基因總覽
SLC19A1（solute carrier family 19 member 1）是蛋白質編碼基因，產物屬於 reduced folate carrier（RFC）transporter 家族。其蛋白質為多次穿膜轉運蛋白，主要角色是將特定分子運送通過細胞膜；來源所述的底物涵蓋還原型葉酸、部分環狀二核苷酸及 methotrexate。這種底物範圍使它與葉酸運輸及細胞對免疫訊息分子的接收相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000311124 ★ | 45,512,565–45,542,440 | 6 |
| ENST00000417954 | 45,493,572–45,531,541 | 5 |
| ENST00000567670 | 45,498,201–45,544,418 | 6 |
| ENST00001003234 | 45,502,513–45,563,189 | 6 |
| ENST00001036097 | 45,502,518–45,542,476 | 6 |
| ENST00000859470 | 45,511,530–45,563,189 | 6 |
| ENST00000930844 | 45,512,548–45,542,429 | 6 |
| ENST00000859476 | 45,512,565–45,542,476 | 6 |
| ENST00001131447 | 45,512,565–45,542,476 | 6 |
| ENST00000859473 | 45,513,706–45,546,975 | 7 |
| ENST00000859474 | 45,513,722–45,546,741 | 8 |
| ENST00000930846 | 45,513,726–45,541,875 | 6 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC19A1 的產物是一種反向運輸蛋白，可將還原型葉酸或部分環狀二核苷酸帶入細胞，同時使有機陰離子向外運輸。這是次級主動運輸：運輸蛋白利用細胞內有機陰離子沿濃度梯度外排所提供的條件，促進底物攝入；來源未指出由此過程直接消耗何種能量分子。
在葉酸運輸方面，該蛋白對 N5-methyltetrahydrofolate 具有高親和力；此分子是循環中占主要比例的葉酸形式。它也可介導抗葉酸藥物 methotrexate 的輸入。AICAR 經磷酸化形成 AICAR monophosphate 後，則可作為反向運輸所需的有機陰離子之一，與葉酸的進入相伴運送。
SLC19A1 也能輸入具免疫反應性的環狀二核苷酸，包括 2′-3′-cGAMP 及其鍵結異構物 3′-3′-cGAMP。2′-3′-cGAMP 是細胞質中因 DNA 病毒而產生的免疫訊息分子；SLC19A1 介導這類分子進入細胞，因而參與引發較大範圍免疫反應的過程。這些作用顯示，同一反向運輸機制可涵蓋葉酸、藥物及特定免疫訊息分子的運送。
Promoter 與基因調控
>SLC19A1 ENST00000311124 GRCh38 chr21:45542340-45543440 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCCGCACTCTTGAGCTGTGGGTACCACGGTGGCCGTCCCCTTCTGTTCTGTGCAGTGGACTTCCTGGCT CCTCCTTAGCCTTGGGGCCCCCACAGCCCTCGGCTTGGCTTCCCTCCCCATAGCCAGGCCCTGGGTAACT CCAGGGGAAAGTGACCCTGAGGCCCCCCACTTCTCCCCGTGTCCTGCACAGGCCTTGGGCTTTCGGCGGT GCTGTCTGCCGCAGCCCCACGCCTTCCTGGGAGAGTGGCCCAGGCCCCCCTTCCTGAGTGTGACTGCGCT GCCGTCTGCGAGGCCTGCGCGGGTCTCCCCCGGGCTGTCCCTGCTGGGATGGGGACTGGTGGCCCCGGGC CACGTCCTGGATCCGGCTTGCTCCTTGGTACAAGCCCGTACGGGTCACGGTCAGGCAGGAGGGCGGGCGG CGGGGTCCCGGGGGCGCCGAGTTCGGGGCCGTGCGGTCCCCAAGAGCAGGCTGTGCGTGTCCCTGTTGGA GCCCCACGAAGGCGGCCCAGGGCCACCCCTGAGGGCGCGTGGGCCCGACCCGCGTCCCGGATCCAGCTTG CGGCCAGGAATGCAGGTGTTCCAGGGTGCCAAAAGGAAAACGCACAAGGCCTCGTCGAGGAGGGGGGGTC AGGAGGGGACCGGGGGTGGGAAGAACGCGGGGGAGAGGGATGGCAGGGTGCCCGCCCGAGGGACCGACAC CTCCGCGAGTGGCACCCCAGGATGCTGACGCCGGCGGGGGTGGGGGCCCGAGGGGCGGTCGGGGTCAGGG GGCGGCCCCAGGGGTAGGGCCGCAGCACGAGGGGCCGCGTGACCCCGGCGGTGACCGGGTGGGGAGAGGC CGGCGCCGGGGCTGGGAGACGGCCGTGGGTGGGAGGGTGCCCCGTGGGGACGCTCCTGCCGCAGCGCCCG GCCACGCGCGAGGCCCCGCCCTCAGGACGCGTTCGGCGGGACGGACCCGCCCACCCCGCAGCCGCGCGCC CGCCGCGCCGCCTTGTGGGCGCTGTAGTCCCGGAGTCCGCGTGCGCGGGGCCGGGTCCGGGAGCCCCAGG GCAGCCGCCCCGCCGAGTCGCAGGTACCGGTGGGGAACGGGGCCACGGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC19A1_3 ↗ | 21:45,541,838 | 負股 | 45,541,828–45,541,887 |
| SLC19A1_1 ↗ | 21:45,542,429 | 負股 | 45,542,419–45,542,478 |
| SLC19A1_4 ↗ | 21:45,544,402 | 負股 | 45,544,392–45,544,451 |
| SLC19A1_2 ↗ | 21:45,563,025 | 負股 | 45,563,015–45,563,074 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_5DP7RN · CTCF_binding_site · 45540928–45540949 · regulatory
ENSR21_C6J2D · enhancer · 45541054–45542429 · regulatory
ENSR21_BC32X · promoter · 45542430–45542961 · regulatory
ENSR21_5DP83N · CTCF_binding_site · 45542439–45542460 · regulatory
ENSR21_5DP884 · CTCF_binding_site · 45543390–45543411 · regulatory
ENSR21_5DP88M · CTCF_binding_site · 45543515–45543536 · regulatory
ENSR21_9N449 · enhancer · 45543962–45544400 · regulatory
ENSR21_74NBCH · promoter · 45544401–45544501 · regulatory
· motif · 45540930–45540946 · motif
· motif · 45541807–45541816 · motif
· motif · 45541807–45541816 · motif
· motif · 45541850–45541863 · motif
· motif · 45542406–45542419 · motif
· motif · 45542441–45542457 · motif
· motif · 45542472–45542485 · motif
· motif · 45542521–45542534 · motif
· motif · 45542564–45542577 · motif
· motif · 45542623–45542635 · motif
· motif · 45542625–45542632 · motif
· motif · 45542667–45542680 · motif
· motif · 45542670–45542682 · motif
· motif · 45542673–45542680 · motif
· motif · 45543392–45543408 · motif
· motif · 45543517–45543533 · motif
· motif · 45544092–45544105 · motif
· motif · 45544092–45544105 · motif
· motif · 45544104–45544121 · motif
· motif · 45544168–45544181 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：591 aa
SLC19A1 蛋白質長 591 個胺基酸，屬於 reduced folate carrier（RFC）transporter（TC 2.A.48）家族。蛋白質特徵資料標示其為多次穿膜蛋白，並包含多段跨膜螺旋與細胞質、細胞外區段，形成跨膜轉運所需的拓樸架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC19A1 位於細胞膜，並有多次穿膜蛋白的定位註解；來源亦記錄其位於細胞膜的頂端或基底外側區域。 資料未提供這些膜區域分布差異所依賴的條件或動態變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- KRT26Q7Z3Y9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
SLC19A1 變異與兩種體染色體隱性疾病相關。葉酸反應性巨幼紅血球性貧血與紅血球葉酸運輸減少相關；患者可有溶血性貧血、高同半胱胺酸血症及低維生素 B12，血清葉酸正常而紅血球葉酸偏低。口服葉酸治療可矯正貧血並使同半胱胺酸恢復正常。葉酸反應性免疫缺陷 114 可於嬰兒早期發病，表現包括反覆皮膚與呼吸道感染、黏膜出血、口腔潰瘍、慢性腹瀉及生長不良；患者可有淋巴球減少、血清免疫球蛋白偏低與 T 細胞增殖受損，部分患者有整體發展遲緩。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC19A1 是反向運輸蛋白，藉由細胞內有機陰離子順濃度梯度外排，促進還原型葉酸或部分環狀二核苷酸輸入；對主要循環葉酸形式 N5-methyltetrahydrofolate 具有高親和力，也運送 methotrexate。AICAR 磷酸化成 AICAR monophosphate 後可充當有機陰離子。它亦輸入具免疫反應性的 2′-3′-cGAMP 與 3′-3′-cGAMP，參與引發較大範圍免疫反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Antiporter that mediates the import of reduced folates or a subset of cyclic dinucleotides, driven by the export of organic anions. Acts as an importer of immunoreactive cyclic dinucleotides, such as cyclic GMP-AMP (2'-3'-cGAMP), an immune messenger produced in response to DNA virus in the cytosol, and its linkage isomer 3'-3'-cGAMP, thus playing a role in triggering larger immune responses. Mechanistically, acts as a secondary active transporter, which exports intracellular organic anions down their concentration gradients to facilitate the uptake of its substrates. Has high affinity for N5-methyltetrahydrofolate, the predominant circulating form of folate. Also mediates the import of antifolate drug methotrexate. 5-amino-4-imidazolecarboxamide riboside (AICAR), when phosphorylated to AICAR monophosphate, can serve as an organic anion for antiporter activity PMID 10787414 ↗ · PMID 14609557 ↗ · PMID 15337749 ↗ · PMID 16115875 ↗ · PMID 22554803 ↗ · PMID 31126740 ↗ · PMID 31511694 ↗ · PMID 32276275 ↗ · PMID 36071163 ↗ · PMID 36265513 ↗ · PMID 36575193 ↗ · PMID 36745868 ↗ · PMID 7615551 ↗ · PMID 7641195 ↗ · PMID 7826387 ↗ · PMID 9041240 ↗ · PMID 9767079 ↗ |
| 分子活性 | 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) + (6S)-5-methyl-5,6,7,8-tetrahydrofolate(out) = 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) + (6S)-5-methyl-5,6,7,8-tetrahydrofolate(in) | 含實驗來源 | 證據與來源5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) + (6S)-5-methyl-5,6,7,8-tetrahydrofolate(out) = 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) + (6S)-5-methyl-5,6,7,8-tetrahydrofolate(in) PMID 14609557 ↗ · PMID 22554803 ↗ · PMID 36071163 ↗ · PMID 36265513 ↗ · PMID 36575193 ↗ |
| 分子活性 | 2',3'-cGAMP(out) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) = 2',3'-cGAMP(in) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) | 含實驗來源 | 證據與來源2',3'-cGAMP(out) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) = 2',3'-cGAMP(in) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) PMID 31126740 ↗ · PMID 36265513 ↗ |
| 分子活性 | 3',3'-cGAMP(out) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) = 3',3'-cGAMP(in) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) | 含實驗來源 | 證據與來源3',3'-cGAMP(out) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(in) = 3',3'-cGAMP(in) + 5-amino-1-(5-phospho-beta-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide(out) PMID 31126740 ↗ |
| 細胞定位 | SLC19A1 被註記為多次穿膜蛋白，定位於細胞膜；資料亦列出細胞膜頂端區域及基底外側區域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 10347183 ↗ · PMID 10787414 ↗ · PMID 15337749 ↗ · PMID 16115875 ↗ · PMID 36071163 ↗ · PMID 36265513 ↗ · PMID 36575193 ↗ · PMID 36745868 ↗ · PMID 9767079 ↗ |
| 疾病關聯 | SLC19A1 相關變異可造成體染色體隱性、葉酸反應性代謝疾病，特徵為葉酸進入紅血球減少所致的巨幼紅血球性貧血；亦可見溶血性貧血、高同半胱胺酸血症及低維生素 B12，血清葉酸正常但紅血球葉酸偏低。口服葉酸可改善貧血並使同半胱胺酸正常化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Megaloblastic anemia, folate-responsive MEGAF An autosomal recessive metabolic disorder characterized by megaloblastic anemia resulting from decreased folate transport into erythrocytes. Disease manifestations include hemolytic anemia, hyperhomocysteinemia, and low vitamin B12. Serum folate levels are normal, but erythrocyte folate levels are decreased. Treatment with oral folate corrects the anemia and normalizes homocysteine. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601775 PMID 32276275 ↗ |
| 疾病關聯 | SLC19A1 相關變異與體染色體隱性、葉酸反應性免疫缺陷 114 有關，通常於嬰兒早期發病。表現包括反覆皮膚及呼吸道感染、黏膜出血、口腔潰瘍、慢性腹瀉與生長不良；患者可有淋巴球減少、血清免疫球蛋白偏低及 T 細胞增殖受損，部分患者出現整體發展遲緩。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 114, folate-responsive IMD114 An autosomal recessive immunologic disorder manifesting in early infancy and characterized by recurrent skin and respiratory infections, mucosal bleeding, oral ulcers, chronic diarrhea, and poor overall growth. Affected individuals have lymphopenia, low serum immunoglobulins, and impaired T cell proliferation. Some patients have global developmental delay. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620603 PMID 36517554 ↗ · PMID 36745868 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTGTAGTCCCGGAGTCCGCGTGCGCGGGGCCGGGTCCGG40GAGCCCCAGGGCAGCCGCCCCGCCGAGTCGCAGGCACAGC80GTCACCTTCGTCCCCTCCGGAGCTGCACGTGGCCTGAGCA120GGATGGTGCCCTCCAGCCCAGCGGTGGAGAAGCAGGTGCC160CGTGGAACCTGGGCCTGACCCCGAGCTCCGGTCCTGGCGG200CACCTCGTGTGCTACCTTTGCTTCTACGGCTTCATGGCGC240AGATACGGCCAGGGGAGAGCTTCATCACCCCCTACCTCCT280GGGGCCCGACAAGAACTTCACGCGGGAGCAGGTCACGAAC320GAGATCACGCCGGTGCTGTCGTACTCCTACCTGGCCGTGC360TGGTGCCCGTGTTCCTGCTCACCGACTACCTGCGCTACAC400GCCGGTGCTGCTGCTGCAGGGGCTCAGCTTCGTGTCGGTG440TGGCTGCTGCTGCTGCTGGGCCACTCGGTGGCGCACATGC480AGCTCATGGAGCTCTTCTACAGCGTCACCATGGCCGCGCG520CATCGCCTATTCCTCCTACATCTTCTCTCTCGTGCGGCCC560GCGCGCTACCAGCGTGTGGCCGGCTACTCGCGCGCTGCGG600TGCTGCTGGGCGTGTTCACCAGCTCCGTGCTGGGCCAGCT640GCTGGTCACTGTGGGCCGAGTCTCCTTCTCCACGCTCAAC680TACATCTCGCTGGCCTTCCTCACCTTCAGCGTGGTCCTCG720CCCTCTTCCTGAAGCGCCCCAAGCGCAGCCTCTTCTTCAA760CCGCGACGACCGGGGGCGGTGCGAAACCTCGGCTTCGGAG800CTGGAGCGCATGAATCCTGGCCCAGGCGGGAAGCTGGGAC840ACGCCCTGCGGGTGGCCTGTGGGGACTCAGTGCTGGCGCG880GATGCTGCGGGAGCTGGGGGACAGCCTGCGGCGGCCGCAG920CTGCGCCTGTGGTCCCTCTGGTGGGTCTTCAACTCGGCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。