基因總覽
SLC26A10P 的正式名稱為 solute carrier family 26 member 10, pseudogene,分類為假基因。名稱指出它與 solute carrier family 26 相關,但現有資料未說明此位點是否產生 RNA 或蛋白質,也未提供可確認的產物結構。因此,不能僅依名稱推定它具有轉運蛋白的分子結構或已知功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000665594 ★ | 57,619,527–57,626,036 | 18 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
目前資料將 SLC26A10P 的功能描述為預測性註記,而非已確認的作用。註記預測其可能具備跨膜轉運活性,並可能參與氯離子與硫酸根的跨膜運輸;這些內容並未提供實驗條件或具體作用機制,應視為推論,而非已證實的功能。
定位方面,資料預測此基因相關功能可能位於膜,並可能在質膜具有活性。來源未進一步說明定位所依據的實驗、細胞或條件;由於 SLC26A10P 被分類為假基因,也不能據此推定它會產生具有膜定位能力的蛋白質。
Promoter 與基因調控
>SLC26A10P ENST00000665594 GRCh38 chr12:57618527-57619627 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTTGAATGCAG TGGCTCCATCTCGGCTTACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCTGA GTAGCTGGAATTACAGGCACCTGCCACCATAACCAGCTAATTTTTGTATATTTTAGTAAAGACAGGGTTT CACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCAAAGTGCT GGGATTACAGGCGTAAGCCATTTCACCTGGCCTGTGAAAAGCATTTGAATGTGATAAATGGTGCTTCAGT TTTTTTGGTTCCTAAGAAAAAAATATCCTGTGGGTTCAGTATTTCCCCTGAGGCCCTGAACTAGGCCCAG CCACTCCTCACAGAGGTGTGGGTGCTGGTTCTGTCATTATCCCTCTCCAATACATGTGGCTGCATTCCAT GTCAGTAGGACATGAAACTGCTTTTTGGAACCAGCTGTGCCCCATGAAGATGTGGGTCTGGGTGAGGTTC AGGATGGGCGCTGAACTTTTTTGCTCTGGCTGGGAGAATGTAGTGGCTCAGGGAAGGACCAGTGACCCAA GAGGAACCAGCCTCTCTCTCCGCCCAAGGTGCCGATGGGGAAAGGAACCGGGAGTTAAGTGAAAAGTCTA AGGAAGGGTAAATAGCGGGTGTTGAGTGTCGGGGTGCGCTTGCCTTTCGGATTCTCTCTCTCTAATATCT ACACATTTCCACAGCCACCCCAGAGCCAGCGATCAGATCCGGCCAAGGATGTCTGCAGAAACGCCTAACA TAGAGACTCTCCCTCTCCAAGCCGCGGCTCTCGCCAGACCCGAGAAGGTCCTCAAGCGAGGGTGACCTCA GGGCCGGATTGGACCCTGCTTCGTGGGAGGCGGGACTCAGGGCTTAGCGGGCGGAGGAGTATTTAAGACC GGGCGGAGTTGGAGGTGGCCAAGGGCAGAATGAGCGGGATTCAGGGCACCAGGACCTACCCAGGCGCGGG GGACACCTCTGACCTTAAGTACCCCTTGGCGACCAGGCTCAGGGAAGCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC26A10_1 ↗ | 12:57,619,527 | 正股 | 57,619,478–57,619,537 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_83NPZK · promoter · 57619293–57619546 · regulatory
ENSR12_9STHH · promoter · 57619859–57620359 · regulatory
ENSR12_C7PD7 · enhancer · 57620574–57622434 · regulatory
ENSR12_5HJX6Z · CTCF_binding_site · 57621223–57621244 · regulatory
ENSR12_5HJXB5 · CTCF_binding_site · 57621909–57621930 · regulatory
· motif · 57614575–57614588 · motif
· motif · 57614601–57614613 · motif
· motif · 57614603–57614610 · motif
· motif · 57614603–57614618 · motif
· motif · 57614924–57614939 · motif
· motif · 57614929–57614941 · motif
· motif · 57615244–57615256 · motif
· motif · 57615246–57615253 · motif
· motif · 57618088–57618097 · motif
· motif · 57618088–57618097 · motif
· motif · 57621225–57621241 · motif
· motif · 57621911–57621927 · motif
· motif · 57621984–57621999 · motif
· motif · 57621992–57621999 · motif
基因座與轉錄註解
SLC26A10P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000665594 ★ | transcribed_unitary_pseudogene | 2,070 nt | 18 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC26A10P 被預測可能具有跨膜轉運活性,並可能參與氯離子與硫酸根的跨膜運輸;其相關功能亦預測位於膜,且可能在質膜具有活性。這些均為預測性註記,來源未提供進一步的實驗條件或作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in chloride transmembrane transport and sulfate transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in plasma membrane. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AAGGGCAGAATGAGCGGGATTCAGGGCACCAGGACCTACC40CAGGCGCGGGGGACACCTCTGACCTTAAGTACCCCTTGGC80GACCAGGCTCAGGGAAGCTCTCACCGAGGCTCGGTTCCAT120CAGCTCTTCAGGGGCGAAGAGCAGGAACCGGAGCTACCTG160AAGAGCGCGGCTTTCCCCGGCTCTTCGGGCTGTGGAGGCT200GCGGGCTCGCGCTTGTTCCGGGACAGGGGCGTGGCGCCTG240CTGCTGGCTCGGCTGCCCGCGCTGCACTGGCTGCCCCATT280ACCGCTGGCGGGCCTGGCTGCTCGGAGATGCGGTGGCCGG320AGTGACCGTGGGCATCGTGCACGTGCCCCAGGGCATGGCT360TTTGCTCTCCTGGCCTCCGTGCCCCCGGTGTTTGGACTCT400ACACTTCTTTCTTCCCCGTCCTCATCTACAGCTTGCTAGG440TACTGGGAGACACCTGTCCACAGGAACTTTCGCCATACTC480AGCCTCATGACAGGCTCGGCCGTCGAGCGGCTGGTGCCGG520AACCCCTCGTGGGGAATCTGAGCGGAATCGAGAAGGAGCA560GCTGGACGCTCAACGGGTTGGGGTAGCCGCGGCCGTGGCC600TTCGGGAGCGGGGCGTTGATGCTGGGGATGTTCGTGCTGC640AGCTCGGCGTCTTGTCCACCTTTTTGTCCGAGCCTGTGGT680CAAGGCGCTGACCAGCGGGGCCGCGCTGCACGTGCTCTTG720TCCCAGCTGCCGAGCCTCTTGGGGTTGTCCCTCCCGCGCC760AGATCGGCTGCTTCTCTCTCTTCAAGACGCTGGCCTCCTT800GCTGACTGCGCTGCCTCGGAGCAGTCCGGCCGAACTGACC840ATCTCCGCGCTCAGCCTGGCGCTGCTCGTGCCGGTCAAGG880AATTGAACGTGAGATTCCGAGACCGGCTACCCACGCCGAT920CCCGGGGGAAGTCGTCTTGGTGCTTCTGGCCTCCGTGCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。