基因總覽
SLC16A3 是蛋白質編碼基因，產物為 Monocarboxylate transporter 4，屬於 major facilitator superfamily 中的 Monocarboxylate porter 家族。此蛋白質是多次穿膜的膜蛋白，具有多段跨膜螺旋，並在膜兩側形成胞質與細胞外區域。其基本角色是以質子依賴方式轉運單羧酸，包含 L-lactate 與 pyruvate；其中在高糖解活性細胞的 L-lactate 外排上占主要作用。這些特徵使它成為細胞膜上負責單羧酸跨膜運送的載體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000582743 ★ | 82,229,042–82,240,086 | 5 |
| ENST00000580098 | 82,217,878–82,240,086 | 5 |
| ENST00000877806 | 82,217,878–82,239,499 | 5 |
| ENST00000877807 | 82,225,748–82,239,483 | 5 |
| ENST00000584689 | 82,228,397–82,240,086 | 5 |
| ENST00000392341 | 82,228,415–82,240,086 | 5 |
| ENST00000578684 | 82,229,042–82,240,086 | 4 |
| ENST00000577650 | 82,229,042–82,240,086 | 6 |
| ENST00000877808 | 82,229,042–82,239,497 | 6 |
| ENST00000877809 | 82,229,042–82,239,481 | 6 |
| ENST00000948113 | 82,229,042–82,239,475 | 6 |
| ENST00001066876 | 82,229,042–82,239,496 | 5 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC16A3 的產物以質子依賴方式轉運單羧酸，來源列出的底物包括 L-lactate 與 pyruvate。轉運方向會隨底物而異：L-lactate 可與 H+ 一同由細胞內移向細胞外；pyruvate 則可與 H+ 一同由細胞外移入細胞內。這些反應描述了底物與質子協同跨膜運送的方向，並非只涉及單一底物或單一方向。
在高糖解活性細胞中，SLC16A3 被描述為 L-lactate 外排的主要承擔者；此項角色標示為依相似性推定，因此應視為相似性支持的功能描述。將 L-lactate 輸出與 pyruvate 輸入的轉運活性合併來看，SLC16A3 能參與單羧酸在細胞膜兩側的移動；但現有資料未提供更廣泛的細胞或生理效應細節，不能據此延伸出未列明的調控結果。
Promoter 與基因調控
>SLC16A3 ENST00000582743 GRCh38 chr17:82228042-82229142 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACGGGCTTACCAGTGCCTCGGTCCCCGAAGCCCCCGGGTCCGGGAGGGGCCAGTTAAAGCATTCCTGTGG CCCTGGCAGGGTGGCCCTGACAACTAGACTCCTTGGTCCAGGCCAACAAAGGCCTTACTCCCTGGAGCCA CCTCAAACCTCAGCACCCAAAGCGGCCCGTTATTTCCATGTTGCAAATGAGAGAAAACAGGCTGGGAGAA GCACCTCACGAGGTCCAGCGGGTGGGCAGCCCTCGCCTCCCCGAAGGTGGGAGCCGCCCCGGCCTCCGCG TCGGGTTCTGGGCCGCGAGAGGGGCGGGGCAGGGGCGCAGGGCTGGAGTCGGTGGCTTTGTAGGGCCCCG CAGGGCGCGGAGCCACCTGGGGAAACGGAAGTTCAGGGAGGGCGAGGCCGTGCCCCACATCCAGGCAGCG CAGGCCGCGGGCCGCTCCCCTAGCCAGGAAGAGCCGCCGTCCGCACCGGGACCGGAGAGGAAGCGGAGGT CTGAAGGGGGACAGGTCGGACGTGGCCTCAGAGAGGGAGGATGTGGGCCCCGGAGCTGAGCCAGGCGGCC GGAACCCCACGGGACCCGCGCGCACCTCCCCACCAAAGGGGCCCCGGCGTTGGGGGGCGAGGGGTCGCTG CCCTGGAGGACGTTGGGACCTGCCGCGCTGCGCTCCGAGGCGGGGAAACGGAGGGACGGCGGGGCGGAGG GGCGAAGCGAGCCTGGACTCCGGGGGAGGCGAGGCCGGGAAGACCCAGTCCCGAGGAGCAGAGGGGGCGG GCCAGCTCCGGGCCGGGGGCGCCGACGGGGCCGGTTCCGGTTGGGGGGGTCCCTGGGCCCGGCGGGGTTG CGGGACGCGCCGTCGGGGAGCTGCGGCCCGGGAGCCCGTCCGGAGGCGGCGCGGGGTCCGGGCGGGGCGC GCAGGGGCGGCGCCAGGCGGTGACGTGCGCGGGGGACGTGCCGCGCCAGCGACCCGAGCACTTAAAGTCG CCCCCGGCGCGGAGCGGACCGGCAGAGGCGGGCAGAGGCGGCGAGAGGCGGCGAGAGGCGGGCTGAGGCG GCCCAGCGGCGGCAGGTAGGCGCGGCCGCGATGCTCGCGCGCGGGCCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC16A3_3 ↗ | 17:82,217,957 | 正股 | 82,217,908–82,217,967 |
| SLC16A3_2 ↗ | 17:82,228,448 | 正股 | 82,228,399–82,228,458 |
| SLC16A3_1 ↗ | 17:82,229,042 | 正股 | 82,228,993–82,229,052 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_937M75 · enhancer · 82225386–82225796 · regulatory
ENSR17_BLBLB · enhancer · 82226973–82227551 · regulatory
ENSR17_937M83 · promoter · 82228552–82229052 · regulatory
ENSR17_5PC7TB · CTCF_binding_site · 82230395–82230416 · regulatory
ENSR17_937M9D · promoter · 82233197–82233697 · regulatory
ENSR17_76SK4X · enhancer · 82233698–82233814 · regulatory
· motif · 82228179–82228194 · motif
· motif · 82228413–82228424 · motif
· motif · 82228413–82228424 · motif
· motif · 82228415–82228424 · motif
· motif · 82228654–82228669 · motif
· motif · 82228799–82228812 · motif
· motif · 82229618–82229626 · motif
· motif · 82230005–82230016 · motif
· motif · 82230307–82230316 · motif
· motif · 82230397–82230413 · motif
· motif · 82230405–82230417 · motif
· motif · 82230450–82230466 · motif
· motif · 82230450–82230466 · motif
· motif · 82231026–82231038 · motif
· motif · 82231029–82231036 · motif
· motif · 82231244–82231259 · motif
· motif · 82231863–82231875 · motif
· motif · 82231865–82231872 · motif
· motif · 82231865–82231878 · motif
缺氧時，SLC16A3 的表現會透過 HIF1A 介導的機制上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：465 aa
Monocarboxylate transporter 4 長 465 個胺基酸，屬於 major facilitator superfamily 的 Monocarboxylate porter 家族。蛋白質具有多段跨膜螺旋，N 端與 C 端均位於胞質側；C 端區域包含兩段 basolateral sorting signal，另有一段被註記為無序區域。跨膜與拓樸特徵的註解包含預測性證據。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC16A3 位於細胞膜；其在極化上皮細胞中的基底外側表現，仰賴 C 端胞質尾端的 basolateral sorting signals。 質膜定位則依賴 BSG/MCT4 互作。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BANPQ8N9N5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASKO14936 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJA8P48165 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HDAC7Q8WUI4-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HPCAP84074 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MPP7Q5T2T1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NR2C2APQ86WQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC16A3 與 BSG 互作；這項互作介導 SLC16A3 朝質膜定位。來源描述的是具定位作用的互作，未提供兩者形成更大型複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC16A3 是質子依賴型單羧酸轉運蛋白，可運送 L-lactate 與 pyruvate。依相似性推定，它在高糖解活性細胞將 L-lactate 輸出方面占主要作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Proton-dependent transporter of monocarboxylates such as L-lactate and pyruvate. Plays a predominant role in L-lactate efflux from highly glycolytic cells (By similarity) PMID 11101640 ↗ · PMID 23935841 ↗ · PMID 31719150 ↗ |
| 分子活性 | (S)-lactate(in) + H(+)(in) = (S)-lactate(out) + H(+)(out) | 含實驗來源 | 證據與來源(S)-lactate(in) + H(+)(in) = (S)-lactate(out) + H(+)(out) PMID 11101640 ↗ · PMID 23935841 ↗ · PMID 31719150 ↗ |
| 分子活性 | pyruvate(out) + H(+)(out) = pyruvate(in) + H(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC16A3 與 BSG 互作；這項互作介導 SLC16A3 朝質膜定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with BSG; interaction mediates SLC16A3 targeting to the plasma membrane PMID 10921872 ↗ |
| 細胞定位 | SLC16A3 是多次穿膜蛋白，位於細胞膜及基底外側細胞膜。它在質膜的定位依賴 BSG/MCT4 互作；在極化上皮細胞中的基底外側表現，則由 C 端胞質尾端的基底外側分選訊號確保。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Plasma membrane localization is dependent upon the BSG/MCT4 interaction. Basolateral sorting signals (BLSS) in C-terminal cytoplasmic tail ensure its basolateral expression in polarised epithelial cells PMID 10921872 ↗ · PMID 11101640 ↗ · PMID 15505343 ↗ · PMID 23935841 ↗ · PMID 21199217 ↗ |
| 調控 | 缺氧會透過 HIF1A 介導的機制上調 SLC16A3。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGCAGAGGCGGGCAGAGGCGGCGAGAGGCGGCGAGAGGCG40GGCTGAGGCGGCCCAGCGGCGGCAGGTGAGGCGGAACCAA80CCCTCCTGGCCATGGGAGGGGCCGTGGTGGACGAGGGCCC120CACAGGCGTCAAGGCCCCTGACGGCGGCTGGGGCTGGGCC160GTGCTCTTCGGCTGTTTCGTCATCACTGGCTTCTCCTACG200CCTTCCCCAAGGCCGTCAGTGTCTTCTTCAAGGAGCTCAT240ACAGGAGTTTGGGATCGGCTACAGCGACACAGCCTGGATC280TCCTCCATCCTGCTGGCCATGCTCTACGGGACAGGTCCGC320TCTGCAGTGTGTGCGTGAACCGCTTTGGCTGCCGGCCCGT360CATGCTTGTGGGGGGTCTCTTTGCGTCGCTGGGCATGGTG400GCTGCGTCCTTTTGCCGGAGCATCATCCAGGTCTACCTCA440CCACTGGGGTCATCACGGGGTTGGGTTTGGCACTCAACTT480CCAGCCCTCGCTCATCATGCTGAACCGCTACTTCAGCAAG520CGGCGCCCCATGGCCAACGGGCTGGCGGCAGCAGGTAGCC560CTGTCTTCCTGTGTGCCCTGAGCCCGCTGGGGCAGCTGCT600GCAGGACCGCTACGGCTGGCGGGGCGGCTTCCTCATCCTG640GGCGGCCTGCTGCTCAACTGCTGCGTGTGTGCCGCACTCA680TGAGGCCCCTGGTGGTCACGGCCCAGCCGGGCTCGGGGCC720GCCGCGACCCTCCCGGCGCCTGCTAGACCTGAGCGTCTTC760CGGGACCGCGGCTTTGTGCTTTACGCCGTGGCCGCCTCGG800TCATGGTGCTGGGGCTCTTCGTCCCGCCCGTGTTCGTGGT840GAGCTACGCCAAGGACCTGGGCGTGCCCGACACCAAGGCC880GCCTTCCTGCTCACCATCCTGGGCTTCATTGACATCTTCG920CGCGGCCGGCCGCGGGCTTCGTGGCGGGGCTTGGGAAGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。