演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC22A1OCT1

solute carrier family 22 member 1

SLC22A1 編碼 Organic cation transporter 1,屬於 major facilitator 超家族。此多次穿膜轉運蛋白可運送多種有機陽離子,參與肝臟、腎臟及其他上皮細胞的物質運輸。

Homo sapiens6q25.3UniProt O15245
OFFICIAL SYMBOL
SLC22A1
CHROMOSOME
6
UNIPROT
O15245
PDB / ALPHAFOLD
8ET6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC22A1 的產物為 Organic cation transporter 1,是一種有機陽離子轉運蛋白,歸屬於 major facilitator 超家族中的 Organic cation transporter 家族。蛋白質長 554 個胺基酸,具有多段穿膜螺旋,構成跨膜運輸所需的膜蛋白架構;序列另註有一段富含脯胺酸的序列。其基本角色是運送多類有機陽離子,底物包括內源性分子及外來化合物。SLC22A1 主要在肝細胞與腎近端小管細胞的基底外側膜表現,也見於腸道與呼吸道上皮等細胞的膜區域。

Official symbol
SLC22A1
Gene name
solute carrier family 22 member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10963
UniProt
O15245
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
OCT1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q25.3
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSLC22A1pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:160,121,372–160,160,590
Gene span
39,219 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000366963 ★160,121,815–160,158,71811
ENST00000898295160,121,372–160,159,39811
ENST00000898296160,121,372–160,159,3989
ENST00000898297160,121,372–160,158,72011
ENST00000898298160,121,372–160,158,71212
ENST00000898299160,121,372–160,158,7109
ENST00000898300160,121,372–160,158,74011
ENST00000898301160,121,372–160,158,72011
ENST00000898302160,121,372–160,158,72011
ENST00000898303160,121,372–160,158,7129
ENST00000898304160,121,372–160,158,71212
ENST00000898305160,121,372–160,158,71210

顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC22A1 是具電生性的電壓依賴型單向轉運蛋白,可運送多種有機陽離子。其運輸方向可雙向進行,且不依賴 pH 或 Na⁺;陽離子的進入或釋出受電化學勢影響,包括膜電位與濃度梯度。此類底物及抑制劑的辨識,也與其疏水性有關。上述雙向特性與部分運輸機制為相似性推論。

其底物範圍涵蓋內源性單胺與其他含氮分子,例如 N-1-methylnicotinamide、guanidine、histamine、dopamine、serotonin 和 adrenaline;也能運送天然多胺 spermidine、agmatine 與 putrescine,後者幾種多胺的親和力較低,但周轉率相對較高。另有 choline、thiamine,以及環狀神經調節物 cyclo(his-pro) 和 salsolinol 等底物;後兩者的運輸效率較低。它也能運送非胺類內源性分子 prostaglandin E2 與 prostaglandin F2-alpha。

在生理作用上,SLC22A1 參與肝細胞與腎近端小管對陽離子化合物的攝取與處置,與這些器官從血流清除相關物質有關。它參與肝臟攝取 thiamine,並因此涉及肝臟脂質及能量代謝調節;在腸細胞中則可能作為攝取載體,協助將全身循環中的有機陽離子排除至腸道。這項腸道角色以可能性描述,並非確定結論。

在支氣管上皮的纖毛細胞中,SLC22A1 可雙向運輸 acetylcholine,並參與 acetylcholine 向氣道腔面的釋出。它也參與多種外來陽離子的運輸,包括 quinidine、N-methyl-quinine、N-methyl-quinidine 與其他列示化合物。至於睪丸中跨越血睪障壁運送陽離子化合物,來源僅指出可能有所貢獻。對 1-methyl-4-phenylpyridinium(MPP⁺)的攝取能力,資料同時記載可介導攝取及不能攝取,未提供足以釐清差異的條件,因此不能據此概括其運輸能力。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 160121815 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC22A1 ENST00000366963 GRCh38 chr6:160120815-160121915 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATGATACATTTTACTCTCCTTACTCACCTCACGTGTAGATCTGTTTTCAGTAGTCATCACTACATGTTAT
AATGGTAGCTCTTAGTAATTGTTAATTTTGGTGAAATACCCAGTAAGTTATTTTAGTTACGTACTTAGGT
GCAGATGAGGTCTAACTATTTCCAGCATAGCTAGGGCAGGCCCTACCAAACTGCAAAGCAGGAAAGTTGA
ACAATTTTCAAAAGCCAAAGCAGTTTATGACCTTAAAGCATTTAGTCAACCTAGTTTCTGACTTGCATAA
TTTAGACCATGTCTATATTTTGAAGACATTTCTATTTTCATTTTACTGATAATTTAAAAGACAGCCTATT
TAGCAAAGTCATACTTAAGTGAATTTGAAAATTGCTTAGACTTATTTACTTAATTTATGAACACTCTTTT
ACTTATAAGCCAATTTGGTAGACACAACATATAACAGTAAGTGTACATACAAGTAAACACATCTAGACAT
GTATACACACACACAAATGAAGAGGTGGAGCTTAAAACACCCAAATTGGGTGCAGTGTATACTGCTTGGG
AGATGGATGCACCAAAATCTCACAAATCACCACTAAAGAACCTGCTCATGTAACCAAATAATACCTGTTC
CCTCAAAACCTATGGGAAAAAAAAACTAAAAAAAATACTTAAATGGTATCACAGAACTAATTAGCCGAAT
ACAGTATCTAGTACCTGGCTGTCACCCAATACTTGCCTCATACCATCACATCTAGAAAACAAGTAGATAT
TCTTTTTGGAAGAGCCCTGAGGGAGCTACTAGGAGGTTTGCACGGCCTGCTCTCCTGCCCTCTTCTTGCT
CTGTGGCTGAACTTCAATTCTCTTCGGGCTTAGACCCCACTGACTCGCTCCCGGGCAAAGCAAACGATTT
GATCAGATGGCCACGTGCATTCTTCCTTTTCCTGAAACCAGCACCATAGGGTAAAAGATTATTTCTACTT
GGTTGCCTTCCAGATGTTTCACACTTGGACAGCAAACTGATTTCAAACCACTCCTTTTCAAAGATCTCTG
AGGGAGACATTGCACCTGGCCACTGCAGCCCAGAGCAGGTCTGGCCACGGC
SLC22A1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC22A1_2 ↗6:160,121,674正股160,121,625–160,121,684
SLC22A1_1 ↗6:160,121,886正股160,121,837–160,121,896

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 160120232–160120247 · motif

· motif · 160124144–160124157 · motif

· motif · 160125165–160125178 · motif

在肝臟中,SLC22A1 受 HNF4A 活化;膽汁酸則可經由 NR0B2 抑制其表現。此外,肝細胞經膽固醇處理後,SLC22A1 表現增加。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:554 aa

1 aa554 aa基序跨膜區拓樸區域
依 O15245 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Organic cation transporter 1 長 554 個胺基酸,屬於 major facilitator 超家族的 Organic cation transporter 家族。序列註解包含多段穿膜螺旋,並在第 283–287 位胺基酸附近標示富含脯胺酸的序列。

拓樸區域Cytoplasmic1–21 aa
跨膜區Helical22–42 aa
拓樸區域Extracellular43–149 aa
跨膜區Helical150–170 aa
拓樸區域Cytoplasmic171–176 aa
跨膜區Helical177–197 aa
拓樸區域Extracellular198–206 aa
跨膜區Helical207–229 aa
拓樸區域Cytoplasmic230–235 aa
跨膜區Helical236–256 aa
拓樸區域Extracellular257–262 aa
跨膜區Helical263–283 aa
拓樸區域Cytoplasmic284–347 aa
跨膜區Helical348–368 aa
拓樸區域Extracellular369–376 aa
跨膜區Helical377–397 aa
拓樸區域Cytoplasmic398–402 aa
跨膜區Helical403–423 aa
拓樸區域Extracellular424–431 aa
跨膜區Helical432–452 aa
拓樸區域Cytoplasmic453–464 aa
跨膜區Helical465–485 aa
拓樸區域Extracellular486–492 aa
跨膜區Helical493–513 aa
拓樸區域Cytoplasmic514–554 aa
基序Proline-rich sequence283–287 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8ET6…

PDB · 8ET6

EM · 3.57 A · A=1-554

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Basolateral cell membrane;Apical cell membrane;Lateral cell membrane;Basal cell membrane;Cell membrane

SLC22A1 在肝細胞主要位於竇狀/基底外側膜;腎近端小管細胞以基底外側膜為主,但也曾在頂端側觀察到。 腸細胞中主要位於側膜,亦見於頂端側;支氣管纖毛上皮細胞中則位於腔面/頂端膜。 Sertoli 細胞的基底膜也有定位紀錄。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
OCT1SLC22A1CERS2SMIM3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

21 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 21 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC22A1 是電生性、電壓依賴的有機陽離子轉運蛋白,可雙向運輸,且不依賴 pH 或 Na⁺;運輸受膜電位與濃度梯度影響,底物辨識與疏水性有關。它涉及肝腎清除、腸道攝取、thiamine 運輸及多類內源性分子與外來化合物的運輸;部分作用僅屬可能或相似性推論。含實驗來源
證據與來源

Electrogenic voltage-dependent uniporter that mediates the transport of a variety of organic cations such as endogenous bioactive amines, cationic drugs and xenobiotics. Functions as a pH- and Na(+)-independent, bidirectional transporter (By similarity). Cation cellular uptake or release is driven by the electrochemical potential (i.e. membrane potential and concentration gradient) and substrate selectivity (By similarity). Hydrophobicity is a major requirement for recognition in polyvalent substrates and inhibitors (By similarity). Primarily expressed at the basolateral membrane of hepatocytes and proximal tubules and involved in the uptake and disposition of cationic compounds by hepatic and renal clearance from the blood flow (By similarity). Most likely functions as an uptake carrier in enterocytes contributing to the intestinal elimination of organic cations from the systemic circulation. Transports endogenous monoamines such as N-1-methylnicotinamide (NMN), guanidine, histamine, neurotransmitters dopamine, serotonin and adrenaline. Also transports natural polyamines such as spermidine, agmatine and putrescine at low affinity, but relatively high turnover. Involved in the hepatic uptake of vitamin B1/thiamine, hence regulating hepatic lipid and energy metabolism. Also transport choline, albeit with low affinity. Mediates the bidirectional transport of acetylcholine (ACh) at the apical membrane of ciliated cell in airway epithelium, thereby playing a role in luminal release of ACh from bronchial epithelium. Transports dopaminergic neuromodulators cyclo(his-pro) and salsolinol with lower efficiency. Also capable of transporting non-amine endogenous compounds such as prostaglandin E2 (PGE2) and prostaglandin F2-alpha (PGF2-alpha). May contribute to the transport of cationic compounds in testes across the blood-testis-barrier (Probable). Also involved in the uptake of xenobiotics tributylmethylammonium (TBuMA), quinidine, N-methyl-quinine (NMQ), N-methyl-quinidine (NMQD) N-(4,4-azo-n-pentyl)-quinuclidine (APQ), azidoprocainamide methoiodide (AMP), N-(4,4-azo-n-pentyl)-21-deoxyajmalinium (APDA) and 4-(4-(dimethylamino)styryl)-N-methylpyridinium (ASP)

PMID 11388889 ↗ · PMID 11408531 ↗ · PMID 11907186 ↗ · PMID 12439218 ↗ · PMID 12719534 ↗ · PMID 15389554 ↗ · PMID 15817714 ↗ · PMID 16263091 ↗ · PMID 16272756 ↗ · PMID 16581093 ↗ · PMID 17460754 ↗ · PMID 19536068 ↗ · PMID 21128598 ↗ · PMID 23680637 ↗ · PMID 24961373 ↗ · PMID 34040533 ↗ · PMID 35469921 ↗ · PMID 40972734 ↗ · PMID 9187257 ↗ · PMID 9260930 ↗ · PMID 9655880 ↗ · PMID 35307651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能資料記載 SLC22A1 可介導 1-methyl-4-phenylpyridinium(MPP⁺)的攝取;此敘述未在該筆內容中提供其他條件或機制細節。含實驗來源
證據與來源

Mediates the uptake of 1-methyl-4-phenylpyridinium (MPP(+))

PMID 11388889 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能資料記載 SLC22A1 無法攝取 1-methyl-4-phenylpyridinium(MPP⁺);此敘述未提供限制條件或與其他相反記載間差異的說明。含實驗來源
證據與來源

Not able to uptake 1-methyl-4-phenylpyridinium (MPP(+))

PMID 11388889 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性1-methylnicotinamide(out) = 1-methylnicotinamide(in)含實驗來源
證據與來源

1-methylnicotinamide(out) = 1-methylnicotinamide(in)

PMID 9260930 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性dopamine(out) = dopamine(in)含實驗來源
證據與來源

dopamine(out) = dopamine(in)

PMID 35469921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性serotonin(out) = serotonin(in)含實驗來源
證據與來源

serotonin(out) = serotonin(in)

PMID 12439218 ↗ · PMID 24961373 ↗ · PMID 35469921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(R)-adrenaline(out) = (R)-adrenaline(in)含實驗來源
證據與來源

(R)-adrenaline(out) = (R)-adrenaline(in)

PMID 35469921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性histamine(out) = histamine(in)含實驗來源
證據與來源

histamine(out) = histamine(in)

PMID 35469921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性guanidine(out) = guanidine(in)推論支持
證據與來源

guanidine(out) = guanidine(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性acetylcholine(in) = acetylcholine(out)含實驗來源
證據與來源

acetylcholine(in) = acetylcholine(out)

PMID 15817714 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thiamine(in) = thiamine(out)含實驗來源
證據與來源

thiamine(in) = thiamine(out)

PMID 24961373 ↗ · PMID 35469921 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性agmatine(out) = agmatine(in)含實驗來源
證據與來源

agmatine(out) = agmatine(in)

PMID 21128598 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性putrescine(out) = putrescine(in)含實驗來源
證據與來源

putrescine(out) = putrescine(in)

PMID 21128598 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性spermidine(in) = spermidine(out)推論支持
證據與來源

spermidine(in) = spermidine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-histidyl-L-proline diketopiperazine(in) = L-histidyl-L-proline diketopiperazine(out)含實驗來源
證據與來源

L-histidyl-L-proline diketopiperazine(in) = L-histidyl-L-proline diketopiperazine(out)

PMID 17460754 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(R)-salsolinol(in) = (R)-salsolinol(out)含實驗來源
證據與來源

(R)-salsolinol(in) = (R)-salsolinol(out)

PMID 17460754 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性prostaglandin F2alpha(out) = prostaglandin F2alpha(in)含實驗來源
證據與來源

prostaglandin F2alpha(out) = prostaglandin F2alpha(in)

PMID 11907186 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in)含實驗來源
證據與來源

prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in)

PMID 11907186 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性choline(out) = choline(in)含實驗來源
證據與來源

choline(out) = choline(in)

PMID 40972734 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC22A1 位於多種細胞的膜區域:在肝細胞及腎近端小管細胞主要於基底外側膜,但腎細胞也見頂端側定位;腸細胞主要位於側膜,亦見於頂端側。支氣管纖毛上皮細胞定位於腔面/頂端膜,Sertoli 細胞則記錄於基底膜。含實驗來源
證據與來源

Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Lateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the sinusoidal/basolateral membrane of hepatocytes (By similarity). Mainly localized to the basolateral membrane of renal proximal tubular cells (By similarity). However, also identified at the apical side of proximal tubular cells. Mainly expressed at the lateral membrane of enterocytes. Also observed at the apical side of enterocytes. Localized to the luminal/apical membrane of ciliated epithelial cells in bronchi. Localized to the basal membrane of Sertoli cells

PMID 12719534 ↗ · PMID 15817714 ↗ · PMID 19536068 ↗ · PMID 23680637 ↗ · PMID 16263091 ↗ · PMID 35307651 ↗ · PMID 35469921 ↗

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調控在肝臟,HNF4A 活化 SLC22A1,而膽汁酸可透過 NR0B2 抑制其表現;在肝細胞中,膽固醇處理會增加 SLC22A1 表現。含實驗來源
證據與來源

In the liver activated by HNF4A and suppressed by bile acids via NR0B2. Increased by cholesterol treatment in hepatocyte cells

PMID 16436500 ↗ · PMID 17635184 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 21 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000366963 · 1,922 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACACTTGGACAGCAAACTGATTTCAAACCACTCCTTTTCA40
41AAGATCTCTGAGGGAGACATTGCACCTGGCCACTGCAGCC80
81CAGAGCAGGTCTGGCCACGGCCATGAGCATGCTGAGCCAT120
121CATGCCCACCGTGGATGACATTCTGGAGCAGGTTGGGGAG160
161TCTGGCTGGTTCCAGAAGCAAGCCTTCCTCATCTTATGCC200
201TGCTGTCGGCTGCCTTTGCGCCCATCTGTGTGGGCATCGT240
241CTTCCTGGGTTTCACACCTGACCACCACTGCCAGAGTCCT280
281GGGGTGGCTGAGCTGAGCCAGCGCTGTGGCTGGAGCCCTG320
321CGGAGGAGCTGAACTATACAGTGCCAGGCCTGGGGCCCGC360
361GGGCGAGGCCTTCCTTGGCCAGTGCAGGCGCTATGAAGTG400
401GACTGGAACCAGAGCGCCCTCAGCTGTGTAGACCCCCTGG440
441CTAGCCTGGCCACCAACAGGAGCCACCTGCCGCTGGGTCC480
481CTGCCAGGATGGCTGGGTGTATGACACGCCCGGCTCTTCC520
521ATCGTCACTGAGTTCAACCTGGTGTGTGCTGACTCCTGGA560
561AGCTGGACCTCTTTCAGTCCTGTTTGAATGCGGGCTTCTT600
601GTTTGGCTCTCTCGGTGTTGGCTACTTTGCAGACAGGTTT640
641GGCCGTAAGCTGTGTCTCCTGGGAACTGTGCTGGTCAACG680
681CGGTGTCGGGCGTGCTCATGGCCTTCTCGCCCAACTACAT720
721GTCCATGCTGCTCTTCCGCCTGCTGCAGGGCCTGGTCAGC760
761AAGGGCAACTGGATGGCTGGCTACACCCTAATCACAGAAT800
801TTGTTGGCTCGGGCTCCAGAAGAACGGTGGCGATCATGTA840
841CCAGATGGCCTTCACGGTGGGGCTGGTGGCGCTTACCGGG880
881CTGGCCTACGCCCTGCCTCACTGGCGCTGGCTGCAGCTGG920
921CAGTCTCCCTGCCCACCTTCCTCTTCCTGCTCTACTACTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。