基因總覽
SLC25A12（solute carrier family 25 member 12）是蛋白質編碼基因，產物屬於粒線體載體（TC 2.A.29）家族。其蛋白質長 678 個胺基酸，具有多段跨膜區，並包含四個 EF-hand、三個 Solcar 重複序列，以及調控性 N 端區、連接環區、載體區與 C 端區等註解區域。這些結構特徵構成其粒線體膜載體的基本架構；其主要生理角色與天門冬胺酸、麩胺酸的跨膜運輸有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000422440 ★ | 171,783,405–171,894,244 | 18 |
| ENST00000855498 | 171,781,168–171,894,310 | 18 |
| ENST00000855500 | 171,781,168–171,894,310 | 18 |
| ENST00000855503 | 171,781,168–171,894,310 | 17 |
| ENST00000855506 | 171,781,168–171,894,310 | 15 |
| ENST00000855507 | 171,781,168–171,894,310 | 19 |
| ENST00000855508 | 171,781,168–171,894,310 | 17 |
| ENST00000855509 | 171,781,168–171,894,240 | 18 |
| ENST00000958779 | 171,781,168–171,894,310 | 14 |
| ENST00000958780 | 171,781,168–171,894,310 | 20 |
| ENST00000958781 | 171,781,168–171,894,310 | 19 |
| ENST00000958782 | 171,781,168–171,894,310 | 13 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC25A12 是具電生性的天門冬胺酸／麩胺酸反向運輸蛋白，參與蘋果酸－天門冬胺酸穿梭。此交換偏向將天門冬胺酸送出粒線體，同時將麩胺酸與質子帶入粒線體。其運輸方向可概括為：粒線體內的天門冬胺酸與粒線體外的麩胺酸、質子互換，使天門冬胺酸外移、麩胺酸及質子內移。
除了這組底物，SLC25A12 也可介導 L-cysteinesulfinate（3-sulfino-L-alanine）進入粒線體，並與 L-glutamate 及質子交換。另有一種不伴隨質子轉運的交換方式：帶陰離子形式的 L-cysteinesulfinate 與天門冬胺酸互換。這些結果顯示，其運輸底物與是否伴隨質子移動，會隨交換物組合而異。
已報告的底物選擇性亦有明確界線：SLC25A12 不具對 L-glutamine 或 γ-aminobutyric acid（GABA）的運輸活性。這些特性界定了其在粒線體內外交換小分子的作用範圍；其中天門冬胺酸、麩胺酸與質子的偶聯交換，構成其參與蘋果酸－天門冬胺酸穿梭的主要分子功能。
Promoter 與基因調控
>SLC25A12 ENST00000422440 GRCh38 chr2:171894144-171895244 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCGAGACTCAGTCTCAACACACACACACACAGACACACATACACACAATACACATGTGATTGGGGTTGTG GAGAAGCATTGACCATCTGTAAGCCCCTAGAGGGTGGGGGCTATAGGTTATTTGCGTTTTTTACAAGCAG GACCATGTCAGGCATATAATGGATGCCCATACATGTTTGAATCAATATGTAGCCTAATACAGTGATATTG GCAAGACGGGTTTAGAAACATTGTTTTGGTTCAAGATAGAGTTACTGCTTCTTCTACTTCTTAGGTAGGG CTAGAAATCGAATGGAGAATTACTTTCTGTTCATGTATGGGCAAGCGATTCATTGCCAGCCCTGTCAAAG ACACATAGAGTTTTTTTTCTCATTGCACACAGGATTTGGGTGATTAGGAAAGTGGAGCGAGTCTACTAAT AAACCGTTGTAATAGCACGCAAAGCAAAAATAAATTCAGCGTATTCGTCCCATGCCAATTTAGGAGCATA TTTCTCAAATTATGTTTACGTAGGTTTTCCCTAGAGTGAGTGGTTCCCAATCTTGTTTTGTCGGTATTTG CCATCAGTTGTCATTAATTCATTGTTATTAATGGGAAGTGCTCTTTGATCCGTCGGAACCTTGCTCAGTA TAGGCCCCAAATGTTCCTTTAAGCCTCGGGGAAAACGACTTTGGCTGGTCGGTGCCCAAAGCCACACCCA CTAAGAGGCCTTAGGAAACCTGGGGCTTTCCTGGCGGCGACCTAGCTGTGGCAACCACGCGGCGCGTCGG GATCCCATGGGTCGCGCTTGTTTTCCCCGTGGGAGGCGCGTCCCCCTCCTCCGCCCGGCCGGCCGGCCCT GGACCAGCTGCCTTTCTGGCCGGGACGCCGGGCCCCTTTCCGCACGCGGCGCGCCCCGAGTTCATTTGCA TAGGGACGCGCGCGGCGCCGGCGAGAGGGAGGGCGGGCGCGGCCGGGAAGACGGCGCGCGCGCGCCCTGA CAGCTCGGCCCTGCTCGCTCACTCGCTCGTCCCCGGCTTCCGAGCACAGCATGGCGGTCAAGGTGACTCC AACTCTCTGCTGCTGCTTTTATTGCATAAGAGACATTCCGAGCGCCCTGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC25A12_1 ↗ | 2:171,894,244 | 負股 | 171,894,234–171,894,293 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_B3953T · enhancer · 171893250–171894233 · regulatory
ENSR2_94J85Z · promoter · 171894234–171894734 · regulatory
· motif · 171890742–171890753 · motif
· motif · 171890888–171890902 · motif
· motif · 171893038–171893053 · motif
· motif · 171893447–171893459 · motif
· motif · 171893808–171893817 · motif
· motif · 171894206–171894216 · motif
· motif · 171894331–171894344 · motif
· motif · 171894439–171894452 · motif
· motif · 171894439–171894452 · motif
· motif · 171894461–171894474 · motif
· motif · 171894461–171894474 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：678 aa
蛋白質長 678 個胺基酸，含六段螺旋跨膜區，並在粒線體膜兩側分布多個拓樸區段。序列註解包含四個 EF-hand、三個 Solcar 重複序列，以及調控性 N 端區、連接環區、載體區與 C 端區；其家族分類為粒線體載體（TC 2.A.29）家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC25A12 位於粒線體內膜，屬多次跨膜蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- MAVSQ7Z434 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC25A13Q9UJS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC25A12 可經由 N 端形成同源二聚體；此處描述的是蛋白質彼此組成二聚體，來源未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
SLC25A12 基因變異與伴白質失養症的發育性與癲癇性腦病 39（DEE39）有關，疾病遺傳方式為常染色體隱性。DEE39 屬嚴重、早發且具異質性的癲癇性腦病；癲癇發作前發育可正常，發作後可能出現認知與動作發展遲緩。其特徵包括中樞神經系統廣泛髓鞘形成不足，而灰質相對未受影響。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC25A12 是粒線體中具電生性的天門冬胺酸／麩胺酸反向運輸蛋白，參與蘋果酸－天門冬胺酸穿梭，偏向將天門冬胺酸送出並讓麩胺酸與質子進入粒線體。它也可促進 L-cysteinesulfinate 進入粒線體，與 L-glutamate 和質子交換；此外，陰離子形式的兩種胺基酸可在不轉運質子的情況下交換。來源指出它不運輸 L-glutamine 或 GABA。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial electrogenic aspartate/glutamate antiporter that favors efflux of aspartate and entry of glutamate and proton within the mitochondria as part of the malate-aspartate shuttle. Also mediates the uptake of L-cysteinesulfinate (3-sulfino-L-alanine) by mitochondria in exchange of L-glutamate and proton. Can also exchange L-cysteinesulfinate with aspartate in their anionic form without any proton translocation. Lacks transport activity towards L-glutamine or gamma-aminobutyric acid (GABA) PMID 11566871 ↗ · PMID 19641205 ↗ · PMID 24515575 ↗ · PMID 38945283 ↗ |
| 分子活性 | L-aspartate(in) + L-glutamate(out) + H(+)(out) = L-aspartate(out) + L-glutamate(in) + H(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源L-aspartate(in) + L-glutamate(out) + H(+)(out) = L-aspartate(out) + L-glutamate(in) + H(+)(in) PMID 11566871 ↗ · PMID 19641205 ↗ · PMID 24515575 ↗ · PMID 38945283 ↗ |
| 分子活性 | 3-sulfino-L-alanine(out) + L-glutamate(in) + H(+)(in) = 3-sulfino-L-alanine(in) + L-glutamate(out) + H(+)(out) | 含實驗來源 | 證據與來源3-sulfino-L-alanine(out) + L-glutamate(in) + H(+)(in) = 3-sulfino-L-alanine(in) + L-glutamate(out) + H(+)(out) PMID 11566871 ↗ |
| 分子活性 | 3-sulfino-L-alanine(out) + L-aspartate(in) = 3-sulfino-L-alanine(in) + L-aspartate(out) | 推論支持 | 證據與來源3-sulfino-L-alanine(out) + L-aspartate(in) = 3-sulfino-L-alanine(in) + L-aspartate(out) |
| 交互作用 | SLC25A12 可透過 N 端與另一個相同蛋白質形成同源二聚體。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC25A12 位於粒線體內膜，並被註記為多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrion inner membrane / Multi-pass membrane protein PMID 11566871 ↗ · PMID 19641205 ↗ · PMID 24515575 ↗ · PMID 9722566 ↗ |
| 疾病關聯 | SLC25A12 基因變異與伴白質失養症的發育性與癲癇性腦病 39（DEE39）相關，遺傳方式為常染色體隱性。此病屬嚴重早發癲癇性腦病，癲癇發作前發育正常，發作後可出現認知與動作遲緩；中樞神經系統有廣泛髓鞘形成不足，灰質相對未受影響。 | 含實驗來源 | 證據與來源Developmental and epileptic encephalopathy 39 with leukodystrophy DEE39 A form of epileptic encephalopathy, a heterogeneous group of severe early-onset epilepsies characterized by refractory seizures, neurodevelopmental impairment, and poor prognosis. Development is normal prior to seizure onset, after which cognitive and motor delays become apparent. DEE39 is characterized by global hypomyelination of the central nervous system, with the gray matter appearing relatively unaffected. Inheritance is autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612949 PMID 19641205 ↗ · PMID 24515575 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCGCTCGTCCCCGGCTTCCGAGCACAGCATGGCGGTCA40AGGTGCAGACAACTAAGCGAGGGGATCCTCATGAGTTAAG80AAACATATTTCTACAGTATGCCAGTACTGAGGTTGATGGA120GAGCGTTATATGACCCCAGAAGACTTTGTTCAGCGCTATC160TTGGACTGTATAATGATCCAAATAGTAACCCAAAGATCGT200GCAGCTCTTGGCAGGAGTAGCTGATCAAACCAAGGATGGG240TTGATCTCCTATCAAGAGTTTTTGGCATTTGAATCTGTTT280TATGTGCTCCAGATTCCATGTTCATAGTGGCTTTCCAGTT320GTTTGACAAGAGTGGAAATGGAGAGGTGACATTTGAAAAT360GTCAAAGAAATTTTTGGACAGACTATTATTCATCATCATA400TCCCTTTTAACTGGGATTGTGAATTTATCCGACTGCATTT440TGGGCATAACCGGAAGAAGCATCTTAACTACACAGAATTC480ACGCAGTTTCTCCAGGAGCTGCAATTGGAACATGCAAGAC520AAGCCTTTGCACTCAAAGACAAAAGCAAAAGTGGCATGAT560TTCTGGTCTGGATTTCAGTGACATCATGGTTACCATTAGA600TCTCACATGCTTACTCCTTTTGTGGAGGAGAACTTAGTTT640CAGCAGCTGGAGGAAGTATCTCACACCAGGTTAGCTTCTC680CTACTTCAATGCATTTAACTCGTTACTGAATAACATGGAG720CTTGTTCGTAAGATATATAGCACTCTAGCTGGCACAAGGA760AAGATGTTGAAGTCACAAAGGAGGAATTTGCCCAGAGTGC800CATACGCTATGGACAAGTCACACCACTAGAAATTGATATT840CTATATCAGCTTGCAGACTTATATAATGCTTCAGGGCGCT880TGACTTTGGCAGATATTGAGAGAATAGCCCCATTGGCTGA920GGGGGCCTTACCTTACAACCTGGCAGAACTTCAGAGACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。