演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC24A4NCKX4

solute carrier family 24 member 4

SLC24A4 編碼 CaCA 家族的多次跨膜陽離子交換蛋白,可交換 Ca²⁺、K⁺與 Na⁺;來源亦指出它與嗅覺感覺神經元的反應調節及牙釉質形成相關。

Homo sapiens14q32.12UniProt Q8NFF2
OFFICIAL SYMBOL
SLC24A4
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q8NFF2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC24A4 的正式名稱為 solute carrier family 24 member 4,屬於蛋白質編碼基因。其產物是 Ca²⁺:cation antiporter(CaCA)家族中的 SLC24A 子家族成員,具有多個穿膜區段,構成多次跨膜蛋白。來源將此蛋白描述為鈣、鉀與鈉的交換運輸蛋白,並指出它與嗅覺感覺神經元反應調節及牙釉質形成相關。這些資訊勾勒出 SLC24A4 的基本性質:它是膜相關的陽離子交換蛋白,涉及離子運輸,且在感覺反應調節與牙齒發育過程中可能具有作用。

Official symbol
SLC24A4
Gene name
solute carrier family 24 member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10978
UniProt
Q8NFF2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NCKX4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q32.12
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegSLC24A4pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:92,322,581–92,501,481
Gene span
178,901 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000532405 ★92,323,165–92,501,48117
ENST0000039326592,322,581–92,501,48117
ENST0000067600192,323,148–92,501,48118
ENST0000053143392,323,148–92,501,48118
ENST0000055446192,408,379–92,442,7535
ENST0000052555792,439,364–92,496,25215

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC24A4 產物是鈣、鉀與鈉的反向運輸蛋白。來源描述其運輸比例為每 1 個 Ca²⁺與 1 個 K⁺,交換 4 個 Na⁺;反應式所列方向為 Ca²⁺與 K⁺由細胞外移入、Na⁺由細胞內移出。這項交換活動構成其主要的分子功能,涉及不同陽離子跨膜運輸。

在嗅覺感覺神經元(OSNs)中,SLC24A4 被描述為可控制快速反應的終止,並適當調節適應過程。這些作用會進一步影響氣味資訊的編碼與感知;此項神經元功能註記標示為依相似性推定,因此不應視為已在此處直接確證的機制細節。

此外,來源指出 SLC24A4 可能參與牙釉質形成期間的鈣運輸。這項作用以「可能」描述,與其離子交換功能相符,但資料未進一步說明該過程中的具體運輸位置或調控方式。整體而言,現有資料支持其主要角色為陽離子交換,並提示它可能連結嗅覺感覺神經元的反應調節及牙釉質形成中的鈣運輸。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 92323165 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC24A4 ENST00000532405 GRCh38 chr14:92322165-92323265 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGCTCCCTTTTGATTTAGAGTTCCTTGAAAGCAGAGACTGGGTCTCATACATTTGTTATTGTTTTGTTCT
CCGGTTGGCACAGGGCCTGCACACGGTGGGTATGTATTTATTTAATTAAAGAGTTGGCCTGTTCCAAGAA
GGATTTTAACCCCTAGCGGCACTGAACAGGTGGCGATGAATTGGCCGGGAAGGAAGTCGGTCCTAGGGGT
AGTCACAGACCCCCTGGGCTGGGGTCCCCTCCACCTGCCTGCACCTGTATCACCCCTCAGCTGCTGTTCT
GAAATTTTCCCTCCTGCCCCATTTTTAAAGCGGTTTACACCAGAGAGCCGACCAGAAAGGAGAGATACAA
AACCAAACCAGCAAGCCCTGGGAAGCGGTAGGCTTAGGAACATGGAAAGCTCAACCGTCGGTTGTGGGGC
CCGCAGATCTCTCTGGTTCCCCTCTCTGCCCCGTCTCCAGCTTTTTTGCAGGTCGGTGTCGCGGCCTCGC
AGATCCCCAACAGCCCCGAGAGCCCTGAAGGAGCTGGTCCCAGCGGGTCCAAGCTCGTGTTGGCTTGGTG
CAAGCCTGTTTGTTAGCTCTGCACGACCAATTAATTTTCTCCTGCATCTTCCCCCCGTGGTGGGTGGCGG
GGTGGGGAGGGGGTGTGTGGCGGGGCCTCGGGTCGGCTCGGGGGTCGGAGAGCCCGGACAGGAGCGACTA
CACTGCAGAAACCCTTTTTCTAAGAGTCCCCAGCGGTGCCATAACCTGTTTCTCTCTGCAGCAGCCTCAG
AGGGTAAAGGAAGGGCTCGTTGCAGCTCCATATGGAAGAAAGGAGAGAAAAAGGGAGAAGGAAGGGGATT
ATATTGGTCAGTAGAGGTCCAACTACTGAAGAGAAGAGTGCACGGGGGAGTGCGCCCTACGGGACGAGTA
CACGTGCTGGGAAGGGCGGGGGGTGAGAGGCGGGCAGGAGGGGAGGAGTAGGGAGGCGAGAGCAGCGGGC
GGGAGGCGCCACGGCCTCTCAGACGCTGGCGCCCGCAGCCGAGAAGCCAGAGAGAAAGTTCCCGGGGAGA
GCTCGCCCCTGGGAGGGCCGACGTCGAGCCTGCTCGCCGCGAGGGTCTCAG
SLC24A4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC24A4_1 ↗14:92,323,165正股92,323,116–92,323,175
SLC24A4_2 ↗14:92,323,585正股92,323,536–92,323,595
SLC24A4_3 ↗14:92,452,779正股92,452,730–92,452,789

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_93CMDS · promoter · 92322876–92323203 · regulatory

ENSR14_5RPBXC · CTCF_binding_site · 92326024–92326045 · regulatory

· motif · 92323073–92323082 · motif

· motif · 92323073–92323082 · motif

· motif · 92325324–92325338 · motif

· motif · 92325324–92325338 · motif

· motif · 92325384–92325398 · motif

· motif · 92326026–92326042 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:622 aa

1 aa622 aa功能區域重複區訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q8NFF2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC24A4 蛋白長 622 個胺基酸,具有 N 端訊號區段及多個螺旋型跨膜區段,屬多次跨膜蛋白。其序列註解包含 Alpha-1 與 Alpha-2 重複區,並將 358–410 位胺基酸標示為無序區;蛋白質家族分類為 CaCA 家族的 SLC24A 子家族。

訊號胜肽1–38 aa
拓樸區域Extracellular39–97 aa
跨膜區Helical98–118 aa
拓樸區域Cytoplasmic119–142 aa
跨膜區Helical143–163 aa
拓樸區域Extracellular164–172 aa
跨膜區Helical173–193 aa
拓樸區域Cytoplasmic194–200 aa
跨膜區Helical201–221 aa
拓樸區域Extracellular222–224 aa
跨膜區Helical225–245 aa
拓樸區域Cytoplasmic246–457 aa
跨膜區Helical458–478 aa
拓樸區域Extracellular479–479 aa
跨膜區Helical480–500 aa
拓樸區域Cytoplasmic501–526 aa
跨膜區Helical527–547 aa
拓樸區域Extracellular548–557 aa
跨膜區Helical558–578 aa
拓樸區域Cytoplasmic579–586 aa
跨膜區Helical587–607 aa
拓樸區域Extracellular608–622 aa
重複區Alpha-1139–179 aa
重複區Alpha-2495–526 aa
功能區域Disordered358–410 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8NFF2…

AlphaFold · Q8NFF2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasm

資料將 SLC24A4 標示於細胞膜,並註明其為多次跨膜蛋白;另列有細胞質定位。 來源未提供不同條件下定位改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NCKX4SLC24A4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 SLC24A4 的變異與 amelogenesis imperfecta, hypomaturation type, 2A5(AI2A5)相關。此病影響乳齒與恆齒的牙釉質形成;牙齒可呈亮澤、類瓊脂外觀,牙釉質較正常柔軟,且其中層可見棕色色素。來源將此疾病描述為由影響該基因的變異所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC24A4 是鈣、鉀與鈉反向運輸蛋白,每 1 個 Ca²⁺和 1 個 K⁺與 4 個 Na⁺交換。它依相似性被認為可調節嗅覺感覺神經元快速反應終止及適應,進而影響氣味資訊編碼與感知;此外,可能參與牙釉質形成期間的鈣運輸。含實驗來源
證據與來源

Calcium, potassium:sodium antiporter that transports 1 Ca(2+) and 1 K(+) in exchange for 4 Na(+). Controls the rapid response termination and proper regulation of adaptation in olfactory sensory neurons (OSNs) which subsequently influences how odor information is encoded and perceived (By similarity). May play a role in calcium transport during amelogenesis

PMID 12379639 ↗ · PMID 23375655 ↗ · PMID 24621671 ↗ · PMID 26631410 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Ca(2+)(out) + K(+)(out) + 4 Na(+)(in) = Ca(2+)(in) + K(+)(in) + 4 Na(+)(out)含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)(out) + K(+)(out) + 4 Na(+)(in) = Ca(2+)(in) + K(+)(in) + 4 Na(+)(out)

PMID 12379639 ↗ · PMID 26631410 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC24A4 被標示定位於細胞膜,屬多次跨膜蛋白;資料也列出細胞質定位。來源沒有提供定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm

PMID 26631410 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SLC24A4 的變異與 hypomaturation type 2A5 amelogenesis imperfecta 相關,疾病涉及乳齒及恆齒牙釉質形成異常。牙齒可呈亮澤、類瓊脂外觀,牙釉質較柔軟,且中層有棕色色素;來源將疾病描述為由影響此基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Amelogenesis imperfecta, hypomaturation type, 2A5 AI2A5 A defect of enamel formation. The disorder involves both primary and secondary dentitions. The teeth have a shiny agar jelly appearance and the enamel is softer than normal. Brown pigment is present in middle layers of enamel. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615887

PMID 23375655 ↗ · PMID 24621671 ↗ · PMID 25442250 ↗ · PMID 32034543 ↗ · PMID 32380970 ↗ · PMID 35055328 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000532405 · 10,388 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGCTGGCGCCCGCAGCCGAGAAGCCAGAGAGAAAGTT40
41CCCGGGGAGAGCTCGCCCCTGGGAGGGCCGACGTCGAGCC80
81TGCTCGCCGCGAGGGTCTCAGGTACCGCGCGTCCAGCCAG120
121CCTTCCCGCGGCGCGCACTCGGCCGCCCGGGCTCGGCTCG160
161TCGGGAAGCAGGGGAACATCGCCGGCTGGCAGCCGGGGCG200
201GCCGCCGCCAAACTTGGAGGAGGAGGATGCTGCGAGTGGG240
241CGCGGCGGCGCGGGGCGCGGGGGCGCACTGAGTGCTCCCT280
281ACGGCGCTGCTGCCAGGGCTGTGGCCGGGCGAGCCGGCCG320
321AAGCGGAGCGGGCAGGTAGCGGCTCTAGCGCCGGGACTGC360
361GCCAGCCCTGCGAGCCCGGGCCGCCAGCGCCACCGTGCCG400
401GCGTCGCCTCCTCGCCACGGAGCCATGGTGCGCGCAGCGC440
441GCACGCGGCGCGCGGGACTCTGAGCTCCGGCCGCGTCGCG480
481CGTCCCCACCTTCCCAAGGGGCTCCCCCGCCGACCTCGCC520
521CTCGGGCCATGAGGCTTTGGCCCGGAGCTCCTCGCCTCTG560
561AGTCGCGCACCGCCTGCTCCAGCCCCAGCGCCGCTCGGCC600
601ACTGATTGCACTCTGGCCGCTGAAGCTCCCCATCCTCTCC640
641CAGAGACGGCACCCAGGCGCTCCGGGATGGCGCTCCGCGG680
681GACCCTCCGGCCGCTCAAAGTTCGCAGGAGGCGAGAGATG720
721CTGCCGCAGCAAGTCGGCTTCGTGTGCGCGGTGCTGGCCC760
761TGGTGTGCTGTGCGTCCGGCCTCTTCGGCAGCTTGGGGCA800
801CAAAACAGCTTCTGCTAGCAAACGTGTCCTGCCAGACACG840
841TGGAGAAATAGAAAGTTGATGGCCCCAGTGAATGGGACAC880
881AGACAGCCAAGAACTGCACAGATCCTGCGATTCACGAGTT920
921CCCCACAGATCTGTTCTCCAATAAGGAGCGACAGCACGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。