演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC23A1YSPL3

solute carrier family 23 member 1

SLC23A1 編碼細胞膜上的多次跨膜轉運蛋白,主要以鈉離子協同運送維生素 C,也保留運送尿酸的能力。

Homo sapiens5q31.2UniProt Q9UHI7
OFFICIAL SYMBOL
SLC23A1
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q9UHI7
PDB / ALPHAFOLD
8JEW
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC23A1(solute carrier family 23 member 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 nucleobase:cation symporter-2(NCS2)家族。這類蛋白質參與陽離子與底物的協同轉運;SLC23A1 的蛋白質具有多個跨膜區段,構成其細胞膜轉運蛋白的基本架構。其主要角色是運送維生素 C,並保留部分對核鹼基類底物的祖先活性;尿酸是來源特別指出的此類底物之一。運輸時的底物選擇與鈉離子耦合,是理解其生理作用的核心。

Official symbol
SLC23A1
Gene name
solute carrier family 23 member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10974
UniProt
Q9UHI7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
YSPL3SVCT1SLC23A2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.2
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSLC23A1pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:139,366,642–139,385,495
Gene span
18,854 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000348729 ★139,367,196–139,383,29715
ENST00000353963139,366,642–139,383,29715
ENST00000882127139,366,642–139,385,49516
ENST00000882128139,366,642–139,384,52116
ENST00001139578139,366,642–139,383,29715
ENST00000882129139,371,255–139,384,52114
ENST00000504513139,378,591–139,380,6074
ENST00000508270139,381,913–139,384,5534

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC23A1 的主要功能是以鈉離子協同轉運 L-抗壞血酸,也就是維生素 C。這項運輸具有電生性,底物由細胞外移入細胞內時,每分子抗壞血酸伴隨兩個 Na(+) 一同進入。這種固定的化學計量關係說明,維生素 C 的攝取與鈉離子梯度相連,而非單獨移動抗壞血酸;來源並未進一步提供此梯度如何建立或調控的細節。

除了維生素 C,SLC23A1 也保留部分祖先性的核鹼基轉運活性。尿酸是氧化型嘌呤,也是來源列出的相關底物。與維生素 C 轉運相比,鈉離子-尿酸共轉運被描述為低親和力、高容量:這表示它對尿酸的親和力較低,但可承載較大的轉運量。尿酸由細胞外移入細胞內的反應式同樣列出每個尿酸分子伴隨兩個 Na(+) 進入。

根據這項尿酸轉運特性,SLC23A1 可能透過腎臟重吸收尿酸,參與調節血清尿酸濃度。這是來源提出的可能生理角色,而非對其調控效果的確定性結論;可支持的範圍限於其低親和力、高容量的鈉離子-尿酸共轉運,以及可能的腎臟尿酸重吸收作用。

資料另將 SLC23A1 描述為 inactive transporter。這項描述與其被記載具有維生素 C 和尿酸轉運活性的資料並列,因此不宜將前述運輸能力擴大解讀為所有情境下皆活躍,亦不能據此推定其活性狀態的條件或調控方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 139383297 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC23A1 ENST00000348729 GRCh38 chr5:139383197-139384297 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGGCCCAGCCCTCACCAGCTGAGGAGCCTGAGTTCTTAGGGCCCCTCCCCATGTCCCCCTCTGCCATCT
CAGGCCCTAGGGCCAGGCTGGGCTGGGCCTGCCAGGAGGGGAGACAGGCTGGGCATAGGACTGCCTTCCT
GGGCTAGGTGATGGGCAGTCACACAGGGCTTGGTGCATAGAAAGGCCCCACGCTCCATCTAATGCTCCTG
CTATCTTTAAATTCTTTATACTTTTGGAATAAAGGCCTCACATTCTTACTTTGCACTGGGTCCCAGAAAT
TATGTGGCTGGGAGGGGAAAGGGATCTGTGCCCTGACACAGAGTGCAGACCCGGCTGGGCCAGCCTAGGC
AGCTCTGCCTGCAGAGGCCCATCTGCTGCCTGCCTCAGGGACCCTGAGGGGTGCAGGGTGGTGAGGGCAA
GGCAGCTCAGACCAACCTGAATTTTAGGATTGGTTTCTGCAAACTTGCTATCTGCATGGCTTGGGTCAAA
TCACATCTACTGAATCTGTTTCCTTCGCTGTTAAAGGGGTTAATACCGCCCAGCACAGGGGTTACTTGGG
ACAGTGCAGATCCATGTTTCTTGGCACAAGGCCAAGGCCATTCCTCAATAACGAGAATGACTATGATGAT
GATGATAATGATGAACTAGTTATTAATCAGTGGGGAAGGGCCTCATACAGGGGGTTACATAATAAGTGCC
TGTTTCCACTCCCTCTTTCTCCGCTCACCTGGGGCTTGGTAAACTTCTGGTCCTCACCCCCTCGACTCTG
GCCCTCTCTTGGGAAACAAGAACAGGTCCAGCGCCCAGGCGCAGATGTGGGCAGGGAAGGGCACATGTGG
CAGAGGCTTGGGTGGCTTTTACTGTCCTAGTGAGAGTTAATACATTACCTCTGCCCGGGCCCCCCTTTCG
CAATCCAGAGCTGGGCATCTGGTTACAGATTTACTTCAAACAATGCCTGATATGTGGAGTAAAGTCCTCC
TCCTTGGCCTTTGTCAAGTCATCCCCTCTTCTCCTCAGGAACTGCTCAAACCTGTGCCCCAAAGATGAGG
GCCCAGGAGGACCTCGAGGGCCGGACACAGGTGCTGGGGGCTGGGGGTGGG
SLC23A1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC23A1_1 ↗5:139,383,297負股139,383,287–139,383,346
SLC23A1_2 ↗5:139,389,890負股139,389,880–139,389,939

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_943BPT · promoter · 139383282–139383787 · regulatory

ENSR5_CHSFT · enhancer · 139384788–139386415 · regulatory

ENSR5_537R773 · CTCF_binding_site · 139385881–139385902 · regulatory

ENSR5_943BR8 · promoter · 139387975–139388475 · regulatory

· motif · 139383318–139383333 · motif

· motif · 139383318–139383333 · motif

· motif · 139384676–139384684 · motif

· motif · 139384676–139384691 · motif

· motif · 139384676–139384693 · motif

· motif · 139385883–139385899 · motif

· motif · 139386295–139386308 · motif

· motif · 139386295–139386308 · motif

· motif · 139386398–139386413 · motif

· motif · 139386400–139386413 · motif

· motif · 139387097–139387108 · motif

· motif · 139387297–139387308 · motif

· motif · 139388255–139388267 · motif

· motif · 139388257–139388272 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:598 aa

1 aa598 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9UHI7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC23A1 蛋白質長 598 個胺基酸,屬於 nucleobase:cation symporter-2(NCS2)家族。序列註解顯示其含多段螺旋跨膜區,並在膜內外分布拓樸區段;N 端與 C 端部分區域則註解為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–52 aa
跨膜區Helical53–73 aa
拓樸區域Extracellular74–81 aa
跨膜區Helical82–102 aa
拓樸區域Cytoplasmic103–103 aa
跨膜區Helical104–124 aa
拓樸區域Extracellular125–159 aa
跨膜區Helical160–180 aa
拓樸區域Cytoplasmic181–207 aa
跨膜區Helical208–225 aa
拓樸區域Extracellular226–229 aa
拓樸區域Extracellular244–250 aa
跨膜區Helical251–271 aa
拓樸區域Cytoplasmic272–312 aa
跨膜區Helical313–333 aa
拓樸區域Extracellular334–358 aa
跨膜區Helical359–379 aa
拓樸區域Cytoplasmic380–402 aa
跨膜區Helical403–423 aa
拓樸區域Extracellular424–426 aa
跨膜區Helical427–447 aa
拓樸區域Cytoplasmic448–457 aa
跨膜區Helical458–478 aa
拓樸區域Extracellular479–490 aa
跨膜區Helical491–511 aa
拓樸區域Cytoplasmic512–598 aa
功能區域Disordered1–25 aa
功能區域Disordered579–598 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8JEW…

PDB · 8JEW

EM · 2.49 A · A=1-598

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC23A1 位於細胞膜,屬多次跨膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 40 個夥伴 · 最多顯示 50 個
YSPL3SLC23A1ADAMTSL4AHCYL1APBA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRHPRGRID2IPGRIP1GRIP2IL16KRT31KRTAP10-5KRTAP10-7KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP4-2LNX2MAGI1MAGI2MTUS2NCK1NOTCH2NLAPATJWHRNCYSRT1EFEMP2HOXA1KRT34KRT40KRTAP1-1KRTAP1-3KRTAP12-3KRTAP4-11KRTAP9-3MEOX2NOTCH2NLC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 40 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC23A1 可與鈉離子共同運送維生素 C,進行具電生性的攝取;每個抗壞血酸分子伴隨兩個 Na(+)。它也保留部分祖先性的核鹼基轉運活性,例如對氧化型嘌呤尿酸的作用。其鈉離子-尿酸共轉運屬低親和力、高容量,可能透過腎臟重吸收尿酸而參與調節血清尿酸濃度。含實驗來源
證據與來源

Sodium:ascorbate cotransporter. Mediates electrogenic uptake of vitamin C, with a stoichiometry of 2 Na(+) for each ascorbate. Has retained some ancestral activity toward nucleobases such as urate, an oxidized purine. Low-affinity high-capacity sodium:urate cotransporter, may regulate serum urate levels by serving as a renal urate re-absorber

PMID 10556483 ↗ · PMID 10556521 ↗ · PMID 10631088 ↗ · PMID 36749388 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能SLC23A1 被描述為非活化的轉運蛋白。含實驗來源
證據與來源

Inactive transporter

PMID 10556483 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-ascorbate(out) + 2 Na(+)(out) = L-ascorbate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

L-ascorbate(out) + 2 Na(+)(out) = L-ascorbate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 10556483 ↗ · PMID 10556521 ↗ · PMID 10631088 ↗ · PMID 36749388 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性urate(out) + 2 Na(+)(out) = urate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

urate(out) + 2 Na(+)(out) = urate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 36749388 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC23A1 是位於細胞膜的多次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 10631088 ↗ · PMID 19379732 ↗ · PMID 36749388 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000348729 · 2,296 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCCCCTCTTCTCCTCAGGAACTGCTCAAACCTGTGCCCC40
41AAAGATGAGGGCCCAGGAGGACCTCGAGGGCCGGACACAG80
81CATGAAACCACCAGGGACCCCTCGACCCCGCTACCCACAG120
121AGCCTAAGTTTGACATGTTGTACAAGATCGAGGACGTGCC160
161ACCTTGGTACCTGTGCATCCTGCTGGGCTTCCAGCACTAC200
201CTGACATGCTTCAGTGGTACCATCGCCGTGCCCTTCCTGC240
241TGGCTGAGGCGCTGTGTGTGGGCCACGACCAGCACATGGT280
281TAGTCAGCTCATCGGCACCATCTTCACGTGCGTGGGCATC320
321ACCACTCTCATCCAGACCACCGTGGGCATCCGGCTGCCGC360
361TGTTCCAGGCCAGTGCCTTTGCATTTCTGGTTCCAGCCAA400
401AGCCATACTGGCTCTGGAGAGATGGAAATGCCCCCCGGAA440
441GAGGAGATCTACGGTAACTGGAGTCTGCCCCTGAACACCT480
481CTCATATTTGGCACCCACGGATACGGGAGGTCCAGGGTGC520
521AATCATGGTGTCCAGCGTGGTGGAGGTGGTGATTGGCCTG560
561CTGGGGCTGCCTGGGGCCCTGCTCAACTACATTGGGCCTC600
601TCACAGTCACCCCCACTGTCTCCCTCATTGGCCTTTCTGT640
641CTTCCAAGCTGCTGGCGACCGAGCTGGCTCCCACTGGGGC680
681ATCTCAGCTTGCTCCATTCTCCTGATCATCCTCTTCTCCC720
721AGTACCTGCGCAACCTCACCTTCCTGCTGCCTGTCTACCG760
761CTGGGGCAAGGGCCTCACTCTCCTCCGCATCCAGATCTTC800
801AAAATGTTTCCTATCATGCTGGCCATCATGACCGTGTGGC840
841TGCTCTGCTATGTCCTGACCTTGACAGACGTGCTGCCCAC880
881AGACCCAAAAGCCTATGGCTTCCAGGCACGAACCGATGCC920
921CGTGGTGACATCATGGCTATTGCACCCTGGATCCGCATCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。