演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC16A5MCT5

solute carrier family 16 member 5

SLC16A5 編碼質子耦聯單羧酸轉運蛋白;依相似性推定,可快速運送多種單羧酸跨越質膜。

Homo sapiens17q25.1UniProt O15375
OFFICIAL SYMBOL
SLC16A5
CHROMOSOME
17
UNIPROT
O15375
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC16A5 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 solute carrier family 16 member 5。其產物被描述為質子耦聯的單羧酸轉運蛋白,主要角色是促進多種單羧酸跨越質膜。相關轉運功能屬於相似性推定,並非此處資料所列的直接實驗證實。

Official symbol
SLC16A5
Gene name
solute carrier family 16 member 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10926
UniProt
O15375
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MCT5MCT6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSLC16A5pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:75,077,226–75,107,420
Gene span
30,195 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000329783 ★75,087,954–75,106,1627
ENST0000087297475,077,226–75,106,1628
ENST0000087297575,078,255–75,106,16210
ENST0000087297675,084,320–75,106,1626
ENST0000096958175,084,326–75,106,1627
ENST0000096958275,086,989–75,106,1628
ENST0000096958375,086,997–75,106,1627
ENST0000087297775,087,143–75,106,1626
ENST0000087297875,087,707–75,106,1626
ENST0000093715175,087,713–75,106,1625
ENST0000058012375,087,727–75,106,1627
ENST0000057884775,087,734–75,093,7963

顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC16A5 的產物被描述為質子耦聯單羧酸轉運蛋白。依相似性推定,它能快速催化多種單羧酸跨越質膜;質子耦聯是此轉運功能的特徵,但現有資料未進一步說明其轉運方向或分子步驟。

列出的可能運輸底物包括乳酸、丙酮酸,以及由 leucine、valine 和 isoleucine 衍生的支鏈 oxo acids。這些底物類別不同,資料將它們一併列為可由此蛋白質快速轉運的單羧酸。

此外,可能的底物還包括酮體 acetoacetate、beta-hydroxybutyrate,以及 acetate。資料未提供各底物間的偏好、轉運效率比較或特定生理情境,因此可支持的結論限於:此蛋白質被推定可參與多種單羧酸的質膜運輸。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 75087954 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC16A5 ENST00000329783 GRCh38 chr17:75086954-75088054 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACATAAAAGGCACCGGATCCTGAGTATACAGGGTGTGGTTGGAGTCACCATGTGGAGTGAGAAGAGGGA
GGGTGAAGGTCTGAGGCTGTGAAACTCCATCGTCCACAGATCAAAAATAAACAAGGCCGGGTGCGGTGCT
CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAAGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA
GCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTACCCGGGTGCCGTGGCGTGCAC
TTGCAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGAAGGCGGAGGCTGCAGTG
AGCTGAGGTCGCGCCGCTGCACTCCAGCGTGGGCAACAGAGCGAGACTCCCGGCCAACTGAGTACATTTC
AACTAATGCACATCAAGGACTACCCAGGTAGGGGAAGAGGGAAAAACCTGAAAAGGGCCTGTAGTTCTGA
GGGCCACATGCAGAAGTGGTGGGTGTCCTCTCACCTGCTCCCAGGGCTGAGGGGTCTGCCTGCTCCCCTA
CAAGGGACTGCCTGGACTCCCACCGGCAGGCGCAGCCCTCAAAGCTCGAGGCTTTCATTGGAAGGGCTCC
TGGGCAGGGAAAACGCAGAAAGAAGGGATCCTCAACCTCGGGCTCTGCGCCTTCCCCACCCCACTTCCTG
GGAGGTGTGGTCTCTTTATGGCATGTTATCTCCGCCCCAAGCCCGGGGCCCTAGACCCTGAGCCGGGAAA
ACCAGAAGCTAGAAAGAGGGCATCCGGGTTGTGCAAATTTCAGACACACGGATATCCCGTGGCGCCTGCG
TCCGGAGCCCGGCCCTGCTGCTGGACTGTCCCCGGCCACGCCCGCCGCCCCTCCCGCATCCTGGCCCCTT
CCCCACCCGACGGAATCCCGGGGAGGCTGGAAGGTGGGTCCCCGCCCACACCGCCCTGGGCCCGCCCTGC
CTGGCCGCGGCGCTTGGCCCAGTCCCGCGGTCCTCGTCGCGACCGGCCCGGGCCGCAGGACGCCGCGCTC
GGGGGAGCTGAGCCACCTCTCCGCCAGGCCCGTGCGAGCGGGTGAGCGGGC
SLC16A5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC16A5_3 ↗17:75,079,049正股75,079,000–75,079,059
SLC16A5_2 ↗17:75,087,765正股75,087,716–75,087,775
SLC16A5_1 ↗17:75,087,962正股75,087,913–75,087,972
SLC16A5_4 ↗17:75,091,702正股75,091,653–75,091,712

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BJWBT · enhancer · 75083887–75084513 · regulatory

ENSR17_934RN7 · enhancer · 75085593–75085898 · regulatory

ENSR17_BJWCC · promoter · 75087237–75087964 · regulatory

ENSR17_934RP3 · promoter · 75088448–75088948 · regulatory

ENSR17_BJWCL · enhancer · 75088949–75089466 · regulatory

ENSR17_847LFQ · enhancer · 75089750–75089909 · regulatory

ENSR17_C9G6Z · enhancer · 75090937–75092374 · regulatory

ENSR17_934RQB · promoter · 75092797–75093297 · regulatory

· motif · 75084303–75084315 · motif

· motif · 75084305–75084312 · motif

· motif · 75084305–75084318 · motif

· motif · 75084305–75084320 · motif

· motif · 75084607–75084618 · motif

· motif · 75085622–75085635 · motif

· motif · 75085730–75085745 · motif

· motif · 75085730–75085745 · motif

· motif · 75086744–75086757 · motif

· motif · 75086744–75086758 · motif

· motif · 75087645–75087656 · motif

· motif · 75087654–75087664 · motif

· motif · 75087768–75087784 · motif

· motif · 75087828–75087838 · motif

· motif · 75087902–75087912 · motif

· motif · 75089176–75089189 · motif

· motif · 75089200–75089215 · motif

· motif · 75089346–75089359 · motif

· motif · 75089537–75089549 · motif

· motif · 75089539–75089546 · motif

· motif · 75089539–75089554 · motif

· motif · 75089964–75089986 · motif

· motif · 75089964–75089986 · motif

· motif · 75091435–75091450 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:505 aa

1 aa505 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O15375 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC16A5 的蛋白質長度為 505 個胺基酸,屬於 major facilitator superfamily,並歸入 Monocarboxylate porter(TC 2.A.1.13)家族。序列註解標示多段螺旋型跨膜區,並交錯分布於細胞質側與細胞外側的區段;第 443–464 位胺基酸另標示為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–17 aa
跨膜區Helical18–38 aa
拓樸區域Extracellular39–53 aa
跨膜區Helical54–74 aa
拓樸區域Cytoplasmic75–80 aa
跨膜區Helical81–101 aa
拓樸區域Extracellular102–110 aa
跨膜區Helical111–131 aa
拓樸區域Cytoplasmic132–137 aa
跨膜區Helical138–158 aa
拓樸區域Extracellular159–171 aa
跨膜區Helical172–192 aa
拓樸區域Cytoplasmic193–239 aa
跨膜區Helical240–260 aa
拓樸區域Extracellular261–274 aa
跨膜區Helical275–295 aa
拓樸區域Cytoplasmic296–305 aa
跨膜區Helical306–326 aa
拓樸區域Extracellular327–329 aa
跨膜區Helical330–350 aa
拓樸區域Cytoplasmic351–367 aa
跨膜區Helical368–388 aa
拓樸區域Extracellular389–396 aa
跨膜區Helical397–417 aa
拓樸區域Cytoplasmic418–505 aa
功能區域Disordered443–464 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15375…

AlphaFold · O15375

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC16A5 被標示為多次穿越膜的蛋白質,定位於細胞膜。 現有資料未描述其定位變化條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MCT5SLC16A5EFEMP2HSPB8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC16A5 的產物被推定為質子耦聯單羧酸轉運蛋白,可快速催化多種單羧酸跨越質膜;可能底物包括乳酸、丙酮酸、由 leucine、valine 和 isoleucine 衍生的支鏈 oxo acids,以及酮體 acetoacetate、beta-hydroxybutyrate 和 acetate。此功能為相似性推定。推論支持
證據與來源

Proton-linked monocarboxylate transporter. Catalyzes the rapid transport across the plasma membrane of many monocarboxylates such as lactate, pyruvate, branched-chain oxo acids derived from leucine, valine and isoleucine, and the ketone bodies acetoacetate, beta-hydroxybutyrate and acetate (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC16A5 被標示為位於細胞膜的多次穿膜蛋白質;該定位資料未提供其他細胞位置或定位變化條件。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000329783 · 1,940 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCGCGGTCCTCGTCGCGACCGGCCCGGGCCGCAGGA40
41CGCCGCGCTCGGGGGAGCTGAGCCACCTCTCCGCCAGGCC80
81CGTGCGAGCGGTACAAAGAAAAGAGCACTTCCCTGCTGGG120
121GCAGAGGCCAAGCCAGAGCCCTGGCCCCATCACCTCTCTG160
161CCCTGCTTGAGTCTGGAATGGACCTCCCTGCCTGGAAGCT200
201GCATTGCCCTTGGTCCTGGGCCTGCCTGCCCCCTGGGGAA240
241CACAGGCAGCAGCCACATTGGCAGTGAGGCCGTGGCAGCG280
281TCGGCAGCAGAGGATGCCCCAGGCCCTGGAGCGTGCAGAT320
321GGCAGCTGGGCCTGGGTGGTGCTGCTGGCCACCATGGTGA360
361CCCAGGGCCTCACCCTGGGCTTCCCCACGTGTATCGGCAT400
401CTTCTTCACTGAATTGCAATGGGAGTTCCAGGCCAGCAAC440
441AGCGAGACCTCTTGGTTCCCCTCCATCCTCACGGCTGTGC480
481TCCACATGGCAGGGCCCCTGTGCAGCATCCTGGTGGGACG520
521CTTCGGCTGCCGAGTGACCGTGATGCTGGGGGGCGTGCTG560
561GCCAGCCTGGGCATGGTGGCCAGCTCCTTCTCTCACAACC600
601TCAGCCAGCTCTACTTCACAGCAGGATTCATCACAGGCCT640
641GGGCATGTGCTTCAGCTTCCAGTCAAGCATCACGGTGCTG680
681GGCTTCTACTTTGTCCGCCGGCGGGTGCTGGCCAACGCGC720
721TGGCCTCGATGGGCGTCTCCCTGGGCATCACCCTCTGGCC760
761GCTGCTCTCCCGCTACCTTCTGGAGAACCTGGGCTGGAGG800
801GGTACCTTCCTTGTCTTCGGCGGGATCTTTCTCCACTGCT840
841GCATCTGCGGGGCCATCATAAGGCCTGTGGCCACCAGTGT880
881GGCCCCTGAGACCAAAGAATGTCCCCCGCCACCTCCCGAG920
921ACACCTGCACTTGGCTGCCTGGCTGCATGCGGCCGGACCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。