演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC17A4KIAA2138

solute carrier family 17 member 4

SLC17A4 編碼 solute carrier family 17 member 4,是多次穿膜的膜蛋白,可運輸尿酸、甲狀腺激素與無機磷酸鹽。

Homo sapiens6p22.2UniProt Q9Y2C5
OFFICIAL SYMBOL
SLC17A4
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q9Y2C5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC17A4 是蛋白質編碼基因,產物 solute carrier family 17 member 4 屬於 major facilitator superfamily,也歸於 sodium/anion cotransporter family。此蛋白質具有多段跨膜螺旋,是一種多次穿膜的膜蛋白。來源描述其可運輸多種有機陰離子或其他溶質;具體運輸物及所需條件則依底物而異。

Official symbol
SLC17A4
Gene name
solute carrier family 17 member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10932
UniProt
Q9Y2C5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA2138

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.2
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSLC17A4pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:25,753,300–25,783,316
Gene span
30,017 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000377905 ★25,754,742–25,781,19912
ENST0000086758825,753,300–25,783,31612
ENST0000086758925,753,300–25,783,3169
ENST0000103526625,753,300–25,783,31610
ENST0000043948525,754,699–25,783,31613
ENST0000086758725,754,699–25,783,3167
ENST0000086759125,754,699–25,783,3168
ENST0000086759225,754,699–25,783,31613
ENST0000086759425,754,699–25,783,3169
ENST0000086759525,754,699–25,783,31611
ENST0000086759625,754,699–25,783,31612
ENST0000086759725,754,699–25,783,31610

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC17A4 的產物可介導多種溶質跨膜運輸,但不同底物的運輸方式並不相同。對有機陰離子而言,其運輸依賴膜電位,且需要低濃度的氯離子;尿酸是其中一種可由此蛋白質介導運輸的底物,該過程具有氯離子依賴性。來源並未將這些條件描述為適用於所有底物,因此不宜將其概括成單一的運輸規則。

此蛋白質也能運輸甲狀腺激素,包括 L-thyroxine(T4)與 3,3',5-triiodo-L-thyronine(T3)。這兩種激素的運輸被描述為高親和力且不依賴鈉離子,與尿酸運輸所述的氯離子依賴條件不同。現有資料支持它參與這些激素的跨膜移動,但未提供更進一步的細胞內作用或生理調控細節。

另一項運輸功能是將無機磷酸鹽帶入細胞,並可透過與 Na(+) 共運輸主動進行。所列反應式呈現三個 Na(+) 與一個磷酸鹽一同由細胞外移至細胞內。這項磷酸鹽運輸與上述有機陰離子及甲狀腺激素運輸,在離子參與方式與方向描述上有所不同。

因此,SLC17A4 所編碼的蛋白質具有多底物運輸特性,涉及尿酸、甲狀腺激素和無機磷酸鹽。各底物對膜電位、氯離子或鈉離子的依賴並不相同;來源支持的是這些運輸活動及其條件,未進一步界定它們在特定組織中的整體生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 25754742 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC17A4 ENST00000377905 GRCh38 chr6:25753742-25754842 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCTGCTTGCAGTCATAAGACTGAGATACCTAATGGGTACTCAAGGAGAGATGGATGAAGTTGAAGTCGAA
GCTCAGAGAAGAGGTCAGAATTGGGTGTGAAAGGAAAGGGGACTGGCTGAGATCTCCTTGGGAGTGAGTT
TAGATAGGGAGGAAGTTCAAGGACAGAGTCTTAGGCATATCAACATTAGAAACCAGAGAAAAGATAAGGA
TTCAGCAAAACGTATTGACAAGGAACAACCAATGAGACACGAGGAAAATCAGATCTGAATGAATTAAATG
AAACAAGGCATCAAGAAGGAACGAGTGGTGGAATCTGTCAAGCACTGACAGATGGGGCCTGGGATGTGAC
CACTGGATTTGCTGGCAGAGAGGCTGGTGATGGCTTTGCTAAGGGCTGTCTTGTTGCTGATGGATTCATG
AGAAAACTAGAGGTGGGGAACCAGAATGCAAATATGTATGAGTCTTCTGAAATGTTTTGCCATAAAAGGG
AGGAGAATCACAGAGTTAATTTTCATGGAAAACTCAATGGCCTTTGTGCAAAAAATTACAATCAGAAAAC
CATAAAAATCACTCAAGTCGACCAAAATGTATTAAGTCTCTCCTCTTTGGAAAGCTCAGTTCTATTAAAC
AGCAGGATGGTGGAAAAGGGACTCAAAAGGGGCAAAATATACCCCATCTCCATGAAGATTATAATAACTC
TGAGAGACCCCAGAAGGGGATAGTGCTGTCAGTGAAACATGTGGGGTGTCAGGATCCTTATAAGAAGGGA
CATTGATTCTGATTAAGGATGAGGGAAGACATAGGTGACCTCAGCTGGGCTTGAAGCATGAGGAAGATTT
AATGAGCTTGATTTGATTATCAATCAAACAATAAAATGTAAAGTTAAAAATTAAACCACTGGGCCAATAA
AATTCTCCAAGCTGGTAACATAAGGGCTAAAGGTTTTGGGTAATTATTTACCTCCCAGAATTAGACAATT
GCAAAGAGCTTAGAATATTTATTTGAAAGGAATGAGGATCCTGCACTCTTCCTCCCTCAGGTTAGTTAGC
TTTCAAACTTTTACCCTTAATATTCTGCTTTTGAGATGATGGGAATGGGTC
SLC17A4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC17A4_2 ↗6:25,753,338正股25,753,289–25,753,348
SLC17A4_1 ↗6:25,754,742正股25,754,693–25,754,752

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 25758106–25758119 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:497 aa

1 aa497 aa跨膜區
依 Q9Y2C5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

solute carrier family 17 member 4 長 497 個胺基酸,屬於 major facilitator superfamily 及 sodium/anion cotransporter family。序列註解標示 10 段螺旋型跨膜區,位置分布於胺基酸 149–481;這些區段構成其多次穿膜的蛋白質架構。

跨膜區Helical149–169 aa
跨膜區Helical171–191 aa
跨膜區Helical203–223 aa
跨膜區Helical230–250 aa
跨膜區Helical292–312 aa
跨膜區Helical332–352 aa
跨膜區Helical368–388 aa
跨膜區Helical398–418 aa
跨膜區Helical431–451 aa
跨膜區Helical461–481 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y2C5…

AlphaFold · Q9Y2C5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Apical cell membrane

solute carrier family 17 member 4 位於細胞頂端膜,並定位於腸道刷狀緣的頂端區域。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA2138SLC17A4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能此蛋白質是依賴膜電位的有機陰離子轉運蛋白,相關運輸需要低濃度氯離子,並介導氯離子依賴性的尿酸運輸。它也能以不依賴鈉離子的高親和力方式運輸甲狀腺激素,包括 L-thyroxine(T4)與 3,3',5-triiodo-L-thyronine(T3)。此外,還可透過 Na(+) 共運輸,主動將無機磷酸鹽運入細胞。含實驗來源
證據與來源

Acts as a membrane potential-dependent organic anion transporter, the transport requires a low concentration of chloride ions. Mediates chloride-dependent transport of urate. Mediates sodium-independent high affinity transport of thyroid hormones including L-thyroxine (T4) and 3,3',5-triiodo-L-thyronine (T3). Can actively transport inorganic phosphate into cells via Na(+) cotransport

PMID 22460716 ↗ · PMID 30367059 ↗ · PMID 34937426 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)含實驗來源
證據與來源

3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)

PMID 22460716 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性urate(out) + n chloride(in) = urate(in) + n chloride(out)含實驗來源
證據與來源

urate(out) + n chloride(in) = urate(in) + n chloride(out)

PMID 22460716 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in)含實驗來源
證據與來源

L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in)

PMID 30367059 ↗ · PMID 34937426 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3,3',5-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5-triiodo-L-thyronine(in)含實驗來源
證據與來源

3,3',5-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5-triiodo-L-thyronine(in)

PMID 30367059 ↗ · PMID 34937426 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此蛋白質是多次穿膜蛋白,定位於細胞頂端膜;在腸道中位於刷狀緣的頂端區域。含實驗來源
證據與來源

Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical in the intestinal brush border

PMID 22460716 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000377905 · 3,581 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTTGAAAGGAATGAGGATCCTGCACTCTTCCTCCCTCAG40
41TAAGTAAATGCCAGTCCCTAGGAAGAGAGAACCAAAATGT80
81CTACCGGACCAGATGTCAAGGCTACAGTGGGGGACATTTC120
121CAGTGATGGCAATTTAAACGTGGCTCAAGAGGAATGCTCC160
161AGGAAAGGTTTTTGTTCAGTCCGACATGGGCTGGCCCTCA200
201TCTTGCAGCTCTGTAATTTTTCAATTTACACCCAACAAAT240
241GAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACA280
281GCCCCACCTAGCCAGCCCAATGCTTCCACAGAACGGCCCT320
321CCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGA360
361ATTTAAAGCAATGGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAA400
401ATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCAT440
441TCTTGGCTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATT480
481TGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC520
521TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGG560
561GAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACAAGGCAT600
601AGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGG640
641GTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGAGTCAACTCACCA680
681CCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGT720
721TCTACTTGCTGGTGGTCTCCTCTGCCAGACCATAGGATGG760
761CCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTT800
801GTTGTCCTCTCTGGTTTCCTCTCATTTATGATGATCCTGT840
841GAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATT880
881GTGTGTTCATTGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGT920
921CTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。