演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC17A3NPT4

solute carrier family 17 member 3

SLC17A3 編碼多重跨膜的有機陰離子轉運蛋白,參與腎臟排出尿毒素 3-indoxyl sulfate,並可運送 urate。

Homo sapiens6p22.2UniProt O00476
OFFICIAL SYMBOL
SLC17A3
CHROMOSOME
6
UNIPROT
O00476
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC17A3(solute carrier family 17 member 3)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 solute carrier family 17。來源將此蛋白描述為多重跨膜膜蛋白,並指出它可在腎臟參與尿毒素 3-indoxyl sulfate 的排出,以及運送多種有機陰離子。其運輸活動與電壓相關,並涉及腎近端小管的頂端側。這些資料勾勒出 SLC17A3 作為膜轉運蛋白的基本性質;可能的運輸底物不只一種,部分底物相關角色仍以「可能」描述。

Official symbol
SLC17A3
Gene name
solute carrier family 17 member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10931
UniProt
O00476
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NPT4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.2
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSLC17A3pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:25,833,066–25,882,478
Gene span
49,413 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000397060 ★25,844,856–25,874,24313
ENST0000048194925,833,066–25,849,8774
ENST0000086106525,833,590–25,882,47813
ENST0000086106625,833,590–25,882,47814
ENST0000086106725,833,590–25,882,47811
ENST0000086106825,833,590–25,874,4088
ENST0000086106925,833,590–25,874,40811
ENST0000086107025,833,590–25,874,40813
ENST0000086107125,833,590–25,874,40813
ENST0000050542025,841,305–25,849,3943
ENST0000036170325,844,856–25,874,40812
ENST0000036065725,844,856–25,882,47812

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC17A3 參與腎臟排出尿毒素 3-indoxyl sulfate。來源所列的運輸反應描述該物質由細胞外移至細胞內;這項資訊支持其參與腎臟排泄,但沒有進一步交代此反應在不同生理條件下的調控方式。

在腎近端小管頂端側,SLC17A3 可依電壓驅動方式運送多種有機陰離子。它尤其參與 urate 從細胞分泌至管腔;相應的反應式指出 urate 與 Na(+) 的移動方向相反,分別為 urate 移出細胞、Na(+) 移入細胞。來源並指出 urate 是 purine 代謝的終產物。

除上述底物外,SLC17A3 可能也參與 estrone sulfate、estradiol-17-beta-glucuronide 與 ochratoxin A 的代謝及分泌,亦可能涉及 bumetanide 等藥物。這些作用在來源中屬可能性描述,不應視為已確立的全部底物或功能。整體來說,現有資料支持它在腎臟有機陰離子運輸及部分物質排泄中的角色,但各底物的功能確定程度並不相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 25874243 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC17A3 ENST00000397060 GRCh38 chr6:25874143-25875243 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGCTAAGGCCAGGAAAGCCATTAAAGCACAGAACAAGGTGTAAATTTCCATGGCTGACTCTAATGCTCAT
ATAAAGAAAGGAGTCTGGATTATGAACCCAAGGCATTCAGAGAGCTGGAAATAAACTACAGAAAGCTAGG
AGTCTGAAGGCTTTGCCTCATCTATGAGACAAGGACAAGCAGAACTATACACATTCTTGGAAAGCAGTGA
CAGTGCTTTTGACTTCCTGGGTGTTAGCGCAAGAGTTAACCACAAGAAACTGAAAGAGTTTGGCCTTCAC
TGTGCACATGTAGGTATGCCAAATTTATGCCACTTATTTTCCAAAGTGGTTACAGAATGGCCCATAAATG
CTACATGATAGCATGTGTGCAAATTTAGAAATAATACAAAGCATTATTACATATAGTTTGTGAATACTCA
TATAAATAGTAAGAATAGAAAAAAATGGAGAAATCATATTATATTTATGCCAGGCTTGTTTGGTTTGGTT
TGGTTTGGTTTGCTGAGAAAAGGACAAGGACCCAGGGAAAGAGAAAGCAACAGAGTGAATGAAGTTCAAG
TTTACCCATAATATTACAATTCACATATTTCAAAGAAGAAAAAAATTAACAAAATTTCAATTAAGGGGGA
AAATCAAAAATAGCAAAGTAAAAAACACAAAAATACTGAACTCTTTAATTATAATTTATCTCTTTTTAAC
CTTTTCAAAAAAGACTAAAGACATTGAAGACACCACAAAGCAAAGCAAAATAGCTATATGCAAGTGTCTG
AACCAGAGGACACCTATGAGGTCCTGAGGAGACACTCACAAGGGGAAGGTGGAGAAGCTTACATCAGCCA
AAAAGCAGAAAGAACTGCAGAGGGGATTGGGCTGGATTTCCGAATGCTTCTTCAAAGCCTATTTGGCAAG
AAGCCCTTCTGAGTCAACTTTGTAGTTTGATGACTTTTATTAATGATTAGCAACTTAAGCCCTAGGGTGG
CAAAGAATCCTCATCTCTCTGCTCCAAAAAGTCCAAGGGAGTAAGCTTGGAGGAAACGCTGGGTTCAACT
TGAAGCCCTTCCACAGACATTAAGTCGGTAAGTCACTTCTCTTGGTATTGA
SLC17A3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC17A3_1 ↗6:25,874,243負股25,874,233–25,874,292

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 25875671–25875686 · motif

· motif · 25875671–25875686 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:420 aa

1 aa420 aa功能區域跨膜區
依 O00476 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC17A3 蛋白長 420 個胺基酸,屬於 major facilitator superfamily 的 Sodium/anion cotransporter family。序列註解預測其含有八段螺旋型跨膜區,分別位於胺基酸 126–146、154–174、218–238、256–276、292–314、319–341、357–377 與 385–405;N 端第 1–21 個胺基酸則標註為無序區。

跨膜區Helical126–146 aa
跨膜區Helical154–174 aa
跨膜區Helical218–238 aa
跨膜區Helical256–276 aa
跨膜區Helical292–314 aa
跨膜區Helical319–341 aa
跨膜區Helical357–377 aa
跨膜區Helical385–405 aa
功能區域Disordered1–21 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O00476…

AlphaFold · O00476

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane;Cell membrane

不同異構型的定位有所差異:Isoform 1 位於內質網膜,Isoform 2 則位於細胞膜。 兩者均被註記為多重跨膜蛋白;來源未提供定位轉換的條件或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NPT4SLC17A3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC17A3 介導腎臟排出尿毒素 3-indoxyl sulfate,來源未進一步說明此作用的細胞情境或調控條件。推論支持
證據與來源

Mediates the renal excretion of uremic toxin 3-indoxyl sulfate

開啟資料庫紀錄 ↗

功能SLC17A3 以電壓驅動、多底物的方式,在腎近端小管頂端側運送有機陰離子,並參與 urate 自細胞分泌至管腔;urate 是 purine 代謝的終產物。此外,它可能參與 estrone sulfate、estradiol-17-beta-glucuronide、ochratoxin A 及 bumetanide 等物質的代謝與分泌。含實驗來源
證據與來源

Transports organic anions in a voltage-driven, multispecific, manner, on the apical side of renal proximal tubule. In particular, participates in the secretion of urate from the cell into the lumen. Urate is the end product of purine metabolism. May have roles in the metabolism and secretion of estrone sulfate, estradiol-17-beta-glucuronide, ochratoxin A, as wells as drugs such as bumetanide

PMID 20810651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性urate(in) + Na(+)(out) = urate(out) + Na(+)(in)推論支持
證據與來源

urate(in) + Na(+)(out) = urate(out) + Na(+)(in)

PMID 20810651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性indoxyl sulfate(out) = indoxyl sulfate(in)推論支持
證據與來源

indoxyl sulfate(out) = indoxyl sulfate(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC17A3 的 Isoform 1 被註記為多重跨膜蛋白,定位於內質網膜;此資料未說明定位變化的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 15505377 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC17A3 的 Isoform 2 被註記為多重跨膜蛋白,定位於細胞膜;此資料未說明定位變化的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 20810651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000397060 · 2,052 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCCAAAAAGTCCAAGGGAGTAAGCTTGGAGGAAACGCT40
41GGGTTCAACTTGAAGCCCTTCCACAGACATTAAGTCGGTG80
81AAAACCATTCACTAGGAGAGGAGAAACACAATGGCCACCA120
121AGACAGAGTTGAGTCCCACAGCAAGGGAGAGCAAGAACGC160
161ACAAGATATGCAAGTGGATGAGACACTGATCCCCAGGAAA200
201GTTCCAAGTTTATGTTCTGCTCGCTATGGAATAGCCCTCG240
241TCTTACATTTCTGCAATTTCACAACGATAGCACAAAATGT280
281CATCATGAACATCACCATGGTAGCCATGGTCAACAGCACA320
321AGCCCTCAATCCCAGCTCAATGATTCCTCTGAGGTGCTGC360
361CTGTTGACTCATTTGGTGGCCTAAGTAAAGCCCCAAAGAG400
401TCTTCCTGCAAAGGCTCCTGTGTATGACTGGTCTCCTCAA440
441ATCCAAGGCATCATCTTTGGTGCTGTTGGCTATGGTGGCA480
481TACTGACAATGGCTCCCAGTGGATACCTGGCTGGAAGAGT520
521AGGAACAAAGCGAGTGGTTGGCATTTCTTTGTTTGCAACT560
561TCATTTCTCACTCTATGCATCCCTCTGGCCACTGACTTTG600
601GAATAGTCTTGCTCATTGTAACTCGAATAGTCCAGGGCCT640
641AAGCCAGTCCTCAATACTTGGGGGTCAGTTTGCAATTTGG680
681GAAAAGTGGGGCCCTCCACAAGAACGAAGCAGACTCTGCA720
721GCATTGCTTTATCAGGAATGTTACTGGGATGCTTTACTGC760
761CATCCTCATAGGTGGCTTCATTAGTGAAACCCTTGGGTGG800
801CCCTTTGTCTTCTATATCTTTGGAGGTGTTGGCTGTGTCT840
841GCTGCCTTCTCTGGTTTGTTGTGATTTATGATGACCCCGT880
881TTCCTATCCATGGATAAGCACCTCAGAAAAAGAATACATC920
921ATATCCTCCTTGAAACAACAGGTCGGGTCTTCTAAGCAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。