根吸收。這些作用與避免高草酸尿及草酸鈣尿路結石有關，但來源描述的是生理功能，不應解讀為對疾病的因果證明。
在腎臟近端小管，SLC26A6 參與碳酸氫根與液體分泌，也可促進刷狀緣的甲酸根外流。在胰管近端，它是液體與碳酸氫根分泌的重要途徑之一，並以具電生性的方式交換氯離子與碳酸氫根，化學計量比為 1:2；此運輸可稀釋並鹼化富含蛋白質的腺泡分泌物。
SLC26A6 的運輸作用也受調控：在十二指腸，PKC 活化可不依賴鈣離子而抑制跨上皮草酸根分泌，以及氯離子與甲酸根、草酸根或碳酸氫根的運輸。此外，SLC26A6 透過提高細胞內 pH 參與精子獲能。它與碳酸酐酶 CA2 結合可形成碳酸氫根運輸代謝體，提升運輸蛋白所在位置的局部碳酸氫根濃度。
Promoter 與基因調控
>SLC26A6 ENST00000395550 GRCh38 chr3:48635361-48636461 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGTTGCCTTTTCCTGTTGGGGGCTGGGGAGGTAGGATGGAAGCTGTGAATGATTCAAGCCAGACTGACC TTTGGGAGGAATCTGAGCCCCTCCCAAGAATATCCAGCTATTTTTAGCCCATTTCATGGCAGATCTCTTT CACCTTGAAATCTGGCCCCTCACTTTGTAATTGGGGCCTGATGTTGGAGCACAGGTGCTGAAAATAAGGT GCTAAGGAAAACCTCCCCGCTGGTCAAGGCAACGGCAACAGGACTTCCTAATTCTTCAGGGTCTGCAGCC CTGACCCGGCATTTTTTGCCCTCACCTGCGGTGAAACCAACCTGAGGAACTGCTCTTGCAGTTCCTGCCT TGCCCACCCAACAGCACTGACGCCCACCCAACAGCACTGACCCCCACCATTCTCCTCGGCGGCCCGCGCA GTAACCTTCTGGGAGCTACGTCCGGGCTGTGCTTAGTGCAGCGGAGGGGATCCTCCAACCATTTCTGGCC TGGGTGGCCAGAGTTAAAGGGGAGGACTTGGGGACCGTTGGCTCCGGGTCTCAAAGAGATGCGTAGTCGC AGAAAGCCTGCGGGTGGCGCTCTCAGCTGAAGGCAAGAGAGGCCCCACAGACCTGGATCCCCTACGAGTT AAGGCTGGGGTCACCGGCCAGTGGAGTTTCCTTTTCCCACTCCGTGAGCACCTTCCGCCGAGCCAGGACC TGGGATCAGCTCCAACCTACTCAGGGCCTGGGGGCGCGACTGCGGCCAGCCCGGCGCGGGTGCTTAGTTC CAGTTCTGCAGTCCCATCCAGCTCCGGGCAGAGGGCCGGGCGAGCAGCGAGAGGCCTCATAGGCCAGGTC GCCGGGGAGGAAGCGGTTAAATCCTCCTTCTCCAGTCTCTCCCCGCCCGGCGCGCGCCACTTAGGCCCCG CCCCAGCGCGCTGATTGGCCCAAGCCTCCCCGTCCTGCCCCGGGATTAGCCCCCGGGAGAGCGCAGCTGG CCTCACCCGGTCCCGGCGCCGCCTTCCGGAGCGTAGCGGCCTCTAGCTCGAGCAGCAGGAGCAGCCCGCA CCGGACAACTTGCGAGCCATGGGGCTGGCGGATGCGTCGGGGTGAGTTCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC26A6_1 ↗ | 3:48,635,461 | 負股 | 48,635,451–48,635,510 |
| SLC26A6_2 ↗ | 3:48,635,592 | 負股 | 48,635,582–48,635,641 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_C6SB6 · enhancer · 48634362–48635430 · regulatory
ENSR3_83FLFK · promoter · 48635431–48635640 · regulatory
ENSR3_5FFTF6 · CTCF_binding_site · 48635449–48635470 · regulatory
ENSR3_C6SB8 · enhancer · 48635641–48636699 · regulatory
ENSR3_5FFTH6 · CTCF_binding_site · 48635879–48635900 · regulatory
· motif · 48635451–48635467 · motif
· motif · 48635547–48635557 · motif
· motif · 48635722–48635732 · motif
· motif · 48635762–48635778 · motif
· motif · 48635788–48635808 · motif
· motif · 48635815–48635827 · motif
· motif · 48635818–48635825 · motif
· motif · 48635881–48635897 · motif
促發炎細胞激素 IFN gamma 會下調 SLC26A6。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：759 aa
SLC26A6 蛋白質長 759 個胺基酸，屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。序列包含多段螺旋型跨膜區，並具有較長的胞質 C 端區域；其 STAS 結構域位於 C 端胞質區。另有一段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC26A6 可位於細胞膜、胞內囊泡膜及精子膜；上皮細胞中的定位包括腎近端小管與小腸上皮的頂端刷狀緣。 Isoform 4 另見於腎小管壁細胞的頂端及基底外側表面，以及胰管細胞刷狀緣。 PMA 誘導的細胞中，Isoform 4 與 CA2 的共定位減少，且可能受 PKC 作用而由細胞膜胞質側移至細胞內。 Isoform 5 與 Isoform 6 的資料則記載為位於細胞膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Microsome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- APOL2Q9BQE5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP2P41181 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BET1O15155 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD81P60033 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERG28Q9UKR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLP1P60201-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNORCQ6UX34 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFP02787 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM128Q5BJH2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM201Q5SNT2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC26A6 的 C 端可與 PDZK1 的 C 端 PDZ 結構域互作；此互作可誘導氯離子與草酸根交換。它也與 NHERF1、NHERF2 的 PDZ 結構域互作。SLC26A6 的 C 端胞質區與 CA2 結合，並刺激氯離子—碳酸氫根交換；兩者亦可形成碳酸氫根運輸代謝體。另有依相似性推定的資料指出，SLC26A6 與 CFTR、SLC26A3 互作；它與 AHCYL1 的互作則會提高 SLC26A6 活性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 15 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC26A6 是廣泛分布於上皮頂端膜的陰離子交換蛋白，參與 pH 緩衝與酸鹼恆定，可交換多種一價及二價陰離子。它在腸道、腎臟、胰管與精子中執行不同功能；十二指腸部分運輸會受 PKC 活化抑制，且不依賴鈣離子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Apical membrane anion-exchanger with wide epithelial distribution that plays a role as a component of the pH buffering system for maintaining acid-base homeostasis. Acts as a versatile DIDS-sensitive inorganic and organic anion transporter that mediates the uptake of monovalent anions like chloride, bicarbonate, formate and hydroxyl ion and divalent anions like sulfate and oxalate. Functions in multiple exchange modes involving pairs of these anions, which include chloride-bicarbonate, chloride-oxalate, oxalate-formate, oxalate-sulfate and chloride-formate exchange. Apical membrane chloride-bicarbonate exchanger that mediates luminal chloride absorption and bicarbonate secretion by the small intestinal brush border membrane and contributes to intracellular pH regulation in the duodenal upper villous epithelium during proton-coupled peptide absorption, possibly by providing a bicarbonate import pathway. Also mediates intestinal chloride absorption and oxalate secretion, thereby preventing hyperoxaluria and calcium oxalate urolithiasis. Transepithelial oxalate secretion, chloride-formate, chloride-oxalate and chloride-bicarbonate transport activities in the duodenum are inhibited by PKC activation in a calcium-independent manner. The apical membrane chloride-bicarbonate exchanger also provides a major route for fluid and bicarbonate secretion into the proximal tubules of the kidney as well as into the proximal part of the interlobular pancreatic ductal tree, where it mediates electrogenic chloride-bicarbonate exchange with a chloride-bicarbonate stoichiometry of 1:2, and hence will dilute and alkalinize protein-rich acinar secretion. Also mediates the transcellular sulfate absorption and oxalate secretion across the apical membrane in the duodenum and the formate ion efflux at the apical brush border of cells in the proximal tubules of kidney. Plays a role in sperm capacitation by increasing intracellular pH PMID 20501439 ↗ · PMID 27681177 ↗ |
| 功能 | SLC26A6 是細胞頂端膜的氯離子—碳酸氫根交換蛋白。它與碳酸酐酶 CA2 結合形成碳酸氫根運輸代謝體，使運輸蛋白所在位置的局部碳酸氫根濃度提高。 | 含實驗來源 | 證據與來源Apical membrane chloride-bicarbonate exchanger. Its association with carbonic anhydrase CA2 forms a bicarbonate transport metabolon; hence maximizes the local concentration of bicarbonate at the transporter site PMID 15990874 ↗ |
| 分子活性 | 2 hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = 2 hydrogencarbonate(out) + chloride(in) | 含實驗來源 | 證據與來源2 hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = 2 hydrogencarbonate(out) + chloride(in) PMID 20501439 ↗ |
| 分子活性 | oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | oxalate(in) + formate(out) = oxalate(out) + formate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | oxalate(in) + sulfate(out) = oxalate(out) + sulfate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | 2 hydrogencarbonate(out) + sulfate(in) = 2 hydrogencarbonate(in) + sulfate(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC26A6 透過 C 端與 PDZK1 的 C 端 PDZ 結構域互作，並誘導氯離子與草酸根交換。資料另指出它與 CFTR、SLC26A3 互作；依相似性推定，與 AHCYL1 的互作會提高 SLC26A6 活性。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts (via C-terminal domain) with PDZK1 (via C-terminal PDZ domain); the interaction induces chloride and oxalate exchange transport. Interacts with CFTR and SLC26A3 (By similarity). Interacts with AHCYL1; the interaction increases SLC26A6 activity (By similarity) |
| 交互作用 | SLC26A6 透過 PDZ 結構域與 NHERF1、NHERF2 互作。它也以 C 端胞質區與 CA2 結合；此互作會刺激氯離子—碳酸氫根交換活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NHERF1 (via the PDZ domains) and NHERF2 (via the PDZ domains). Interacts (via C-terminal cytoplasmic domain) with CA2; the interaction stimulates chloride-bicarbonate exchange activity PMID 12444019 ↗ · PMID 15990874 ↗ |
| 交互作用 | SLC26A6 與 NHERF1 及 NHERF2 互作，涉及這兩種蛋白質的 PDZ 結構域。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC26A6 位於細胞膜、頂端細胞膜及胞內囊泡膜，也見於微粒體與精子膜。它與 CFTR 在精子尾部中段共定位，並位於腎近端小管上皮、小腸腸細胞及胃壁細胞的頂端刷狀緣。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Microsome; Localized in sperm membranes. Colocalizes with CFTR at the midpiece of sperm tail. Localizes to the apical membrane brush border of epithelial cells in the proximal tubules of kidney, of enterocytes of the small intestine and of gastric parietal cells in the stomach PMID 11247665 ↗ · PMID 27681177 ↗ · PMID 20501439 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 4 位於細胞膜的頂端與基底外側表面，也見於腎小管壁細胞及胰管細胞刷狀緣。它可與 CA2 在細胞表面共定位；PMA 誘導後共定位減少，且可能受 PKC 作用由細胞膜胞質側移至細胞內。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 4; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localizes to the apical and basolateral surfaces of tubular wall cells in kidney and in the brush border of pancreatic duct cells. Colocalized with CA2 at the surface of the cell membrane in order to form a bicarbonate transport metabolon; colocalization is reduced in phorbol myristate acetate (PMA)-induced cells. May be translocated from the cytosolic surface of the cell membrane to the intracellular space by PKC in phorbol myristate acetate (PMA)-induced cells PMID 12444019 ↗ · PMID 15990874 ↗ · PMID 11087667 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 5 被記載為位於細胞膜，且屬於多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 6 被記載為位於細胞膜，且屬於多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 促發炎細胞激素 IFN gamma 會使 SLC26A6 下調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCTTCCGGAGCGTAGCGGCCTCTAGCTCGAGCAGCAGGA40GCAGCCCGCACCGGACAACTTGCGAGCCATGGGGCTGGCG80GATGCGTCGGGACCGAGGGACACACAGGCACTGCTGTCTG120CAACACAAGCAATGGACCTGCGGAGGCGAGACTACCACAT160GGAACGGCCGCTGCTGAACCAGGAGCATTTGGAGGAGCTG200GGGCGCTGGGGCTCAGCACCTAGGACCCACCAGTGGCGGA240CCTGGTTGCAGTGCTCCCGTGCTCGGGCCTATGCCCTTCT280GCTCCAACACCTCCCGGTTTTGGTCTGGTTACCCCGGTAT320CCTGTGCGTGACTGGCTCCTGGGTGACCTGTTATCCGGCC360TGAGTGTGGCCATCATGCAGCTTCCGCAGGGCTTGGCCTA400CGCCCTCCTGGCTGGATTGCCCCCCGTGTTTGGCCTCTAT440AGCTCCTTCTACCCTGTCTTCATCTACTTCCTGTTTGGCA480CTTCCCGGCACATCTCCGTGGGGACCTTTGCTGTCATGTC520TGTGATGGTGGGCAGTGTGACAGAATCCCTGGCCCCGCAG560GCCTTGAACGACTCCATGATCAATGAGACAGCCAGAGATG600CTGCCCGGGTACAGGTGGCCTCCACACTCAGTGTCCTGGT640TGGCCTCTTCCAGGTGGGGCTGGGCCTGATCCACTTCGGC680TTCGTGGTCACCTACCTGTCAGAACCTCTTGTCCGAGGCT720ATACCACAGCTGCAGCTGTGCAGGTCTTCGTCTCACAGCT760CAAGTATGTGTTTGGCCTCCATCTGAGCAGCCACTCTGGG800CCACTGTCCCTCATCTATACAGTGCTGGAGGTCTGCTGGA840AGCTGCCCCAGAGCAAGGTTGGCACCGTGGTCACTGCAGC880TGTGGCTGGGGTGGTGCTCGTGGTGGTGAAGCTGTTGAAT920GACAAGCTGCAGCAGCAGCTGCCCATGCCGATACCCGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。