基因總覽
SLC22A6(solute carrier family 22 member 6)是蛋白質編碼基因,產物屬於 major facilitator 超家族中的 Organic cation transporter 家族。其蛋白質為多次穿膜蛋白,具有跨膜螺旋,分布於細胞膜;這種結構使其能參與細胞膜兩側的物質運輸。SLC22A6 的主要角色是運輸有機陰離子,運輸範圍涵蓋多種內源性分子及外來化合物。其功能與腎臟近端小管細胞的物質處理有關,也有資料指出它可能參與睪丸中的有機化合物運輸。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000360421 ★ | 62,976,597–62,984,967 | 10 |
| ENST00000377871 | 62,976,597–62,984,973 | 10 |
| ENST00000856538 | 62,976,597–62,984,973 | 10 |
| ENST00001142158 | 62,976,597–62,984,973 | 10 |
| ENST00000421062 | 62,976,794–62,984,690 | 10 |
| ENST00000458333 | 62,976,794–62,984,690 | 10 |
| ENST00001121496 | 62,982,777–62,984,973 | 2 |
| ENST00001111183 | 62,982,781–62,984,973 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC22A6 是鈉離子非依賴型的次級主動運輸蛋白,主要以有機陰離子/二羧酸反向運輸方式作用:細胞攝入一個有機陰離子分子時,會伴隨一個細胞內二羧酸分子排出,例如 2-oxoglutarate 或 glutarate。這種交換方式支持多種有機陰離子跨膜移動。
在腎臟近端小管上皮細胞,SLC22A6 介導有機陰離子由基底外側進入細胞,參與將全身循環中的內源性有機陰離子送往尿液排除。它也參與尿毒素及可能具毒性的外來化合物經腎臟有機陰離子分泌途徑的處理,可能有助減少這些物質對身體造成的不良毒理影響。相關運輸物包括 indoxyl sulfate、hippurate/N-benzoylglycine、indole acetate、CMPF、urate,以及黴菌毒素 ochratoxin。
其運輸底物不只限於排泄相關物質。SLC22A6 可運輸 tetrahydrobiopterin(BH4)、dihydrobiopterin(BH2)與 sepiapterin,參與這些輔因子的攝取及分泌至尿液,並影響血液中 biopterin 的基礎濃度。它也運輸 prostaglandin E2 與 prostaglandin F2-alpha,可能參與兩者的腎臟排泄;此外,資料指出它可介導 cAMP、cGMP 的攝取。
SLC22A6 亦參與神經活性 tryptophan 代謝物 kynurenate 與 xanthurenate 的運輸,可能有助它們由腦部分泌;是否運輸 glutamate 則仍屬可能性。另有資料指出,它可能參與有機化合物跨越血睪丸屏障的運輸。這些不同底物與組織相關的作用,顯示 SLC22A6 涉及多類分子的跨膜處理,但部分生理貢獻仍以可能性描述。
Promoter 與基因調控
>SLC22A6 ENST00000360421 GRCh38 chr11:62984867-62985967 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCGTGGTAGCACATGCCCATAATCCCAGCTACTCGGGAGGTTGAGGCATGATAATCACTTGAACCTGGGA GGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTGTGTCT CAAAAAGAAAGAGAAGAGAGGAGAAGAGAAGAGAAGAGGGGAGGAGAGGGGAGGGGAGCGAAGGGGAGGT GACAAAGGAGGGGAGGGGAGGGGAGAAGAGAAGAAAACAAGAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGACACTATGG ACAGAAGACAATATGACTAAGGGAAAAATCTGACCCTTGGAAGGGTCAGAAGAATCACTGGAAGAATCAC CCGACATTGTGTATGACGTTGGTCTTAGGTCCCACTCCAAGAGCGGCCTCTGACTTCTGTTGTTTCTTCC AAATGAATAAAACCATGGTTCTATAAGATGTGAGCTGTCCCCAGAAGAACAAAGACTGGGGTTGTCACAT TTAGCAAATAAAGATACAGGGTGCCCAGTCAAATTTGCATTTCAAATCAATGAAGAATTGCTTAGTATAA GTATGTCTCATGCAATATTAGAGACATACTCATACTTTTAAAAACTCTTCATTGACCTAAAATGCAAATT TGACTGGGCACCCTGTAATTTCCCTGGCAACCCTTCCCAAAAGCAGACTATTTGGATCTCATCCACTAAA AAGGGCAGAAACTCCTCAAGAGGCCACCACACTTCCCAGAGCCCAGTCTCCTTCCTAAAAGGAAGACAAA TAGGTCCAATAGATCCCACTCTGGCCCCCCCTGCCCCCAGATGCCCCCCTAATACACCCCTCTCCCTGCT CCTATTCAGTCCACCCTCTCCTGCCCTTTATAACCACTTGGAGAAATTCCACTGACACAAGGAATCCTTG GAGGGTTAATCCTTCTGATACCAAGTCACACTTTAACTCATTCCCTCCAGGCCAAGGATTAAAAACTGCC CATGCAAGGGTCAGGTCTCCAGCAGACCCTGAAAGCTGAGCTGCCCTGACCCCCAAAGTGAGGAGAAGCT GCAAGGGAAAAGGGAGGGACAGATCAGGGAGACCGGGGAAGAAGGAGGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC22A6_1 ↗ | 11:62,984,789 | 負股 | 62,984,779–62,984,838 |
| SLC22A6_2 ↗ | 11:62,984,967 | 負股 | 62,984,957–62,985,016 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:563 aa
SLC22A6 蛋白質長 563 個胺基酸,屬於 major facilitator 超家族及 Organic cation transporter 家族。序列註解指出其含多段螺旋型跨膜區,並交替排列細胞質側與細胞外側區段;C 端 525–563 位胺基酸區域被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC22A6 位於腎臟近端小管細胞的基底外側細胞膜;在 Sertoli 細胞則定位於基底細胞膜。 來源描述的是不同細胞類型中的膜定位,未提供定位改變的條件或動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 15 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC22A6 以不依賴 Na⁺ 的次級主動反向運輸方式,將有機陰離子帶入細胞並交換排出二羧酸;它參與腎臟處理多種內源性分子、尿毒素與外來化合物,也涉及 biopterin、前列腺素、環核苷酸及神經活性代謝物運輸。其腦部分泌、glutamate 運輸及睪丸屏障運輸的貢獻仍以可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secondary active transporter that functions as a Na(+)-independent organic anion (OA)/dicarboxylate antiporter where the uptake of one molecule of OA into the cell is coupled with an efflux of one molecule of intracellular dicarboxylate such as 2-oxoglutarate or glutarate. Mediates the uptake of OA across the basolateral side of proximal tubule epithelial cells, thereby contributing to the renal elimination of endogenous OA from the systemic circulation into the urine. Functions as a biopterin transporters involved in the uptake and the secretion of coenzymes tetrahydrobiopterin (BH4), dihydrobiopterin (BH2) and sepiapterin to urine, thereby determining baseline levels of blood biopterins. Transports prostaglandin E2 (PGE2) and prostaglandin F2-alpha (PGF2-alpha) and may contribute to their renal excretion. Also mediates the uptake of cyclic nucleotides such as cAMP and cGMP. Involved in the transport of neuroactive tryptophan metabolites kynurenate (KYNA) and xanthurenate (XA) and may contribute to their secretion from the brain. May transport glutamate. Also involved in the disposition of uremic toxins and potentially toxic xenobiotics by the renal organic anion secretory pathway, helping reduce their undesired toxicological effects on the body. Uremic toxins include the indoxyl sulfate (IS), hippurate/N-benzoylglycine (HA), indole acetate (IA), 3-carboxy-4- methyl-5-propyl-2-furanpropionate (CMPF) and urate. Xenobiotics include the mycotoxin ochratoxin (OTA). May also contribute to the transport of organic compounds in testes across the blood-testis-barrier PMID 11669456 ↗ · PMID 11907186 ↗ · PMID 14675047 ↗ · PMID 22108572 ↗ · PMID 23832370 ↗ · PMID 26377792 ↗ · PMID 28534121 ↗ · PMID 35307651 ↗ · PMID 9887087 ↗ · PMID 9950961 ↗ |
| 分子活性 | (6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin(out) + a dicarboxylate(in) = (6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源(6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin(out) + a dicarboxylate(in) = (6R)-L-erythro-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin(in) + a dicarboxylate(out) PMID 28534121 ↗ |
| 分子活性 | L-erythro-7,8-dihydrobiopterin(out) + a dicarboxylate(in) = L-erythro-7,8-dihydrobiopterin(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源L-erythro-7,8-dihydrobiopterin(out) + a dicarboxylate(in) = L-erythro-7,8-dihydrobiopterin(in) + a dicarboxylate(out) PMID 28534121 ↗ |
| 分子活性 | L-sepiapterin(out) + a dicarboxylate(in) = L-sepiapterin(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源L-sepiapterin(out) + a dicarboxylate(in) = L-sepiapterin(in) + a dicarboxylate(out) PMID 28534121 ↗ |
| 分子活性 | prostaglandin F2alpha(out) + a dicarboxylate(in) = prostaglandin F2alpha(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源prostaglandin F2alpha(out) + a dicarboxylate(in) = prostaglandin F2alpha(in) + a dicarboxylate(out) PMID 11907186 ↗ |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) + a dicarboxylate(in) = prostaglandin E2(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源prostaglandin E2(out) + a dicarboxylate(in) = prostaglandin E2(in) + a dicarboxylate(out) PMID 11907186 ↗ |
| 分子活性 | 3',5'-cyclic AMP(out) + a dicarboxylate(in) = 3',5'-cyclic AMP(in) + a dicarboxylate(out) | 推論支持 | 證據與來源3',5'-cyclic AMP(out) + a dicarboxylate(in) = 3',5'-cyclic AMP(in) + a dicarboxylate(out) |
| 分子活性 | 3',5'-cyclic GMP(out) + a dicarboxylate(in) = 3',5'-cyclic GMP(in) + a dicarboxylate(out) | 推論支持 | 證據與來源3',5'-cyclic GMP(out) + a dicarboxylate(in) = 3',5'-cyclic GMP(in) + a dicarboxylate(out) |
| 分子活性 | urate(out) + a dicarboxylate(in) = urate(in) + a dicarboxylate(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | kynurenate(out) + glutarate(in) = kynurenate(in) + glutarate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源kynurenate(out) + glutarate(in) = kynurenate(in) + glutarate(out) PMID 22108572 ↗ · PMID 23832370 ↗ |
| 分子活性 | (indol-3-yl)acetate(out) + a dicarboxylate(in) = (indol-3-yl)acetate(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源(indol-3-yl)acetate(out) + a dicarboxylate(in) = (indol-3-yl)acetate(in) + a dicarboxylate(out) PMID 14675047 ↗ |
| 分子活性 | indoxyl sulfate(out) + a dicarboxylate(in) = indoxyl sulfate(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源indoxyl sulfate(out) + a dicarboxylate(in) = indoxyl sulfate(in) + a dicarboxylate(out) PMID 14675047 ↗ |
| 分子活性 | N-benzoylglycine(out) + a dicarboxylate(in) = N-benzoylglycine(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源N-benzoylglycine(out) + a dicarboxylate(in) = N-benzoylglycine(in) + a dicarboxylate(out) PMID 14675047 ↗ |
| 分子活性 | 3-carboxy-4-methyl-5-propyl-2-furanpropanoate(out) + a dicarboxylate(in) = 3-carboxy-4-methyl-5-propyl-2-furanpropanoate(in) + a dicarboxylate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源3-carboxy-4-methyl-5-propyl-2-furanpropanoate(out) + a dicarboxylate(in) = 3-carboxy-4-methyl-5-propyl-2-furanpropanoate(in) + a dicarboxylate(out) PMID 14675047 ↗ |
| 細胞定位 | SLC22A6 是多次穿膜蛋白,在腎臟近端小管細胞定位於基底外側膜;在 Sertoli 細胞則位於基底膜。這些定位資料分別描述兩種細胞中的膜位置,未指出定位變化的條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the basolateral membrane of renal proximal tubular cells. Localized to the basal membrane of Sertoli cells PMID 9887087 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCAGACCCTGAAAGCTGAGCTGCCCTGACCCCCAAAGTG40AGGAGAAGCTGCAAGGGAAAAGGGAGGGACAGATCAGGGA80GACCGGGGAAGAAGGAGGAGCAGCCAAGGAGGCTGCTGTC120CCCCCACAGAGCAGCTCGGACTCAGCTCCCGGAGCAACCC160AGCTGCGGAGGCAACGGCAGTGCTGCTCCTCCAGCGAAGG200ACAGCAGGCAGGCAGACAGACAGAGGTCCTGGGACTGGAA240GGCCTCAGCCCCCAGCCACTGGGCTGGGCCTGGCCCAATG280GCCTTTAATGACCTCCTGCAGCAGGTGGGGGGTGTCGGCC320GCTTCCAGCAGATCCAGGTCACCCTGGTGGTCCTCCCCCT360GCTCCTGATGGCTTCTCACAACACCCTGCAGAACTTCACT400GCTGCCATCCCTACCCACCACTGCCGCCCGCCTGCCGATG440CCAACCTCAGCAAGAACGGGGGGCTGGAGGTCTGGCTGCC480CCGGGACAGGCAGGGGCAGCCTGAGTCCTGCCTCCGCTTC520ACCTCCCCGCAGTGGGGACTGCCCTTTCTCAATGGCACAG560AAGCCAATGGCACAGGGGCCACAGAGCCCTGCACCGATGG600CTGGATCTATGACAACAGCACCTTCCCATCTACCATCGTG640ACTGAGTGGGACCTTGTGTGCTCTCACAGGGCCCTACGCC680AGCTGGCCCAGTCCTTGTACATGGTGGGGGTGCTGCTCGG720AGCCATGGTGTTCGGCTACCTTGCAGACAGGCTAGGCCGC760CGGAAGGTACTCATCTTGAACTACCTGCAGACAGCTGTGT800CAGGGACCTGCGCAGCCTTCGCACCCAACTTCCCCATCTA840CTGCGCCTTCCGGCTCCTCTCGGGCATGGCTCTGGCTGGC880ATCTCCCTCAACTGCATGACACTGAATGTGGAGTGGATGC920CCATTCACACACGGGCCTGCGTGGGCACCTTGATTGGCTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。