基因總覽
SIPA1（signal-induced proliferation-associated 1）是位於人類第 11 號染色體的蛋白質編碼基因，產物為 Signal-induced proliferation-associated protein 1。此蛋白質含有 Rap-GAP 與 PDZ 結構域，並具有數段被註記為無序的區域。現有資料將其描述為 Ras 相關調控蛋白 Rap1、Rap2 的 GTPase activator；其體外作用及與細胞週期進程的關聯，詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000534313 ★ | 65,638,101–65,650,912 | 16 |
| ENST00000871954 | 65,638,086–65,650,930 | 17 |
| ENST00000871955 | 65,638,086–65,650,930 | 16 |
| ENST00000871956 | 65,638,086–65,650,930 | 16 |
| ENST00000871957 | 65,638,086–65,650,930 | 17 |
| ENST00000871958 | 65,638,086–65,650,930 | 16 |
| ENST00000871959 | 65,638,086–65,650,927 | 16 |
| ENST00000871960 | 65,638,086–65,650,930 | 17 |
| ENST00000871961 | 65,638,086–65,650,930 | 17 |
| ENST00000871962 | 65,638,086–65,650,930 | 12 |
| ENST00000871963 | 65,638,086–65,650,930 | 16 |
| ENST00000926387 | 65,638,086–65,650,930 | 17 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Signal-induced proliferation-associated protein 1 可促進 Ras 相關調控蛋白 Rap1 與 Rap2 的 GTPase 活性。體外資料顯示，它能使這兩種蛋白由 GTP 結合狀態轉為 GDP 結合狀態；來源將轉換後的 GDP 結合形式描述為推定不活化狀態。因此，SIPA1 的作用涉及調節 Rap1、Rap2 的核苷酸結合狀態，但此處所述證據為體外觀察，不能據此延伸為所有細胞情境下均已確認的作用。
資料亦指出 SIPA1 會影響細胞週期進程，但此項資訊標示為依相似性推定（By similarity），並未提供具體的細胞週期階段、作用方向或實驗條件。故可將細胞週期進程視為與 SIPA1 相關的生物學過程，但現有內容不足以進一步說明其如何連結 Rap1、Rap2 的調控與細胞週期變化。
Promoter 與基因調控
>SIPA1 ENST00000534313 GRCh38 chr11:65637101-65638201 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTTGGCCAGAGTACCAAAACTGAGTGACCCAGACCTCTGACCTTGACCCCTGATCTCTCTCATCCCCAG TCCAGGGCCTGGGCTCCCCAGATGGAGGCAGTCAGCCTCCCAGCCAGGCCCTAAGAGCCAAACCATGGGC TGGTCCCACTTGGAGCCTGTGGCCAGGACCACCTCAGCCCCTGGGCCTGCACTGCCTGCAGGTGTGGCCC CCTTGGCCTGGACCTGGGGCCTGAATTGTGGGAAGGGTGGTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTCTTTTCTTT TTTTTTTTTTTTTTTGTGCTTCGGAGACATCAGAATTAATAACACTATTTTTGATTTTGGTTGGCAGTTT CTTTTTCTACCTGGGAATGGGTACATGATAGTACAGGCGGCTAAGTTGGGATGGACAAGCACGCAGAGGG GTGAAGGATGTGGGGCTGAAGTCTAGTAGAGATCAAGGGCAGACCAAGGTGGGGTTCAGGTAGAACCGGG TCCTCTTCACCGCATGGCTGCTCCCTTTTCAAGCCTTTATCTGAAGGGTATTGTCTGCCATTTCCCACCA TATGGTCAGACTTCCAGGTCTGGTGGCTCCTACATTTATCAGGCTTGTTCTTGGCCAAAGCCTTTCTCTG CACCTCAGCTGCTCCAGGGCGTAAAGAGATGACACCTATCTAAGGTGTTTTTAGAATAAATGAGAGCGCG CTAGTGGAATGGTTGCCCAGGGCCCAGTGCTTAGCAAGTGCTCCATAAAATAGTGGCAGACTCTTGAGCA CCTGCTGGCCGGGAGCTGGACGCTAGGTGGCCTCCGCTAGCCCTCCCGGTTGGTCTGGAAGGCAGGCACA AGTTTCTCAGGAGAGGAAATGGCCTTAGAATGAGCACTGCTCGGTGCTGACCTCCGCCAGGCCTGGAATC CCCGCTGCTGCGCTTCCCGCCGCAGACAGCTCCCGGCCGGCCCCGCCTCCCGGCATGGCCCCGCCTCCCA GCATGGCCCCGCCCCCAGGCGGAGCCGGCGCCGGGAGCGGTAGCGGGAGAGCGGCAGCGGGACCCCAGCG CGGGCGGCGGCGGCTGGGCGGGAGCCCCAGAGGTACTGGCGGGAGCAGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SIPA1_1 ↗ | 11:65,638,101 | 正股 | 65,638,052–65,638,111 |
| SIPA1_2 ↗ | 11:65,639,866 | 正股 | 65,639,817–65,639,876 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_83X4QL · enhancer · 65633851–65634086 · regulatory
ENSR11_9Z3FF · promoter · 65637611–65638111 · regulatory
ENSR11_5KFSS4 · CTCF_binding_site · 65638086–65638107 · regulatory
ENSR11_C8HT6 · enhancer · 65638112–65639690 · regulatory
ENSR11_5KFSWC · CTCF_binding_site · 65638580–65638601 · regulatory
ENSR11_9Z3G2 · promoter · 65639691–65640131 · regulatory
· motif · 65633400–65633413 · motif
· motif · 65633699–65633712 · motif
· motif · 65636373–65636379 · motif
· motif · 65636744–65636757 · motif
· motif · 65637079–65637094 · motif
· motif · 65637081–65637094 · motif
· motif · 65637084–65637096 · motif
· motif · 65637132–65637145 · motif
· motif · 65637135–65637147 · motif
· motif · 65637136–65637151 · motif
· motif · 65637141–65637153 · motif
· motif · 65637144–65637151 · motif
· motif · 65637145–65637158 · motif
· motif · 65637643–65637653 · motif
· motif · 65637651–65637662 · motif
· motif · 65637867–65637876 · motif
· motif · 65637987–65637994 · motif
· motif · 65638088–65638104 · motif
· motif · 65638462–65638469 · motif
· motif · 65638462–65638477 · motif
· motif · 65638476–65638498 · motif
· motif · 65638476–65638498 · motif
· motif · 65638582–65638598 · motif
· motif · 65638604–65638611 · motif
· motif · 65638604–65638617 · motif
· motif · 65638604–65638617 · motif
· motif · 65638610–65638617 · motif
· motif · 65638673–65638686 · motif
· motif · 65638679–65638692 · motif
· motif · 65639327–65639342 · motif
· motif · 65639332–65639344 · motif
· motif · 65639335–65639342 · motif
· motif · 65639727–65639736 · motif
· motif · 65639747–65639758 · motif
· motif · 65639764–65639777 · motif
· motif · 65639764–65639777 · motif
· motif · 65639863–65639872 · motif
· motif · 65640141–65640154 · motif
· motif · 65640153–65640160 · motif
· motif · 65640153–65640168 · motif
· motif · 65640216–65640225 · motif
· motif · 65640349–65640362 · motif
· motif · 65640349–65640362 · motif
· motif · 65640392–65640405 · motif
· motif · 65640392–65640405 · motif
· motif · 65640686–65640697 · motif
· motif · 65640702–65640715 · motif
· motif · 65640704–65640715 · motif
· motif · 65640704–65640715 · motif
· motif · 65640706–65640715 · motif
· motif · 65640737–65640746 · motif
· motif · 65640780–65640793 · motif
· motif · 65640875–65640886 · motif
· motif · 65640894–65640907 · motif
· motif · 65640894–65640907 · motif
· motif · 65640980–65640992 · motif
· motif · 65640983–65640990 · motif
· motif · 65640983–65640998 · motif
· motif · 65640984–65641001 · motif
· motif · 65640993–65641008 · motif
· motif · 65641021–65641038 · motif
· motif · 65641313–65641326 · motif
· motif · 65641313–65641326 · motif
在 promyelocytic HL-60 細胞中，12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate（TPA）會抑制 SIPA1。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1042 aa
Signal-induced proliferation-associated protein 1 長 1,042 個胺基酸，含有 Rap-GAP 結構域（第 321–539 位）與 PDZ 結構域（第 687–763 位）。資料另將第 1–87、132–153、830–903 及 946–980 位標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SIPA1 主要位於核周膜性區域，並被描述為周邊膜蛋白；資料也列出細胞核、核周細胞質與膜內系統等位置。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CDKN1AP38936 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD4Q14CM0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SIPA1L2Q9P2F8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TAMALINQ7Z6J2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP2Q9UDY2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SIPA1 與 RRP1B 互作；此互作會抑制 SIPA1 的 GTPase 活性。來源未提供兩者所屬複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SIPA1 在體外可活化核內 Ras 相關調控蛋白 Rap1 與 Rap2 的 GTPase，促使兩者轉為推定不活化的 GDP 結合狀態。資料另指出 SIPA1 會影響細胞週期進程，此項關聯依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源GTPase activator for the nuclear Ras-related regulatory proteins Rap1 and Rap2 in vitro, converting them to the putatively inactive GDP-bound state. Affects cell cycle progression (By similarity) PMID 9346962 ↗ |
| 交互作用 | SIPA1 與 RRP1B 互作；此互作會抑制 SIPA1 的 GTPase 活性。來源未進一步描述互作發生的實驗條件或其對其他分子的影響。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SIPA1 被列於細胞核、核周細胞質及膜內系統，並被描述為周邊膜蛋白；其主要定位在核周膜性區域。來源未說明定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, perinuclear region; Endomembrane system / Peripheral membrane protein; Mostly localized in the perinuclear membraneous region PMID 9346962 ↗ |
| 調控 | 在 promyelocytic HL-60 細胞中，12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate（TPA）會抑制 SIPA1。此調控描述限於該細胞系，來源未提供其他細胞或條件下的結果。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGAGCCGGCGCCGGGAGCGGTAGCGGGAGAGCGGCAGCGG40GACCCCAGCGCGGGCGGCGGCGGCTGGGCGGGAGCCCCAG80AGGGCAGGAACTGCTGCCACAACCTCAGGCTGGGCACCAA120ACACCCGTGCCCGCCAATGCGGCCCAGCCCCCGGAGAGTC160AGGCCCACAGAGCATGCCCATGTGGGCCGGCGGTGTGGGG200AGCCCTCGGCGGGGCATGGCCCCTGCGTCCACAGATGACC240TCTTTGCCCGCAAGCTGCGCCAGCCAGCAAGGCCCCCGCT280GACACCGCACACCTTCGAGCCGAGGCCAGTCCGGGGCCCA320CTCCTGCGCAGCGGCAGCGATGCAGGCGAGGCCAGGCCCC360CCACGCCAGCCAGCCCCCGTGCCCGTGCCCACAGCCACGA400AGAGGCCAGCCGACCTGCAGCCACTTCCACCCGGCTCTTC440ACTGACCCGCTGGCACTGCTGGGGCTGCCAGCAGAGGAAC480CAGAGCCTGCCTTCCCACCAGTGCTTGAGCCTCGATGGTT520TGCCCACTATGACGTGCAAAGCCTGCTCTTTGATTGGGCT560CCGAGGTCTCAGGGGATGGGGAGCCACTCAGAGGCCAGCT600CTGGGACCCTGGCTTCAGCCGAGGACCAGGCTGCCAGCTC640GGACCTGCTGCATGGGGCACCTGGCTTTGTGTGTGAGCTC680GGGGGTGAGGGTGAGCTAGGCCTGGGTGGACCAGCATCCC720CACCTGTGCCCCCTGCACTGCCCAACGCGGCCGTGTCCAT760CCTGGAGGAGCCACAGAACCGAACCTCGGCCTACAGCCTG800GAGCACGCAGACCTGGGTGCTGGCTACTACCGCAAATACT840TCTATGGCAAAGAACATCAGAACTTCTTCGGGATGGACGA880GTCGCTGGGCCCGGTGGCAGTGAGCCTGCGGCGGGAGGAG920AAGGAGGGCAGCGGAGGGGGCACCCTGCACAGCTACCGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。