基因總覽
SLC17A2(solute carrier family 17 member 2)是蛋白質編碼基因,其產物為膜上的物質轉運蛋白。來源將它描述為膜電位依賴型有機陰離子轉運蛋白,並指出其可參與尿酸與無機磷酸的跨膜運送;這些功能註記均為依相似性推定。相關描述涵蓋不同類型的溶質,呈現此蛋白質具有多種轉運相關角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377850 ★ | 25,912,754–25,930,691 | 12 |
| ENST00000882944 | 25,906,892–25,930,815 | 13 |
| ENST00000882945 | 25,906,892–25,930,699 | 13 |
| ENST00000882946 | 25,906,892–25,930,815 | 12 |
| ENST00000994183 | 25,906,892–25,930,699 | 13 |
| ENST00000994184 | 25,906,892–25,930,699 | 12 |
| ENST00000360488 | 25,911,072–25,930,699 | 11 |
| ENST00000882947 | 25,911,072–25,930,815 | 12 |
| ENST00000882948 | 25,911,072–25,930,815 | 11 |
| ENST00000882949 | 25,911,072–25,930,699 | 11 |
| ENST00000882950 | 25,911,072–25,930,815 | 9 |
| ENST00000882951 | 25,911,072–25,930,815 | 11 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC17A2 的產物被描述為膜電位依賴型有機陰離子轉運蛋白。其轉運作用需要低濃度的氯離子;此條件與其轉運有機陰離子的能力相關。來源並以相似性推定指出,該蛋白質可介導氯離子依賴的尿酸運輸,但未提供更具體的細胞或生理情境。
所列尿酸轉運反應式為尿酸由細胞外進入細胞內,同時 n 個氯離子由細胞內移至細胞外。這表示尿酸與氯離子的運送方向相反;反應式中的 n 未指定固定數值。此項運輸描述同樣屬於相似性推定,不能據此延伸為來源未載明的調控方式或生理結果。
來源也指出,SLC17A2 可透過與 Na(+) 共轉運,將無機磷酸主動運入細胞。所列反應式呈現三個 Na(+) 與磷酸一同由細胞外移向細胞內。此磷酸轉運功能亦標註為依相似性推定。整體而言,現有資料支持其與尿酸及無機磷酸跨膜運輸有關,但未提供這些功能在特定組織中的作用或更廣泛生物學後果。
Promoter 與基因調控
>SLC17A2 ENST00000377850 GRCh38 chr6:25930591-25931691 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTCACTACAAGCTGAAAAGAAAAAGAAATGGATTTTCCCCTAAAGCCTCTGGAGGGGGCACAACCTTGC CAATACCTTGATTTTGGCTCAGTGAAACCCATTTTGGACTTCTGACCTTTAGAATTGTAAATAAATAAAT AATTTTGTGTTGTTTCAAGCCATCACAGTTGTGGTAATTTACTACAACAGCAATAAAATAGAATTAAATA CAGAGATCTGAGGAGTTGAGTAGGATAAGCCTACTCCAGCAGGTTATTTCGGGAGTATGGTGAGACTCAC TAGGATGGCGGAACTCAATTAAGGAAGTCTGAAGCTGATAAGCCAGAGAGGGAAGGCTCTCATTTCATTT TATAAGGGTTGCGTCACACTAGGAAGATCCAATAGCAACCACAGTCTCAAAATTAATGATTACAAATAGG ACACAATTCCAAGAGTCGGGAGCCAAGCAGAAAATGGATTAGGGAAGACATGGATGATATGAAACAGGAA GGAGGGGTACAAGGCAGCTTCCTGGGAAGTTGCCAGGGCAGTCACAGTTCACATTCATTAGGCTGTGGGC ACCAAATGCATATGGAAAATCTAGCTGACTTAACTGAACTCCTGAAGAGGAATGAACACCTCATTTATTG AGGAGCTACTACCAATTAGAATATGTATTTCATTTGTTCAATAACCCCATGAGTACAGTAACACAATCCT TGCTTTACTAAAGCGGAAGCCAATTCAAAGAGGTTCAGTGACTTGTCCAAGCTCAGGGAAAACACTAGGA AGTGAATATGGGTCTGACTCCATCACTGATTTCAGGAGCCCTGCCCTTTCCTCCACACCATGCCCCCTTG CTTTCAGAAAAAAAGGCTTGTTGACTGAATGGTTGTATGCACAGTTCAAAGCAGAAACACACGATGACAT CTTTTGAGATACTCTAACAGTGAGAACTTGAAAATGAAGTTAAAAATTAAGCGGCAAAACCAAGCCGAGG CTTTCTGAGAAAGTGGGGCCAAACCTGTTGCCGTCTGACTGCCACGTGGCTCACTATTTATCCCTGTAAA AATCTGCAAAAGTATTTGAAAGGGAAGAAGGGACAGAAAACTCCCTCCTTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC17A2_1 ↗ | 6:25,930,691 | 負股 | 25,930,681–25,930,740 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_9D9TB · enhancer · 25927844–25928126 · regulatory
· motif · 25929351–25929366 · motif
· motif · 25930855–25930865 · motif
· motif · 25931325–25931334 · motif
· motif · 25931566–25931579 · motif
· motif · 25931566–25931580 · motif
· motif · 25931574–25931589 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:439 aa
SLC17A2 蛋白質長 439 個胺基酸,屬於 major facilitator superfamily 及 Sodium/anion cotransporter family。序列註解預測有九段螺旋型跨膜區,分布於第 98–118、130–150、183–203、211–231、273–293、317–337、350–369、374–396 與 415–435 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC17A2 被標註為多次跨膜蛋白,定位於細胞頂端膜。 來源未提供定位變動條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC17A2 被描述為膜電位依賴型有機陰離子轉運蛋白,轉運需要低濃度氯離子;其可介導氯離子依賴的尿酸運輸,也可透過 Na(+) 共轉運將無機磷酸主動送入細胞。這些功能均為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a membrane potential-dependent organic anion transporter, the transport requires a low concentration of chloride ions (By similarity). Mediates chloride-dependent transport of urate (By similarity). Can actively transport inorganic phosphate into cells via Na(+) cotransport (By similarity) |
| 分子活性 | 3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | urate(out) + n chloride(in) = urate(in) + n chloride(out) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLC17A2 被標註為多次跨膜蛋白,位於細胞頂端膜。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AAACCTGTTGCCGTCTGACTGCCACGTGGCTCACTATTTA40TCCCTGTAAAAATCTGCAAAAGTATTTGAAAGGGAAGAAG80GGACAGAAAACTCCCTCCTTTTCCAAGTTAGCCTTATAGT120CTAGGGCTTAAAATACTGGTTTAATGGTGAAGGTAAGTGC160TTTTCTTCTTTTTGGGTAGAAGGATTATTACTAACTTACC200AAAGGTCCATTAAGGGGAGGGAACAGTTTTAGGAGAAGTC240AGAGAAAAGACATTAACAGCAACATAAGGATCTCCATCTG280GTAATATTGCCTAATTCCAAAATGAAGAGACTCTCTGAAA320AAGATAACTGATTCAATGAAGACCCTAGGGCAAGGCTTGA360GAAGCCACTGGTACCAATGGACACTGTGGACAATGGTCAT400TTCTCCAAGGACGCTATAAAAGACTGTCGTAGTAAAAGAG440ATTCAGGGCACAGGGAAACTCCACCACAAAGCGTGGTACC480ATTTCCCACAGAAGCTAAATGGACGGGAAGCCTGCCACCA520GGAAAGGTCCAGATTTCTGTTCATTACGCTATGGGCTGGC560TCTTATCATGCACTTCTCAAACTTCACCATGATAACGCAG600CGTGTGAGTCTGAGCATTGCGATCATCGCCATGGTGAACA640CCACTCAGCAGCAAGGTCTATCTAATGCCTCCACTGAGGG680GCCTGTTGCAGATGCCTTCAATAACTCCAGCATATCCATC720AAGGAATTTGATACAAAGGCCTCTGTGTATCAATGGAGCC760CAGAAACTCAGGGTATCATCTTTAGCTCCATCAACTATGG800GATAATACTGACTCTGATCCCAAGTGGATATTTAGCAGGG840ATATTTGGAGCAAAAAAAATGCTTGGTGCTGGTTTGCTGA880TCTCTTCCCTTCTCACCCTCTTTACACCACTGGCTGCTGA920CTTCGGAGTGATTTTGGTCATCATGGTTCGGACAGTCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。