演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC26A11

solute carrier family 26 member 11

SLC26A11 是 SLC26A/SulP 家族的多次穿膜蛋白,具有不依賴鈉離子的陰離子轉運功能;其硫酸根運輸可能與 SLC26A2 協同。

Homo sapiens17q25.3UniProt Q86WA9
OFFICIAL SYMBOL
SLC26A11
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q86WA9
PDB / ALPHAFOLD
9IAR
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC26A11(solute carrier family 26 member 11)是蛋白質編碼基因,產物屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。其蛋白質由 606 個胺基酸組成,是具有多個跨膜區段的膜蛋白;序列末端區域包含 STAS 結構域。這些結構特徵與其作為膜上陰離子運輸蛋白的基本性質相符。來源所述的轉運功能包括多種陰離子,但部分功能依據相似性推定,應與有直接實驗支持的觀察區分看待。

Official symbol
SLC26A11
Gene name
solute carrier family 26 member 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14471
UniProt
Q86WA9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.3
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSLC26A11pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:80,219,699–80,253,509
Gene span
33,811 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000361193 ★80,220,427–80,253,50018
ENST0000057715580,219,699–80,223,2834
ENST0000094551280,219,828–80,253,49917
ENST0000041150280,220,122–80,253,49818
ENST0000054604780,220,122–80,253,50917
ENST0000085272880,220,122–80,253,50018
ENST0000085272980,220,122–80,253,50017
ENST0000085273080,220,122–80,253,49917
ENST0000085273180,220,122–80,253,50016
ENST0000085273280,220,122–80,253,49816
ENST0000085273380,220,122–80,253,49818
ENST0000085273480,220,122–80,253,50018

顯示 12/48 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC26A11 被描述為不依賴鈉離子的陰離子交換蛋白,可參與碳酸氫根、氯離子、硫酸根與草酸根的運輸。其中碳酸氫根與氯離子可進行交換;來源也列出硫酸根與草酸根相關的運輸反應。這些陰離子轉運能力部分是依據相似性提出,並非都具有同等程度的直接實驗證據。

在高內皮微靜脈內皮細胞(HEVEC)中,SLC26A11 顯示不依賴鈉離子的硫酸根陰離子轉運活性,並可能與 SLC26A2 協同,促進對 DIDS 敏感的硫酸根攝取。這項觀察指出其硫酸根運輸可能涉及特定細胞中的協同作用;來源未進一步界定兩者如何配合。

在腎臟中,SLC26A11 介導氯離子與碳酸氫根交換,並有助於 V-ATPase 介導的酸分泌。此項作用同樣標示為依據相似性推定,說明陰離子交換可能與腎臟的酸分泌過程相連,但來源沒有提供更細的分子步驟。

此外,SLC26A11 可能具有氯離子通道功能,並在小腦中參與維持氯離子恆定及神經活動。這些描述亦屬相似性推定;因此,氯離子通道作用及其對小腦神經活動的影響應保留「可能」的限定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 80220427 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC26A11 ENST00000361193 GRCh38 chr17:80219427-80220527 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGACTCTGACAGCCTCCTGTAGGAATTCTGATCCGCAGGTGAGGGTCCATGCAGATTCTCTGCTGTGTTT
CTGGGAGGCGAGGAGTTGGCAGGAGAGCTGTTTATGTTACAGTGAGCCGAACCCCCGCCCAGAGACCACA
AAATTAATCAGAAAGAGGGCAACTGGCAGGGCGCCAGACCTCAGAAGGGGAAAGAATCGCAGGCCTTGGG
TTTGGCCTTGTCACTTGTCATGAGCCAGAGCCTTGATTACCTAAACCGGAAGTCTTGTGAGCAGCACGGT
GCTTGCTCTGGAGGAACCTGGGGTTTCTGAGAGGGACTGGGGTTGGGGGAGACGGTGGTGGGTGGGTGGT
GGAGGGCTGTGCCCTTGGGATAAGGGAAAAGACAGCTGAGACACAGGCTCTGGGGTCGGAAATGAGAGCC
AGGAGGGCACCCTGTCTGCAGTCTCTGGGGACCGGAGCACCAGCCCCTCCTCTGGGATCCCCTCCCAAGA
GGGATTTGAGATCCGTGGACCCCTGAGCCCTGGCTGGGCAGGGTCAGAGGAGGGTGGGACAGGCGGCACG
AGGTAAGTGTAGGGGTGCTGGATGCTGGGGCTCACTCCTCCAGCCTTTGCTGCCCTCTCTGGGGAGACAC
CCGTGAAGAGTCTGGGGGCGGCACAGAGAGGAGGACGAGAGGGAATGGCAGCGGGGGATACAAGGGCAGG
GCACACTAGGGTCAGCATTGACCACGGGTGGGGAGGAGGCCAGTGGCCACTTCCCCGGGCCACCGCAGGT
GGGCGTGGGGGGGCGGCGCCGGCACTCACCGAGGAGCAGCAGTGCGTTCCGGGGACGCGCCCGGCAGAGC
CCCAGGACTAGCAGCAGCGCGCAGCAGGCGGGCACGGGGCAGCTCATGGCGGCGGCGGCTCGGACTCGGG
ATCGGGATCCGGCTCCGGCTCTCTGGTCTCCCGCTCGGCCCCGCCCCCTGCCCCGACCCCGGTCACGTGC
GCGCCAGACCCCGCCCCGGCCTGTCCCCGGCGATTCCTGCGGACCCAGCTGCGGCGACGCCAGGAGACCC
CAAGCTGCATCGCCGAGTGGGTGAGTCCGTGGCCCGCGAGGGCGGCGAGCG
SLC26A11 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC26A11_1 ↗17:80,220,427正股80,220,378–80,220,437

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_C9XWX · enhancer · 80219276–80220322 · regulatory

ENSR17_84CNDS · promoter · 80220323–80220479 · regulatory

ENSR17_C9XX2 · enhancer · 80220480–80221623 · regulatory

· motif · 80219331–80219353 · motif

· motif · 80219331–80219353 · motif

· motif · 80219559–80219567 · motif

· motif · 80219643–80219665 · motif

· motif · 80219643–80219665 · motif

· motif · 80219644–80219657 · motif

· motif · 80219679–80219690 · motif

· motif · 80219679–80219690 · motif

· motif · 80219681–80219690 · motif

· motif · 80219785–80219798 · motif

· motif · 80219805–80219818 · motif

· motif · 80219866–80219879 · motif

· motif · 80219866–80219879 · motif

· motif · 80219954–80219966 · motif

· motif · 80220190–80220199 · motif

· motif · 80220310–80220320 · motif

· motif · 80220398–80220407 · motif

· motif · 80220398–80220407 · motif

· motif · 80220471–80220486 · motif

· motif · 80221160–80221173 · motif

· motif · 80221160–80221173 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:606 aa

1 aa606 aa結構域跨膜區拓樸區域
依 Q86WA9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC26A11 蛋白質長 606 個胺基酸,屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。序列註解列出多個跨膜螺旋,並標示細胞外與細胞質側區段交錯排列;近 C 端含有 STAS 結構域。

拓樸區域Extracellular1–51 aa
跨膜區Helical52–72 aa
拓樸區域Cytoplasmic73–73 aa
跨膜區Helical74–94 aa
拓樸區域Extracellular95–100 aa
跨膜區Helical101–117 aa
拓樸區域Cytoplasmic118–119 aa
跨膜區Helical120–140 aa
拓樸區域Extracellular141–147 aa
跨膜區Helical148–168 aa
拓樸區域Cytoplasmic169–197 aa
跨膜區Helical198–218 aa
拓樸區域Extracellular219–250 aa
跨膜區Helical251–271 aa
拓樸區域Cytoplasmic272–307 aa
跨膜區Helical308–328 aa
拓樸區域Extracellular329–341 aa
跨膜區Helical342–362 aa
拓樸區域Cytoplasmic363–374 aa
跨膜區Helical375–395 aa
拓樸區域Extracellular396–398 aa
跨膜區Helical399–419 aa
拓樸區域Cytoplasmic420–441 aa
跨膜區Helical442–462 aa
拓樸區域Extracellular463–606 aa
結構域STAS470–584 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9IAR…

PDB · 9IAR

EM · 3.20 A · A/B=1-583

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Lysosome membrane;Apical cell membrane;Basolateral cell membrane

SLC26A11 被註解位於細胞膜、溶酶體膜,以及細胞膜的頂端與基底外側區域;這些位置均描述為多次穿膜蛋白的定位。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLC26A11SLC26A11SMIM1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC26A11 是不依賴鈉離子的陰離子交換蛋白,可運輸碳酸氫根、氯離子、硫酸根及草酸根,這些功能依據相似性推定。在高內皮微靜脈內皮細胞中,其硫酸根轉運可能與 SLC26A2 協同,介導對 DIDS 敏感的硫酸根攝取。於腎臟中,它可介導氯離子與碳酸氫根交換,協助 V-ATPase 介導的酸分泌;也可能作為氯離子通道,參與小腦氯離子恆定與神經活動。含實驗來源
證據與來源

Sodium-independent anion exchanger mediating bicarbonate, chloride, sulfate and oxalate transport (By similarity). Exhibits sodium-independent sulfate anion transporter activity that may cooperate with SLC26A2 to mediate DIDS-sensitive sulfate uptake into high endothelial venules endothelial cells (HEVEC). In the kidney, mediates chloride-bicarbonate exchange, facilitating V-ATPase-mediated acid secretion (By similarity). May function as a chloride channel, playing an important role in moderating chloride homeostasis and neuronal activity in the cerebellum (By similarity)

PMID 12626430 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)推論支持
證據與來源

hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性sulfate(in) + H(+)(in) = sulfate(out) + H(+)(out)推論支持
證據與來源

sulfate(in) + H(+)(in) = sulfate(out) + H(+)(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in)推論支持
證據與來源

oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC26A11 被註解為多次穿膜蛋白,位於細胞膜、溶酶體膜,以及細胞膜的頂端與基底外側區域。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 12626430 ↗ · PMID 20957757 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000361193 · 2,888 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGTCCCCGGCGATTCCTGCGGACCCAGCTGCGGCGACGC40
41CAGGAGACCCCAAGCTGCATCGCCGAGTGGAAGCAACTAG80
81AACTCCAGGGCTGTGAAAGCCACAGGTGGGGGCTGAGCGA120
121GGCGTGGCCTCAGGAGCGGAGGACCCCCCCACTCTCCCTC160
161GAGCGCCGCAGTCCACCGTAGCGGGTGGAGCCCGCCTTGG200
201TGCGCAGTTGGAAAACCTCGGAGCCCCGCTGGATCTCCTG240
241GCTGCCACCCGCACCCCCCGCCAGCCTACGCCCCACCGTA280
281GAGATGCCTTCTTCGGTGACGGCGCTGGGTCAGGCCAGGT320
321CCTCTGGCCCCGGGATGGCCCCGAGCGCCTGCTGCTGCTC360
361CCCTGCGGCCCTGCAGAGGAGGCTGCCCATCCTGGCGTGG400
401CTGCCCAGCTACTCCCTGCAGTGGCTGAAGATGGATTTCG440
441TCGCCGGCCTCTCAGTTGGCCTCACTGCCATTCCCCAGGC480
481GCTGGCCTATGCTGAAGTGGCTGGACTCCCGCCCCAGTAT520
521GGCCTCTACTCTGCCTTCATGGGCTGCTTCGTGTATTTCT560
561TCCTGGGCACCTCCCGGGATGTGACTCTGGGCCCCACCGC600
601CATTATGTCCCTCCTGGTCTCCTTCTACACCTTCCATGAG640
641CCCGCCTACGCTGTGCTGCTGGCCTTCCTGTCCGGCTGCA680
681TCCAGCTGGCCATGGGGGTCCTGCGTTTGGGGTTCCTGCT720
721GGACTTCATTTCCTACCCCGTCATTAAAGGCTTCACCTCT760
761GCTGCTGCCGTCACCATCGGCTTTGGACAGATCAAGAACC800
801TGCTGGGACTACAGAACATCCCCAGGCCGTTCTTCCTGCA840
841GGTGTACCACACCTTCCTCAGGATTGCAGAGACCAGGGTA880
881GGTGACGCCGTCCTGGGGCTGGTCTGCATGCTGCTGCTGC920
921TGGTGCTGAAGCTGATGCGGGACCACGTGCCTCCCGTCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。