演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SKP1EMC19

S-phase kinase associated protein 1

SKP1(S-phase kinase associated protein 1)是多種泛素連接酶複合體的核心成分,協助連結底物辨識蛋白與複合體其他部分。

Homo sapiens5q31.1UniProt P63208
OFFICIAL SYMBOL
SKP1
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P63208
PDB / ALPHAFOLD
1FQV
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SKP1(S-phase kinase associated protein 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 SKP1 family。它是多種蛋白質泛素連接酶複合體的重要組成,尤其見於以 SKP1、CUL1 與 F-box 蛋白構成的 SCF 複合體。SKP1在其中擔任連接角色,協助組合複合體的不同成分;而各複合體所含的 F-box 蛋白不同,底物辨識範圍也隨之改變。除 SCF 複合體外,SKP1亦是 Cul7-RING(FBXW8) 與 Cul1-RING(FBXL4) 泛素連接酶複合體的核心成分。這些組合使 SKP1參與多種蛋白質調控途徑;其具體作用取決於所處的複合體及其底物辨識成分。

Official symbol
SKP1
Gene name
S-phase kinase associated protein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10899
UniProt
P63208
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EMC19OCP2TCEB1LMGC34403OCP-IIp19ASKP1A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSKP1pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:134,145,693–134,177,911
Gene span
32,219 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000353411 ★134,148,935–134,176,9506
ENST00001128131134,145,693–134,177,2586
ENST00000986185134,145,709–134,177,2587
ENST00001104973134,146,155–134,177,2588
ENST00001104974134,147,004–134,177,2587
ENST00001135163134,148,935–134,177,2586
ENST00001104975134,152,451–134,177,2586
ENST00000880996134,155,960–134,176,9775
ENST00000934648134,156,391–134,177,2586
ENST00000934649134,156,395–134,177,2586
ENST00001037625134,156,395–134,177,2586
ENST00000934650134,156,428–134,177,2585

顯示 12/40 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SKP1的主要功能是作為泛素連接酶複合體的組成與連接元件。於 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)複合體中,它連結 F-box 蛋白與 CUL1;F-box 蛋白負責辨識底物,因此不同 F-box 蛋白可使 SCF複合體作用於不同標的。此類複合體介導蛋白質泛素化,所涉及的生物過程包括細胞週期進程、訊息傳遞與轉錄調控。

不同 SCF組合所辨識的底物涵蓋多種蛋白質。例如,SCF(BTRC)與SCF(FBXW11)可促進CTNNB1泛素化,並參與Wnt訊息傳遞;SCF(SKP2)促進已磷酸化的CDKN1B/p27kip泛素化,並參與G1/S轉換調控。SCF(FBXW7)作用於cyclin E及由NOTCH1釋出的細胞內結構域NICD;SCF(FBXL3)與SCF(FBXL21)則作用於CRY1和CRY2。另有多種SCF組合分別促進不同標的的泛素化,顯示底物選擇性主要隨F-box蛋白而異;部分標的在來源中以「可能」描述,並非確定指認。

部分泛素化與後續蛋白質降解相連。例如,SCF(BTRC)在NFKBIA的Lys-21與Lys-22促進泛素化;NFKBIA降解後,與其相關的NFKB1-RELA二聚體得以轉位至細胞核並活化轉錄。SKP1也作為Cul7-RING(FBXW8)複合體的核心成分,參與標的蛋白的泛素化及其後續蛋白酶體降解;在Cul1-RING(FBXL4)複合體中,則促進BNIP3與BNI3L的泛素化及後續降解。SKP1因此透過不同複合體的組成,參與多類蛋白質命運與細胞調控過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 134176950 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SKP1 ENST00000353411 GRCh38 chr5:134176850-134177950 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGTGGGGCTTTCAGACTACTCCCTTTCCTTTACAGCTGGCTTCATTCCATCGACCTCATCAAAGCCTTC
CTGGGAGCACCCTAGAGAAGAGTTACGTCCAGGCCGGGCCCTGGCTGCCTGGTTCACGGCGGAATCCCCA
GCACCACGCCTCGCACGTCGGGCTCAAAGCATGTTTAGTGAAGGAGTAGGTACCTACTGCTAGATGGAGC
CATCTCTCTAGACTTGGGGTTTCCCTATAACGATGGCTATGTTTGGCATGGAAGCCTCTTTAGAAGTCAA
TAGTAGGAAATAAGGGCTAACAGCACCTAATTGTGGAGTAAGGTTCAAATCCTAGCTCTGCCACTTAACC
GTTCCGAACCTGTTCCCTCACTGCAGAGGCGAAAAGGCTAACACTATTTCACCTCGGAGGGTTACCGTGG
AGAATGGAAGCTGGACAAGCTGTATCAGTTCAGTAGTAAAACACACACACACAAGCGCCCCACCCCCACC
CCACCCCACCCCAGGAATGAACACACACACCCGCGCGCGCACATACACCTCAGGAATGAACACACGCGCG
TACACACACACGCAGCCCCCCCCAGGAGTGAACACACACACACACGCCCCGTTCTGTTGTTCCCAGGAAC
ACACACAGAGACGCACACACTCGCCCGGTTTTGTTTTTTCCAGGCTTTTTAACTGGGGTCTTTCACTCGG
CTTAGGGCACCGCTGCCTGAAAGACCTTTCTAGGCCAGTCGGGGTCCGGCACCCAGTTGACGAGACAGCG
CGGCGCTTTCAGAGCTGGGGAGAGGCGAAAACTCTTCCGGCCCCCCGATCCCCCGGCCAGCCGCCCCCGG
CAGCTCCTTGCCGCCTCCCGGCCTGGGCCCGCCCAGCCGTTCTCGGCCTGCCGTCAGGCGATCTCGGCGG
CCAGCCCAGCCGCGATGTGACGCCGCGCGCCCCGGGGTCCTCGGCGCCTGCGCCCTCTCCTATAAAGCAG
ACGCCGCGCCGCGCTGCGACGCTGTAGTGGCTTCGTCTTCGGTTTTTCTCTTCCTTCGCTAACGCCTCCC
GGCTCTCGTCAGCCTCCCGCCGGCCGTCTCCTTAACACCGAACACCGTGAG
SKP1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SKP1_1 ↗5:134,176,950負股134,176,940–134,176,999

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_CHBH2 · enhancer · 134174965–134176708 · regulatory

ENSR5_BZLZ7 · promoter · 134176709–134177454 · regulatory

ENSR5_536K52Q · CTCF_binding_site · 134176974–134176995 · regulatory

ENSR5_536K569 · CTCF_binding_site · 134177738–134177759 · regulatory

· motif · 134175011–134175024 · motif

· motif · 134175011–134175024 · motif

· motif · 134175631–134175642 · motif

· motif · 134176772–134176787 · motif

· motif · 134176779–134176787 · motif

· motif · 134176976–134176992 · motif

· motif · 134177055–134177070 · motif

· motif · 134177740–134177756 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:163 aa

1 aa163 aa功能區域
依 P63208 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SKP1蛋白長163個胺基酸,屬於SKP1 family。第63至83位胺基酸區段註記為無序區;第104至163位則是與F-box proteins之F-box domain互作的區域。這些區段註解描述了蛋白質序列中的特徵與互作區域。

功能區域Disordered63–83 aa
功能區域Interaction with the F-box domain of F-box proteins104–163 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1FQV…

PDB · 1FQV

X-ray · 2.80 A · B/D/F/H/J/L/N/P=1-163

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EMC19SKP1ANKRD36BP1APIPATXN1BTRCCCNFCDKN1ACUL1FBXL12FBXL14FBXL17FBXL2FBXL20FBXL22FBXL5FBXL6FBXL8FBXO11FBXO17FBXO2FBXO21FBXO22FBXO25FBXO27FBXO28FBXO3FBXO31FBXO33FBXO4FBXO43FBXO44FBXO46FBXO48FBXO5FBXO6FBXO7FBXO9FBXW11FBXW2FBXW4FBXW5FBXW7FBXW8FBXW9KCTD9KDM2AKDM2BLMO2MEOX2MTUS1MYC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 64 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SKP1可與KDM2B形成異二聚體;SKP1-KDM2B複合體再與PCGF1-BCORL異二聚體互作,形成PRC1.1。它也是多種SCF複合體的成分,與不同F-box蛋白及CUL1、RBX1共同組成複合體;亦見於Cul7-RING(FBXW8)與Cul1-RING(FBXL4)複合體。另有來源記載SKP1與CEP68、NOTCH2、BCORL1等互作。微生物感染條件下,SKP1與vaccinia virus蛋白C9L互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SKP1是SCF及其他泛素連接酶複合體的核心或必要成分,在SCF中連結F-box底物辨識蛋白與CUL1。不同F-box蛋白使複合體辨識不同標的,參與細胞週期、訊息傳遞與轉錄調控;部分標的及作用以可能性描述。特定複合體可促進標的泛素化,並與蛋白酶體降解或轉錄活化相關。含實驗來源
證據與來源

Essential component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination of proteins involved in cell cycle progression, signal transduction and transcription. In the SCF complex, serves as an adapter that links the F-box protein to CUL1. The functional specificity of the SCF complex depends on the F-box protein as substrate recognition component. SCF(BTRC) and SCF(FBXW11) direct ubiquitination of CTNNB1 and participate in Wnt signaling. SCF(FBXW11) directs ubiquitination of phosphorylated NFKBIA. SCF(BTRC) directs ubiquitination of NFKBIB, NFKBIE, ATF4, SMAD3, SMAD4, CDC25A, FBXO5, CEP68 and probably NFKB2. SCF(SKP2) directs ubiquitination of phosphorylated CDKN1B/p27kip and is involved in regulation of G1/S transition. SCF(SKP2) directs ubiquitination of ORC1, CDT1, RBL2, ELF4, CDKN1A, RAG2, FOXO1A, and probably MYC and TAL1. SCF(FBXW7) directs ubiquitination of cyclin E, NOTCH1 released notch intracellular domain (NICD), and probably PSEN1. SCF(FBXW2) directs ubiquitination of GCM1. SCF(FBXO32) directs ubiquitination of MYOD1. SCF(FBXO7) directs ubiquitination of BIRC2 and DLGAP5. SCF(FBXO33) directs ubiquitination of YBX1. SCF(FBXO11) directs ubiquitination of BCL6 and DTL but does not seem to direct ubiquitination of TP53. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of NFKBIA at 'Lys-21' and 'Lys-22'; the degradation frees the associated NFKB1-RELA dimer to translocate into the nucleus and to activate transcription. SCF(CCNF) directs ubiquitination of CCP110. SCF(FBXL3) and SCF(FBXL21) direct ubiquitination of CRY1 and CRY2. SCF(FBXO9) directs ubiquitination of TTI1 and TELO2. SCF(FBXO10) directs ubiquitination of BCL2. Core component of the Cul7-RING(FBXW8) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Also acts as a core component of the Cul1-RING(FBXL4) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of BNIP3 and BNI3L

PMID 16209941 ↗ · PMID 20181953 ↗ · PMID 22113614 ↗ · PMID 23431138 ↗ · PMID 25704143 ↗ · PMID 28727686 ↗ · PMID 35982156 ↗ · PMID 36896912 ↗

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分子活性SKP1相關的活動類別包括蛋白質修飾,具體列為蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

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交互作用SKP1與KDM2B形成異二聚體,該複合體可再與PCGF1-BCORL異二聚體組成PRC1.1。SKP1亦參與多種SCF及其他泛素連接酶複合體,並與多種F-box蛋白、CUL1、RBX1等共同組成複合體;另記載其與CEP68、NOTCH2、BCORL1等互作,以及SKP1-KDM2A和SKP1-KDM2B複合體與UBB互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with KDM2B, forming heterodimers. The KDM2B-SKP1 heterodimeric complex interacts with the PCGF1-BCORL heterodimeric complex to form a homotetrameric polycomb repression complex 1 (PRC1.1). Component of multiple SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complexes formed of CUL1, SKP1, RBX1 and a variable F-box domain-containing protein as substrate-specific subunit. Component of the SCF(FBXW11) complex containing FBXW11. Component of the SCF(SKP2) complex containing SKP2, in which it interacts directly with SKP1, SKP2 and RBX1. Component of the SCF(FBXW2) complex containing FBXW2. Component of the SCF(FBXO32) complex containing FBXO32. Component of the probable SCF(FBXO7) complex containing FBXO7. Component of the SCF(FBXO10) complex containing FBXO10. Component of the SCF(FBXO11) complex containing FBXO11. Component of the SCF(FBXO25) complex containing FBXO25. Component of the SCF(FBXO33) complex containing FBXO33. Component of the probable SCF(FBXO4) complex containing FBXO4. Component of the SCF(FBXO44) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO44. Component of the SCF(BTRC) complex, composed of SKP1, CUL1 and BTRC. This complex binds phosphorylated NFKBIA. Part of a SCF complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and FBXO2. Component of a SCF(SKP2)-like complex containing CUL1, SKP1, TRIM21 and SKP2. Component of the SCF(FBXO17) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO17. Component of the SCF(FBXO27) complex, composed of SKP1, CUL1 and FBXO27. Component of the SCF(CCNF) complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and CCNF. Component of the SCF(FBXL3) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL3. Component of the SCF(FBXL21) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL21. Component of the SCF(FBXO9) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXO9. Component of the SCF(FBXW7) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXW7. Component of the SCF(FBXO31) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXO31. Component of the SCF(FBXW15) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXW15 (By similarity). Component of the SCF(FBXL2) complex composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL2. Interacts with CEP68. Interacts with NOTCH2. Interacts with FBXW15 (By similarity). The SKP1-KDM2A and SKP1-KDM2B complexes interact with UBB. Component of the Cul7-RING(FBXW8) complex consisting of CUL7, RBX1, SKP1 and FBXW8; within the complex interacts with FBXW8. Interacts with BCORL1. Interacts with FBXL4

PMID 11389839 ↗ · PMID 12481031 ↗ · PMID 12820959 ↗ · PMID 16209941 ↗ · PMID 16880511 ↗ · PMID 17389369 ↗ · PMID 17434132 ↗ · PMID 18203720 ↗ · PMID 20181953 ↗ · PMID 20596027 ↗ · PMID 22113614 ↗ · PMID 23431138 ↗ · PMID 25503564 ↗ · PMID 27568929 ↗ · PMID 28727686 ↗ · PMID 29149593 ↗ · PMID 30033217 ↗ · PMID 31209342 ↗ · PMID 31413110 ↗ · PMID 35982156 ↗ · PMID 36896912 ↗ · PMID 38342987 ↗ · PMID 39880951 ↗

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交互作用在微生物感染條件下,SKP1與vaccinia virus蛋白C9L互作。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with vaccinia virus protein C9L

PMID 29444943 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000353411 · 9,386 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTGTAGTGGCTTCGTCTTCGGTTTTTCTCTTCCTTCGCT40
41AACGCCTCCCGGCTCTCGTCAGCCTCCCGCCGGCCGTCTC80
81CTTAACACCGAACACCATGCCTTCAATTAAGTTGCAGAGT120
121TCTGATGGAGAGATATTTGAAGTTGATGTGGAAATTGCCA160
161AACAATCTGTGACTATTAAGACCATGTTGGAAGATTTGGG200
201AATGGATGATGAAGGAGATGATGACCCAGTTCCTCTACCA240
241AATGTGAATGCAGCAATATTAAAAAAGGTCATTCAGTGGT280
281GCACCCACCACAAGGATGACCCTCCTCCTCCTGAAGATGA320
321TGAGAACAAAGAAAAGCGAACAGATGATATCCCTGTTTGG360
361GACCAAGAATTCCTGAAAGTTGACCAAGGAACACTTTTTG400
401AACTCATTCTGGCTGCAAACTACTTAGACATCAAAGGTTT440
441GCTTGATGTTACATGCAAGACTGTTGCCAATATGATCAAG480
481GGGAAAACTCCTGAGGAGATTCGCAAGACCTTCAATATCA520
521AAAATGACTTTACTGAAGAGGAGGAAGCCCAGGTACGCAA560
561AGAGAACCAGTGGTGTGAAGAGAAGTGAAATGTTGTGCCT600
601GACACTGTAACACTGTAAGGATTGTTCCAAATACTAGTTG640
641CACTGCTCTGTTTATAATTGTTAATATTAGACAAACAGTA680
681GACAAATGCAGCAGCAAGTCAATTGTATTAGCAGAATATT720
721GTCCTCATTGCATGTGTAGTTTGAGCACAGATCCCAAACC760
761TTACGGCCAAGTTTCTTCTAGTATGATGGAAAGTTTCTTT800
801TTTCTTTGCTCTGAATAAAACTGAACTGTGGGTTCTCTAT840
841AAGTGGCATTTTGGGCTTTCCCTCTTTTTTGTAAAGCAAT880
881GTCTGCCTAGTTTATTGTCCAGTTAACTTTAGTGACCTTT920
921TAAAAGTTGGCATTGTAAATAAAACAACTTGCAAAAAAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。