演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SIRAL2FLJ20635

SIR2 antiphage like 2

SIRAL2(SIR2 antiphage like 2)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 SIRAL family,具有 NAD(+) nucleosidase 活性。

Homo sapiens22q13.31UniProt Q9NWS6
OFFICIAL SYMBOL
SIRAL2
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q9NWS6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SIRAL2(SIR2 antiphage like 2)是人類的蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 SIRAL family。現有資料指出,其蛋白質具有 NAD(+) nucleosidase 活性;相關功能特性與 SIRAL1 的互作及兩者形成的絲狀結構有關。來源未提供其蛋白質長度、結構域或其他序列層級的特徵,因此此處不進一步推定其分子結構。

Official symbol
SIRAL2
Gene name
SIR2 antiphage like 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1313
UniProt
Q9NWS6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ20635bK268H5.C22.4C22orf8FAM118A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.31
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegSIRAL2pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:45,308,968–45,342,828
Gene span
33,861 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000441876 ★45,309,934–45,341,9559
ENST0000021621445,308,982–45,342,82810
ENST0000040567345,309,794–45,329,4125
ENST0000089442345,309,794–45,342,8288
ENST0000089442445,309,794–45,342,82810
ENST0000089442545,309,794–45,342,8289
ENST0000089442645,309,794–45,342,8289
ENST0000089442745,309,794–45,342,82811
ENST0000089442845,309,794–45,342,82810
ENST0000089442945,309,794–45,342,8285
ENST0000091581045,309,794–45,342,8287
ENST0000091581145,309,794–45,342,82810

顯示 12/45 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SIRAL2 具有內在的 NAD(+) nucleosidase 活性,但單獨呈現時活性較弱。與其旁系同源蛋白 SIRAL1 互作後,這項活性會大幅提升;資料並指出,SIRAL1 與 SIRAL2 形成絲狀結構時,兩者的 NAD 處理活性具有協同提升的現象。

其催化反應以 NAD(+) 和水為底物,產生 ADP-D-ribose、nicotinamide 與 H(+)。因此,SIRAL2 的功能特性不僅包含對 NAD(+) 的水解,也受到與 SIRAL1 的互作及絲狀結構形成影響。現有資料支持這些分子層級的活性與互作關係,但未進一步說明其在特定生理過程中的作用或下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45309934 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SIRAL2 ENST00000441876 GRCh38 chr22:45308934-45310034 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGGCAGGGCAGGCTGGGAAGAGGAAGTGGATTGGGTCTTGTTTAGGTAAAAGACTTCAGTGGCAGACAA
AGGAGGAGTAATAAGATCGCTAGGGGGCCCGTGCCCAGCCCACCCACGCACAATCTCAGTCCTCGCAATA
CCCACAAGGTAGGTGCTAGGATCACACCCTTTACGGACGCGGCACCTGCGACAGGGATGCGCGAGGAGTC
AGGGGGCCTCGCCGGATCGAACCTAAGCTGGGGAAGAGTATTTCTTGTATTTTTAGGAGAAATTCTCAGC
CTCGGGGAAGAGTATTTCTTGATGAGGGAAGAGCGCGGGGAAGACACTCACGCACGCACAAACATGTGGG
CGGCCATGGTGTGCCCAGCGCCGTGCTGGCTTCTGGGAACCCCCAGTGGACAAGACGGACAAGGTACCGG
CTCTCAGGGGAAGTGGGAGCCAGTCACAAGCGTACCTAATTTCGGAGAGTGACAAGTACTCTGAAAAAGA
AAGAAGGTAGGGCTGGTGACTGGCCAATTTAAGCGGGCAGGAGTCTGCTGGGGGACGGAGACCAGCCTCA
GGTCTGGGTTGGGGACAGAAGCTGTGCCTAAGTGTGGTGCAGGATGCAGTTGCAAAGGAGCGCTTCCGAT
CGCACTTGATGCTCGCCACGTCCCTGCAAAGTGCTCCCGCCCCCTTTCTGCAAATGAGGAAACGGGACGC
GCGGCTCGCCGGGCCAGGTAGGGCTAGGACGCGGACTCTAGGCCCAAGCGCTCCCCAGCGCAAGCCCTCC
CCCGCACATCCGACCGCGCCTGCGCTGGAGACCCCGGGGGCGTGGCCTCCCCGGTGGGCGGGACCGTGGT
CACCGAGGTGGGCGGTGCCAGAGGATCTGGCGGCGGGGCGGGGCGGGGCGCGCGTCCTGGCTTCGCCCTT
CCCCGGGGCGGGGCCTCCGGGGACCGCGGGGCCGTTGGTTTCGGGACGGAACGTTCACGCGGCTGGGGCG
GGCGCGCGGGGGAAGGGTTTGCGGCGGCGCCGCTGCCGGCTAACGCGGAGGGGCGCCTGGAGGCGGCGTG
GCGTCCGCTCTGGCTCCGACTCCGGCTCTCGCTCTCGCTTCTAGCCCGCGT
SIRAL2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FAM118A_2 ↗22:45,309,934正股45,309,885–45,309,944
FAM118A_1 ↗22:45,310,118正股45,310,069–45,310,128

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_9MZK6 · promoter · 45308602–45308992 · regulatory

ENSR22_BBZR8 · promoter · 45309444–45310134 · regulatory

ENSR22_5DMQ5N · CTCF_binding_site · 45309597–45309618 · regulatory

ENSR22_BBZRC · enhancer · 45310135–45311067 · regulatory

ENSR22_9MZLQ · enhancer · 45314064–45314377 · regulatory

· motif · 45308949–45308962 · motif

· motif · 45309091–45309103 · motif

· motif · 45309189–45309200 · motif

· motif · 45309353–45309366 · motif

· motif · 45309599–45309615 · motif

· motif · 45309608–45309621 · motif

· motif · 45309698–45309711 · motif

· motif · 45309718–45309729 · motif

· motif · 45309718–45309729 · motif

· motif · 45309734–45309747 · motif

· motif · 45309767–45309784 · motif

· motif · 45309834–45309856 · motif

· motif · 45309834–45309856 · motif

· motif · 45309866–45309879 · motif

· motif · 45310125–45310138 · motif

· motif · 45310183–45310196 · motif

· motif · 45310222–45310235 · motif

· motif · 45310222–45310235 · motif

· motif · 45310308–45310323 · motif

· motif · 45310454–45310467 · motif

· motif · 45310454–45310467 · motif

· motif · 45314199–45314205 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:357 aa

SIRAL2 所屬的蛋白質家族為 SIRAL family。現有來源未提供其結構域、功能區域或序列註解的具體資料。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NWS6…

AlphaFold · Q9NWS6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

SIRAL2 可見於細胞核與細胞質。 SIRAL1 和 SIRAL2 的多數焦點位於細胞核,但也觀察到位於細胞質的焦點。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 13 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SIRal2SIRAL2AIDAATOX1CDC37DCDC2FAM118BGLRX3LNX1MOB1AMOB3CRNF4SDCBPUBE2IWDR4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SIRAL2 可自發組裝成螺旋狀絲狀結構,並與 SIRAL1 互作。這項互作與 NAD 處理活性的協同提升相關;資料未進一步指出其他結合夥伴或複合體成分。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SIRAL2 本身具有較弱的 NAD(+) nucleosidase 活性;與其旁系同源蛋白 SIRAL2 互作,並形成 SIRAL1-SIRAL2 絲狀結構後,這項活性會大幅提升。含實驗來源
證據與來源

Exhibits weak intrinsic NAD(+) nucleosidase activity, which is strongly stimulated upon interaction with its paralog SIRAL2 and the formation of SIRAL1-SIRAL2 filaments

PMID 40705877 ↗ · PMID 41249820 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性NAD(+) + H2O = ADP-D-ribose + nicotinamide + H(+)含實驗來源
證據與來源

NAD(+) + H2O = ADP-D-ribose + nicotinamide + H(+)

PMID 41249820 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SIRAL2 可自發組裝成螺旋狀絲狀結構,也會與 SIRAL1 互作;兩者互作會帶來協同的 NAD 處理活性。含實驗來源
證據與來源

Spontaneously self-assemble into helical filaments. Interacts with SIRAL1; interaction leads to synergistic NAD-processing activity

PMID 41249820 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SIRAL1 和 SIRAL2 的多數細胞內焦點位於細胞核,也可觀察到位於細胞質的焦點;資料列出的定位包括細胞核與細胞質。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; Most SIRAL1 and SIRAL2 foci are nuclear, cytoplasmic ones are also detected

PMID 41249820 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000441876 · 2,883 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCGGCGGCGCCGCTGCCGGCTAACGCGGAGGGGCGCCTGG40
41AGGCGGCGTGGCGTCCGCTCTGGCTCCGACTCCGGCTCTC80
81GCTCTCGCTTCTAGCCCGCGTGCCTGCGCAGTCCCCTCCC120
121CGAGAACCATCCCCTTGCCCCGCCCAGCGTCAGGGGTGCG160
161CGGCCGCCGAGAGACCCCGGAGGCGTAGCCGGCTGCGGAG200
201GCGAAGAGGTGGCAGCGCGAGCTGGGACCAGCGTCTCGGA240
241GGCGCCGCAGAATTCACAGATGGATTCAGTGGAAAAGACA280
281ACAAATAGAAGTGAACAAAAATCCAGAAAGTTTTTAAAAA320
321GCCTCATCCGGAAACAGCCCCAGGAACTGCTCCTGGTTAT360
361CGGGACTGGCGTCAGCGCAGCAGTGGCCCCCGGAATCCCT400
401GCCCTTTGCTCGTGGAGAAGCTGCATCGAGGCCGTCATCG440
441AGGCTGCAGAGCAGCTGGAGGTGCTGCACCCCGGAGACGT480
481CGCCGAGTTCCGGAGGAAAGTGACAAAGGACCGGGACCTG520
521TTGGTTGTCGCCCATGATCTGATCCGGAAGATGTCACCTC560
561GCACAGGCGATGCCAAGCCCAGCTTCTTCCAGGACTGCCT600
601GATGGAGGTGTTTGACGACCTGGAGCAGCACATCCGGAGT640
641CCTGTGGTGCTGCAGTCGATCCTCAGCCTGATGGACAGGG680
681GCGCCATGGTCCTGACCACCAACTATGACAACCTGCTGGA720
721GGCCTTTGGCCGGCGGCAGAACAAGCCCATGGAGTCCCTG760
761GACTTGAAGGACAAGACCAAGGTCCTTGAATGGGCAAGAG800
801GGCACATGAAGTACGGCGTCCTCCACATTCACGGCCTCTA840
841CACGGACCCCTGCGGGGTGGTGCTGGACCCATCGGGGTAT880
881AAAGACGTCACTCAAGACGCAGAAGTCATGGAAGTCCTCC920
921AGAACTTATACCGCACCAAGTCCTTTCTGTTTGTGGGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。