基因總覽
SLC16A4(solute carrier family 16 member 4)是蛋白質編碼基因,產物屬於主要易化子超家族中的 Monocarboxylate porter 家族。此蛋白質全長 487 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,並包含位於細胞質側的區域。資料將其歸類為單羧酸轉運蛋白,並以可能性描述其轉運角色;現有來源未提供更具體的底物、運輸方向或生理情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369779 ★ | 110,362,857–110,391,026 | 9 |
| ENST00000541986 | 110,362,847–110,391,082 | 8 |
| ENST00000472422 | 110,362,847–110,391,082 | 8 |
| ENST00000369781 | 110,362,847–110,391,082 | 8 |
| ENST00000855890 | 110,362,847–110,391,082 | 10 |
| ENST00000855891 | 110,362,847–110,391,082 | 7 |
| ENST00000855892 | 110,362,847–110,391,082 | 10 |
| ENST00000962116 | 110,362,847–110,391,082 | 8 |
| ENST00000962117 | 110,362,847–110,391,082 | 9 |
| ENST00001145407 | 110,362,847–110,391,082 | 9 |
| ENST00000437429 | 110,362,851–110,391,082 | 7 |
| ENST00000467986 | 110,375,036–110,379,183 | 3 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC16A4 的產物被推定為單羧酸轉運蛋白,屬於 Monocarboxylate porter 家族,並歸入主要易化子超家族。這項註釋指出它可能參與單羧酸的跨膜運輸,但來源以「可能」描述其功能,並未提供足以確認底物種類或運輸特性的細節。
目前資料僅支持將 SLC16A4 視為可能具有單羧酸轉運作用的膜蛋白;沒有說明其轉運方向、是否依賴其他物質共同運輸,或在何種細胞與生理條件下發揮作用。因此,不能由家族歸屬進一步推定特定底物或調控方式。
這項功能註釋依據序列相似性推定,並非來源中直接描述的實驗確認結果。其生物學意義可限定為:SLC16A4 可能提供單羧酸跨越細胞膜的運輸途徑;其確切作用範圍與生理功能仍無法從現有資料判定。
Promoter 與基因調控
>SLC16A4 ENST00000369779 GRCh38 chr1:110390926-110392026 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAAAAAAAGTTGTCTAGAGTGTATTCATAATTACAAACAGCTCTCTGAAAAGCATTTATTTGCCTTCTC TCTTTGGGTTTTCTCCTTCTGTTGAATGTTTATTTGATCCTTGCCACCAGCATCATGTAACTGCATAATC CTTCCATGCTTACACTTACAGGGCACCCTCCCAAACCACTAAGCTGTCCTTCTGCAAGCACTTTAATCAA AAAGTATTATAGAGTTTGATTTTAAGAATCTGAGAAGCCTCTTGCTTCTTAAAAAGGAACATGCATAAAT ATGTGCAGATTTTCCAGATAAAACTAAAAACACATCCTTTCGTCTAAAATATACTCTGGTTTAAAATCTG GAATATTGGTGTGGGAGACGAAAGACAATTTCCCATTTGACTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTATGTGGAG GGTAGAGGGAGGAAATGGGAAGAGAAAGTTGAATTATCCCAGTAATTTTCTAGGGGTCTCAGCCTTAACC ATTTCCAAAATATAATAAAAAAAATCTCATTAAAATTACTACGAGCATACGTCTTTTGCAGGAGGTGGTT GAGGTAATCAGATCTCAAAAATGCAATTAAAATGGGGTCTGAAACCCCAAATTAGTAACCAGAATCTTTA GTCAATATACAAAAGGCCACACGAATGGGTTGAGCTTACTGAAGATTTCTGTTTGTGGCCCAGGAAATGC CTCTCTCACCACCCATCCAGGAGTTTTATATTCTCCTGTAAAATAAGCATGTTGTGAGAAGTTCCCTGAG GAAATTTGAAGACAAGTGTATGAGAGCTCTGGAGCCCCATCCCCCTGCCCTGAGCATAGTCGCCAAAAGG ACTTTCCACTTAGTTTACTTCATGCTTGCTTTTGAGCCTGCGGCAAAAAATTCTACCTTCTGAGTGACTG TGGGTGGAGGGAGGGCCTGAGATGACATCAAATCACAGTCTTTCCTCCTCCCCTCAGGAAGTAAAGTCCA CTAGCAGGAGGGCCTAAATCGTCTGAGCCCTCCTTGGCTCTTACAATGCTCACTTGTTTTCACAATGCAG CAAAATGAAATGCCTTAGAAAAAGAGTAACATTCCAGAAAACGGTGTAATT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC16A4_2 ↗ | 1:110,391,026 | 負股 | 110,391,016–110,391,075 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_BRWHT · enhancer · 110390111–110391015 · regulatory
ENSR1_93LS2W · promoter · 110391016–110391397 · regulatory
ENSR1_BRWJC · enhancer · 110393460–110394454 · regulatory
· motif · 110387541–110387555 · motif
· motif · 110387541–110387555 · motif
· motif · 110387723–110387737 · motif
· motif · 110387723–110387737 · motif
· motif · 110394072–110394086 · motif
· motif · 110394072–110394086 · motif
· motif · 110394382–110394393 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:487 aa
SLC16A4 蛋白質長 487 個胺基酸,預測具有多段跨膜螺旋,並在膜兩側形成細胞質側與細胞外側區段。第 206 至 250 位胺基酸另註記為無序區。這些拓樸與區域特徵屬序列註解;來源未提供各區段的實驗功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC16A4 被註記為細胞膜上的多次跨膜蛋白。 此定位依據包含序列特徵預測及相似性證據;來源沒有描述定位隨條件改變的情形,也未指出不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- REEP2Q9BRK0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM237Q96Q45-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTGAGCCCTCCTTGGCTCTTACAATGCTCACTTGTTTT40CACAATGCAGCAAAATGAAATGCCTTAGAAAAAGAGTAAC80ATTCCAGAAAACGGTGTAATTTATTTTTCTTCCTTAATTG120CCCCATCTGTGGAGGATTTCTTTGCTGAACACCACATCAA160AGGGATCTTCTGCATTTAAAATAGAAGAGGCATCATGCTG200AAGAGGGAGGGGAAGGTCCAACCTTACACTAAAACCCTGG240ATGGAGGATGGGGATGGATGATTGTGATTCATTTTTTCCT280GGTGAATGTGTTTGTGATGGGGATGACCAAGACTTTTGCA320ATTTTCTTTGTGGTCTTTCAAGAAGAGTTTGAAGGCACCT360CAGAGCAAATTGGTTGGATTGGATCCATCATGTCATCTCT400TCGTTTTTGTGCAGGTCCCCTGGTTGCTATTATTTGTGAC440ATACTTGGAGAGAAAACTACCTCCATTCTTGGGGCTTTCG480TTGTTACTGGTGGATATCTGATCAGCAGCTGGGCCACAAG520TATTCCTTTTCTTTGTGTGACTATGGGACTTCTACCCGGT560TTGGGTTCTGCTTTCTTATACCAAGTGGCTGCTGTGGTAA600CTACCAAATACTTCAAAAAACGATTGGCTCTTTCTACAGC640TATTGCCCGTTCTGGGATGGGACTGACTTTTCTTTTGGCA680CCCTTTACAAAATTCCTGATAGATCTGTATGACTGGACAG720GAGCCCTTATATTATTTGGAGCTATCGCATTGAATTTGGT760GCCTTCTAGTATGCTCTTAAGACCCATCCATATCAAAAGT800GAGAACAATTCTGGTATTAAAGATAAAGGCAGCAGTTTGT840CTGCACATGGTCCAGAGGCACATGCAACAGAAACACACTG880CCATGAGACAGAAGAGTCTACCATCAAGGACAGTACTACG920CAGAAGGCTGGACTACCTAGCAAAAATTTAACAGTCTCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。