基因總覽
SLC12A4 是蛋白質編碼基因，產物為 solute carrier family 12 member 4。此蛋白屬於 SLC12A transporter family 的 K/Cl cotransporter 子家族，是多次穿越細胞膜的膜蛋白。其結構包含跨膜區，以及位於細胞質側的區域；跨膜區與較長的細胞質端共同構成蛋白質的主要架構。來源資料將它歸入鉀離子與氯離子共同運輸蛋白家族，並指出其運輸功能受細胞狀態影響。這些家族與結構特徵提供了理解其膜運輸角色的基本背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000316341 ★ | 67,943,474–67,968,637 | 24 |
| ENST00000541864 | 67,943,474–67,966,878 | 24 |
| ENST00000537830 | 67,943,474–67,964,065 | 24 |
| ENST00000858394 | 67,943,474–67,968,642 | 24 |
| ENST00000858395 | 67,943,474–67,968,642 | 21 |
| ENST00000858396 | 67,943,474–67,968,642 | 23 |
| ENST00000858397 | 67,943,474–67,968,642 | 20 |
| ENST00000858398 | 67,943,474–67,968,642 | 24 |
| ENST00000858399 | 67,943,474–67,968,642 | 24 |
| ENST00000937903 | 67,943,474–67,968,642 | 24 |
| ENST00000937904 | 67,943,474–67,968,642 | 24 |
| ENST00000937905 | 67,943,474–67,968,642 | 20 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC12A4 的產物可介導鉀離子與氯離子以電中性方式共同運輸；資料指出，細胞腫脹時會活化這項運輸功能。其運輸方向可表示為細胞內的 K⁺與 Cl⁻移至細胞外，兩種離子以共同運輸方式通過細胞膜。這項方向性描述與所列反應式一致，並非將兩種離子分別運輸的功能。
細胞腫脹是來源明確指出的活化條件，因此此蛋白的運輸作用與細胞體積狀態相連。資料也指出，SLC12A4 可能參與單一細胞的體積恆定；「可能」表示這項功能定位仍帶有不確定性，不宜視為已涵蓋所有細胞或情境的確定作用。依此資料，離子外移與細胞體積調節之間具有關聯，但來源未進一步界定其在不同細胞中的效應幅度或調控細節。
在吸收 NaCl 的上皮組織中，SLC12A4 可能參與調節基底外側的 Cl⁻外流。這項敘述標示為依相似性推定，證據性質不同於直接陳述的運輸活性；因此只能說它可能涉及該上皮環境中的氯離子外流調節，不能據此擴大為已確認的普遍功能。另有資料記載未觀察到 transporter activity，顯示運輸活性的證據並非一致；現有資訊未說明此差異所對應的實驗條件或原因，故不宜將此結果與細胞腫脹時的活化描述合併成單一確定結論。
Promoter 與基因調控
>SLC12A4 ENST00000316341 GRCh38 chr16:67968537-67969637 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGGGGAGGGGTCAGAGGGTGGTAAGCTCGGGGGTCGTCTTGCGGGGCCCAGCGGCTCTGATTCCGTACC CCCCACCCCAAGGGCTGGAGGCTGGCAGTAGGCGTAGTCAGAGGACGCCACCCGAGCCACGCGAGGGAGA AGAGTGGAGATAGACAAGTAAGATGGGCTCTGGGGTTTTCTGATAGAGAAAAAAATAGTAAAGCCAGCTA GATAAGTAATCTGAAGCAGTGGAGAAGAAAGTGAAAGAAACGTTAAAAGCAAATAAGTAAACGGCTTGGA TAGAGGAACACCCAGGAGGCGAGATAGAGAAAGTTAAAATGAAGGGACTTGGCTACAGCACCCAGTGCAC TGTCCCAAAAAGGCAAGCGAGGCAAGCGGGGCGGGGAAGGGTGGGTGTGCGTGTTCTTCCTGCGGAGGAC GCAGCAGCCCCTGGGGAGGGACCGAGAATCCCCAGCTGCCTCCAACAGGAGAGGCTGCAGCTAGAGGGCC CAGGGCTGGGACGGGACCTTCGCGGGGGTCTGGTTCCCAGGGTCGCGGAGAAATGGGATGCAGACGCTGG AAATGGGAAGGAGGTATACGGGGTTGGTGGGAGGCCCTGGGCAGGTGGCTTCTGCAGTCCTGGGCCGGTC CGGCCTACCCTGCCCCGTCCCTAAGTAACAGAGCGCTTCGTAAGCCCAGGGCGCAGAGCCAGGACACTCC GCGACCCATCTCACGGAGCCCTAAAACAACCCCGAGGTGGAAGTGTGTTTCCCCCATTTTACAAATGTTG CATCTGGGGCTCAGAGAGGGCGGCCTCTCACCCGAGGTCACACAGGAATCGGGCCCGCCCCCAGGCCGTG GAGCCACTAGGAGTGCTCCCGCCCAGGGGTCTTCCCGCCACCAGGGCCCCCGCTCTGGGAGGAGCCGGCC GAGCCCCTCCCGCTCTCCGCCCCCGAGGGGCGGCCCGGGGGGCGGGCGGAGGAAGTGAGCGCAGCGGGGA GGAATGCGAGCGGGCGGGGCGTGTCGGCCCGGGGCGGCGGGGACAGCGGCGGGGACAGCGGCGGGCGGCT GGGACGGCGGGTGCGGCGGGGCCGAGCCCGCACGATGCCTCACTTCACCGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC12A4_1 ↗ | 16:67,943,765 | 負股 | 67,943,755–67,943,814 |
| SLC12A4_2 ↗ | 16:67,968,613 | 負股 | 67,968,603–67,968,662 |
| SLC12A4_3 ↗ | 16:67,969,624 | 負股 | 67,969,614–67,969,673 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_83ZXP5 · promoter · 67964055–67964306 · regulatory
ENSR16_C8Q4J · enhancer · 67965712–67966867 · regulatory
ENSR16_9ZZDF · promoter · 67966868–67967368 · regulatory
ENSR16_BHH7G · promoter · 67968543–67969127 · regulatory
· motif · 67963855–67963865 · motif
· motif · 67963874–67963884 · motif
· motif · 67963893–67963903 · motif
· motif · 67968046–67968059 · motif
· motif · 67968699–67968712 · motif
· motif · 67968824–67968836 · motif
· motif · 67969044–67969055 · motif
· motif · 67969199–67969212 · motif
· motif · 67969199–67969212 · motif
· motif · 67969422–67969428 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1085 aa
solute carrier family 12 member 4 屬於 K/Cl cotransporter 子家族，蛋白質長 1085 個胺基酸。其跨膜部分由多段螺旋區組成，另有細胞質區域；其中 N 端與 C 端均位於細胞質側。跨膜區與 C 端之間包含 scissor helices，相關結構可形成 domain-swap 構形。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC12A4 是多次穿越細胞膜的蛋白質，定位於細胞膜。 來源未提供定位隨細胞狀態改變的資訊，也未指出不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- AP3M1Q9Y2T2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CNFNQ9BYD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-2P59991 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-2Q3LHN2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MB21D2Q8IYB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM102Q8N9M5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF655Q8N720 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLC12A4 可形成同源二聚體，並在連接跨膜區與 C 端的 scissor helices 處採取 domain-swap 構形。與其他 K-Cl cotransporters 形成異源二聚體則屬於推定關係；資料未提供其具體成員或進一步的互作條件。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 細胞腫脹時，SLC12A4 可介導電中性的鉀離子與氯離子共同運輸，方向為由細胞內移至細胞外。它可能協助單一細胞維持體積恆定；在吸收 NaCl 的上皮中，也可能依相似性參與調節基底外側的氯離子外流。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates electroneutral potassium-chloride cotransport when activated by cell swelling. May contribute to cell volume homeostasis in single cells. May be involved in the regulation of basolateral Cl(-) exit in NaCl absorbing epithelia (By similarity) PMID 10913127 ↗ · PMID 34031912 ↗ · PMID 35759661 ↗ |
| 功能 | 資料記載未觀察到 transporter activity；來源未說明此結果所對應的具體實驗條件。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | K(+)(in) + chloride(in) = K(+)(out) + chloride(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC12A4 可形成同源二聚體，並在連接跨膜區與 C-terminal domain 的 scissor helices 處採取 domain-swap 構形。它也可能與其他 K-Cl cotransporters 形成異源二聚體，但此關係標示為推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; adopts a domain-swap conformation at the scissor helices connecting the transmembrane domain and C-terminal domain. Heterodimer with other K-Cl cotransporters (Probable) PMID 31649201 ↗ · PMID 34031912 ↗ · PMID 35759661 ↗ · PMID 11551954 ↗ |
| 細胞定位 | SLC12A4 位於細胞膜，屬於多次穿越細胞膜的蛋白質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGTCGGCCCGGGGCGGCGGGGACAGCGGCGGGGACAGCG40GCGGGCGGCTGGGACGGCGGGTGCGGCGGGGCCGAGCCCG80CACGATGCCTCACTTCACCGTGGTGCCAGTGGACGGGCCG120AGGCGCGGCGACTATGACAACCTCGAGGGGCTCAGTTGGG160TGGACTACGGGGAGCGCGCCGAGCTGGATGACTCGGACGG200ACATGGCAACCACAGAGAGAGCAGCCCTTTTCTTTCCCCC240TTGGAGGCTTCCAGAGGAATTGACTACTATGACAGGAACC280TGGCACTGTTTGAGGAAGAGCTGGACATCCGCCCAAAGGT320ATCGTCTCTTCTGGGAAAGCTCGTCAGCTACACCAACCTC360ACCCAGGGCGCCAAAGAGCATGAGGAGGCCGAGAGTGGGG400AGGGCACCCGCCGGAGGGCAGCCGAGGCACCCAGCATGGG440CACCCTCATGGGGGTGTACCTGCCCTGCCTGCAGAATATC480TTTGGGGTTATCCTCTTCCTGCGGCTGACCTGGATGGTGG520GCACAGCAGGTGTGCTACAGGCCCTCCTCATCGTGCTTAT560CTGCTGCTGTTGTACCCTGCTGACGGCCATCTCCATGAGT600GCCATCGCCACCAACGGTGTGGTTCCAGCTGGGGGCTCCT640ATTTCATGATCTCTCGTTCACTGGGGCCAGAATTTGGAGG680TGCTGTGGGCCTGTGCTTCTACCTGGGAACAACATTCGCA720GCAGCCATGTACATCCTGGGGGCCATCGAGATCTTGCTGA760CCTACATTGCCCCACCAGCTGCCATTTTTTACCCATCGGG800TGCTCATGACACGTCGAATGCCACTTTGAACAATATGCGT840GTGTATGGGACCATTTTCCTGACCTTCATGACCCTGGTGG880TGTTTGTGGGGGTCAAGTATGTGAACAAATTTGCCTCGCT920CTTCCTGGCCTGTGTGATCATCTCCATCCTCTCCATCTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。