基因總覽
SIRAL2(SIR2 antiphage like 2)是人類的蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 SIRAL family。現有資料指出,其蛋白質具有 NAD(+) nucleosidase 活性;相關功能特性與 SIRAL1 的互作及兩者形成的絲狀結構有關。來源未提供其蛋白質長度、結構域或其他序列層級的特徵,因此此處不進一步推定其分子結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000441876 ★ | 45,309,934–45,341,955 | 9 |
| ENST00000216214 | 45,308,982–45,342,828 | 10 |
| ENST00000405673 | 45,309,794–45,329,412 | 5 |
| ENST00000894423 | 45,309,794–45,342,828 | 8 |
| ENST00000894424 | 45,309,794–45,342,828 | 10 |
| ENST00000894425 | 45,309,794–45,342,828 | 9 |
| ENST00000894426 | 45,309,794–45,342,828 | 9 |
| ENST00000894427 | 45,309,794–45,342,828 | 11 |
| ENST00000894428 | 45,309,794–45,342,828 | 10 |
| ENST00000894429 | 45,309,794–45,342,828 | 5 |
| ENST00000915810 | 45,309,794–45,342,828 | 7 |
| ENST00000915811 | 45,309,794–45,342,828 | 10 |
顯示 12/45 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SIRAL2 具有內在的 NAD(+) nucleosidase 活性,但單獨呈現時活性較弱。與其旁系同源蛋白 SIRAL1 互作後,這項活性會大幅提升;資料並指出,SIRAL1 與 SIRAL2 形成絲狀結構時,兩者的 NAD 處理活性具有協同提升的現象。
其催化反應以 NAD(+) 和水為底物,產生 ADP-D-ribose、nicotinamide 與 H(+)。因此,SIRAL2 的功能特性不僅包含對 NAD(+) 的水解,也受到與 SIRAL1 的互作及絲狀結構形成影響。現有資料支持這些分子層級的活性與互作關係,但未進一步說明其在特定生理過程中的作用或下游效應。
Promoter 與基因調控
>SIRAL2 ENST00000441876 GRCh38 chr22:45308934-45310034 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGGCAGGGCAGGCTGGGAAGAGGAAGTGGATTGGGTCTTGTTTAGGTAAAAGACTTCAGTGGCAGACAA AGGAGGAGTAATAAGATCGCTAGGGGGCCCGTGCCCAGCCCACCCACGCACAATCTCAGTCCTCGCAATA CCCACAAGGTAGGTGCTAGGATCACACCCTTTACGGACGCGGCACCTGCGACAGGGATGCGCGAGGAGTC AGGGGGCCTCGCCGGATCGAACCTAAGCTGGGGAAGAGTATTTCTTGTATTTTTAGGAGAAATTCTCAGC CTCGGGGAAGAGTATTTCTTGATGAGGGAAGAGCGCGGGGAAGACACTCACGCACGCACAAACATGTGGG CGGCCATGGTGTGCCCAGCGCCGTGCTGGCTTCTGGGAACCCCCAGTGGACAAGACGGACAAGGTACCGG CTCTCAGGGGAAGTGGGAGCCAGTCACAAGCGTACCTAATTTCGGAGAGTGACAAGTACTCTGAAAAAGA AAGAAGGTAGGGCTGGTGACTGGCCAATTTAAGCGGGCAGGAGTCTGCTGGGGGACGGAGACCAGCCTCA GGTCTGGGTTGGGGACAGAAGCTGTGCCTAAGTGTGGTGCAGGATGCAGTTGCAAAGGAGCGCTTCCGAT CGCACTTGATGCTCGCCACGTCCCTGCAAAGTGCTCCCGCCCCCTTTCTGCAAATGAGGAAACGGGACGC GCGGCTCGCCGGGCCAGGTAGGGCTAGGACGCGGACTCTAGGCCCAAGCGCTCCCCAGCGCAAGCCCTCC CCCGCACATCCGACCGCGCCTGCGCTGGAGACCCCGGGGGCGTGGCCTCCCCGGTGGGCGGGACCGTGGT CACCGAGGTGGGCGGTGCCAGAGGATCTGGCGGCGGGGCGGGGCGGGGCGCGCGTCCTGGCTTCGCCCTT CCCCGGGGCGGGGCCTCCGGGGACCGCGGGGCCGTTGGTTTCGGGACGGAACGTTCACGCGGCTGGGGCG GGCGCGCGGGGGAAGGGTTTGCGGCGGCGCCGCTGCCGGCTAACGCGGAGGGGCGCCTGGAGGCGGCGTG GCGTCCGCTCTGGCTCCGACTCCGGCTCTCGCTCTCGCTTCTAGCCCGCGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAM118A_2 ↗ | 22:45,309,934 | 正股 | 45,309,885–45,309,944 |
| FAM118A_1 ↗ | 22:45,310,118 | 正股 | 45,310,069–45,310,128 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9MZK6 · promoter · 45308602–45308992 · regulatory
ENSR22_BBZR8 · promoter · 45309444–45310134 · regulatory
ENSR22_5DMQ5N · CTCF_binding_site · 45309597–45309618 · regulatory
ENSR22_BBZRC · enhancer · 45310135–45311067 · regulatory
ENSR22_9MZLQ · enhancer · 45314064–45314377 · regulatory
· motif · 45308949–45308962 · motif
· motif · 45309091–45309103 · motif
· motif · 45309189–45309200 · motif
· motif · 45309353–45309366 · motif
· motif · 45309599–45309615 · motif
· motif · 45309608–45309621 · motif
· motif · 45309698–45309711 · motif
· motif · 45309718–45309729 · motif
· motif · 45309718–45309729 · motif
· motif · 45309734–45309747 · motif
· motif · 45309767–45309784 · motif
· motif · 45309834–45309856 · motif
· motif · 45309834–45309856 · motif
· motif · 45309866–45309879 · motif
· motif · 45310125–45310138 · motif
· motif · 45310183–45310196 · motif
· motif · 45310222–45310235 · motif
· motif · 45310222–45310235 · motif
· motif · 45310308–45310323 · motif
· motif · 45310454–45310467 · motif
· motif · 45310454–45310467 · motif
· motif · 45314199–45314205 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
SIRAL2 可見於細胞核與細胞質。 SIRAL1 和 SIRAL2 的多數焦點位於細胞核,但也觀察到位於細胞質的焦點。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- AIDAQ96BJ3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ATOX1O00244 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DCDC2Q9UHG0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM118BQ9BPY3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GLRX3O76003 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MOB1AQ9H8S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MOB3CQ70IA8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RNF4P78317 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WDR4P57081 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
SIRAL2 可自發組裝成螺旋狀絲狀結構,並與 SIRAL1 互作。這項互作與 NAD 處理活性的協同提升相關;資料未進一步指出其他結合夥伴或複合體成分。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SIRAL2 本身具有較弱的 NAD(+) nucleosidase 活性;與其旁系同源蛋白 SIRAL2 互作,並形成 SIRAL1-SIRAL2 絲狀結構後,這項活性會大幅提升。 | 含實驗來源 | 證據與來源Exhibits weak intrinsic NAD(+) nucleosidase activity, which is strongly stimulated upon interaction with its paralog SIRAL2 and the formation of SIRAL1-SIRAL2 filaments PMID 40705877 ↗ · PMID 41249820 ↗ |
| 分子活性 | NAD(+) + H2O = ADP-D-ribose + nicotinamide + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SIRAL2 可自發組裝成螺旋狀絲狀結構,也會與 SIRAL1 互作;兩者互作會帶來協同的 NAD 處理活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spontaneously self-assemble into helical filaments. Interacts with SIRAL1; interaction leads to synergistic NAD-processing activity PMID 41249820 ↗ |
| 細胞定位 | SIRAL1 和 SIRAL2 的多數細胞內焦點位於細胞核,也可觀察到位於細胞質的焦點;資料列出的定位包括細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Most SIRAL1 and SIRAL2 foci are nuclear, cytoplasmic ones are also detected PMID 41249820 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGGCGGCGCCGCTGCCGGCTAACGCGGAGGGGCGCCTGG40AGGCGGCGTGGCGTCCGCTCTGGCTCCGACTCCGGCTCTC80GCTCTCGCTTCTAGCCCGCGTGCCTGCGCAGTCCCCTCCC120CGAGAACCATCCCCTTGCCCCGCCCAGCGTCAGGGGTGCG160CGGCCGCCGAGAGACCCCGGAGGCGTAGCCGGCTGCGGAG200GCGAAGAGGTGGCAGCGCGAGCTGGGACCAGCGTCTCGGA240GGCGCCGCAGAATTCACAGATGGATTCAGTGGAAAAGACA280ACAAATAGAAGTGAACAAAAATCCAGAAAGTTTTTAAAAA320GCCTCATCCGGAAACAGCCCCAGGAACTGCTCCTGGTTAT360CGGGACTGGCGTCAGCGCAGCAGTGGCCCCCGGAATCCCT400GCCCTTTGCTCGTGGAGAAGCTGCATCGAGGCCGTCATCG440AGGCTGCAGAGCAGCTGGAGGTGCTGCACCCCGGAGACGT480CGCCGAGTTCCGGAGGAAAGTGACAAAGGACCGGGACCTG520TTGGTTGTCGCCCATGATCTGATCCGGAAGATGTCACCTC560GCACAGGCGATGCCAAGCCCAGCTTCTTCCAGGACTGCCT600GATGGAGGTGTTTGACGACCTGGAGCAGCACATCCGGAGT640CCTGTGGTGCTGCAGTCGATCCTCAGCCTGATGGACAGGG680GCGCCATGGTCCTGACCACCAACTATGACAACCTGCTGGA720GGCCTTTGGCCGGCGGCAGAACAAGCCCATGGAGTCCCTG760GACTTGAAGGACAAGACCAAGGTCCTTGAATGGGCAAGAG800GGCACATGAAGTACGGCGTCCTCCACATTCACGGCCTCTA840CACGGACCCCTGCGGGGTGGTGCTGGACCCATCGGGGTAT880AAAGACGTCACTCAAGACGCAGAAGTCATGGAAGTCCTCC920AGAACTTATACCGCACCAAGTCCTTTCTGTTTGTGGGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。