演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLASLA1

Src like adaptor

SLA(Src like adaptor)是蛋白質編碼基因,其產物為參與負向調節 T 細胞受體訊號的接合蛋白。

Homo sapiens8q24.22UniProt Q13239
OFFICIAL SYMBOL
SLA
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q13239
PDB / ALPHAFOLD
2CUD
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLA(Src like adaptor)是人類的蛋白質編碼基因,產物為接合蛋白。現有資料將其描述為 T 細胞受體訊號的負向調節因子,並指出它具有可參與蛋白質互作的區域;這些結構特徵與具體作用方式詳述於功能及蛋白質特徵欄。來源未提供足以進一步說明其蛋白質家族或其他基本性質的資訊。

Official symbol
SLA
Gene name
Src like adaptor
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10902
UniProt
Q13239
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SLA1SLAP-1hSLAPSLAP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q24.22
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSLApq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:133,035,385–133,129,216
Gene span
93,832 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000338087 ★133,036,728–133,102,6029
ENST00000427060133,035,385–133,060,3587
ENST00000395352133,035,385–133,102,9128
ENST00000524345133,035,385–133,102,6287
ENST00000517648133,035,385–133,102,9127
ENST00000953118133,035,385–133,076,2469
ENST00000953119133,035,385–133,075,4728
ENST00000953120133,035,385–133,075,0279
ENST00000953121133,035,385–133,075,0278
ENST00001119089133,035,385–133,129,2169
ENST00001119090133,035,385–133,119,5579
ENST00001134054133,035,385–133,102,6029

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLA 產物是接合蛋白,參與抑制 T 細胞受體(TCR)訊號。資料指出,它能抑制 T 細胞抗原受體誘發的活化,降低活化 T 細胞核因子(nuclear factor of activated T-cells)的活化。這些作用指向 SLA 對 T 細胞受體訊號反應具有負向調節功能。

SLA 也參與 T 細胞正向選擇與有絲分裂的負向調節。來源未進一步交代這些過程中受影響的細胞步驟或調控條件,因此其功能意義可概括為限制相關 T 細胞反應,而不宜延伸為更具體的機制。

在可能的作用方式上,SLA 或可連結訊號蛋白,例如 ZAP70,與 CBL。此連結可能促成依賴 CBL 的訊號蛋白降解,進而抑制訊號;來源以「可能」描述此機制,並未將其表述為已確立的唯一途徑。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133102602 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLA ENST00000338087 GRCh38 chr8:133102502-133103602 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATATAATAATAATGAAAATGTAATAATGAATCCAGCCTGGTTTACATTCATCCTTATAACAATGCAGTCA
TGAAATACAATATTTTAATATTTTGGGGGGGACAAGTCAGTCCTTCTGATCCTCAGCTTTCTCTGAACCA
TAATCCCAGCTCACAGGGCCCCTGGGGAGAATTAGACAACGTGACGTGTAAGCGTCAGCTGTGAGGGGTA
ATGTGGGGCTATAGCTCCAGGGTGGAGGGTTTACAGTGTGCAAGGGCATCCTAGAGCCATGAGACCTACA
GGGCTCTCTGGGTGTTGGGAGATACCTCTTTCGCTTCTTATAACACTGCAAGAGACAGACAGGGTGGCTC
TCACTGTGTCCATTTGAAGGCTAAAGAAACTGCAGCTCAGACCAGTTCAGCAACTCTCCTACATCGTGTG
GCTAAAGCTAAGAATTGTGACCCATTTTTCTGAATCCAGGTCCCCGCGATGCCCTGGGTTCAGACCCTAA
CACCCTCCCGTCCCTGAGTGCTGGGGATTTAAGGCAGCAGTGCCTCCTTTCAGGAAATCACACACACACT
GGAAACTCCTGCATACTCCTCTTACTATAATCTGTCACCAAAGACTGGATATTCCTGTGCTGGGGCTCGT
GCCAGCGCCTCGGGCTGCCAGGTGCTGCTTTCCAACTCCCACATGGGCTGCCCTCCCCCTACTGCTACCC
ACAGGGCCCCCACTCCACCTGCTCCCAGACGAGGCCAACTCCTGGCCAAGCTTAGGGGCACAGCGGAGGC
GCTCTGTTTCTGATTTTTCTCGCCTTCCTTGGAGATGCCTGTGCTTGGAAGGGAAGGCAGAACATTGCAT
CTTGGAACAAATCTGCTTTTGATCATGCAAATGAATGCCTGGATAATGTAGGCAGACTGTCAATTTCACC
AGTTAGAAAGAAAGAGAAAAGGGGGAGAAATTCCCCATGACAGCGACTGATGAAGAATTTCAATAGAAAG
CTGCTACTTCAGAAAATAAGATCATTTGCTGCGAATGGAGAACATCTCAGGCAGCCCTGATGCTCCACCG
GTAGGTTGCTAACTTTGCTGTCATTGGGACCCCCTGGGTGGGCCATAGGTG
SLA 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLA_2 ↗8:133,060,299負股133,060,289–133,060,348
SLA_1 ↗8:133,075,027負股133,075,017–133,075,076
SLA_3 ↗8:133,102,876負股133,102,866–133,102,925
SLA_4 ↗8:133,129,160負股133,129,150–133,129,209

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_85WMQ9 · enhancer · 133097871–133098016 · regulatory

ENSR8_BZF7R · promoter · 133102592–133103224 · regulatory

全反式維甲酸(ATRA)可誘導 SLA;此誘導並非直接作用,而是由其他蛋白質介導。來源未提供更具體的中介蛋白或調控步驟。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:276 aa

1 aa276 aa結構域功能區域
依 Q13239 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLA 蛋白長 276 個胺基酸。其 SH3 結構域位於第 22–82 位,SH2 結構域位於第 84–175 位;C 端區域涵蓋第 212–276 位。這些區域的序列註解描述蛋白質結構,來源未提供其他區域的功能說明。

結構域SH322–82 aa
結構域SH284–175 aa
功能區域SLA C-terminal212–276 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2CUD…

PDB · 2CUD

NMR · - · A=15-80

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Endosome

SLA 位於細胞質,並與胞內體共定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLA1SLAEGFRNCOA2PDGFRBABI2BLKMYO15BPTK6QARS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLA 可形成同源二聚體;其 C 端區域參與二聚化及與磷酸化 CBL 的互作。其 SH2 結構域可與磷酸化的 ZAP70、CD3Z、SYK 及 LAT 互作。另有與 EPHA2、VAV1、LCP2 和 PDGFRB 互作的註記,但此類關係標示為依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLA 是負向調節 T 細胞受體(TCR)訊號的接合蛋白,可抑制 T 細胞抗原受體誘發的活化及活化 T 細胞核因子的活化。它也參與 T 細胞正向選擇與有絲分裂的負向調節;可能藉由連結 ZAP70 等訊號蛋白與 CBL,促進依賴 CBL 的訊號蛋白降解。含實驗來源
證據與來源

Adapter protein, which negatively regulates T-cell receptor (TCR) signaling. Inhibits T-cell antigen-receptor induced activation of nuclear factor of activated T-cells. Involved in the negative regulation of positive selection and mitosis of T-cells. May act by linking signaling proteins such as ZAP70 with CBL, leading to a CBL dependent degradation of signaling proteins

PMID 10449770 ↗ · PMID 11696592 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLA 可形成同源二聚體,且 C 端區域參與二聚化及與磷酸化 CBL 的互作;SH2 結構域可與磷酸化的 ZAP70、CD3Z、SYK 和 LAT 互作。與 EPHA2、VAV1、LCP2 及 PDGFRB 的互作則標示為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Interacts with EPHA2, VAV1, LCP2 and PDGFRB (By similarity). Homodimer. Homodimerization and interaction with phosphorylated CBL occurs via its C-terminal domain. Interacts with phosphorylated proteins ZAP70, CD3Z, SYK and LAT via its SH2 domain

PMID 10449770 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLA 位於細胞質,並與胞內體共定位。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Endosome; Colocalizes with endosomes

開啟資料庫紀錄 ↗

調控全反式維甲酸(ATRA)可誘導 SLA;此誘導為間接作用,並由其他蛋白質介導。含實驗來源
證據與來源

By all-trans retinoic acid (ATRA). Induction is indirect and is mediated through other proteins

PMID 9020066 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000338087 · 2,995 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCATTTGCTGCGAATGGAGAACATCTCAGGCAGCCCTGA40
41TGCTCCACCGTCCTTGCAGAGAGAAGCTTGCTCAGAGTGG80
81TTACTGAAAACAGGAACCTGCCCTTCTGCAAGCCCTGTGC120
121CTTCCTCGTTCCTAGCAGAGGAAGTATGCGGCCAGTTTAG160
161CAACTGCAGTTCTTCTGTGTAGCATGGGCTGCTTCTCCAC200
201AACCGCGAGAAGCCCGGCTGCCTGTTTATTCTGGAGCAGC240
241AGCAGTTGACAGACGGAGAGGCAGTGACTCTGCACCCAGC280
281AATCCCTCTGCAGACAGCTCCCACAGGAGTCATGCCCAGT320
321GTGTGAAGGCTCTGGGCATCACCAGCGGCCCCAGGGAAAA360
361AGAAAGAAATGGGAAACAGCATGAAATCCACCCCTGCGCC400
401TGCCGAGAGGCCCCTGCCCAACCCGGAGGGACTGGATAGC440
441GACTTCCTTGCCGTGCTAAGTGACTACCCGTCTCCTGACA480
481TCAGCCCCCCGATATTCCGCCGAGGGGAGAAACTGCGTGT520
521GATTTCTGATGAAGGGGGCTGGTGGAAAGCTATTTCTCTT560
561AGCACTGGTCGAGAGAGTTACATCCCTGGAATATGTGTGG600
601CCAGAGTTTACCATGGCTGGCTGTTTGAGGGCCTGGGCAG640
641AGACAAGGCCGAGGAGCTGCTGCAGCTGCCAGACACAAAG680
681GTCGGCTCCTTCATGATCAGAGAGAGTGAGACCAAGAAAG720
721GGTTTTACTCACTGTCGGTGAGACACAGGCAGGTAAAGCA760
761TTACCGCATTTTCCGTCTGCCCAACAACTGGTACTACATT800
801TCCCCGAGGCTCACCTTCCAGTGCCTGGAGGACCTGGTGA840
841ACCACTATTCTGAGGTGGCTGATGGCCTGTGCTGTGTGCT880
881CACCACGCCCTGCCTGACACAAAGCACGGCTGCCCCAGCA920
921GTGAGGGCCTCCAGCTCACCTGTCACCTTGCGTCAGAAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。