基因總覽
SLC12A2（solute carrier family 12 member 2）是蛋白質編碼基因，產物屬於 SLC12A transporter family。其蛋白質長 1,212 個胺基酸，是多次穿膜蛋白；結構包含跨膜區段與細胞質區域，並在細胞膜上執行陽離子與氯離子的共同運輸。這些基本結構特徵使其能參與細胞內外離子平衡及細胞體積調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000262461 ★ | 128,083,766–128,189,677 | 27 |
| ENST00000343225 | 128,083,165–128,189,687 | 26 |
| ENST00000929370 | 128,083,165–128,189,687 | 28 |
| ENST00000941318 | 128,083,165–128,189,687 | 26 |
| ENST00000941319 | 128,083,165–128,189,687 | 27 |
| ENST00001110361 | 128,083,165–128,163,528 | 17 |
| ENST00001112912 | 128,083,165–128,172,954 | 19 |
| ENST00001138377 | 128,083,165–128,189,687 | 27 |
| ENST00000628403 | 128,083,791–128,184,740 | 26 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC12A2 的蛋白質產物是陽離子－氯離子共運輸蛋白，能讓氯離子與鉀離子及／或鈉離子跨越細胞膜運輸。此運輸為電中性，亦即離子移動的整體效果不造成淨電荷跨膜轉移。
來源所列的運輸反應具體描述為：細胞外的鉀離子、兩個氯離子及鈉離子，與細胞內相同種類及數量的離子相對應移動。這項化學計量描述指出運輸中包含鉀、鈉與氯離子，但來源對一般功能的敘述亦保留「和／或」的可能性，因此不宜將所有條件概括成每次運輸都必然同時涉及相同離子組合。
透過跨膜移動這些離子，SLC12A2 在調節細胞的離子平衡與細胞體積方面具有重要作用。離子平衡和細胞體積是來源明確指出的功能結果；現有資料未進一步說明其在特定細胞或生理情境中的調節方式，也不支持延伸推論其他下游機制。
Promoter 與基因調控
>SLC12A2 ENST00000262461 GRCh38 chr5:128082766-128083866 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCAGAAGTGTGTAGACACCCACTGCATCACAACTGGAACTGATCTCTGGTTATGCCAATCTAGGTCTG CCTGGCAGGGTGAGTCTACCGCTCGAAAGCTGCACAGAGGAAATCCTCCCTCCTCCAGGTTCAGGCCCGG AGTTACGAGCGGAGATTCGCGGCGGCGGGTCAGAGCCCAGAGCAAACCAGGCTGGGGAACGCACCTCGCC CGCGGCTCCGGAAGCGGCTGCGGCCCCGACCGGAAAGCCCCCAGCATCGCCCGAAGGAATCGCGGCTGGC CTGCGGCTCCGGCCCGGCCTCGGGTACCACGCGCCTAGTGGGAAGCCGCACTGACGCCTGCAGCATCTCG CGAGATTTCGGGCTCAGCCCAAGTACTGCGAGTTCACCAAAGCGGGGGGAAAAAAAAAAAGCCAGCGTGC GAGAGCCTCTGAAGCCGTGGCTGGGGCGCTGGGGTGGCAGCTGCCGCGGGAGCATCAGCTACCGGCGTGA GGCGAGGCAGGGCACGCGCGCCGTCCGCAGCCCCGTTGCCTGGGCTGCAGGTCCACTGACGCGCGGCCCC TGGGTGGAGAGAGGGGAGGTGGCCTGGGAGCCCGCTCCTTTTCGCCGCAGAGCGCGGCGGGGGAGGGAGG TGAAGGCGTGGGAGGAAGGCGGCGGAAGAGGAGGTAGCCGCGCGGAGATCCTCCCGGCGACATCACTGAG GCGGAGCGTAGCCGCGCCTGCTCCCCGATCGCGCCGTTCGTGCTGCCCGCACTGCCCGAGGCCCTTTGCG GACTGGCTGGCCGCGCTCTTCGCACGGGGCGCTTTTGCGTGGGGTCGCGCAGGAGCCGCGGAGGGCCGGA TCGCTGAGGGAGCGTCAGCCGCGCGCCGCTGCGGGACCGCGGGTGGGCGGGCTGAGGGGCGGAGGAGCCT CCGGCCCCGCCTCCCGCGTGCTGCTGCCGGAGCCGCCGCCGCCGCAGCCCCGCCGAGGCTTTAAACAGCG GGGCCCGCCCCGCGCCCGCCACACTCGCGCGCTCGCTCGGCTGCCGGTGGCCTCTGTGGCCGTCCAGGCT AGCGGCGGCCCGCAGGCGGCGGGGAGAAAGACTCTCTCACCTGGTCTTGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC12A2_2 ↗ | 5:128,083,179 | 正股 | 128,083,130–128,083,189 |
| SLC12A2_1 ↗ | 5:128,083,766 | 正股 | 128,083,717–128,083,776 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_BXF9X · enhancer · 128078680–128079317 · regulatory
ENSR5_CGP67 · enhancer · 128081222–128083038 · regulatory
ENSR5_BXFBK · promoter · 128083039–128083858 · regulatory
ENSR5_5355F9D · CTCF_binding_site · 128083970–128083991 · regulatory
· motif · 128079129–128079151 · motif
· motif · 128079129–128079151 · motif
· motif · 128079390–128079402 · motif
· motif · 128080643–128080652 · motif
· motif · 128080643–128080654 · motif
· motif · 128081286–128081297 · motif
· motif · 128082759–128082771 · motif
· motif · 128082982–128082991 · motif
· motif · 128083219–128083232 · motif
· motif · 128083219–128083232 · motif
· motif · 128083367–128083382 · motif
· motif · 128083379–128083392 · motif
· motif · 128083398–128083411 · motif
· motif · 128083457–128083473 · motif
· motif · 128083462–128083478 · motif
· motif · 128083643–128083656 · motif
· motif · 128083675–128083688 · motif
· motif · 128083705–128083722 · motif
· motif · 128083707–128083720 · motif
· motif · 128083710–128083723 · motif
· motif · 128083790–128083807 · motif
· motif · 128083972–128083988 · motif
· motif · 128084095–128084111 · motif
· motif · 128084196–128084205 · motif
· motif · 128084366–128084377 · motif
· motif · 128084366–128084377 · motif
· motif · 128084981–128084992 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1212 aa
SLC12A2 蛋白質長 1,212 個胺基酸，屬於多次穿膜蛋白。序列註解指出其 N 端具有細胞質區域，後續包含多個跨膜螺旋區段，並穿插細胞質及細胞外區域；其中部分跨膜區段為不連續螺旋。蛋白質屬於 SLC12A transporter family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC12A2 是多次穿膜蛋白，定位於細胞膜的基底外側區域。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- EZRP15311 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OXSR1O95747 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SLC12A2 形成同源二聚體。二聚體採取 domain-swap 構形，交換位置位於連接跨膜區域與 C 端區域的 scissor helices；來源描述的是蛋白質亞基組成與構形，未指出其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
影響 SLC12A2 的變異與三種疾病相關。常染色體顯性遺傳的 DFNA78 以先天、嚴重且雙側、涵蓋所有頻率的感音神經性聽力損失為特徵，部分患者可能因前庭功能障礙而在早期有輕度動作發展遲緩。Delpire-McNeill syndrome 為常染色體顯性神經發展疾病，可見全面性發展遲緩、肌張力低下、行走延遲或缺如、雙側感音神經性聽損、言語不佳或缺如，以及輕至重度智能障礙；其他特徵可能包括痙攣或髖關節脫位、心室中隔缺損等器官影響。常染色體隱性 Kilquist syndrome 則為多系統疾病，特徵包括嚴重全面性發展遲緩、感音神經性聽損、生長不佳、輕微臉部特徵異常、胃腸道異常，以及淚液、唾液和汗液顯著缺乏。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC12A2 的蛋白質產物是陽離子－氯離子共運輸蛋白，可使氯離子與鉀離子及／或鈉離子以電中性的方式跨膜移動。此蛋白質對維持細胞離子平衡及調節細胞體積具有重要作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cation-chloride cotransporter which mediates the electroneutral transport of chloride, potassium and/or sodium ions across the membrane. Plays a vital role in the regulation of ionic balance and cell volume PMID 16669787 ↗ · PMID 32081947 ↗ · PMID 32294086 ↗ · PMID 33597714 ↗ · PMID 35585053 ↗ · PMID 36239040 ↗ · PMID 36306358 ↗ · PMID 7629105 ↗ |
| 分子活性 | K(+)(out) + 2 chloride(out) + Na(+)(out) = K(+)(in) + 2 chloride(in) + Na(+)(in) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SLC12A2 以同源二聚體形式存在，並在連接跨膜區域與 C 端區域的 scissor helices 處形成 domain-swap 構形。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; adopts a domain-swap conformation at the scissor helices connecting the transmembrane domain and C-terminal domain PMID 32081947 ↗ · PMID 35585053 ↗ · PMID 36239040 ↗ · PMID 36306358 ↗ |
| 細胞定位 | SLC12A2 是多次穿膜蛋白，定位於細胞膜的基底外側區域。 | 推論支持 | 證據與來源Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 32081947 ↗ · PMID 7629105 ↗ · PMID 33597714 ↗ |
| 疾病關聯 | DFNA78 是常染色體顯性、非症候群型聽力障礙，特徵為先天、嚴重、雙側且影響所有頻率的感音神經性聽力損失；部分患者可能因前庭功能障礙而早期出現輕度動作發展遲緩。此病與影響 SLC12A2 的變異相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Deafness, autosomal dominant, 78 DFNA78 A form of non-syndromic deafness characterized by congenital, profound bilateral sensorineural hearing loss affecting all frequencies. Some patients may have mild motor delay early in life due to vestibular dysfunction. Sensorineural hearing loss results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619081 PMID 32294086 ↗ · PMID 32658972 ↗ |
| 疾病關聯 | Delpire-McNeill syndrome 是常染色體顯性神經發展疾病，具有全面性發展遲緩、肌張力低下、行走延遲或缺如、雙側感音神經性聽損、言語不佳或缺如，以及輕至重度智能障礙等表現。其他可能特徵包括痙攣或髖關節脫位、心室中隔缺損等輕微器官影響；此病與影響 SLC12A2 的變異相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Delpire-McNeill syndrome DELMNES An autosomal dominant neurodevelopmental disorder characterized by global developmental delay, hypotonia with delayed or absent walking, bilateral sensorineural deafness, poor or absent speech, and mild to severe intellectual disability. Additional variable features may include spasticity or minor involvement of other organ systems, such as hip dislocation or ventricular septal defect. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619083 PMID 32658972 ↗ |
| 疾病關聯 | Kilquist syndrome 是常染色體隱性多系統疾病，特徵包括嚴重全面性發展遲緩、感音神經性聽力損失、生長不佳、輕微臉部特徵異常、胃食道逆流或中腸旋轉不良等胃腸道異常，以及淚液、唾液和汗液顯著缺乏。此病與影響 SLC12A2 的變異相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Kilquist syndrome KILQS An autosomal recessive, multisystem disorder characterized by severe global developmental delay, sensorineural hearing loss, poor overall growth, mild facial dysmorphism, gastrointestinal anomalies such as gastroesophageal reflux or midgut malrotation, and a striking lack of tear fluid, saliva, and sweat. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619080 PMID 30740830 ↗ · PMID 32754646 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACACTCGCGCGCTCGCTCGGCTGCCGGTGGCCTCTGTGGC40CGTCCAGGCTAGCGGCGGCCCGCAGGCGGCGGGGAGAAAG80ACTCTCTCACCTGGTCTTGCGGCTGTGGCCACCGCCGGCC120AGGGGTGTGGAGGGCGTGCTGCCGGAGACGTCCGCCGGGC160TCTGCAGTTCCGCCGGGGGTCGGGCAGCTATGGAGCCGCG200GCCCACGGCGCCCTCCTCCGGCGCCCCGGGACTGGCCGGG240GTCGGGGAGACGCCGTCAGCCGCTGCGCTGGCCGCAGCCA280GGGTGGAACTGCCCGGCACGGCTGTGCCCTCGGTGCCGGA320GGATGCTGCGCCCGCGAGCCGGGACGGCGGCGGGGTCCGC360GATGAGGGCCCCGCGGCGGCCGGGGACGGGCTGGGCAGAC400CCTTGGGGCCCACCCCGAGCCAGAGCCGTTTCCAGGTGGA440CCTGGTTTCCGAGAACGCCGGGCGGGCCGCTGCTGCGGCG480GCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGCTGGTGCTGGGG520CGGGGGCCAAGCAGACCCCCGCGGACGGGGAAGCCAGCGG560CGAGAGCGAGCCGGCTAAAGGCAGCGAGGAAGCCAAGGGC600CGCTTCCGCGTGAACTTCGTGGACCCAGCTGCCTCCTCGT640CGGCTGAAGACAGCCTGTCAGATGCTGCCGGGGTCGGAGT680CGACGGGCCCAACGTGAGCTTCCAGAACGGCGGGGACACG720GTGCTGAGCGAGGGCAGCAGCCTGCACTCCGGCGGCGGCG760GCGGCAGTGGGCACCACCAGCACTACTATTATGATACCCA800CACCAACACCTACTACCTGCGCACCTTCGGCCACAACACC840ATGGACGCTGTGCCCAGGATCGATCACTACCGGCACACAG880CCGCGCAGCTGGGCGAGAAGCTGCTCCGGCCTAGCCTGGC920GGAGCTCCACGACGAGCTGGAAAAGGAACCTTTTGAGGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。