基因總覽
SLC25A16(solute carrier family 25 member 16)是蛋白質編碼基因,產物屬於粒線體載體家族(TC 2.A.29)。蛋白質長 332 個胺基酸,具有多次跨膜的膜蛋白特徵,序列中可辨識出六段螺旋跨膜區及三個 Solcar 重複區。這些特徵符合其作為粒線體內膜載體的基本性質;其與輔酶 A(CoA)代謝物運輸的關係見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000609923 ★ | 68,477,998–68,527,523 | 9 |
| ENST00000873655 | 68,473,079–68,527,523 | 10 |
| ENST00000873656 | 68,477,998–68,527,523 | 7 |
| ENST00000873657 | 68,477,998–68,527,523 | 5 |
| ENST00000966724 | 68,477,998–68,527,523 | 9 |
| ENST00000966725 | 68,477,998–68,527,523 | 9 |
| ENST00000966726 | 68,477,998–68,527,523 | 8 |
| ENST00000608053 | 68,487,074–68,488,590 | 2 |
| ENST00001127249 | 68,525,451–68,527,523 | 2 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC25A16 被描述為粒線體內膜載體,與細胞質和粒線體之間的輔酶 A(CoA)平衡有關。現有資料提出兩種可能的運輸方向,尚不能將其中一種視為已確定的唯一機制:一種是將 CoA 自細胞質輸入粒線體基質;另一種則是把 3′-去磷酸輔酶 A(3′-dephospho-CoA)由粒線體基質輸出至細胞質。來源以「可能」描述這些作用,並未將兩種方向合併成單一已證實的運輸途徑。
所列反應式分別描述 CoA 與 ADP,以及 3′-dephospho-CoA 與 ADP 的交換:前者表示 CoA 向內、ADP 向外,後者表示 3′-dephospho-CoA 向外、ADP 向內。這些反應式提供可能的交換形式,但其證據標示為相似性推定,因此不宜據此將特定運輸方向或反應機制表述為已在此蛋白質中確立。
因此,來源支持的功能重點是 SLC25A16 可能參與粒線體與細胞質間 CoA 相關分子的運輸,並與兩區室間的 CoA 平衡相關;具體運輸底物及方向仍保留來源提出的不同可能性。
Promoter 與基因調控
>SLC25A16 ENST00000609923 GRCh38 chr10:68527423-68528523 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGCTTGAACCCAGGGGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCTCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA GAACGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGCGATAGGCGATTACTGGTCAGTGGTCAATAT AGGTCAAGGGACGAGACAGGAGAGAGCTTTCTAAGGTTGTGGGCCTTTTTATTTTTTATTTTTTTGAGGC GTAGTCTCGCTGTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTAGGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCT GGGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCCTCACGCCTGG CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTCGCCTGGCTAGTCTTTTTTTTTTTTAG ACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCTATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTC CTGGATTCAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCTCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCCCGCCC GGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAC TTTGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGGGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACGGCGCCCGGCATCC AGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGTCCGCCTGGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG CGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGGTTGTGGGTTTTAATGGGACCATCTCACTGCCTACCGTTTCCTTTTT CCGTCCGAACAGAAGGGGCCTGAGCAGTGAACTGACAGTGGCAACGCCGGGTGAGGCGGGATGGAGGAGT TTACGAGCCTGGGTGACGCCCTGTTCCGCGTCCTGGCCCCGCCCCTCCCGGCAGAGCCCCTTGGCGCGTG ACACAGGCCCCGCCCTTGCTGTACGCCATCAGCCGGCGCCGCGCCGCCGGGTGTTACTTTGCCCCGCCGG CGGGGCGGTCAGCCTCCTGTCACCGCCTGTTCCGGCTATGGTCCCGTCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC25A16_1 ↗ | 10:68,527,487 | 負股 | 68,527,477–68,527,536 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_9327D6 · enhancer · 68525886–68526337 · regulatory
ENSR10_6B3L5H · CTCF_binding_site · 68527486–68527525 · regulatory
ENSR10_9327DM · promoter · 68527513–68528013 · regulatory
· motif · 68527010–68527023 · motif
· motif · 68527243–68527252 · motif
· motif · 68527281–68527296 · motif
· motif · 68527306–68527321 · motif
· motif · 68527367–68527377 · motif
· motif · 68527479–68527494 · motif
· motif · 68527488–68527504 · motif
· motif · 68527506–68527522 · motif
· motif · 68527513–68527523 · motif
· motif · 68527527–68527537 · motif
· motif · 68527568–68527578 · motif
· motif · 68527591–68527604 · motif
· motif · 68527676–68527696 · motif
· motif · 68527682–68527702 · motif
· motif · 68527797–68527809 · motif
· motif · 68527799–68527806 · motif
· motif · 68527799–68527814 · motif
· motif · 68527891–68527906 · motif
· motif · 68528639–68528650 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:332 aa
SLC25A16 蛋白質長 332 個胺基酸,屬於粒線體載體家族(TC 2.A.29)。序列註解標示六段螺旋跨膜區,位置分別為 37–57、88–108、134–154、191–211、244–264 與 299–319;另有三個 Solcar 重複區,分別位於 34–120、128–216 與 238–328。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC25A16 位於粒線體內膜,並被註記為多次跨膜蛋白。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC25A16 是粒線體內膜載體,與細胞質和粒線體間的輔酶 A(CoA)平衡有關。來源提出兩種可能:CoA 可由細胞質輸入粒線體基質;或者 3′-去磷酸輔酶 A 可由粒線體基質輸出至細胞質。運輸方向仍屬可能性,未確定為單一途徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial inner membrane transporter that regulates coenzyme A homeostasis between cytosol and mitochondria. Could mediate the import of coenzyme A from the cytosol into the mitochondrial matrix. Alternatively, it could function in the export of 3'-dephospho-CoA from the mitochondrial matrix to the cytosol PMID 11158296 ↗ · PMID 36316571 ↗ · PMID 40925986 ↗ |
| 分子活性 | ADP(out) + CoA(in) = ADP(in) + CoA(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | 3'-dephospho-CoA(in) + ADP(out) = 3'-dephospho-CoA(out) + ADP(in) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLC25A16 被註記為位於粒線體內膜的多次跨膜蛋白;此定位資料未說明其他細胞區室、異構型差異或定位改變條件。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTACGCCATCAGCCGGCGCCGCGCCGCCGGGTGTTACTTT40GCCCCGCCGGCGGGGCGGTCAGCCTCCTGTCACCGCCTGT80TCCGGCTATGGTCCCGTCCGGTGTTCTGTAAGTTGGCAAC120CTAGGCTCCTGACGCGACCCTGGTCCTGATGGCGGCGGCG160ACGGCCGCGGCAGCCCTGGCGGCGGCCGATCCCCCTCCCG200CAATGCCGCAGGCGGCAGGGGCCGGAGGGCCCACAACCCG240CAGAGACTTCTACTGGCTGCGCTCCTTTCTGGCCGGAGGT280ATTGCTGGATGCTGTGCCAAAACAACAGTTGCTCCATTGG320ATCGAGTAAAGGTTTTATTACAAGCTCACAATCACCATTA360CAAGCATTTAGGAGTATTTTCTGCATTGCGTGCTGTTCCT400CAAAAAGAAGGATTCCTTGGATTGTATAAAGGAAATGGTG440CAATGATGATTCGAATCTTTCCCTATGGTGCAATCCAGTT480TATGGCATTTGAGCATTATAAAACGTTAATTACTACGAAG520CTGGGAATTTCAGGTCATGTGCACAGATTAATGGCTGGAT560CCATGGCAGGTATGACAGCAGTTATCTGTACTTACCCTCT600TGACATGGTTAGGGTCCGCCTAGCATTCCAGGTGAAAGGG640GAACACAGCTATACAGGAATTATTCATGCTTTCAAAACAA680TTTATGCAAAGGAAGGTGGTTTCTTTGGATTTTACAGAGG720TCTGATGCCTACTATTTTAGGAATGGCTCCATATGCAGGT760GTTTCATTTTTTACTTTTGGTACCTTGAAGAGTGTTGGGC800TTTCCCATGCTCCTACCCTTCTTGGCAGACCTTCATCAGA840CAATCCTAATGTCTTAGTTTTGAAAACTCATGTAAACTTA880CTTTGTGGTGGTGTTGCTGGAGCAATAGCGCAGACAATAT920CCTACCCATTTGATGTGACTCGTCGGCGAATGCAATTAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。