基因總覽
SLC15A2(solute carrier family 15 member 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於主要促進因子超家族,並歸入質子依賴型寡胜肽轉運蛋白 POT/PTR 家族。蛋白質全長 729 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,並含有較長的胞外區域;這些結構特徵與其膜轉運蛋白性質相符。其主要角色是協助胜肽跨膜運輸,此外也能運送特定非胜肽分子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000489711 ★ | 121,894,401–121,944,188 | 22 |
| ENST00000295605 | 121,894,355–121,944,188 | 21 |
| ENST00000886960 | 121,894,355–121,944,188 | 22 |
| ENST00000886961 | 121,894,355–121,944,188 | 20 |
| ENST00000886962 | 121,894,355–121,944,188 | 21 |
| ENST00000886963 | 121,894,355–121,944,188 | 20 |
| ENST00000886964 | 121,894,355–121,944,188 | 22 |
| ENST00000966831 | 121,894,355–121,944,188 | 22 |
| ENST00000966832 | 121,894,355–121,944,188 | 22 |
| ENST00001143656 | 121,894,355–121,944,188 | 22 |
| ENST00000469013 | 121,895,339–121,915,639 | 7 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC15A2 是質子偶聯的胺基酸轉運蛋白,可運輸由二至四個胺基酸組成的寡胜肽,其中以二胜肽為優先底物。來源列出的運輸反應顯示,二胜肽與質子可共同由膜外移至膜內;不同底物所需的質子數並不相同。對中性及陰離子二胜肽而言,質子與胜肽的化學計量比為 2:1 或 3:1,此項比例為相似性推定。具體列出的底物包括 glycyl-L-leucine、glycyl-L-lysine、glycyl-L-glutamate、L-alanyl-L-alanine,以及 L-胺基酸三胜肽;其中 glycyl-L-glutamate 與 muramyl dipeptide 的運輸反應各伴隨三個質子,其餘所列例子則伴隨兩個質子。
在腎臟中,SLC15A2 參與從腎小球濾液吸收循環中的二胜肽與三胜肽。其運輸範圍也包括若干胜肽樣或非胜肽分子:可運送二胜肽樣的胺基肽酶抑制劑 bestatin、carnosine,以及 β-內醯胺抗生素,例如 aminocephalosporin cefadroxil;來源亦指出它可運輸其他抗病毒與抗癌藥物,但未列出這些藥物的名稱。這些資料說明其底物不只限於一般膳食或循環胜肽。
SLC15A2 也與先天免疫中的微生物辨識相關。它可促進 NOD 樣受體(NLRs)偵測微生物病原體;此功能為相似性推定。對特定細菌肽聚醣,SLC15A2 可促使其跨越細胞膜;在巨噬細胞中,運輸亦可經由吞噬體膜進行。例子包括 muramyl dipeptide(MDP),即 NOD2 的配體。這項運輸將特定細菌成分移至細胞內側,與 NOD 受體對微生物訊號的偵測相連結。
Promoter 與基因調控
>SLC15A2 ENST00000489711 GRCh38 chr3:121893401-121894501 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTAAGCCTCTGCACCCAGCCAAAACTCACCATCTTTCTTA TCTTCCAAACTCAGTTTTATGATGACTTTCCTTCTCCAATGCATTTTAATCCTCTGCATTCCTACATTCC ATTTATGTAACCTCCATACCTGAATAATGACTGACACTAACTCCACTTTTCCCAGCTGTCATGGCATAGT GAAAATTCCAGATCTGCCACTTAGTGGACAGGTACTTTGAACAAATTTCTTAACCTCTGGGAACATTACT TTCTATAAAATGGGGATAGTAATATGAATTAGAATAAATATATATGTTATAGATATACAACATAGATGTA ATTCATATATATTAACCTTTCAATAGTAGATGTTCAATAAATTACAGCTATTGTTACCCTGAAATCAGTT TTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATC TCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTTCTGCCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA TTATAGGCGCCCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCAT GTGGGCCAGGCTGCTGACCTAAAACGATCCGCCTGCCTGGGCCTTCCAAAGTGCTAGGATTATATGCGTG AACCACCGCGCCTGACCATGGAATCAGTTTTTCAATCTGTGCTCGAGGTGTTGTGTTCTTAACTATCTTC TACTCCTTTGCAAAGATAATCTTTCTTAAACATAGACTTTCTAATCAGTTCTCTAGCATTGTTTCATTCT GTCTTTGGCATGTTTTCACTTTGCTGTGCTGTACTTTTACACATTCTTTTTAACTATAGCTTCCTGCTTT GCTCTGGATCAGGAAGCTATTGAAGCTGACACCCACAGAGTTAAACTGAGTTGCTGAAGCCACCAGCTCC CCCTCCCAGTCCTTCTTTTCAGAGTAGGCTGGCAGCTGTCCTAACTGCCTACTAAAGCCAAATGCTTGAG GAGAGAGAGAGAGTAAGGAGCCAGCCATGAATCCTTTCCAGAAAAATGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC15A2_1 ↗ | 3:121,894,440 | 正股 | 121,894,391–121,894,450 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_93RDBC · promoter · 121894119–121894450 · regulatory
ENSR3_85KQM9 · enhancer · 121895222–121895381 · regulatory
· motif · 121895341–121895350 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:729 aa
蛋白質長 729 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,並屬於主要促進因子超家族中的質子依賴型寡胜肽轉運蛋白 POT/PTR 家族。其胞外區域包括胺基酸 402–611;胺基酸 1–34 則註解為無序區。其餘序列分布於胞質側、胞外側及跨膜區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC15A2 定位於頂端細胞膜及細胞膜,也可見於胞質囊泡與吞噬體膜。 在靜止的巨噬細胞中,它與細胞膜相關;粒子內化後,則在吞噬杯及吞噬體中富集,呈現隨吞噬過程改變的定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
- ADAM12O43184-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKS1AQ49AR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C11orf87Q6NUJ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRDQ9H2X0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KLHL38Q2WGJ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPRPQ5T749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-2P59991 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP15-1Q3LI76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP26-1Q6PEX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-3Q3LI67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO4P61968 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC15A2 經由胞外區域與 trypsin 互作。來源描述的是蛋白質互作,未指出兩者形成複合體或具有其他功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 11 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC15A2 是質子偶聯轉運蛋白,可運送二至四個胺基酸組成的寡胜肽,並偏好二胜肽;中性與陰離子二胜肽的質子:胜肽比例為 2:1 或 3:1,此比例為相似性推定。它在腎臟參與吸收腎小球濾液中的二胜肽及三胜肽,也能運送 cefadroxil、bestatin、carnosine、其他抗病毒與抗癌藥物。它亦參與 NLR 相關先天免疫,並可運輸細菌肽聚醣,包括 NOD2 配體 MDP;巨噬細胞中可經吞噬體膜運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源Proton-coupled amino-acid transporter that transports oligopeptides of 2 to 4 amino acids with a preference for dipeptides. Transports neutral and anionic dipeptides with a proton to peptide stoichiometry of 2:1 or 3:1 (By similarity). In kidney, involved in the absorption of circulating di- and tripeptides from the glomerular filtrate. Can also transport beta-lactam antibiotics, such as the aminocephalosporin cefadroxil, and other antiviral and anticancer drugs. Transports the dipeptide-like aminopeptidase inhibitor bestatin (By similarity). Also able to transport carnosine. Involved in innate immunity by promoting the detection of microbial pathogens by NOD-like receptors (NLRs) (By similarity). Mediates transport of bacterial peptidoglycans across the plasma membrane or, in macrophages, the phagosome membrane: catalyzes the transport of certain bacterial peptidoglycans, such as muramyl dipeptide (MDP), the NOD2 ligand PMID 16434549 ↗ · PMID 18367661 ↗ · PMID 20406817 ↗ · PMID 31073693 ↗ · PMID 7756356 ↗ |
| 分子活性 | a dipeptide(out) + 2 H(+)(out) = a dipeptide(in) + 2 H(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | N-acetyl-D-muramoyl-L-alanyl-D-isoglutamine(out) + 3 H(+)(out) = N-acetyl-D-muramoyl-L-alanyl-D-isoglutamine(in) + 3 H(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源N-acetyl-D-muramoyl-L-alanyl-D-isoglutamine(out) + 3 H(+)(out) = N-acetyl-D-muramoyl-L-alanyl-D-isoglutamine(in) + 3 H(+)(in) PMID 20406817 ↗ |
| 分子活性 | glycyl-L-leucine(out) + 2 H(+)(out) = glycyl-L-leucine(in) + 2 H(+)(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | glycyl-L-lysine(out) + 2 H(+)(out) = glycyl-L-lysine(in) + 2 H(+)(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | glycyl-L-glutamate(out) + 3 H(+)(out) = glycyl-L-glutamate(in) + 3 H(+)(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-alanyl-L-alanine(out) + 2 H(+)(out) = L-alanyl-L-alanine(in) + 2 H(+)(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | an L-amino acid tripeptide(out) + 2 H(+)(out) = an L-amino acid tripeptide(in) + 2 H(+)(in) | 推論支持 | 證據與來源an L-amino acid tripeptide(out) + 2 H(+)(out) = an L-amino acid tripeptide(in) + 2 H(+)(in) |
| 分子活性 | carnosine(out) + 2 H(+)(out) = carnosine(in) + 2 H(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC15A2 可透過其胞外區域與 trypsin 互作。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLC15A2 位於頂端細胞膜、細胞膜、胞質囊泡及吞噬體膜。在靜止巨噬細胞中與細胞膜相關;粒子內化後,則在吞噬杯及吞噬體中富集。 | 含實驗來源 | 證據與來源Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, phagosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Associated with the cell membrane in resting macrophages and enriched in phagocytic cups and phagosomes after particle internalization PMID 20406817 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGTAGGCTGGCAGCTGTCCTAACTGCCTACTAAAGCCA40AATGCTTGAGGAGAGAGAGAGAGTAAGGAGCCAGCCATGA80ATCCTTTCCAGAAAAATGAGTCCAAGGAAACTCTTTTTTC120ACCTGTCTCCATTGAAGAGGTACCACCTCGACCACCTAGC160CCTCCAAAGAAGCCATCTCCGACAATCTGTGGCTCCAACT200ATCCACTGAGCATTGCCTTCATTGTGGTGAATGAATTCTG240CGAGCGCTTTTCCTATTATGGAATGAAAGCTGTGCTGATC280CTGTATTTCCTGTATTTCCTGCACTGGAATGAAGATACCT320CCACATCTATATACCATGCCTTCAGCAGCCTCTGTTATTT360TACTCCCATCCTGGGAGCAGCCATTGCTGACTCGTGGTTG400GGAAAATTCAAGACAATCATCTATCTCTCCTTGGTGTATG440TGCTTGGCCATGTGATCAAGTCCTTGGGTGCCTTACCAAT480ACTGGGAGGACAAGTGGTACACACAGTCCTATCATTGATC520GGCCTGAGTCTAATAGCTTTGGGGACAGGAGGCATCAAAC560CCTGTGTGGCAGCTTTTGGTGGAGACCAGTTTGAAGAAAA600ACATGCAGAGGAACGGACTAGATACTTCTCAGTCTTCTAC640CTGTCCATCAATGCAGGGAGCTTGATTTCTACATTTATCA680CACCCATGCTGAGAGGAGATGTGCAATGTTTTGGAGAAGA720CTGCTATGCATTGGCTTTTGGAGTTCCAGGACTGCTCATG760GTAATTGCACTTGTTGTGTTTGCAATGGGAAGCAAAATAT800ACAATAAACCACCCCCTGAAGGAAACATAGTGGCTCAAGT840TTTCAAATGTATCTGGTTTGCTATTTCCAATCGTTTCAAG880AACCGTTCTGGAGACATTCCAAAGCGACAGCACTGGCTAG920ACTGGGCGGCTGAGAAATATCCAAAGCAGCTCATTATGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。