基因總覽
SLC22A7 是蛋白質編碼基因,產物屬於 major facilitator 超家族中的 Organic cation transporter 家族。蛋白質全長 548 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,符合多次穿越細胞膜的轉運蛋白特徵;其 C 端另有一段被註記為無序區。此蛋白亦稱 Organic anion transporter 2(OAT2)。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372585 ★ | 43,298,260–43,305,538 | 11 |
| ENST00000451757 | 43,297,998–43,300,066 | 6 |
| ENST00000372589 | 43,298,205–43,305,538 | 10 |
| ENST00000875170 | 43,298,205–43,305,543 | 10 |
| ENST00000875171 | 43,298,205–43,305,542 | 10 |
| ENST00000875172 | 43,298,205–43,305,542 | 9 |
| ENST00000875173 | 43,298,205–43,305,539 | 9 |
| ENST00000875174 | 43,298,205–43,305,537 | 8 |
| ENST00000875175 | 43,298,205–43,305,537 | 10 |
| ENST00000875176 | 43,298,205–43,305,537 | 10 |
| ENST00000875177 | 43,298,205–43,305,543 | 10 |
| ENST00000875178 | 43,298,205–43,305,537 | 9 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC22A7 的產物是 Na⁺ 非依賴性的多底物雙向轉運蛋白,能讓多類有機分子進出細胞。它參與腎臟與肝臟將內源性有機化合物由全身循環移除,分別進入尿液與膽汁。可運送的底物包括嘌呤、嘧啶鹼基、核苷及核苷酸,其中 cGMP、2′-deoxyguanosine 和 GMP 被列為偏好的底物。
對 cGMP 而言,SLC22A7 可進行雙向促進性轉運,且此作用不依賴 pH 或氯離子,因此可能調節細胞內外的 cGMP 濃度,並參與 cGMP 訊息傳遞。已列出的其他可運送核苷酸或相關分子包括 GDP、GTP、guanosine 與 cAMP;資料亦記錄其可轉運 2′-deoxyguanosine。這些底物顯示其運輸範圍涵蓋多種核苷酸與核苷,但除 orotate/glutamate 交換外,其他底物攝取所需的反向離子仍未確定。
在肝臟中,SLC22A7 介導 orotate 與 glutamate 的雙向交換,並可能具有將 glutamate 釋放至血液的生理功能。腎臟方面,它參與 creatinine 分泌,也可能參與其再吸收;此外能運送 urate 與 2-oxoglutarate。蛋白質可攝取 prostaglandin E2(PGE2),並可能有助於 PGE2 的腎臟排泄;另有資料指出它參與 prostaglandin F2-alpha(PGF2-alpha)的攝取。這些排泄與交換功能共同指出,SLC22A7 涉及多種內源性分子的體內移動;其中 PGE2 的相關作用仍屬可能性,而非確定結論。
Promoter 與基因調控
>SLC22A7 ENST00000372585 GRCh38 chr6:43297260-43298360 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTTTTCTTCAGCTCTGCTGCTGAGTCATTGTGTGACCCCAGCAGGTCCCCTCCCTGTCTTTAGTTTTCTG ACCTGTTCAAAGTAGGAGCTGGATTAAACCAGTGGGTCTGCCAGCTAAGTGTTTGGAGAATCAGATGAGA ATAAACCAGACATTGCTGGTTTCTGCTGTACTTTTGCTGCAGGGACCATGATTGAGAATTGAGTGGGAGG GTCAGATTGAACATTTGAGTCTTAGGTATTGCATGTACCTTTGACAAGACCTTGGTAACTCCCCCTCCCC CATTCCCTACCCCTCCAAAAGGTAATCTTAGGCATTGCAGGTACCTTGGCAACATGTCCCCCGCCATTCC CTATCCCTCCAAAAGGTAATTTAGGAAGCTGCTGGAAATAGGGGAATGGGACAGGCAGTTGGAACCATAT GTATGGGGAGAGTCCCTGAGTGAAGTGGGAATGGGATGAGCCTGGGATCCTCAGAGACATCAAGTTGCCC GGTGTGATCACAGGTGTGTCTTAGGCCAGGGCATCAGCTCCCAGCAGGGGAGAGGGATGCGAGGAGGCCT CATGGCTCAGCAGAAAGAAACCTGGTTAGGATCCAGCTTTCAGTCCTGAATCCTGGGCTGTCGGCCAGGC CATGGCTGTAGCTGCAAATAGGCAAGGCTGACCTAAGGTCTCACAGGACAAAGGGCACCCTGGGAGAGCT GGCCCCAGGCCCCAGGGGCCTCCTCTTCTTAGGGATCCTGGGAGCTCTGCTGACCAAGGGGCTAGGGGCT CACCTCCTATGCCATCACCCAGCTACCTCATCATGGTAGCCTTGGTCCCTGAACACTAATGGGTAAGCCC CAGAGCCACGAGCCAGTGACCTCTGAATGGATGGCTTCCCCTTCCCCCAGGCACCAGGCAAGACAGGTAG AGGTCCCTGGAGACCTGATGGCTGGGGAGGGCCCAGTCCTGGGCCAGCCCCTGAGGGCTGGATTCTGGCT GCAGGCTCTCCAGTCCATCCACTCCCACCTCCAGAGTCCAAGGGTCTATGTGGTGGGCAGTTTGAGCTGG CTGGATACTAGAGGGAGGCTGCACCTGAAGCATTTGGTGGGTGAGCAGCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC22A7_1 ↗ | 6:43,298,272 | 正股 | 43,298,223–43,298,282 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 43297933–43297946 · motif
· motif · 43297933–43297947 · motif
· motif · 43298257–43298267 · motif
· motif · 43298273–43298287 · motif
· motif · 43298273–43298288 · motif
· motif · 43299016–43299030 · motif
· motif · 43299016–43299030 · motif
· motif · 43300096–43300109 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:548 aa
SLC22A7 蛋白長 548 個胺基酸,具有 12 段註記為螺旋的跨膜區段。其第 522–548 位胺基酸區段被註記為無序區。此蛋白屬於 major facilitator 超家族的 Organic cation transporter 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 2 定位於細胞膜,在腎近端小管可見於基底外側,亦有資料記錄於腎小管頂端側。 Isoform 1 則定位於細胞質溶膠;兩種異構型的定位紀錄不同。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 20 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC22A7 是不依賴 Na⁺ 的多底物雙向轉運蛋白,參與腎臟及肝臟將內源性有機化合物排入尿液與膽汁。其底物涵蓋嘌呤、嘧啶鹼基、核苷及核苷酸,偏好 cGMP、2′-deoxyguanosine 和 GMP;可不依賴 pH 與氯離子地雙向轉運 cGMP,可能調節細胞內外 cGMP 並參與其訊息傳遞。它也介導 orotate/glutamate 交換,可能促進肝臟將 glutamate 釋入血液,並參與腎臟 creatinine 分泌及可能的再吸收。蛋白質可攝取 PGE2,可能有助其腎臟排泄,也可運送 2-oxoglutarate 與 urate;除 orotate/glutamate 交換外,其他底物攝取所需的反向離子仍未確定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a Na(+)-independent bidirectional multispecific transporter. Contributes to the renal and hepatic elimination of endogenous organic compounds from the systemic circulation into the urine and bile, respectively. Capable of transporting a wide range of purine and pyrimidine nucleobases, nucleosides and nucleotides, with cGMP, 2'deoxyguanosine and GMP being the preferred substrates. Functions as a pH- and chloride-independent cGMP bidirectional facilitative transporter that can regulate both intracellular and extracellular levels of cGMP and may be involved in cGMP signaling pathways. Mediates orotate/glutamate bidirectional exchange and most likely display a physiological role in hepatic release of glutamate into the blood. Involved in renal secretion and possible reabsorption of creatinine. Able to uptake prostaglandin E2 (PGE2) and may contribute to PGE2 renal excretion (Probable). Also transports alpha-ketoglutarate and urate. Apart from the orotate/glutamate exchange, the counterions for the uptake of other SLC22A7/OAT2 substrates remain to be identified PMID 11327718 ↗ · PMID 18216183 ↗ · PMID 21446918 ↗ · PMID 25904762 ↗ · PMID 26377792 ↗ · PMID 28945155 ↗ · PMID 11907186 ↗ |
| 功能 | 資料將此轉運蛋白標記為無功能。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | SLC22A7 參與攝取 prostaglandin F2-alpha(PGF2-alpha)。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | orotate(out) + L-glutamate(in) = orotate(in) + L-glutamate(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 3',5'-cyclic GMP(in) = 3',5'-cyclic GMP(out) | 含實驗來源 | 證據與來源3',5'-cyclic GMP(in) = 3',5'-cyclic GMP(out) PMID 18216183 ↗ · PMID 25904762 ↗ · PMID 26377792 ↗ · PMID 28945155 ↗ |
| 分子活性 | GMP(in) = GMP(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 2'-deoxyguanosine(in) = 2'-deoxyguanosine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | GDP(in) = GDP(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | guanosine(in) = guanosine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | GTP(in) = GTP(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 3',5'-cyclic AMP(in) = 3',5'-cyclic AMP(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | creatinine(in) = creatinine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | 2-oxoglutarate(in) = 2-oxoglutarate(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | glutarate(in) = glutarate(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | urate(out) = urate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | prostaglandin F2alpha(out) = prostaglandin F2alpha(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 2 是多次跨膜蛋白,定位於細胞膜。在腎臟中,它被記錄於近端小管的基底外側,也位於腎小管頂端側。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 2; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the basolateral side of the proximal tubules. Apical side of the renal tubule PMID 12023506 ↗ · PMID 25904762 ↗ · PMID 18216183 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1 定位於細胞質溶膠。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCCCACCTCCAGAGTCCAAGGGTCTATGTGGTGGGCAG40TTTGAGCTGGCTGGATACTAGAGGGAGGCTGCACCTGAAG80CATTTGGTGGGTGAGCAGCATGGGCTTTGAGGAGCTGCTG120GAGCAGGTGGGCGGCTTTGGGCCCTTCCAACTGCGGAATG160TGGCACTGCTGGCCCTGCCCCGAGTGCTGCTACCACTGCA200CTTCCTCCTGCCCATCTTCCTGGCTGCCGTGCCTGCCCAC240CGATGTGCCCTGCCGGGTGCCCCTGCCAACTTCAGCCATC280AGGATGTGTGGCTGGAGGCCCATCTTCCCCGGGAGCCTGA320TGGCACGCTCAGCTCCTGCCTCCGCTTTGCCTATCCCCAG360GCTCTCCCCAACACCACGTTGGGGGAAGAAAGGCAGAGCC400GTGGGGAGCTGGAGGATGAACCTGCCACAGTGCCCTGCTC440TCAGGGCTGGGAGTACGACCACTCAGAATTCTCCTCTACC480ATTGCAACTGAGTCCCAGTGGGATCTGGTGTGTGAGCAGA520AAGGTCTGAACAGAGCTGCGTCCACTTTCTTCTTCGCCGG560TGTGCTGGTGGGGGCTGTGGCCTTTGGATATCTGTCCGAC600AGGTTTGGGCGGCGGCGTCTGCTGCTGGTAGCCTACGTGA640GTACCCTGGTGCTGGGCCTGGCATCTGCAGCCTCCGTCAG680CTATGTAATGTTTGCCATCACCCGCACCCTTACTGGCTCA720GCCCTGGCTGGTTTTACCATCATCGTGATGCCACTGGAGC760TGGAGTGGCTGGATGTGGAGCACCGCACCGTGGCTGGAGT800CCTGAGCAGCACCTTCTGGACAGGGGGCGTGATGCTGCTG840GCACTGGTTGGGTACCTGATACGGGACTGGCGATGGCTTC880TGCTAGCTGTCACCCTGCCTTGTGCCCCAGGCATCCTCAG920CCTCTGGTGGGTGCCTGAGTCTGCACGCTGGCTTCTGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。