基因總覽
solute carrier family 22 member 3(SLC22A3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 major facilitator 超家族中的有機陽離子轉運蛋白家族。此蛋白為多次跨膜膜蛋白,具有七段來源註記為螺旋型跨膜區域,並含有一段富含脯胺酸的序列。其基本角色是運送多種有機陽離子;底物包括內源性生物胺、陽離子藥物及外源性化合物。蛋白質的多跨膜特徵與其跨膜運輸角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000275300 ★ | 160,348,378–160,452,577 | 11 |
| ENST00000855212 | 160,348,325–160,452,577 | 7 |
| ENST00000855213 | 160,348,325–160,452,577 | 7 |
| ENST00000855214 | 160,348,325–160,452,577 | 12 |
| ENST00001107254 | 160,348,325–160,444,357 | 9 |
| ENST00001107260 | 160,348,325–160,437,453 | 7 |
| ENST00001120216 | 160,348,325–160,431,148 | 6 |
| ENST00001120217 | 160,348,325–160,429,825 | 6 |
| ENST00001120218 | 160,348,325–160,429,293 | 6 |
| ENST00001120219 | 160,348,325–160,398,571 | 3 |
| ENST00001120220 | 160,348,325–160,391,841 | 2 |
| ENST00001122161 | 160,348,325–160,444,352 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC22A3 產物是電生性的電壓依賴型單向轉運蛋白,但可朝兩個方向運送底物;其運輸不依賴 Na(+) 或 Cl(-)。陽離子的攝取或釋放由電化學勢驅動,亦即受到膜電位與濃度梯度影響。因此,運輸方向取決於跨膜條件,而非固定只將底物送入或送出細胞。
其底物涵蓋多種單胺神經傳導物質,包括 dopamine、adrenaline/epinephrine、noradrenaline/norepinephrine、histamine、serotonin 與 tyramine。這些運輸作用支持 SLC22A3 參與腦部胺能神經傳導的恆定調節。它也可運送多胺 agmatine,且具雙向運輸特性;另有 spermidine、putrescine、guanidine 與 choline 的運輸註記。關於 spermidine 與 putrescine 的資料標示為相似性推論。
SLC22A3 亦能運送與多巴胺調節相關的 cyclo(his-pro) 和 salsolinol,但效率偏低。這些底物與其他胺類及有機陽離子共同顯示其運輸範圍不只限於典型單胺。來源也指出,此蛋白可能參與腎臟自血流攝取並處置陽離子化合物;在睪丸中則可能協助調節陽離子化合物跨越血睪屏障的運輸。
由於 SLC22A3 也定位於內膜系統,來源提出它可能參與細胞內有機陽離子的運輸,進而影響胺類代謝與細胞內訊號傳遞;這項作用以相似性推論呈現,應視為可能功能,而非確定結論。
Promoter 與基因調控
>SLC22A3 ENST00000275300 GRCh38 chr6:160347378-160348478 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGAACGTGGGCCGATAACGTGGGGGCGTGGGGGGACCGCGACCCAGCCCGGGGAAGGCGTCCCAGCATG GACCCAGCAGCCTGGGCAGCCTGGGCGGGAAGTTCTGATCGCGCTCTGCCGAATTGGCAGGCGCAATAAG TAAGCGGAAAAACCAGGATTCAAACCAACCACCAACACCCTTCCCTGGCGTTCAGACCGAAGGTGGGTGG GAAGGCCCTGGCGAAGGAGGTCTGCATCAGGCCTGGCCTTGAGGCGATCCCTTCTCACCCCAAACCTCCT GGACGCTGAGCAAGCCCCTTCGCCTGTGTGGGTTGCCCGGCTGCCCTCTGGGGAAAGTTGGGTGATCAAA TCCCAAGTTGTAGCTCTCGATGGGTCGAGGGCGATGGCCAGCGCTGTGCTGGGAACGGGCAGCCCTGCCC TGCCCTGCCCTGCCCTGCCCTGCCCTGCCCTGCCCTGCCCCACATGGGCGCAGGAGGCCTCCGCACGCGC AAGGGCCAAGGGCTGGAGGGGGCTCTCCCGGGCACAGGCACCGGACCCGGGGCGCGCGCGCGCGTCCTTA GTCCCCGGGCTGCACTCCGGGCCGCTGAGAGATCGGGTCCCAGAAGTTCCGGGAGTGGTCGGGTGACCCT GGAACTTTCTTCTTCTGGAGCCCGACCTGGGGCTGACTGCAGAGCAGGCTGCTGGCAGGGACCAAAAGGA GCTCCGCGCCAGGCCGGAGGCTGCGCCCGTCACTCGCGGTCCCGGCCGGGTCCCTGGCGCGTAGTCAGGC CGCACCGCCCGAGCCCCACCGCGCGCCCACCCCGGCCGGGTGCGTCCGGCTCGCGGCCGTCCCTCCCGCG ACCTGTGGCCCGGGGCTGCTGCGGGCGCCCGGGGAAGAGAGGCGGGGGCCGCGGGGGGCAGGAGGAGCGG CTGCGGCCGGCACAGCGCCAGGGCGAGTGAGGCGGGTGGCGCGGGGGAGGCGGCGGAGTAAAGAGAGGCC GCCGGCTGGGTCCGCGGGTCACTCCGAGGCGCGGGCTGCGGGCGGCGGGCGGCGGGCGCACCATGCCCTC CTTCGACGAGGCGCTGCAGCGGGTGGGCGAGTTCGGGCGCTTCCAGAGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC22A3_2 ↗ | 6:160,348,252 | 正股 | 160,348,203–160,348,262 |
| SLC22A3_1 ↗ | 6:160,348,378 | 正股 | 160,348,329–160,348,388 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:556 aa
SLC22A3 蛋白長 556 個胺基酸,屬於 major facilitator 超家族的有機陽離子轉運蛋白家族。序列註記包含七段螺旋型跨膜區域,以及位於第 289 至 293 位胺基酸的富脯胺酸序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC22A3 可位於細胞膜的頂端或基底外側區域,也見於內膜系統及多種膜性區室。 在腸道,enterocytes 的刷狀緣膜可見此蛋白;在支氣管上皮,不同細胞類型的膜分布有所差異:纖毛上皮細胞位於腔面/頂端膜,中間細胞位於基底外側膜,而基底細胞分布於整個質膜。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- ABL1P00519 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 14 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC22A3 是電生性、電壓依賴且不依賴 Na(+) 與 Cl(-) 的雙向單向轉運蛋白,依膜電位及濃度梯度形成的電化學勢運送多種有機陽離子。底物包括多種單胺、多胺、guanidine 與 choline;cyclo(his-pro) 和 salsolinol 的運輸效率較低。它可能參與腎臟清除陽離子化合物、睪丸血睪屏障運輸,以及內膜系統中的細胞內運輸;部分功能為相似性推論或可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Electrogenic voltage-dependent uniporter that mediates the transport of a variety of organic cations such as endogenous bioactive amines, cationic drugs and xenobiotics. Cation cellular uptake or release is driven by the electrochemical potential, i.e. membrane potential and concentration gradient. Functions as a Na(+)- and Cl(-)-independent, bidirectional uniporter. Implicated in monoamine neurotransmitters uptake such as dopamine, adrenaline/epinephrine, noradrenaline/norepinephrine, histamine, serotonin and tyramine, thereby supporting a role in homeostatic regulation of aminergic neurotransmission in the brain. Transports dopaminergic neuromodulators cyclo(his-pro) and salsolinol with low efficiency. May be involved in the uptake and disposition of cationic compounds by renal clearance from the blood flow. May contribute to regulate the transport of cationic compounds in testis across the blood-testis-barrier (Probable). Mediates the transport of polyamine spermidine and putrescine (By similarity). Mediates the bidirectional transport of polyamine agmatine. Also transports guanidine. Mediates the transport of choline. May mediate intracellular transport of organic cations due to its localization on endomembranes, thereby contributing to amine metabolism and intracellular signaling (By similarity) PMID 10196521 ↗ · PMID 10966924 ↗ · PMID 12538837 ↗ · PMID 16581093 ↗ · PMID 17460754 ↗ · PMID 20858707 ↗ · PMID 40972734 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
| 分子活性 | (R)-noradrenaline(out) = (R)-noradrenaline(in) | 含實驗來源 | 證據與來源(R)-noradrenaline(out) = (R)-noradrenaline(in) PMID 10196521 ↗ · PMID 16581093 ↗ · PMID 20858707 ↗ |
| 分子活性 | (R)-adrenaline(out) = (R)-adrenaline(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | serotonin(out) = serotonin(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | dopamine(out) = dopamine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | histamine(out) = histamine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | tyramine(in) = tyramine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | guanidine(out) = guanidine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | agmatine(out) = agmatine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | spermidine(in) = spermidine(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-histidyl-L-proline diketopiperazine(in) = L-histidyl-L-proline diketopiperazine(out) | 含實驗來源 | 證據與來源L-histidyl-L-proline diketopiperazine(in) = L-histidyl-L-proline diketopiperazine(out) PMID 17460754 ↗ |
| 分子活性 | (R)-salsolinol(in) = (R)-salsolinol(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | choline(out) = choline(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC22A3 註記於細胞膜、粒線體膜、內膜系統及核膜等位置。在腸道 enterocytes 中可見於頂端刷狀緣膜;在支氣管上皮,纖毛細胞位於腔面/頂端膜,中間細胞位於基底外側膜,基底細胞則分布於整個質膜,顯示其質膜分布依細胞類型而異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Mitochondrion membrane; Endomembrane system; Nucleus membrane; Nucleus outer membrane; Localized to the apical/brush border membrane of enterocytes. Localized to the luminal/apical membrane of ciliated epithelial cells in bronchi. Localized to the basolateral membrane of intermediate cells in bronchi. Localized to the entire plasma membrane of basal cells in bronchi PMID 15817714 ↗ · PMID 20858707 ↗ · PMID 16263091 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCCGAGGCGCGGGCTGCGGGCGGCGGGCGGCGGGCGCA40CCATGCCCTCCTTCGACGAGGCGCTGCAGCGGGTGGGCGA80GTTCGGGCGCTTCCAGAGGCGCGTGTTTTTGCTGCTGTGC120CTGACGGGCGTCACCTTCGCCTTCCTCTTCGTCGGCGTGG160TCTTCCTGGGCACGCAGCCCGACCACTACTGGTGCCGCGG200GCCAAGTGCCGCGGCGCTGGCCGAGCGCTGCGGCTGGAGC240CCGGAGGAGGAGTGGAACCGCACGGCGCCCGCCTCCCGCG280GCCCAGAGCCCCCCGAGCGCCGCGGCCGCTGCCAGCGCTA320CCTCCTGGAGGCGGCCAACGACAGCGCCTCCGCCACTAGC360GCTCTCAGCTGCGCGGACCCACTCGCCGCCTTCCCCAACC400GCTCGGCTCCCCTTGTGCCGTGCCGCGGCGGCTGGCGCTA440CGCCCAGGCCCACTCCACCATCGTCAGCGAGTTTGACCTT480GTCTGTGTCAATGCGTGGATGCTGGACCTCACCCAAGCCA520TCCTGAACCTCGGCTTCCTGACTGGAGCATTCACCTTAGG560CTATGCAGCAGACAGGTATGGCAGGATCGTCATTTACTTG600CTATCCTGCCTTGGTGTTGGCGTCACTGGGGTTGTGGTGG640CCTTTGCACCAAACTTCCCTGTGTTTGTGATCTTCCGCTT680CCTGCAAGGTGTATTTGGAAAGGGGACGTGGATGACTTGC720TACGTGATTGTGACAGAAATAGTAGGTTCGAAACAAAGGA760GGATTGTGGGAATCGTGATTCAAATGTTCTTTACCCTTGG800AATCATAATTCTCCCTGGAATTGCCTACTTCATCCCCAAC840TGGCAAGGAATCCAGTTAGCCATCACGCTGCCCAGCTTTC880TCTTCCTCCTTTATTACTGGGTGGTCCCTGAGTCTCCCCG920TTGGCTGATTACTCGGAAGAAAGGAGATAAAGCATTACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。