演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

SLC26A10PSLC26A10

solute carrier family 26 member 10, pseudogene

SLC26A10P 是人類 solute carrier family 26 member 10 的假基因;其相關功能註記屬預測,並非已確立的生物學作用。

Homo sapiens12q13.3
OFFICIAL SYMBOL
SLC26A10P
CHROMOSOME
12
LOCUS TYPE
transcribed_unitary_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC26A10P 的正式名稱為 solute carrier family 26 member 10, pseudogene,分類為假基因。名稱指出它與 solute carrier family 26 相關,但現有資料未說明此位點是否產生 RNA 或蛋白質,也未提供可確認的產物結構。因此,不能僅依名稱推定它具有轉運蛋白的分子結構或已知功能。

Official symbol
SLC26A10P
Gene name
solute carrier family 26 member 10, pseudogene
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:14470
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SLC26A10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.3
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegSLC26A10Ppq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:57,619,527–57,626,036
Gene span
6,510 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000665594 ★57,619,527–57,626,03618

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

目前資料將 SLC26A10P 的功能描述為預測性註記,而非已確認的作用。註記預測其可能具備跨膜轉運活性,並可能參與氯離子與硫酸根的跨膜運輸;這些內容並未提供實驗條件或具體作用機制,應視為推論,而非已證實的功能。

定位方面,資料預測此基因相關功能可能位於膜,並可能在質膜具有活性。來源未進一步說明定位所依據的實驗、細胞或條件;由於 SLC26A10P 被分類為假基因,也不能據此推定它會產生具有膜定位能力的蛋白質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57619527 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC26A10P ENST00000665594 GRCh38 chr12:57618527-57619627 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTTGAATGCAG
TGGCTCCATCTCGGCTTACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTATCCTGCTTCAGCCTCCTGA
GTAGCTGGAATTACAGGCACCTGCCACCATAACCAGCTAATTTTTGTATATTTTAGTAAAGACAGGGTTT
CACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCAAAGTGCT
GGGATTACAGGCGTAAGCCATTTCACCTGGCCTGTGAAAAGCATTTGAATGTGATAAATGGTGCTTCAGT
TTTTTTGGTTCCTAAGAAAAAAATATCCTGTGGGTTCAGTATTTCCCCTGAGGCCCTGAACTAGGCCCAG
CCACTCCTCACAGAGGTGTGGGTGCTGGTTCTGTCATTATCCCTCTCCAATACATGTGGCTGCATTCCAT
GTCAGTAGGACATGAAACTGCTTTTTGGAACCAGCTGTGCCCCATGAAGATGTGGGTCTGGGTGAGGTTC
AGGATGGGCGCTGAACTTTTTTGCTCTGGCTGGGAGAATGTAGTGGCTCAGGGAAGGACCAGTGACCCAA
GAGGAACCAGCCTCTCTCTCCGCCCAAGGTGCCGATGGGGAAAGGAACCGGGAGTTAAGTGAAAAGTCTA
AGGAAGGGTAAATAGCGGGTGTTGAGTGTCGGGGTGCGCTTGCCTTTCGGATTCTCTCTCTCTAATATCT
ACACATTTCCACAGCCACCCCAGAGCCAGCGATCAGATCCGGCCAAGGATGTCTGCAGAAACGCCTAACA
TAGAGACTCTCCCTCTCCAAGCCGCGGCTCTCGCCAGACCCGAGAAGGTCCTCAAGCGAGGGTGACCTCA
GGGCCGGATTGGACCCTGCTTCGTGGGAGGCGGGACTCAGGGCTTAGCGGGCGGAGGAGTATTTAAGACC
GGGCGGAGTTGGAGGTGGCCAAGGGCAGAATGAGCGGGATTCAGGGCACCAGGACCTACCCAGGCGCGGG
GGACACCTCTGACCTTAAGTACCCCTTGGCGACCAGGCTCAGGGAAGCTCT
SLC26A10P 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC26A10_1 ↗12:57,619,527正股57,619,478–57,619,537

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_83NPZK · promoter · 57619293–57619546 · regulatory

ENSR12_9STHH · promoter · 57619859–57620359 · regulatory

ENSR12_C7PD7 · enhancer · 57620574–57622434 · regulatory

ENSR12_5HJX6Z · CTCF_binding_site · 57621223–57621244 · regulatory

ENSR12_5HJXB5 · CTCF_binding_site · 57621909–57621930 · regulatory

· motif · 57614575–57614588 · motif

· motif · 57614601–57614613 · motif

· motif · 57614603–57614610 · motif

· motif · 57614603–57614618 · motif

· motif · 57614924–57614939 · motif

· motif · 57614929–57614941 · motif

· motif · 57615244–57615256 · motif

· motif · 57615246–57615253 · motif

· motif · 57618088–57618097 · motif

· motif · 57618088–57618097 · motif

· motif · 57621225–57621241 · motif

· motif · 57621911–57621927 · motif

· motif · 57621984–57621999 · motif

· motif · 57621992–57621999 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

SLC26A10P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000665594 ★transcribed_unitary_pseudogene2,070 nt18

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC26A10P 被預測可能具有跨膜轉運活性,並可能參與氯離子與硫酸根的跨膜運輸;其相關功能亦預測位於膜,且可能在質膜具有活性。這些均為預測性註記,來源未提供進一步的實驗條件或作用機制。推論支持
證據與來源

Predicted to enable transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in chloride transmembrane transport and sulfate transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in plasma membrane.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000665594 · 2,070 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGGGCAGAATGAGCGGGATTCAGGGCACCAGGACCTACC40
41CAGGCGCGGGGGACACCTCTGACCTTAAGTACCCCTTGGC80
81GACCAGGCTCAGGGAAGCTCTCACCGAGGCTCGGTTCCAT120
121CAGCTCTTCAGGGGCGAAGAGCAGGAACCGGAGCTACCTG160
161AAGAGCGCGGCTTTCCCCGGCTCTTCGGGCTGTGGAGGCT200
201GCGGGCTCGCGCTTGTTCCGGGACAGGGGCGTGGCGCCTG240
241CTGCTGGCTCGGCTGCCCGCGCTGCACTGGCTGCCCCATT280
281ACCGCTGGCGGGCCTGGCTGCTCGGAGATGCGGTGGCCGG320
321AGTGACCGTGGGCATCGTGCACGTGCCCCAGGGCATGGCT360
361TTTGCTCTCCTGGCCTCCGTGCCCCCGGTGTTTGGACTCT400
401ACACTTCTTTCTTCCCCGTCCTCATCTACAGCTTGCTAGG440
441TACTGGGAGACACCTGTCCACAGGAACTTTCGCCATACTC480
481AGCCTCATGACAGGCTCGGCCGTCGAGCGGCTGGTGCCGG520
521AACCCCTCGTGGGGAATCTGAGCGGAATCGAGAAGGAGCA560
561GCTGGACGCTCAACGGGTTGGGGTAGCCGCGGCCGTGGCC600
601TTCGGGAGCGGGGCGTTGATGCTGGGGATGTTCGTGCTGC640
641AGCTCGGCGTCTTGTCCACCTTTTTGTCCGAGCCTGTGGT680
681CAAGGCGCTGACCAGCGGGGCCGCGCTGCACGTGCTCTTG720
721TCCCAGCTGCCGAGCCTCTTGGGGTTGTCCCTCCCGCGCC760
761AGATCGGCTGCTTCTCTCTCTTCAAGACGCTGGCCTCCTT800
801GCTGACTGCGCTGCCTCGGAGCAGTCCGGCCGAACTGACC840
841ATCTCCGCGCTCAGCCTGGCGCTGCTCGTGCCGGTCAAGG880
881AATTGAACGTGAGATTCCGAGACCGGCTACCCACGCCGAT920
921CCCGGGGGAAGTCGTCTTGGTGCTTCTGGCCTCCGTGCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。