基因總覽
SLC18A3（solute carrier family 18 member A3）是蛋白質編碼基因，產物為 Vesicular acetylcholine transporter，屬於 major facilitator superfamily 中的 Vesicular transporter family。此蛋白為多重跨膜運輸蛋白，嵌入囊泡膜，主要與膽鹼性神經傳遞物質的囊泡儲存有關。它的膜穿越區段與胞質側、囊泡腔側區域交錯排列，形成跨膜運輸所需的結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374115 ★ | 49,610,310–49,612,720 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC18A3 產物是一種電生性反向轉運蛋白，可在突觸囊泡膜上交換膽鹼性神經傳遞物質與囊泡內的質子。其主要底物乙醯膽鹼可與兩個囊泡內質子進行交換；來源也指出它能運輸膽鹼，並可運輸 serotonin。這些轉運反應的方向依底物而異，不能將不同底物的交換式視為完全相同的反應條件。
囊泡內的質子電化學梯度由 V-type proton-pump ATPase 建立。SLC18A3 利用這個梯度將神經傳遞物質裝載進囊泡，使其在胞吐作用釋放之前得以儲存。這項作用連結囊泡膜的離子梯度與神經傳遞物質的囊泡含量；來源並未提供其在不同底物間的運輸效率或偏好比較。
在發育中的神經肌肉接點，SLC18A3 會影響突觸前神經末梢膽鹼性囊泡的量子大小，並進一步影響運動神經元分化及神經支配模式。這項發育相關作用是依相似性推定，應保留其證據限制。
SLC18A3 也屬於前腦膽鹼性系統的一部分，並被認為可調節海馬突觸傳遞；該突觸傳遞與空間記憶形成有關。這些神經迴路層級的描述同樣標示為依相似性推定，來源沒有在此提供更細的細胞或行為機制。
Promoter 與基因調控
>SLC18A3 ENST00000374115 GRCh38 chr10:49609310-49610410 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGTCACTCCAGAGCCCACCCGGGGCTTGGAGGAGGCTCTGGAAAATGAGGGATGGGGGAGTGTGCAGAA CAGGGGGCGGAGGCTGGCAGGAGCCGAGGGAGGGCTTGGTCGGGTGCGAAGAGTGCCTGGGAGGAGTTAG AGTGGGGAGGGGGTGCGGCGGCGGGGAGAGAAGAGGCGGAGCTGGGGGACCAGACCGCTAAAGGAGAAAG GGGGATTCCAGGCAAGGGGAATGTGGCCAGGCAGTGCGGGAGGGCGGCAGCGGCCAGGCTAATATTCGCG ACCCCGACTGGGGCGCGGCAACTTCTGCCCTCAGTCCCCACAAGCTCCCGGCCGCGATTCGCGGCCGAGA AATTCTGCGGAGGGGCCGGTGGGTCAGAGCCAGGCCAGGCAGTTGCTGAGCCTTCCCCTCCCCTCCTGGC GGGAGTGTGTGTGCAAGGGGCCAGGGGGCGGAGTCGGAGAAAGGGTTGGGGGTGTCCGTGTCCAGCGCTC CTCCGGACGCGGCTCCACAATCCAGCTGCGAGAACAGATGGACGCAGCGGCGGCTCACCTCGGGGGCTTC CTGCTCGCTGTGCGCCGAGGTCCAGGCTGAAGCGGAGATCGCAAGCCTCTGGCTCCCGCCTCTCCCAAGG GGCCTCGAGGAACCGGCTGCCGCGCCCCCTTCCCCAAGAGGAGAAGAGCGGGCGCTGACCCCGCGAGTCC TAGAACCGCGGGCGGGGGGCAGGCAGGGGGCGGGGGGCAGAGGGCCAGCTACCGGCGCGGAACGCCCATC CCAGGGGCTGGTTCAAGACTTCCACACCGAGAGCCCTTCCTGGGCCTCCAGCCCTGGAGCATCTGGAGAG CGGACCCCTGCCCGGCCACGCCCCGCCCCCGGCCCCCGCCCCGCCGACGTCGCATTAGCATGAGCGACGT AAGTGGCCCGGGCACCACTCGGGGGCTGGGACTCGCCGCGTCACAGCCCCGAGTGGAAGGGAAAAAAAAA GAGGAGGCGGCGGAGGAGGCAAGAGCCGACGCGAGGGGAGGGGAGCGCAGCGGCGGGGCTAACGGGCGGG CAAGCGGGCGGGCGGCAACAGCATGTCCCTCGGCCAGCGCGGGCGGCCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_BCSRX · enhancer · 49606833–49607457 · regulatory
ENSR10_9PNMQ · promoter · 49609820–49610320 · regulatory
ENSR10_9PNNL · promoter · 49612768–49613118 · regulatory
ENSR10_5FN42Q · CTCF_binding_site · 49612980–49613001 · regulatory
ENSR10_74WQQM · enhancer · 49613119–49613245 · regulatory
· motif · 49612982–49612998 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：532 aa
Vesicular acetylcholine transporter 長 532 個胺基酸，屬於 major facilitator superfamily 的 Vesicular transporter family。蛋白質具有多段螺旋跨膜區，並在囊泡腔側與胞質側分布不同長度的區域。其 C 端 471–532 位胺基酸區域註解為與 SEC14L1 互作；502–523 位胺基酸則標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC18A3 蛋白定位於細胞質囊泡、分泌囊泡及突觸囊泡膜，屬多重跨膜蛋白。 來源未提供定位隨細胞狀態或條件改變的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CCDC167Q9P0B6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFFQ9GZY8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PEDS1-UBE2V1I3L0A0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC18A3 與 SEC14L1 有互作關係；蛋白質特徵資料亦將其 C 端區域標註為介導此互作。來源未說明兩者是否形成特定複合體，也未提供超出互作註記的功能關係。
疾病與遺傳關聯
SLC18A3 基因變異與先天性重症肌無力症候群 21 型（CMS21）有關。這是常染色體隱性、突觸前型疾病，屬於非自體免疫性的神經肌肉傳遞障礙。患者可有眼瞼下垂、眼肌麻痺、易疲倦的肌無力、呼吸暫停危象，且症狀可能在冷水中惡化；部分患者可能有學習困難或左心室功能障礙。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC18A3 產物是電生性反向轉運蛋白，能在突觸囊泡膜上以兩個囊泡內質子交換乙醯膽鹼或膽鹼，並利用 V-type proton-pump ATPase 建立的質子電化學梯度，將神經傳遞物質儲存於囊泡，供胞吐作用釋放。依相似性推定，它也影響發育中神經肌肉接點的膽鹼性囊泡量子大小、運動神經元分化與神經支配模式，並參與前腦膽鹼性系統及海馬突觸傳遞；另可運輸 serotonin。 | 含實驗來源 | 證據與來源Electrogenic antiporter that exchanges one cholinergic neurotransmitter, acetylcholine or choline, with two intravesicular protons across the membrane of synaptic vesicles. Uses the electrochemical proton gradient established by the V-type proton-pump ATPase to store neurotransmitters inside the vesicles prior to their release via exocytosis (By similarity). Determines cholinergic vesicular quantal size at presynaptic nerve terminals in developing neuro-muscular junctions with an impact on motor neuron differentiation and innervation pattern (By similarity). Part of forebrain cholinergic system, regulates hippocampal synapse transmissions that underlie spatial memory formation (By similarity). Can transport serotonin PMID 20225888 ↗ · PMID 25355561 ↗ · PMID 8910293 ↗ |
| 分子活性 | acetylcholine(out) + 2 H(+)(in) = acetylcholine(in) + 2 H(+)(out) | 含實驗來源 | 證據與來源acetylcholine(out) + 2 H(+)(in) = acetylcholine(in) + 2 H(+)(out) PMID 20225888 ↗ · PMID 25355561 ↗ · PMID 8910293 ↗ |
| 分子活性 | choline(in) + 2 H(+)(out) = choline(out) + 2 H(+)(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | serotonin(in) + 2 H(+)(out) = serotonin(out) + 2 H(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC18A3 與 SEC14L1 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC18A3 是多重跨膜蛋白，定位於細胞質囊泡、分泌囊泡及突觸囊泡膜。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein |
| 疾病關聯 | SLC18A3 變異可造成先天性重症肌無力症候群 21 型（CMS21），此病為常染色體隱性、突觸前型的神經肌肉傳遞障礙，且非自體免疫性。表現包括眼瞼下垂、眼肌麻痺、易疲倦的肌無力、呼吸暫停危象，以及在冷水中症狀惡化；部分患者可能有學習困難或左心室功能障礙。 | 含實驗來源 | 證據與來源Myasthenic syndrome, congenital, 21, presynaptic CMS21 A form of congenital myasthenic syndrome, a group of disorders characterized by failure of neuromuscular transmission, including pre-synaptic, synaptic, and post-synaptic disorders that are not of autoimmune origin. Clinical features are easy fatigability and muscle weakness. CMS21 is an autosomal recessive, pre-synaptic form characterized by ptosis, ophthalmoplegia, fatigable weakness, apneic crises, and deterioration of symptoms in cold water. Learning difficulties and left ventricular dysfunction may be present in some patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617239 PMID 27590285 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AAGAGCCGACGCGAGGGGAGGGGAGCGCAGCGGCGGGGCT40AACGGGCGGGCAAGCGGGCGGGCGGCAACAGCATGTCCCT80CGGCCAGCGCGGGCGGCCTCTTAGCGCGGCGGGGGCTGCT120CTGGGCGCGCCCCGGGCGAAGTGCGCCCAGTCTCCGGCCC160CGGCCCCTCGGCGCGCCCGACTTCCCGGCCGCCCCTGAGC200CCAGCAGCCGCGGGTCCCGGGATCGGCTAAGAGTAGCTGC240AACGCCTCGCCGGACGGAGTCCTTTCCTTTCCCGGGACGC280TGGGCCATGAGCTCCGCGGCCACCTGAGGCACAGGGGAGT320CTGCTCGGCCAGGACAGCCTCCCCGAAGTCCCGTGCCCTC360GCCTCTGCACTGCGGGACGCCAGCGCTCGGCCCTGGCGGA400GGCGTCCTCGGAAGAGCATCGGGGTGGGGGCATGGAATCC440GCGGAACCTGCGGGCCAGGCCCGGGCGGCGGCCACCAAGC480TGTCGGAGGCTGTGGGCGCGGCGCTGCAGGAGCCCCGGCG520GCAGAGGCGCCTGGTGCTTGTTATCGTGTGCGTGGCGCTG560TTACTGGACAACATGCTGTACATGGTCATCGTGCCCATAG600TGCCCGACTACATCGCCCACATGCGCGGGGGCGGCGAGGG640CCCCACCCGGACTCCCGAGGTGTGGGAGCCCACCCTGCCG680CTGCCCACTCCGGCCAATGCCAGCGCCTACACGGCCAACA720CCTCGGCGTCCCCGACAGCTGCGTGGCCAGCGGGCTCAGC760CCTTCGGCCCCGCTACCCTACGGAGAGCGAAGACGTGAAG800ATCGGGGTGCTGTTTGCTTCCAAGGCTATCCTGCAGCTGC840TAGTGAACCCCTTGAGCGGGCCCTTCATCGACCGCATGAG880CTACGACGTGCCGCTGCTGATCGGCCTGGGCGTCATGTTC920GCCTCTACAGTCCTGTTCGCCTTCGCCGAGGACTACGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。