基因總覽
SLC12A3 是位於第 16 號染色體的蛋白質編碼基因，產物屬於 SLC12A transporter family。其蛋白質為多重跨膜膜蛋白，具有跨膜區域以及細胞質內的區段，並以同源二聚體形式存在。這些基本特徵使它能在細胞膜上執行離子運輸；其主要生理角色與腎臟遠曲小管的鈉、氯再吸收有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000563236 ★ | 56,865,207–56,915,850 | 26 |
| ENST00000438926 | 56,865,203–56,915,850 | 26 |
| ENST00000262502 | 56,865,203–56,915,850 | 26 |
| ENST00000898207 | 56,865,203–56,915,850 | 26 |
| ENST00000898208 | 56,865,203–56,915,850 | 26 |
| ENST00000898209 | 56,865,203–56,915,850 | 25 |
| ENST00000898210 | 56,865,203–56,915,850 | 25 |
| ENST00000898211 | 56,865,203–56,915,850 | 18 |
| ENST00000898212 | 56,865,203–56,915,850 | 24 |
| ENST00000898213 | 56,865,203–56,915,850 | 26 |
| ENST00000898214 | 56,865,203–56,915,850 | 25 |
| ENST00000898215 | 56,865,203–56,915,850 | 25 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC12A3 的蛋白質是電中性的鈉、氯離子共同轉運蛋白，作為腎臟遠曲小管中鈉與氯再吸收的重要介質。轉運時，細胞外的 Na(+) 與氯離子一同進入細胞，對應的反應方向可寫為 chloride(out) + Na(+)(out) = chloride(in) + Na(+)(in)。此作用連結腎小管對這兩種離子的處理，是來源所述的主要功能。
除了離子共同轉運之外，來源亦記載 SLC12A3 可作為促發炎細胞激素 IL18 的受體，並參與 IL18 誘導的細胞激素生成，包括 IFNG、IL6、IL18 與 CCL2。此受體相關角色標註為依相似性推定，因此應視為 By similarity 的功能描述，而非與鈉、氯再吸收同等層級的直接證據。來源指出，SLC12A3 可能獨立於 IL18R1 發揮作用，也可能與 IL18R1 形成複合體；此機制同樣屬於依相似性推定。
因此，來源支持的功能涵蓋腎臟離子再吸收，以及一項帶有推定性質的 IL18 相關訊號角色。兩者的證據限定不同：鈉、氯共同轉運及其在遠曲小管的作用有研究支持；受體功能、細胞激素生成的參與方式，以及是否依賴 IL18R1，則保留來源明示的相似性推論。
Promoter 與基因調控
>SLC12A3 ENST00000563236 GRCh38 chr16:56864207-56865307 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTT AATAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGATCCATCCACCTCAGCCTCCCAATATTAAATA AATTTTTTAAATCCAAATACTAATATGAGAGGTTTTTGAACTCTCATAGAGTAGGACCCAGAGTGTGTCC TCAGGCTAAGGGAGGACACCACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAGTTTCTGCTTCCAAAGAAAGAAAAAG TAAAAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGCCCGGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAGTTA AAGATCGAGCCCTGACCTAATCGGTTATGTAATCTATAGATTACAGACATTTTATAGAAATGCACTTTGA AAATCCCTGTCCTGTTTTGTTCCAATCTAATGATCGGTGCATGCAGCCCCCAGTCACGTACCCCCTGCTT GCTCAATCAATCACGACCCTCTCACATGCACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTGAAAAGGGACAGGAATTG CTCACTCTGGGAGCTCGGCTCTTGAGACAGGAGTCTTGCCGATGCCCCCCGGCCGAATAAACCCCTTCCT TCTTTAAGTCGGTGTTTGAGGAGTTTTGACTGCAGCTCGTCCTGCTACAAAGCCACCAGGCTATCTCTAG GATCCCTTATGGGGCCCCTCAGGGTCCTCTCTGACAACTCCTTCTTGGGTCCTGGCTGAAGATCTCTGCT GCCCCCAGACTCAGAAGAGCCACTCCAGGACTCAGGGAGTGGCTGGCTTTGGGCCAGCCCAGCCCTCCAG ATCCAAGGCGGGTCCCCTATCTCCACAATCAAATGGTGTTCTGCCTCCGGCCCTGTCCGGGGACCCTGCT CACCAGCCACGGGCGGTTTAGGCCAACCTCCCTGCCTCCTCCCCAGTGCAGACGCAGCCTATAAAACCAC CCTGTGTGTCCTTGCGGATCCTGGCCCCTCCCTGGACACCCAGGCGACAATGGCAGAACTGCCCACAACA GAGACGCCTGGGGACGCCACTTTGTGCAGCGGGCGCTTCACCATCAGCACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC12A3_1 ↗ | 16:56,865,207 | 正股 | 56,865,158–56,865,217 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_C7MC7 · enhancer · 56860163–56861851 · regulatory
ENSR16_83N5QC · enhancer · 56862120–56862268 · regulatory
ENSR16_9SKDF · enhancer · 56862815–56863212 · regulatory
ENSR16_5HD5RP · CTCF_binding_site · 56866685–56866706 · regulatory
ENSR16_5HD6BQ · CTCF_binding_site · 56869713–56869734 · regulatory
· motif · 56860487–56860504 · motif
· motif · 56860496–56860513 · motif
· motif · 56860594–56860605 · motif
· motif · 56860596–56860613 · motif
· motif · 56860605–56860613 · motif
· motif · 56860917–56860932 · motif
· motif · 56860917–56860932 · motif
· motif · 56861019–56861034 · motif
· motif · 56866687–56866703 · motif
· motif · 56869499–56869510 · motif
· motif · 56869546–56869561 · motif
· motif · 56869551–56869563 · motif
· motif · 56869554–56869569 · motif
· motif · 56869683–56869696 · motif
· motif · 56869683–56869696 · motif
· motif · 56869715–56869731 · motif
· motif · 56869917–56869934 · motif
· motif · 56869994–56870011 · motif
· motif · 56870104–56870115 · motif
· motif · 56870104–56870115 · motif
· motif · 56870157–56870177 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1021 aa
蛋白質長 1021 個胺基酸，屬於 SLC12A transporter family。序列註解包含多個跨膜區段，涵蓋不連續螺旋與螺旋型跨膜區，並有細胞質及細胞外拓樸區段。跨膜區與 C 端區域之間由 scissor helices 連接；同源二聚體在此處具有 domain-swap 構形。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC12A3 被定位於細胞膜，並有頂端細胞膜定位的註記；它是多重跨膜蛋白。 來源未提供定位隨處理或其他條件改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
SLC12A3 形成同源二聚體，並在連接跨膜區與 C 端區域的 scissor helices 處呈現 domain-swap 構形。它也與 KLHL3 互作。與 IL18R1 的互作會在 IL18 處理後增加；此項描述標註為依相似性推定，來源並未將其明確界定為直接結合或特定複合體。
疾病與遺傳關聯
SLC12A3 的基因變異會造成 Gitelman syndrome，屬自體隱性疾病。其特徵包括低血鉀性鹼中毒、低血鎂、尿鈣偏低，以及血壓正常時腎素活性升高。患者可能沒有症狀，也可能短暫出現肌肉無力與手足搐搦，常伴隨腹痛、嘔吐及發燒。發病年齡與嚴重程度差異很大；低尿鈣與低血鎂等典型表徵也可能隨患者生命歷程改變。此症與 Bartter syndrome 有部分重疊表現。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC12A3 是電中性的鈉、氯共同轉運蛋白，在腎臟遠曲小管中促進鈉與氯再吸收。另有依相似性推定的描述指出，它可作為促發炎細胞激素 IL18 的受體，參與 IL18 誘導的 IFNG、IL6、IL18 與 CCL2 生成；其作用可能不依賴 IL18R1，也可能與 IL18R1 形成複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Electroneutral sodium and chloride ion cotransporter, which acts as a key mediator of sodium and chloride reabsorption in kidney distal convoluted tubules. Also acts as a receptor for the pro-inflammatory cytokine IL18, thereby contributing to IL18-induced cytokine production, including IFNG, IL6, IL18 and CCL2 (By similarity). May act either independently of IL18R1, or in a complex with IL18R1 (By similarity) PMID 18270262 ↗ · PMID 21613606 ↗ · PMID 22009145 ↗ · PMID 36351028 ↗ · PMID 36792826 ↗ |
| 分子活性 | chloride(out) + Na(+)(out) = chloride(in) + Na(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC12A3 形成同源二聚體，並在連接跨膜區與 C 端區域的 scissor helices 處採 domain-swap 構形。它與 KLHL3 互作；與 IL18R1 的互作會因 IL18 處理而增加，後者標註為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; adopts a domain-swap conformation at the scissor helices connecting the transmembrane domain and C-terminal domain. Interacts with KLHL3. Interacts with IL18R1; this interaction is increased by IL18 treatment (By similarity) PMID 22406640 ↗ · PMID 36351028 ↗ · PMID 36792826 ↗ |
| 細胞定位 | SLC12A3 是多重跨膜蛋白，定位於細胞膜及頂端細胞膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 22009145 ↗ · PMID 36370249 ↗ · PMID 36351028 ↗ · PMID 36792826 ↗ |
| 疾病關聯 | SLC12A3 變異會造成自體隱性 Gitelman syndrome，患者可有低血鉀性鹼中毒、低血鎂、尿鈣偏低及正常血壓下腎素活性升高。患者可能無症狀，或間歇出現肌肉無力與手足搐搦，常伴腹痛、嘔吐和發燒；發病年齡與嚴重程度差異大，低尿鈣及低血鎂也可能隨生命歷程變化。此症與 Bartter syndrome 表現部分重疊。 | 含實驗來源 | 證據與來源Gitelman syndrome GTLMNS An autosomal recessive disorder characterized by hypokalemic alkalosis in combination with hypomagnesemia, low urinary calcium, and increased renin activity associated with normal blood pressure. Patients are often asymptomatic or present transient periods of muscular weakness and tetany, usually accompanied by abdominal pain, vomiting and fever. The phenotype is highly heterogeneous in terms of age at onset and severity. Cardinal features such as hypocalciuria and hypomagnesemia might also change during the life cycle of a given patient. It has overlapping features with Bartter syndrome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 263800 PMID 10616841 ↗ · PMID 10988270 ↗ · PMID 11168953 ↗ · PMID 11940055 ↗ · PMID 12008755 ↗ · PMID 12112667 ↗ · PMID 15069170 ↗ · PMID 15687331 ↗ · PMID 16429844 ↗ · PMID 17654016 ↗ · PMID 17873326 ↗ · PMID 22009145 ↗ · PMID 26099046 ↗ · PMID 33462018 ↗ · PMID 33772578 ↗ · PMID 34079339 ↗ · PMID 34657521 ↗ · PMID 35693921 ↗ · PMID 36370249 ↗ · PMID 36460433 ↗ · PMID 8528245 ↗ · PMID 8900229 ↗ · PMID 8954067 ↗ · PMID 9734597 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTGGCCCCTCCCTGGACACCCAGGCGACAATGGCAGAACT40GCCCACAACAGAGACGCCTGGGGACGCCACTTTGTGCAGC80GGGCGCTTCACCATCAGCACACTGCTGAGCAGTGATGAGC120CCTCTCCACCAGCTGCCTATGACAGCAGCCACCCCAGCCA160CCTGACCCACAGCAGCACCTTCTGCATGCGCACCTTTGGC200TACAACACGATCGATGTGGTGCCCACATATGAGCACTATG240CCAACAGCACCCAGCCTGGTGAGCCCCGGAAGGTCCGGCC280CACACTGGCTGACCTGCACTCCTTCCTCAAGCAGGAAGGC320AGACACCTGCATGCCCTGGCCTTTGACAGCCGGCCCAGCC360ACGAGATGACTGATGGGCTGGTGGAGGGCGAGGCAGGCAC400CAGCAGCGAGAAGAACCCCGAGGAGCCAGTGCGCTTCGGC440TGGGTCAAGGGGGTGATGATTCGTTGCATGCTCAACATTT480GGGGCGTGATCCTCTACCTGCGGCTGCCCTGGATTACGGC520CCAGGCAGGCATCGTCCTGACCTGGATCATCATCCTGCTG560TCGGTCACGGTGACCTCCATCACAGGCCTCTCCATCTCAG600CCATCTCCACCAATGGCAAGGTCAAGTCAGGTGGCACCTA640CTTCCTCATCTCCCGGAGTCTGGGCCCAGAGCTTGGGGGC680TCCATCGGCCTCATTTTCGCTTTCGCCAATGCCGTGGGTG720TGGCCATGCACACGGTGGGCTTTGCAGAGACCGTGCGGGA760CCTGCTCCAGGAGTATGGGGCACCCATCGTGGACCCCATT800AACGACATCCGCATCATTGCCGTGGTCTCGGTCACTGTGC840TGCTGGCCATCTCCCTGGCTGGCATGGAGTGGGAGTCCAA880GGCCCAGGTGCTGTTCTTCCTTGTCATCATGGTCTCCTTT920GCCAACTATTTAGTGGGGACGCTGATCCCCCCATCTGAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。