演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC1A1EAAC1

solute carrier family 1 member 1

SLC1A1 編碼高親和力、依賴鈉離子的胺基酸轉運蛋白,屬於 DAACS 家族,參與麩胺酸與天門冬胺酸的運輸。

Homo sapiens9p24.2UniProt P43005
OFFICIAL SYMBOL
SLC1A1
CHROMOSOME
9
UNIPROT
P43005
PDB / ALPHAFOLD
6X2L
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC1A1(solute carrier family 1 member 1)是蛋白質編碼基因,產物為多次穿膜的膜蛋白,屬於 dicarboxylate/amino acid:cation symporter(DAACS)家族的 SLC1A1 subfamily。蛋白質長 524 個胺基酸,具有多段螺旋型跨膜區,並在膜兩側分布不同的胞質與細胞外區段。它的基本角色是作為依賴鈉離子的高親和力胺基酸轉運蛋白,負責跨膜搬運特定胺基酸。

Official symbol
SLC1A1
Gene name
solute carrier family 1 member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10939
UniProt
P43005
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EAAC1EAAT3hEAAC1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p24.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegSLC1A1pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:4,490,207–4,587,469
Gene span
97,263 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262352 ★4,490,468–4,587,46912
ENST000009318824,490,207–4,587,46911
ENST000009540754,490,207–4,587,46911
ENST000009986304,490,207–4,576,9189
ENST000011214434,490,207–4,550,1523
ENST000011283554,490,207–4,587,26012
ENST000011373584,490,207–4,587,46912
ENST000004223984,572,335–4,585,5575

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC1A1 以高親和力、依賴鈉離子的方式轉運 L-glutamate,也可轉運 L-aspartate、D-aspartate 與 L-cysteine。這些底物運輸仰賴離子共同轉運:每運送一個胺基酸分子,會同時帶入兩個或三個 Na(+) 離子及一個質子,並反向運出一個 K(+) 離子。已列出的反應式中,L-glutamate、L-aspartate、D-aspartate 與 L-cysteine 的轉運均呈現三個 Na(+) 與一個質子向內、K(+) 向外的配置。

此蛋白質也介導 Cl(-) 通量,但該通量不與胺基酸轉運耦合。這項離子通量可避免天門冬胺酸與 Na(+) 同向運輸造成負電荷累積,因而與轉運過程的電荷平衡有關。

在腎臟中,SLC1A1 對腎小管重吸收 L-glutamate 與 L-aspartate 具有重要作用。其轉運功能與腎小球濾液中陰離子胺基酸的回收相連;若回收不完全,尿液中 glutamate 與 aspartate 的排出會異常增加,與二羧酸胺基酸尿症的疾病描述相符。

在突觸環境中,SLC1A1 與其他機制共同參與快速移除突觸間隙中釋出的 glutamate;這項作用被描述為具有冗餘性,並有助於終止 glutamate 對突觸後細胞的作用。這部分功能依據相似性註釋,而非在此來源中列出的直接實驗證據。

SLC1A1 對 L-glutamate 與 L-cysteine 的運輸也被認為有助於 glutathione 生合成及抵禦氧化壓力;這項功能同樣標示為依相似性推定。此外,ARL6IP5 被描述為對 SLC1A1 具有負向調控作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 4490468 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC1A1 ENST00000262352 GRCh38 chr9:4489468-4490568 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAGGAACGCTGATAAGAAGACCGCTTACAGCTGCGGAGGTACTGATTTGGTAAAGGGAGGGAAAGAGAT
TGTATACGTGAGAGTGAAAAAATTGGGTAGAAAAATGGAAGAGCATCAGAAATTCACTTAGCAACACCAA
ATATATTTGGCACCACTAACCTAGTTTCTCCTGTGTTTGCCTTTCCAATCCGTTGGACCTTAGGGGATGG
ACCGCCCACTTTCTCCCCAGAGCGGCTCCCGGGTCCGGTTCTCAGTTCTAATCACTGCCCCAAGCCTCCA
TGCTCCAGGGCCTGTGGTCACAGAGCAAGTCCCAAGGAGCAGAAGTAAAGTTCTAAGAGAAATCACCATC
TCCTTGTGCAGGGAACACTCCCAAGCCCAGTGTCCACAGACAAATCACCTCCAGCGACTCGAAGAGGAGA
ATAATCCCTGTGGGGGCACTGGAGGCTCCGCGTGAAAGTTTCCAAAGCCATGTTCTGCCCCAGGACTCCT
TTCTCTCCTCCCAGAAGCTTCAGGCTTTCGCGGCTGCTGGCACATCCCAGCCTGAGTAGCCGAGCAAGAG
GGACCCAAGGCAGGATCAGCTTCCCCCGACTTGAAAGGGCACCCGTTCTGCAGGTGCCGGCGCTGGAAAT
AGCTGGTGTGGAGAACGGAGAGGGAGACGTGCAGGATGAAGTCCGCGCCCAGGAGGGCAGTGGCTCCGCC
TCTCTGGGTTAGGGACAGAAGAAAACCCTTAACCCAAAGCCCTAGCATGAGTGAGGCGTGGAAAGCGAGA
CAGACTCCAGTGGAAGGCTGTGGGGCGGGACTCAGGGTTCCCGGAGAGGCCGCCCCAGCTCCTGCCGCAG
CGCTGGGCGCCCTACCACGCCTGCTCCCTAGGGACCCCGGGCGTCCCACGCACGCACCCACCCTCCTTCC
CGGGCCTGCCGCTCCTCCCTCCTTCCTCGCTGGTTGGCCCAGGCGCCGCAGAGCGCGGCGGCAGCAGGAG
GAGCCGGGCGCGCCTGCCACGCAAAACTACCGGGCTGGCAGGGCGGCGGGCGCGGTGCGCGATCCCGGGT
GGCGGCGGCAACGGCGGTGGTGACGGCGGCGACTGCAGCGGCCGGCTCTCA
SLC1A1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC1A1_2 ↗9:4,490,216正股4,490,167–4,490,226
SLC1A1_1 ↗9:4,490,468正股4,490,419–4,490,478

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_BW3K · enhancer · 4489455–4490085 · regulatory

ENSR9_93R59 · promoter · 4490086–4490478 · regulatory

ENSR9_CG2T · enhancer · 4490479–4492000 · regulatory

ENSR9_533J58 · CTCF_binding_site · 4491326–4491347 · regulatory

· motif · 4486269–4486282 · motif

· motif · 4486278–4486291 · motif

· motif · 4486394–4486406 · motif

· motif · 4486621–4486632 · motif

· motif · 4486973–4486985 · motif

· motif · 4486975–4486990 · motif

· motif · 4487261–4487273 · motif

· motif · 4489976–4489993 · motif

· motif · 4490129–4490144 · motif

· motif · 4490253–4490269 · motif

· motif · 4490330–4490343 · motif

· motif · 4490330–4490343 · motif

· motif · 4490420–4490435 · motif

· motif · 4490459–4490472 · motif

· motif · 4490520–4490537 · motif

· motif · 4490532–4490549 · motif

· motif · 4490630–4490643 · motif

· motif · 4490962–4490975 · motif

· motif · 4490962–4490975 · motif

· motif · 4491328–4491344 · motif

· motif · 4491747–4491756 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:524 aa

1 aa524 aa跨膜區拓樸區域
依 P43005 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC1A1 蛋白質長 524 個胺基酸,屬於 DAACS 家族的 SLC1A1 subfamily。序列註解指出其含多段螺旋型跨膜區,並包含胞質側與細胞外側區段;部分跨膜區的註解依據與 UniProtKB P43003 的相似性。

拓樸區域Cytoplasmic1–18 aa
跨膜區Helical19–38 aa
拓樸區域Extracellular39–61 aa
跨膜區Helical62–82 aa
拓樸區域Cytoplasmic83–93 aa
跨膜區Helical94–114 aa
拓樸區域Extracellular115–205 aa
跨膜區Helical; Name=4206–229 aa
拓樸區域Cytoplasmic230–238 aa
跨膜區Helical; Name=5239–266 aa
拓樸區域Extracellular267–286 aa
跨膜區Helical; Name=6287–308 aa
拓樸區域Cytoplasmic309–313 aa
拓樸區域Cytoplasmic345–353 aa
跨膜區Helical; Name=7354–380 aa
拓樸區域Extracellular381–393 aa
拓樸區域Extracellular428–440 aa
跨膜區Helical; Name=8441–462 aa
拓樸區域Cytoplasmic463–524 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6X2L…

PDB · 6X2L

EM · 2.85 A · A/B/C=1-524

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Apical cell membrane;Synapse, synaptosome;Early endosome membrane;Late endosome membrane;Recycling endosome membrane

SLC1A1 定位於細胞膜,包括頂端細胞膜,也見於突觸/突觸體及早期、晚期與回收胞內體膜。 這些註解涵蓋細胞表面與胞內膜區室,未提供特定條件下定位轉換的細節。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Synapse, synaptosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 30 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EAAC1SLC1A1APBA1APBA2DLG1DLG3DLG4ERGIC3FAM209AFRMPD2FXYD3GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LDLRAD1LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF2NHERF4PAGE1PATJPDZK1RNF5SLC35A1SYNPRTJP1TMEM179BWHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC1A1 可形成同源三聚體。它與 ARL6IP5、RTN2 及 SORCS2 有互作;其中 RTN2 透過 N 端與 SLC1A1 互作,並促進其細胞表面表現。SORCS2 的互作則被描述為對 SLC1A1 在細胞膜的正常表現很重要,該關係依相似性註釋。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC1A1 相關變異可造成二羧酸胺基酸尿症,這是一種自體隱性疾病,特徵為尿液中 glutamate 與 aspartate 排出異常,原因是腎臟未能充分重吸收陰離子胺基酸;疾病也可能伴隨智能障礙。另有資料指出,SLC1A1 變異與思覺失調症 18 的易感性相關,並非表示單一基因變異必然造成疾病。一項包含 SLC1A1 的 9p24.2 位點缺失曾在精神病患者中被發現;另一項 84 kb 缺失位於基因上游調控區、涵蓋原生啟動子並延伸至 SLC1A1 mRNA 的 exon 1,在一個五代家系中與疾病共分離,且家族成員疾病風險增加超過 18 倍。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

9 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 9 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC1A1 是依賴鈉離子的高親和力胺基酸轉運蛋白,可運送 L-glutamate、L-aspartate、D-aspartate,也可運送 L-cysteine。每個胺基酸分子與兩個或三個 Na(+) 及一個質子共同進入,同時反向運出一個 K(+);另介導不與胺基酸運輸耦合的 Cl(-) 通量,以避免天門冬胺酸與 Na(+) 同向運輸造成負電荷累積。它參與腎小管胺基酸重吸收、突觸 glutamate 清除及 glutathione 生合成;後兩者標示為依相似性推定,且 ARL6IP5 對其有負向調控作用。含實驗來源
證據與來源

Sodium-dependent, high-affinity amino acid transporter that mediates the uptake of L-glutamate and also L-aspartate and D-aspartate. Can also transport L-cysteine. Functions as a symporter that transports one amino acid molecule together with two or three Na(+) ions and one proton, in parallel with the counter-transport of one K(+) ion. Mediates Cl(-) flux that is not coupled to amino acid transport; this avoids the accumulation of negative charges due to aspartate and Na(+) symport. Plays an important role in L-glutamate and L-aspartate reabsorption in renal tubuli. Plays a redundant role in the rapid removal of released glutamate from the synaptic cleft, which is essential for terminating the postsynaptic action of glutamate (By similarity). Contributes to glutathione biosynthesis and protection against oxidative stress via its role in L-glutamate and L-cysteine transport (By similarity). Negatively regulated by ARL6IP5 (By similarity)

PMID 21123949 ↗ · PMID 26690923 ↗ · PMID 33658209 ↗ · PMID 7521911 ↗ · PMID 7914198 ↗ · PMID 8857541 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性K(+)(in) + L-glutamate(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-glutamate(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)含實驗來源
證據與來源

K(+)(in) + L-glutamate(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-glutamate(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)

PMID 7521911 ↗ · PMID 7914198 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性K(+)(in) + L-aspartate(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-aspartate(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)含實驗來源
證據與來源

K(+)(in) + L-aspartate(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-aspartate(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)

PMID 7521911 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-aspartate(out) + K(+)(in) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = D-aspartate(in) + K(+)(out) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)含實驗來源
證據與來源

D-aspartate(out) + K(+)(in) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = D-aspartate(in) + K(+)(out) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)

PMID 7521911 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性K(+)(in) + L-cysteine(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-cysteine(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)含實驗來源
證據與來源

K(+)(in) + L-cysteine(out) + 3 Na(+)(out) + H(+)(out) = K(+)(out) + L-cysteine(in) + 3 Na(+)(in) + H(+)(in)

PMID 21123949 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC1A1 可形成同源三聚體,並與 ARL6IP5、RTN2 及 SORCS2 互作。RTN2 透過 N 端與 SLC1A1 互作,且此互作促進 SLC1A1 出現在細胞表面;SORCS2 的互作則被描述為維持 SLC1A1 在細胞膜正常表現的重要因素,這項關係依相似性註釋。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer. Interacts with ARL6IP5. Interacts with RTN2 (via N-terminus); the interaction promotes cell surface expression of SLC1A1. Interacts with SORCS2; this interaction is important for normal expression at the cell membrane (By similarity)

PMID 33658209 ↗

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細胞定位SLC1A1 被註記為多次穿膜蛋白,定位包括細胞膜與頂端細胞膜,也見於突觸、突觸體,以及早期、晚期和回收胞內體膜。資料列出這些膜區室,但未說明特定條件下的定位變化或動態。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Synapse, synaptosome; Early endosome membrane; Late endosome membrane; Recycling endosome membrane

PMID 21123949 ↗ · PMID 26690923 ↗ · PMID 7521911 ↗ · PMID 7914198 ↗ · PMID 8857541 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯二羧酸胺基酸尿症為自體隱性疾病,因腎臟未能充分重吸收腎小球濾液中的陰離子胺基酸,造成尿液中 glutamate 與 aspartate 異常排出,並可能伴隨智能障礙。資料將此病歸因於影響 SLC1A1 的變異。含實驗來源
證據與來源

Dicarboxylic aminoaciduria DCBXA An autosomal recessive disorder characterized by abnormal excretion of urinary glutamate and aspartate, resulting from the incomplete reabsorption of anionic amino acids from the glomerular filtrate in the kidney. It can be associated with intellectual disability. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 222730

PMID 21123949 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯思覺失調症 18 是複雜且多因素的精神病性疾患,可能涉及思考內容與形式、情緒、自我感、與外界關係及行為的改變,部分患者也可能有輕度認知功能受損,或同時呈現雙相情緒症狀。疾病易感性與影響 SLC1A1 的變異相關。一項 84 kb 的 9p24.2 缺失位於基因上游調控區,涵蓋原生啟動子並延伸至 SLC1A1 mRNA 的 exon 1;該缺失在一個五代家系中與疾病共分離,家族成員風險增加超過 18 倍。含實驗來源
證據與來源

Schizophrenia 18 SCZD18 A complex, multifactorial psychotic disorder or group of disorders characterized by disturbances in the form and content of thought (e.g. delusions, hallucinations), in mood (e.g. inappropriate affect), in sense of self and relationship to the external world (e.g. loss of ego boundaries, withdrawal), and in behavior (e.g bizarre or apparently purposeless behavior). Although it affects emotions, it is distinguished from mood disorders in which such disturbances are primary. Similarly, there may be mild impairment of cognitive function, and it is distinguished from the dementias in which disturbed cognitive function is considered primary. Some patients manifest schizophrenic as well as bipolar disorder symptoms and are often given the diagnosis of schizoaffective disorder. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. A deletion at the chromosome 9p24.2 locus, including SLC1A1, has been identified in patients with psychotic disorders. This 84 kb deletion is immediately upstream of the SLC1A1 gene in a regulatory region that contains the full native promoter sequence, extends through exon 1 of the SLC1A1 mRNA, co-segregates with disease in an extended 5-generation pedigree and increases disease risk more than 18-fold for family members MIM: 615232

PMID 21982423 ↗ · PMID 23341099 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 9 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262352 · 3,698 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAAAACTACCGGGCTGGCAGGGCGGCGGGCGCGGTGCGC40
41GATCCCGGGTGGCGGCGGCAACGGCGGTGGTGACGGCGGC80
81GACTGCAGCGGCCGGCTCTCACCTCTCCCCTGTGCACCCG120
121CATCTCGCCGCGCCGCCGAGCAGCCAGCAGTCCCCGGGTC160
161GCCCAGCCCACGCGCGCACGGCCGAGCCCAGCGCACAATA200
201GCGGCGACAGCCATGGGGAAACCGGCGAGGAAAGGATGCG240
241AGTGGAAGCGCTTCCTGAAGAATAACTGGGTGTTGCTGTC280
281CACCGTGGCCGCGGTGGTGCTAGGCATTACCACAGGAGTC320
321TTGGTTCGAGAACACAGCAACCTCTCAACTCTAGAGAAAT360
361TCTACTTTGCTTTTCCTGGAGAAATTCTAATGCGGATGCT400
401GAAACTCATCATTTTGCCATTAATTATATCCAGCATGATT440
441ACAGGTGTTGCTGCACTGGATTCCAACGTATCCGGAAAAA480
481TTGGTCTGCGCGCTGTCGTGTATTATTTCTGTACCACTCT520
521CATTGCTGTTATTCTAGGTATTGTGCTGGTGGTGAGCATC560
561AAGCCTGGTGTCACCCAGAAAGTGGGTGAAATTGCGAGGA600
601CAGGCAGCACCCCTGAAGTCAGTACGGTGGATGCCATGTT640
641AGATCTCATCAGGAATATGTTCCCTGAGAATCTTGTCCAG680
681GCCTGTTTTCAGCAGTACAAAACTAAGCGTGAAGAAGTGA720
721AGCCTCCCAGCGATCCAGAGATGAACATGACAGAAGAGTC760
761CTTCACAGCTGTCATGACAACTGCAATTTCCAAGAACAAA800
801ACAAAGGAATACAAAATTGTTGGCATGTATTCAGATGGCA840
841TAAACGTCCTGGGCTTGATTGTCTTTTGCCTTGTCTTTGG880
881ACTTGTCATTGGAAAAATGGGAGAAAAGGGACAAATTCTG920
921GTGGATTTCTTCAATGCTTTGAGTGATGCAACCATGAAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。