基因總覽
SLC26A11(solute carrier family 26 member 11)是蛋白質編碼基因,產物屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。其蛋白質由 606 個胺基酸組成,是具有多個跨膜區段的膜蛋白;序列末端區域包含 STAS 結構域。這些結構特徵與其作為膜上陰離子運輸蛋白的基本性質相符。來源所述的轉運功能包括多種陰離子,但部分功能依據相似性推定,應與有直接實驗支持的觀察區分看待。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361193 ★ | 80,220,427–80,253,500 | 18 |
| ENST00000577155 | 80,219,699–80,223,283 | 4 |
| ENST00000945512 | 80,219,828–80,253,499 | 17 |
| ENST00000411502 | 80,220,122–80,253,498 | 18 |
| ENST00000546047 | 80,220,122–80,253,509 | 17 |
| ENST00000852728 | 80,220,122–80,253,500 | 18 |
| ENST00000852729 | 80,220,122–80,253,500 | 17 |
| ENST00000852730 | 80,220,122–80,253,499 | 17 |
| ENST00000852731 | 80,220,122–80,253,500 | 16 |
| ENST00000852732 | 80,220,122–80,253,498 | 16 |
| ENST00000852733 | 80,220,122–80,253,498 | 18 |
| ENST00000852734 | 80,220,122–80,253,500 | 18 |
顯示 12/48 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC26A11 被描述為不依賴鈉離子的陰離子交換蛋白,可參與碳酸氫根、氯離子、硫酸根與草酸根的運輸。其中碳酸氫根與氯離子可進行交換;來源也列出硫酸根與草酸根相關的運輸反應。這些陰離子轉運能力部分是依據相似性提出,並非都具有同等程度的直接實驗證據。
在高內皮微靜脈內皮細胞(HEVEC)中,SLC26A11 顯示不依賴鈉離子的硫酸根陰離子轉運活性,並可能與 SLC26A2 協同,促進對 DIDS 敏感的硫酸根攝取。這項觀察指出其硫酸根運輸可能涉及特定細胞中的協同作用;來源未進一步界定兩者如何配合。
在腎臟中,SLC26A11 介導氯離子與碳酸氫根交換,並有助於 V-ATPase 介導的酸分泌。此項作用同樣標示為依據相似性推定,說明陰離子交換可能與腎臟的酸分泌過程相連,但來源沒有提供更細的分子步驟。
此外,SLC26A11 可能具有氯離子通道功能,並在小腦中參與維持氯離子恆定及神經活動。這些描述亦屬相似性推定;因此,氯離子通道作用及其對小腦神經活動的影響應保留「可能」的限定。
Promoter 與基因調控
>SLC26A11 ENST00000361193 GRCh38 chr17:80219427-80220527 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGACTCTGACAGCCTCCTGTAGGAATTCTGATCCGCAGGTGAGGGTCCATGCAGATTCTCTGCTGTGTTT CTGGGAGGCGAGGAGTTGGCAGGAGAGCTGTTTATGTTACAGTGAGCCGAACCCCCGCCCAGAGACCACA AAATTAATCAGAAAGAGGGCAACTGGCAGGGCGCCAGACCTCAGAAGGGGAAAGAATCGCAGGCCTTGGG TTTGGCCTTGTCACTTGTCATGAGCCAGAGCCTTGATTACCTAAACCGGAAGTCTTGTGAGCAGCACGGT GCTTGCTCTGGAGGAACCTGGGGTTTCTGAGAGGGACTGGGGTTGGGGGAGACGGTGGTGGGTGGGTGGT GGAGGGCTGTGCCCTTGGGATAAGGGAAAAGACAGCTGAGACACAGGCTCTGGGGTCGGAAATGAGAGCC AGGAGGGCACCCTGTCTGCAGTCTCTGGGGACCGGAGCACCAGCCCCTCCTCTGGGATCCCCTCCCAAGA GGGATTTGAGATCCGTGGACCCCTGAGCCCTGGCTGGGCAGGGTCAGAGGAGGGTGGGACAGGCGGCACG AGGTAAGTGTAGGGGTGCTGGATGCTGGGGCTCACTCCTCCAGCCTTTGCTGCCCTCTCTGGGGAGACAC CCGTGAAGAGTCTGGGGGCGGCACAGAGAGGAGGACGAGAGGGAATGGCAGCGGGGGATACAAGGGCAGG GCACACTAGGGTCAGCATTGACCACGGGTGGGGAGGAGGCCAGTGGCCACTTCCCCGGGCCACCGCAGGT GGGCGTGGGGGGGCGGCGCCGGCACTCACCGAGGAGCAGCAGTGCGTTCCGGGGACGCGCCCGGCAGAGC CCCAGGACTAGCAGCAGCGCGCAGCAGGCGGGCACGGGGCAGCTCATGGCGGCGGCGGCTCGGACTCGGG ATCGGGATCCGGCTCCGGCTCTCTGGTCTCCCGCTCGGCCCCGCCCCCTGCCCCGACCCCGGTCACGTGC GCGCCAGACCCCGCCCCGGCCTGTCCCCGGCGATTCCTGCGGACCCAGCTGCGGCGACGCCAGGAGACCC CAAGCTGCATCGCCGAGTGGGTGAGTCCGTGGCCCGCGAGGGCGGCGAGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC26A11_1 ↗ | 17:80,220,427 | 正股 | 80,220,378–80,220,437 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_C9XWX · enhancer · 80219276–80220322 · regulatory
ENSR17_84CNDS · promoter · 80220323–80220479 · regulatory
ENSR17_C9XX2 · enhancer · 80220480–80221623 · regulatory
· motif · 80219331–80219353 · motif
· motif · 80219331–80219353 · motif
· motif · 80219559–80219567 · motif
· motif · 80219643–80219665 · motif
· motif · 80219643–80219665 · motif
· motif · 80219644–80219657 · motif
· motif · 80219679–80219690 · motif
· motif · 80219679–80219690 · motif
· motif · 80219681–80219690 · motif
· motif · 80219785–80219798 · motif
· motif · 80219805–80219818 · motif
· motif · 80219866–80219879 · motif
· motif · 80219866–80219879 · motif
· motif · 80219954–80219966 · motif
· motif · 80220190–80220199 · motif
· motif · 80220310–80220320 · motif
· motif · 80220398–80220407 · motif
· motif · 80220398–80220407 · motif
· motif · 80220471–80220486 · motif
· motif · 80221160–80221173 · motif
· motif · 80221160–80221173 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:606 aa
SLC26A11 蛋白質長 606 個胺基酸,屬於 SLC26A/SulP transporter 家族。序列註解列出多個跨膜螺旋,並標示細胞外與細胞質側區段交錯排列;近 C 端含有 STAS 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC26A11 被註解位於細胞膜、溶酶體膜,以及細胞膜的頂端與基底外側區域;這些位置均描述為多次穿膜蛋白的定位。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SMIM1B2RUZ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC26A11 是不依賴鈉離子的陰離子交換蛋白,可運輸碳酸氫根、氯離子、硫酸根及草酸根,這些功能依據相似性推定。在高內皮微靜脈內皮細胞中,其硫酸根轉運可能與 SLC26A2 協同,介導對 DIDS 敏感的硫酸根攝取。於腎臟中,它可介導氯離子與碳酸氫根交換,協助 V-ATPase 介導的酸分泌;也可能作為氯離子通道,參與小腦氯離子恆定與神經活動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sodium-independent anion exchanger mediating bicarbonate, chloride, sulfate and oxalate transport (By similarity). Exhibits sodium-independent sulfate anion transporter activity that may cooperate with SLC26A2 to mediate DIDS-sensitive sulfate uptake into high endothelial venules endothelial cells (HEVEC). In the kidney, mediates chloride-bicarbonate exchange, facilitating V-ATPase-mediated acid secretion (By similarity). May function as a chloride channel, playing an important role in moderating chloride homeostasis and neuronal activity in the cerebellum (By similarity) PMID 12626430 ↗ |
| 分子活性 | hydrogencarbonate(in) + chloride(out) = hydrogencarbonate(out) + chloride(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | sulfate(in) + H(+)(in) = sulfate(out) + H(+)(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | oxalate(in) + chloride(out) = oxalate(out) + chloride(in) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLC26A11 被註解為多次穿膜蛋白,位於細胞膜、溶酶體膜,以及細胞膜的頂端與基底外側區域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 12626430 ↗ · PMID 20957757 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTGTCCCCGGCGATTCCTGCGGACCCAGCTGCGGCGACGC40CAGGAGACCCCAAGCTGCATCGCCGAGTGGAAGCAACTAG80AACTCCAGGGCTGTGAAAGCCACAGGTGGGGGCTGAGCGA120GGCGTGGCCTCAGGAGCGGAGGACCCCCCCACTCTCCCTC160GAGCGCCGCAGTCCACCGTAGCGGGTGGAGCCCGCCTTGG200TGCGCAGTTGGAAAACCTCGGAGCCCCGCTGGATCTCCTG240GCTGCCACCCGCACCCCCCGCCAGCCTACGCCCCACCGTA280GAGATGCCTTCTTCGGTGACGGCGCTGGGTCAGGCCAGGT320CCTCTGGCCCCGGGATGGCCCCGAGCGCCTGCTGCTGCTC360CCCTGCGGCCCTGCAGAGGAGGCTGCCCATCCTGGCGTGG400CTGCCCAGCTACTCCCTGCAGTGGCTGAAGATGGATTTCG440TCGCCGGCCTCTCAGTTGGCCTCACTGCCATTCCCCAGGC480GCTGGCCTATGCTGAAGTGGCTGGACTCCCGCCCCAGTAT520GGCCTCTACTCTGCCTTCATGGGCTGCTTCGTGTATTTCT560TCCTGGGCACCTCCCGGGATGTGACTCTGGGCCCCACCGC600CATTATGTCCCTCCTGGTCTCCTTCTACACCTTCCATGAG640CCCGCCTACGCTGTGCTGCTGGCCTTCCTGTCCGGCTGCA680TCCAGCTGGCCATGGGGGTCCTGCGTTTGGGGTTCCTGCT720GGACTTCATTTCCTACCCCGTCATTAAAGGCTTCACCTCT760GCTGCTGCCGTCACCATCGGCTTTGGACAGATCAAGAACC800TGCTGGGACTACAGAACATCCCCAGGCCGTTCTTCCTGCA840GGTGTACCACACCTTCCTCAGGATTGCAGAGACCAGGGTA880GGTGACGCCGTCCTGGGGCTGGTCTGCATGCTGCTGCTGC920TGGTGCTGAAGCTGATGCGGGACCACGTGCCTCCCGTCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。