演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SIGLEC9CD329

sialic acid binding Ig like lectin 9

SIGLEC9 編碼 sialic acid binding Ig like lectin 9,屬免疫球蛋白超家族中的 SIGLEC 家族,是一種可能參與細胞黏附、辨識唾液酸的膜蛋白。

Homo sapiens19q13.41UniProt Q9Y336
OFFICIAL SYMBOL
SIGLEC9
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y336
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SIGLEC9 是蛋白質編碼基因,其產物為 sialic acid binding Ig like lectin 9,屬於免疫球蛋白超家族中的 SIGLEC(sialic acid binding Ig-like lectin)家族。蛋白質具有單次穿膜的第一型膜蛋白架構:胞外部分包含一個 Ig-like V-type 結構域及兩個 Ig-like C2-type 結構域,並以穿膜區連接胞質端。其結構與家族分類提供了辨識細胞表面唾液酸的基礎;詳細的結合特性見功能說明。

Official symbol
SIGLEC9
Gene name
sialic acid binding Ig like lectin 9
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10878
UniProt
Q9Y336
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD329

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SIGLEC9pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:51,124,871–51,141,053
Gene span
16,183 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000250360 ★51,124,906–51,130,3107
ENST0000044080451,124,906–51,136,6517
ENST0000086086351,124,906–51,130,7367
ENST0000086086451,124,906–51,130,3096
ENST0000096661451,124,906–51,131,6278
ENST0000109342451,124,906–51,130,3085
ENST0000109342551,124,906–51,130,2567
ENST0000110941451,124,906–51,127,7414
ENST0000111500851,124,906–51,141,0538
ENST0000085084951,124,975–51,136,8698
ENST0000085085051,124,975–51,140,4708
ENST0000059994851,127,030–51,128,9584

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SIGLEC9 的產物被描述為可能具有黏附功能的分子,可介導依賴唾液酸的細胞間結合。此功能描述帶有推定性質,因此應理解為可能的作用,而非已確立的黏附結果。

在唾液酸辨識方面,該蛋白質優先結合以 α-2,3 或 α-2,6 鍵結的唾液酸。這表示其結合偏好涵蓋兩種鍵結型態;來源未進一步說明不同型態的相對親和力或其對細胞結合的具體影響。

唾液酸辨識位點可能受到同一細胞表面唾液酸的 cis 交互作用遮蔽。這種遮蔽描述了辨識位點可受細胞自身表面分子影響的情況;來源未提供解除遮蔽的條件,也未指出此現象在特定細胞或生物過程中的效果。因此,SIGLEC9 的功能可概括為可能介導唾液酸依賴性細胞結合,而其辨識能力則可能受自身細胞表面唾液酸的 cis 作用調節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51124906 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SIGLEC9 ENST00000250360 GRCh38 chr19:51123906-51125006 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTCTTCTCCCATGAAATCCTGCCCATCGCGGAGGGTGCATGCCCCGGGGCTGGTGTCCTCACTCCACAT
CTCCTGTTCACCGGGACCCCTGGGAGCAGAGCTTGCAGAAGCAAAGCCCCAGGGCCAGCTGATCCCTCAT
GTTCTGGAGTAACCAGGGAAGTGTGGCTGAGCGAGACATCGGTGGTGAAGAAACCCTTCGTGGTGCAGTG
AGGAAAGGAGAAATATCTTCCCTTTTGAAATCTGCCCCTTTTCTTCCGAATTTCCTCCCTTCCAAGCCCC
ACAGTACAACAGTCACAGCCTCAGTTTCCCAGACCTCCTGCGAGCCAGGCTCCCCTCTGTGTCCTTGGCG
TGTATCAACACATAGAATCCTCACCTCCACAGCCCCATGTCCCTCTGCTCAGTCCTCCTGAGATTGAACC
CCTGACCTACGGGAGAGTGACCCCATCCTGCCTGTGCCCCCCAACTGAAGCTCCTGCCGTGGACAGCTCA
GACGTCAGGAGCCTCCATGTCTCCCCTCCGCACAGTGACCCCTTGGGGACAGTGTCCAGCTCTGCTGTGT
TGACCTCGTTGTGCAGAAAGGGGGTGCCCACCTCGTGCTTGCTTGGGGGGGATGAGAGGCTGCCTGCTCA
CCCCACCTGCACCCCCATCTCTCATGGCCCCAAGTCCCACCTCTGAGCTACGCAGATATCCACAGCCTCT
GACTCAGGGGTCTGGCCAGATGGGACTCATTTTCACCCTGCAGAAAATGTCACCTAAGGGGAAGGGCATT
GAGAGGGAGGCAGGAGGTGGGGTGGGCCCTGCATGGGGTGGGAATCTGGGTGAGTCTGTCTCCCGCTCTG
GCCTCAGGGACCCAGGAGTGAACATGGGGTGGTGGACGGTGGATCTCCCAGGGCTGACCCGGGCCTGACA
GTGTCTGGGTGTAAAGTTCCTCCTCTGAGGAGGTCACTGTTCCGACCTCGCCCCTGTCTTCCTGTAGGGC
CTCCTCTAAGTCTTGAGCCCGCAGTTCCTGAGAGAAGAACCCTGAGGAACAGACGTTCCCTCGCGGCCCT
GGCACCTCTAACCCCAGACATGCTGCTGCTGCTGCTGCCCCTGCTCTGGGG
SIGLEC9 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SIGLEC9_1 ↗19:51,124,893正股51,124,844–51,124,903

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83HKR6 · promoter · 51124816–51124985 · regulatory

ENSR19_9Q9X9 · enhancer · 51128843–51129143 · regulatory

· motif · 51123664–51123677 · motif

· motif · 51125034–51125045 · motif

· motif · 51125038–51125052 · motif

· motif · 51125038–51125052 · motif

· motif · 51127843–51127856 · motif

· motif · 51128035–51128044 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:463 aa

1 aa463 aa結構域功能區域基序訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9Y336 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

sialic acid binding Ig like lectin 9 長 463 個胺基酸。其 N 端含訊號胜肽,胞外區具有一個 Ig-like V-type 與兩個 Ig-like C2-type 結構域;其後為螺旋型穿膜區,C 端則位於胞質側。胞質區另註有 ITIM motif 與 SLAM-like motif,部分區段被標示為無序區。

訊號胜肽1–17 aa
拓樸區域Extracellular18–348 aa
跨膜區Helical349–369 aa
拓樸區域Cytoplasmic370–463 aa
結構域Ig-like V-type20–140 aa
結構域Ig-like C2-type 1146–229 aa
結構域Ig-like C2-type 2236–336 aa
功能區域Disordered380–428 aa
功能區域Disordered444–463 aa
基序ITIM motif431–436 aa
基序SLAM-like motif454–459 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y336…

AlphaFold · Q9Y336

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

SIGLEC9 是單次穿膜的第一型膜蛋白,蛋白質特徵資料將其胞外區標示為胺基酸 18–348,穿膜區為 349–369,胞質區為 370–463。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD329SIGLEC9BRICD5CD33MAGNCS1SFTPCSIGLEC15TLR4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SIGLEC9 被描述為可能具有黏附功能的分子,可介導依賴唾液酸的細胞結合,並優先辨識以 α-2,3 或 α-2,6 鍵結的唾液酸。其辨識位點可能受到同一細胞表面唾液酸的 cis 交互作用遮蔽;此處為推定性功能描述,未提供遮蔽條件或具體生物學結果。資料庫紀錄
證據與來源

Putative adhesion molecule that mediates sialic-acid dependent binding to cells. Preferentially binds to alpha-2,3- or alpha-2,6-linked sialic acid. The sialic acid recognition site may be masked by cis interactions with sialic acids on the same cell surface

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SIGLEC9 是膜蛋白,具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓樸。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000250360 · 1,692 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGTTCCTGAGAGAAGAACCCTGAGGAACAGACGTTCCC40
41TCGCGGCCCTGGCACCTCTAACCCCAGACATGCTGCTGCT80
81GCTGCTGCCCCTGCTCTGGGGGAGGGAGAGGGCGGAAGGA120
121CAGACAAGTAAACTGCTGACGATGCAGAGTTCCGTGACGG160
161TGCAGGAAGGCCTGTGTGTCCATGTGCCCTGCTCCTTCTC200
201CTACCCCTCGCATGGCTGGATTTACCCTGGCCCAGTAGTT240
241CATGGCTACTGGTTCCGGGAAGGGGCCAATACAGACCAGG280
281ATGCTCCAGTGGCCACAAACAACCCAGCTCGGGCAGTGTG320
321GGAGGAGACTCGGGACCGATTCCACCTCCTTGGGGACCCA360
361CATACCAAGAATTGCACCCTGAGCATCAGAGATGCCAGAA400
401GAAGTGATGCGGGGAGATACTTCTTTCGTATGGAGAAAGG440
441AAGTATAAAATGGAATTATAAACATCACCGGCTCTCTGTG480
481AATGTGACAGCCTTGACCCACAGGCCCAACATCCTCATCC520
521CAGGCACCCTGGAGTCCGGCTGCCCCCAGAATCTGACCTG560
561CTCTGTGCCCTGGGCCTGTGAGCAGGGGACACCCCCTATG600
601ATCTCCTGGATAGGGACCTCCGTGTCCCCCCTGGACCCCT640
641CCACCACCCGCTCCTCGGTGCTCACCCTCATCCCACAGCC680
681CCAGGACCATGGCACCAGCCTCACCTGTCAGGTGACCTTC720
721CCTGGGGCCAGCGTGACCACGAACAAGACCGTCCATCTCA760
761ACGTGTCCTACCCGCCTCAGAACTTGACCATGACTGTCTT800
801CCAAGGAGACGGCACAGTATCCACAGTCTTGGGAAATGGC840
841TCATCTCTGTCACTCCCAGAGGGCCAGTCTCTGCGCCTGG880
881TCTGTGCAGTTGATGCAGTTGACAGCAATCCCCCTGCCAG920
921GCTGAGCCTGAGCTGGAGAGGCCTGACCCTGTGCCCCTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。