演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC23A2SVCT2

solute carrier family 23 member 2

SLC23A2 編碼多次穿膜的鈉/抗壞血酸共運輸蛋白,能以每個抗壞血酸分子伴隨兩個 Na(+) 的方式,促進維生素 C 進入細胞。

Homo sapiens20p13UniProt Q9UGH3
OFFICIAL SYMBOL
SLC23A2
CHROMOSOME
20
UNIPROT
Q9UGH3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC23A2 是位於人類第 20 號染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於 nucleobase:cation symporter-2(NCS2)家族。其蛋白質全長 650 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,並包含延伸的細胞質區段;這些結構特徵與其作為膜運輸蛋白的性質相符。SLC23A2 的主要角色是協助細胞攝取維生素 C。

Official symbol
SLC23A2
Gene name
solute carrier family 23 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10973
UniProt
Q9UGH3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SVCT2KIAA0238YSPL2SLC23A1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020p13
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegSLC23A2pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:4,851,729–5,010,313
Gene span
158,585 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000338244 ★4,852,358–5,001,51017
ENST000003793334,851,729–5,010,29717
ENST000008779674,851,729–5,001,52818
ENST000008779684,851,729–5,001,52816
ENST000008779694,851,729–5,001,52817
ENST000008779704,851,729–5,001,52819
ENST000008779714,851,729–5,001,89517
ENST000008779724,851,729–5,001,52818
ENST000008779734,851,729–5,001,52816
ENST000008779744,851,729–5,001,52818
ENST000009226204,851,729–5,001,52815
ENST000009226214,851,729–5,001,52818

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC23A2 的蛋白質產物是鈉/抗壞血酸共運輸蛋白,負責將維生素 C 的形式之一 L-ascorbate 帶入細胞。這項運輸與 Na(+) 的共同移動相連,屬於電生性運輸,亦即跨膜運輸伴隨電荷移動。

其運輸方向可描述為 L-ascorbate 與 Na(+) 一同由細胞外移至細胞內。每轉運一個 L-ascorbate,會有兩個 Na(+) 同方向進入細胞,因此兩種物質的移動具有固定的 2:1 化學計量關係。這項比例說明了 SLC23A2 如何耦合鈉離子與抗壞血酸的跨膜通量;來源並未提供更細部的結合或構形變化機制。

藉由促進維生素 C 攝取,SLC23A2 參與細胞對此營養分子的輸入。現有資料支持其共運輸角色與特定的離子比例,但沒有進一步指出不同組織中的作用差異、調控條件,或該運輸對特定生理過程的下游影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 5001510 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC23A2 ENST00000338244 GRCh38 chr20:5001410-5002510 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTTTCTCAAGAGTTGCCCGGGAACTAGTACATTATCATTCAGTTAGTAAAGCAACCATGACAACGGTTT
CAAGATGGAAGGTGTTAAGAAAGTACTAATTATTAGAACATTTAAAAAATTGTATTCAGATTTCAGCAGT
GGCTCAATACGTGTGGTCCCCAGACCAGTAGCATCAGCATCACCTGGGAACTTGGCAGAAATGCAGATTC
TGGAGCCTCACGCCAGACCTCCAGCCTTAGCAACTCTGGGGGTGGGGCCCAGCCATCTGCATCTTAATGA
AGTCCTCAAAGTGAGGCTGCCCAGCTCTAAGACCGAGGGCCAGGGATTTACACTTGGCCTTTCTGCTTAG
CGGTCCAAGAACCTCACCCGGGGGCATCACCTGGGGACAATTTAGAAGTGCAGACTTTTGGGCTGCACCC
CAGAGCCACTGAATGTGAACCCGCCCCTAGCCTAACACGACCCCCAGAGAATTCACGTCTGAAAAGCCTT
GGTCTGTATTACGATCTCTGCATGAGGTAAGAAGGACTTCTTCTCCAGTTAGGTTAAAAAAACTGGCTAC
CTAAGTGGAGAAGCGGTGAAATTGTTTTAAAACATCCAACCCACTGAGCCCAATGCACCACAAACTGCTT
GCTTATCACGCTCGAGCAATGACAGGGCTCGGTGGCAGGCGGGGTAAAAAGGGGGGACCTGGACCAGGAC
ACTCAGGGACCAGCGCTCTGCTTGCCAGGTGGGTCCCCAGGAACAGGTGTGACTGGTGGGAAGGGTCGCG
AAGGGGGGCGATCTTTCTGCGCAGGGGAGGGAAATGAAAGGAACGGGAAGGGGACGGCTGGGTGCGAGGC
CCGGGATGTTCCGGGGAGCGCTGCCGGGTGCCAGGGAGCAGCCCCTCCCCGGGGGGAGGCCCGAGGGCAG
GGGTCGGGGGCGGGGAGGGAGGTGGGCCCCAGACCGGCGCGGGGGCGGGCGGCTCCGCTGCACCCCGCCC
CCGGCCCGCCCCTCCGCGGCGCCATTTTGCAGGCGGCTGTCGCGGGGACCGGAGGCGGAGGCTGCAGCGG
GCACTGCGGCGCCGAGGCGCGGCGGCAGGACGGGAACCACGCGAGCTGCAG
SLC23A2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC23A2_3 ↗20:4,949,963負股4,949,953–4,950,012
SLC23A2_1 ↗20:5,001,502負股5,001,492–5,001,551
SLC23A2_2 ↗20:5,010,313負股5,010,303–5,010,362

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_93ZKB · enhancer · 4998364–4998628 · regulatory

ENSR20_CHDQ · enhancer · 5000280–5001499 · regulatory

ENSR20_93ZL9 · promoter · 5001500–5002000 · regulatory

· motif · 4996809–4996821 · motif

· motif · 4996827–4996839 · motif

· motif · 4996837–4996849 · motif

· motif · 4996839–4996846 · motif

· motif · 4996839–4996852 · motif

· motif · 4997897–4997909 · motif

· motif · 4999668–4999680 · motif

· motif · 5000614–5000627 · motif

· motif · 5000774–5000785 · motif

· motif · 5001524–5001537 · motif

· motif · 5001552–5001565 · motif

· motif · 5001587–5001600 · motif

· motif · 5002420–5002432 · motif

· motif · 5005970–5005980 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:650 aa

1 aa650 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9UGH3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC23A2 蛋白質全長 650 個胺基酸,屬於 nucleobase:cation symporter-2(NCS2)家族。序列註解標示多段螺旋型跨膜區,並在細胞質側與細胞外側交錯分布;N 端另有一段預測為無序的區域。

拓樸區域Cytoplasmic9–110 aa
跨膜區Helical111–131 aa
拓樸區域Extracellular132–139 aa
跨膜區Helical140–160 aa
拓樸區域Cytoplasmic161–161 aa
跨膜區Helical162–182 aa
拓樸區域Extracellular183–218 aa
跨膜區Helical219–239 aa
拓樸區域Cytoplasmic240–266 aa
跨膜區Helical267–284 aa
拓樸區域Extracellular285–288 aa
拓樸區域Extracellular303–309 aa
跨膜區Helical310–330 aa
拓樸區域Cytoplasmic331–371 aa
跨膜區Helical372–392 aa
拓樸區域Extracellular393–417 aa
跨膜區Helical418–438 aa
拓樸區域Cytoplasmic439–461 aa
跨膜區Helical462–482 aa
拓樸區域Extracellular483–485 aa
跨膜區Helical486–506 aa
拓樸區域Cytoplasmic507–516 aa
跨膜區Helical517–537 aa
拓樸區域Extracellular538–547 aa
跨膜區Helical548–568 aa
拓樸區域Cytoplasmic569–650 aa
功能區域Disordered1–21 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UGH3…

AlphaFold · Q9UGH3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC23A2 位於細胞膜,並被註解為多次穿膜蛋白。 來源未提供定位隨條件變動或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SVCT2SLC23A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料記載 SLC23A2 與 CLSTN3 有交互作用,但未說明兩者是否直接結合、是否共同形成複合體,或其功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC23A2 是鈉/抗壞血酸共運輸蛋白,可促進維生素 C 的電生性攝取;每運輸一個抗壞血酸分子,會伴隨兩個 Na(+) 移動。含實驗來源
證據與來源

Sodium/ascorbate cotransporter. Mediates electrogenic uptake of vitamin C, with a stoichiometry of 2 Na(+) for each ascorbate

PMID 10471399 ↗ · PMID 10556521 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-ascorbate(out) + 2 Na(+)(out) = L-ascorbate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

L-ascorbate(out) + 2 Na(+)(out) = L-ascorbate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 10471399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC23A2 與 CLSTN3 有交互作用;此敘述未進一步說明交互作用的型態或功能意義。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CLSTN3

PMID 34673103 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC23A2 位於細胞膜,並被註記為多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 19379732 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000338244 · 6,953 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCATTTTGCAGGCGGCTGTCGCGGGGACCGGAGGCGGAG40
41GCTGCAGCGGGCACTGCGGCGCCGAGGCGCGGCGGCAGGA80
81CGGGAACCACGCGAGCTGCAGCCAGCTAGGTCTTGACTCC120
121ACTAACGGGGACTTCTCATACGGCTTTGAACTTGGACCTT160
161GGTGCATAAGCAAATGTAACTCAGCGAATTGTAATGGAAA200
201GCATATGGACAGGTCTACGCCACATCACTTAGGTGCTAAG240
241AGATGCCGTTTGCAGGCCTCATCTCTGCTTGAGAATCGGG280
281GGCTCCAGGCACTAGAAGAGCCGGCTGATCCTGGGCTCCT320
321AGCTTGAATAAGCCTTCACTTCCAGCTGCTCTCCCCAACG360
361GCTGTGTAAACTACTCGTTTCTCTTAATGATGGGTATTGG400
401TAAGAATACCACATCCAAATCAATGGAGGCTGGAAGTTCA440
441ACAGAAGGCAAATACGAAGACGAGGCAAAGCACCCAGCTT480
481TCTTCACTCTTCCGGTGGTGATAAATGGAGGCGCCACCTC520
521CAGCGGTGAGCAGGACAATGAGGACACTGAGCTCATGGCG560
561ATCTACACTACGGAAAACGGCATTGCAGAAAAGAGCTCTC600
601TCGCTGAGACCCTGGATAGCACTGGCAGTCTGGACCCCCA640
641GCGATCAGACATGATTTATACCATAGAAGATGTTCCTCCC680
681TGGTACCTGTGTATATTTCTGGGGCTACAGCACTACCTGA720
721CATGCTTCAGCGGCACGATCGCAGTGCCCTTCCTGTTGGC760
761CGATGCCATGTGTGTGGGGTACGACCAGTGGGCCACCAGC800
801CAGCTCATTGGGACCATTTTCTTCTGTGTGGGAATCACTA840
841CTTTGCTACAGACAACGTTTGGATGCAGGTTACCCCTGTT880
881TCAGGCCAGTGCTTTTGCATTTTTGGCCCCTGCTCGAGCC920
921ATCCTGTCTTTAGATAAATGGAAATGTAACACCACAGATG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。