演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC14A1HsT1341

solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group)

SLC14A1 編碼 urea transporter family 的膜蛋白,參與紅血球尿素運輸,並可促進水分通過紅血球細胞膜;其尿素運輸與濃度梯度相關。

Homo sapiens18q12.3UniProt Q13336
OFFICIAL SYMBOL
SLC14A1
CHROMOSOME
18
UNIPROT
Q13336
PDB / ALPHAFOLD
8XDF
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC14A1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group)。其產物屬於 urea transporter family,為多次穿越細胞膜的膜蛋白。蛋白質序列註解包含多段螺旋型跨膜區,整體構造適合在膜中形成尿素通過的路徑。此蛋白主要與尿素跨膜運輸相關,並具有促進紅血球水分運輸的作用;來源另指出其在腎臟內髓集合管的尿素運輸與尿液濃縮機制有關,但此項描述標示為依相似性推定。

Official symbol
SLC14A1
Gene name
solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10918
UniProt
Q13336
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HsT1341RACH1RACH2JK

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q12.3
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegSLC14A1pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:45,687,025–45,752,521
Gene span
65,497 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000321925 ★45,724,181–45,752,52010
ENST0000089933645,687,026–45,752,5219
ENST0000041542745,724,083–45,750,00211
ENST0000096413245,724,083–45,751,3409
ENST0000089933745,724,121–45,751,37311
ENST0000061940345,724,127–45,752,5209
ENST0000058760145,724,150–45,734,3325
ENST0000089933845,724,181–45,751,37312
ENST0000089933945,724,181–45,751,3729
ENST0000089934045,724,181–45,751,36710
ENST0000110336645,724,181–45,752,52010
ENST0000113104945,724,181–45,748,3399

顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC14A1 的主要功能是介導尿素跨越細胞膜。於紅血球中,尿素運輸由濃度梯度驅動;因此,運輸方向取決於膜兩側的尿素濃度差,而不是來源所述的主動逆梯度輸送。此項紅血球功能有實驗文獻支持。

在腎臟內髓集合管,SLC14A1 也被描述為介導尿素跨膜運輸。來源指出這項作用對尿液濃縮機制至關重要,但其證據標示為依相似性推定,應視為推論性描述,而非此處直接確認的人類實驗結論。

此外,來源指出 SLC14A1 可促進水分在紅血球細胞膜上的運輸;這項功能同樣標示為依相似性推定。現有資料支持其兼具尿素運輸與紅血球水分運輸相關作用,但未提供兩者之間的詳細分子機制或相對貢獻,因此不宜進一步推定其運輸耦合方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45724181 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC14A1 ENST00000321925 GRCh38 chr18:45723181-45724281 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGACCTATGACATCTGCATGGCTGGCTGTGGGATTACATATATATATTATATATATATTTAAAAGTATAT
GTATATATGTATATATATTACATATATACACACATATATATCTACACATATGTAATATATGTATATATGT
ATATTTATTATATGTATATATCTACATATATACATGTATGTATGTAATATAGATGTATATATGTTACATA
TATACACACATATACATATATACACATATATTTTTTTAAAATTCTGCACTCATAAAAGTAGATTTGAGTT
AGATTTTTGCCATAACAGAACAAGCCACAAAATTGAAATTTAAAAAGAAGGGGGAAGGAGGAGATATTTT
AATTCAGTTTTAGATTTCCCTGCTATAGAATGTTTGCTTCCTGACTTTTAAAGAGGCAGCAGAGTATGTC
CAAGAATTCTCACCTGGGAAGACAGACATTCCAGGGAAACACTGATATTTTTGTTTTCTCCTCACTGGGA
AAAAGGCAGCTGGCCTTCAGAAAACAACTTGCATGTACCTTATCTTCCCCACCCTCCCAACAGCCCCTCA
GGCCCTTGCTGGAGTCTTACATCTGTGTAGAAGTTGTGCCAAGTCTAAGAAAATTTCACCCCAGGAGCAG
TCGCTTAGCTTCCGAGTCCACACAGCAGCAACCTGCCCCATGGTTTTTAGTTTGACACCGTGTTGATCCT
TTTCAGTTGTAAATCTTTCCAAAAATATGAGTAGGGGCCAGAGGAAACAGGAGAAGAAAAAGATGCATTT
TGGTAGGATTATTGCTGGTCAAAGACCTTGGAATGCTGTGGAAACTGTGGCAAAGCAGTTGGTACTCTGT
CAAGAACAGAGAGAGAGACATCGGGTACTGAAGCCAGGGGACCAGTTCCTTGGTGTTGCTTTGGCATTGA
TGCCTGAAGTGGGAGGAGAAAGCCGAGCCCACAAACACACAGAGCAGAGTGGGGCTCTGAGTATATAACT
GTTAGGTGCCTCCCTCCAGCACCATCTCCTGAGAAGCACTCTCCCTTGTCGTGGAGGTGGGCAAATCTTT
ATCAGCCACTGCCTTCTGCTGCCAGGAAGCCAGCTAGAGTGGTGTAAGTAC
SLC14A1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC14A1_1 ↗18:45,724,181正股45,724,132–45,724,191

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_9N623 · enhancer · 45722815–45723247 · regulatory

ENSR18_5DQD2Z · CTCF_binding_site · 45723079–45723100 · regulatory

ENSR18_9N63N · enhancer · 45728601–45728933 · regulatory

· motif · 45721776–45721785 · motif

· motif · 45721776–45721785 · motif

· motif · 45723081–45723097 · motif

· motif · 45723709–45723715 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:389 aa

1 aa389 aa跨膜區
依 Q13336 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC14A1 蛋白長 389 個胺基酸,屬於 urea transporter family。序列註解標示九段螺旋型跨膜區,分布於胺基酸位置 53–73、91–110、116–136、143–163、173–193、242–262、281–301、310–330 與 333–353。

跨膜區Helical53–73 aa
跨膜區Helical91–110 aa
跨膜區Helical116–136 aa
跨膜區Helical143–163 aa
跨膜區Helical173–193 aa
跨膜區Helical242–262 aa
跨膜區Helical281–301 aa
跨膜區Helical310–330 aa
跨膜區Helical333–353 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8XDF…

PDB · 8XDF

EM · 2.40 A · A/B/C=1-389

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Basolateral cell membrane

SLC14A1 位於細胞膜,並標示為多次穿膜蛋白。 在尿路上皮的不同區域,其定位受限於基底外側細胞膜;來源未描述其他定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HsT1341SLC14A1BTN2A2FIS1GIMAP1MIPRTP2SNORCSTRIT1THSD7BTMEM97
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC14A1 以同源三聚體形式存在;依相似性資料,每個次單元各含有一個供尿素通過的孔道。此外,SLC14A1 曾被鑑定與 STOM 同處一個複合體;此資料支持複合體關聯,但未指出兩者是否直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC14A1 介導尿素依濃度梯度跨越紅血球細胞膜的運輸。它也被描述為參與腎臟內髓集合管的尿素跨膜運輸,而該作用對尿液濃縮機制至關重要;此腎臟功能標示為依相似性推定。此外,SLC14A1 促進水分通過紅血球細胞膜的描述同樣屬於依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Mediates the transport of urea driven by a concentration gradient across the cell membrane of erythrocytes. Also mediates the transport of urea across the cell membrane of the renal inner medullary collecting duct which is critical to the urinary concentrating mechanism (By similarity). Facilitates water transport in erythrocytes (By similarity)

PMID 10514515 ↗ · PMID 7797558 ↗ · PMID 7989337 ↗ · PMID 8997401 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性urea(in) = urea(out)含實驗來源
證據與來源

urea(in) = urea(out)

PMID 10514515 ↗ · PMID 7797558 ↗ · PMID 7989337 ↗ · PMID 8997401 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC14A1 以同源三聚體形式存在,且依相似性資料,每個次單元都含有尿素可通過的孔道。另有資料指出 SLC14A1 曾被鑑定於含 STOM 的複合體中;此描述未進一步說明兩者是否直接結合。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer; each subunit contains a pore through which urea permeates (By similarity). Identified in a complex with STOM

PMID 23219802 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC14A1 是多次穿膜的細胞膜蛋白;在尿路上皮的不同區域,其定位受限於基底外側細胞膜。來源未提供定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Restricted to the basolateral membrane in various portions of the urothelium

PMID 10514515 ↗ · PMID 23219802 ↗ · PMID 7797558 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000321925 · 3,917 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCATCTCCTGAGAAGCACTCTCCCTTGTCGTGGAGGTGG40
41GCAAATCTTTATCAGCCACTGCCTTCTGCTGCCAGGAAGC80
81CAGCTAGAGTGGTCTTTAAAGAAAACTGGGCATCTCCTGC120
121TACTTAAAATCAAAAACTACCTAAAATAAAGATTATAGAG160
161CCAGAGGAAGAGATAGCCATGGAGGACAGCCCCACTATGG200
201TTAGAGTGGACAGCCCCACTATGGTTAGGGGTGAAAACCA240
241GGTTTCGCCATGTCAAGGGAGAAGGTGCTTCCCCAAAGCT280
281CTTGGCTATGTCACCGGTGACATGAAAGAACTTGCCAACC320
321AGCTTAAAGACAAACCCGTGGTGCTCCAGTTCATTGACTG360
361GATTCTCCGGGGCATATCCCAAGTGGTGTTCGTCAACAAC400
401CCCGTCAGTGGAATCCTGATTCTGGTAGGACTTCTTGTTC440
441AGAACCCCTGGTGGGCTCTCACTGGCTGGCTGGGAACAGT480
481GGTCTCCACTCTGATGGCCCTCTTGCTCAGCCAGGACAGG520
521TCATTAATAGCATCTGGGCTCTATGGCTACAATGCCACCC560
561TGGTGGGAGTACTCATGGCTGTCTTTTCGGACAAGGGAGA600
601CTATTTCTGGTGGCTGTTACTCCCTGTATGTGCTATGTCC640
641ATGACTTGCCCAATTTTCTCAAGTGCATTGAATTCCATGC680
681TCAGCAAATGGGACCTCCCCGTCTTCACCCTCCCTTTCAA720
721CATGGCGTTGTCAATGTACCTTTCAGCCACAGGACATTAC760
761AATCCATTCTTTCCAGCCAAACTGGTCATACCTATAACTA800
801CAGCTCCAAATATCTCCTGGTCTGACCTCAGTGCCCTGGA840
841GTTGTTGAAATCTATACCAGTGGGAGTTGGTCAGATCTAT880
881GGCTGTGATAATCCATGGACAGGGGGCATTTTCCTGGGAG920
921CCATCCTACTCTCCTCCCCACTCATGTGCCTGCATGCTGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。