演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SIGLEC7SIGLEC-7

sialic acid binding Ig like lectin 7

SIGLEC7 是免疫球蛋白超家族的唾液酸結合凝集素,屬於單次跨膜蛋白,可能參與細胞黏附及免疫抑制訊號調節。

Homo sapiens19q13.41UniProt Q9Y286
OFFICIAL SYMBOL
SIGLEC7
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y286
PDB / ALPHAFOLD
1NKO
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SIGLEC7 的正式名稱為 sialic acid binding Ig like lectin 7,屬於蛋白質編碼基因。其產物歸入免疫球蛋白超家族中的 SIGLEC 家族,是一種單次跨膜的細胞表面蛋白。蛋白質具有多個細胞外免疫球蛋白樣區域,以及位於細胞內的區段;這些結構特徵與其辨識唾液酸相關配體的性質相符。來源將其描述為可能具有黏附作用,並指出它在免疫反應中可能具有抑制性受體角色。

Official symbol
SIGLEC7
Gene name
sialic acid binding Ig like lectin 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10876
UniProt
Q9Y286
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SIGLEC-7p75/AIRM1QA79CD328SIGLEC19PSIGLECP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SIGLEC7pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:51,142,288–51,153,702
Gene span
11,415 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000317643 ★51,142,301–51,153,5267
ENST0000030562851,142,288–51,153,6586
ENST0000088091251,142,288–51,153,6585
ENST0000088091351,142,288–51,153,6584
ENST0000088091451,142,288–51,153,6585
ENST0000088091551,142,288–51,153,6586
ENST0000096502551,142,288–51,153,6583
ENST0000096502651,142,288–51,153,6586
ENST0000098627651,142,288–51,153,6587
ENST0000113984451,142,288–51,153,6587
ENST0000060168251,142,299–51,144,9203
ENST0000060057751,142,370–51,153,2452

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SIGLEC7 被描述為可能具有黏附功能,能介導依賴唾液酸的細胞結合;它偏好辨識以 α-2,3 或 α-2,6 鍵結的唾液酸,也可結合數種雙唾液酸神經節苷脂,包括 disialogalactosyl globoside、disialyl lactotetraosylceramide 和 disialyl GalNAc lactotetraoslylceramide。這些辨識特性提供其與細胞表面配體接觸的基礎。

其唾液酸辨識位點可能受到順式交互作用遮蔽,也就是同一細胞表面的唾液酸可能影響該位點的可接近性。因此,配體辨識能力可能受細胞表面自身唾液酸環境調節;來源並未將此描述為在所有條件下都會發生的固定狀態。

在免疫反應中,SIGLEC7 可能作為抑制性受體。配體誘導的酪胺酸磷酸化後,它可能透過 SH2 結構域招募細胞質磷酸酶,進而使訊號分子去磷酸化並阻斷訊號傳遞。來源指出,這種受體功能可介導自然殺手細胞細胞毒性的抑制;其描述支持抑制性作用,但未進一步界定所有參與的訊號分子或條件。

SIGLEC7 也可能參與造血調節。體外資料指出,它可抑制 CD34+ 前驅細胞向髓系單核細胞譜系分化,並抑制白血病髓系細胞增殖。這些結果限定於體外研究,不能據此推定其在體內的效應或臨床結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51142301 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SIGLEC7 ENST00000317643 GRCh38 chr19:51141301-51142401 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTCTTCTCTCAGAAAATCGCGCCCATCACTGAGGGTGGACGCCCCGGGGCTGGTGTCTTTGCTCCACGT
CTCCTGTTCACCTGAACCCCTAGGAGCAGTTCCTGCAGGAGCAAAGCCCCAGGGCCAGCAGACCCCTCAC
ACTCTGCACTAACCAGGCCTCATGAGATAGCAGTGGTGAAGGGAAATGTCCTTGTGCTCAGAGAGCTGTG
AGGATGGGAATAGTGTCTGCTCTTTTCATATTGATCCTTTCCCTTATGACTTTCCTGTCTACCAAGCCCC
ACAATACAACAATCACAGCCTCAGCTTCCCCGGCCTCCTGCAGGCTGGGCTCCCCTCCGTGTCCTTGGCG
TGTATCAACAGGCGCAATCCTCACCTTCACAGCCCCATGTCCGTCTGCTCGGTCCTCCTGAGACTGAACC
CCCGACCTAGGGGAGAGTGACCCCACCCTGCCTGTGCCCCCCACTGAAGCTCCTGTCATGGGGAGCTCAA
ACGTCAGGAGACTCAGTGTCTCCCCACCACACAGTGACTCCTTGGGGACAGTGTCCGGCTCTGCTGTGTT
GACCTCATTGTGCAGAAAGGGGGTGCCCACCTCGTGGCTGCTGAGGGAGGGATGAGAGGCTGCCTGTTCA
CCCCACCTGCACCCCTGTCTCTCATGGCCCCGAGTCCCACTTCTGAGCTACGCAGACATCCACAGCCTGT
GACTCAGGGGTCTGGGCAGATGGGAGTTATTTTCACCCTGCAGAAAATATCACCTAAAGGGAAAGGCATT
GAGAGGGAGGCAGGAGGTGGGGTGGGCCCTGCATGGGGTGGGAATCTGGGTGAGTCTGTCTCCCGCTCTG
GCCTCAGGGACCCAGGAGTGAATGTCGGGTGGTGGACGGTGGATCTCCCAGGGCTGACCCAGCCCTGACA
GTGTCTGTGTGTGAAGTTCTTCTTCTAAGGAGGTCACTGTTTTGACCTCACCACCGACTTCCTGTAGGGC
CTCTTCTAAGTCTTGAGCCCGCAGTTCCTGAGAGAAGAACCCTGAGGAACAGACGTTCCCTCGCGGCCCT
GGCACCTCCAACCCCAGATATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCCCTGCTCTG
SIGLEC7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SIGLEC7_1 ↗19:51,142,301正股51,142,252–51,142,311

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BD62B · enhancer · 51136876–51137510 · regulatory

· motif · 51139791–51139806 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:467 aa

1 aa467 aa結構域功能區域基序訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9Y286 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SIGLEC7 蛋白質長 467 個胺基酸,具有 18 個胺基酸的訊號胜肽;細胞外區域含一個 Ig-like V-type 與兩個 Ig-like C2-type 結構域,之後由跨膜螺旋連接至細胞質區。細胞質尾端帶有 ITIM motif,另有兩段被註記為無序區域。蛋白質屬於免疫球蛋白超家族的 SIGLEC 家族。

訊號胜肽1–18 aa
拓樸區域Extracellular19–353 aa
跨膜區Helical354–376 aa
拓樸區域Cytoplasmic377–467 aa
結構域Ig-like V-type39–122 aa
結構域Ig-like C2-type 1150–233 aa
結構域Ig-like C2-type 2240–336 aa
功能區域Disordered401–431 aa
功能區域Disordered443–467 aa
基序ITIM motif435–440 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1NKO…

PDB · 1NKO

X-ray · 1.45 A · A=19-150

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

SIGLEC7 是單次跨膜的第一型膜蛋白,具有細胞外區域與細胞質區。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間的差異資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SIGLEC-7SIGLEC7SMIM1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

磷酸化後,SIGLEC7 與 PTPN6(SHP-1)發生交互作用。來源指出的是此磷酸化條件下的交互作用,未進一步說明兩者是否同屬特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SIGLEC7 可能是介導唾液酸依賴性細胞結合的黏附分子,偏好結合 α-2,3 與 α-2,6 鍵結的唾液酸,也能結合數種雙唾液酸神經節苷脂。同一細胞表面的唾液酸可能經順式交互作用遮蔽其辨識位點。免疫反應中,配體誘導的酪胺酸磷酸化可能促使其透過 SH2 結構域招募細胞質磷酸酶,抑制訊號傳遞及自然殺手細胞細胞毒性;它也可能參與造血,並在體外抑制 CD34+ 前驅細胞分化及白血病髓系細胞增殖。含實驗來源
證據與來源

Putative adhesion molecule that mediates sialic-acid dependent binding to cells. Preferentially binds to alpha-2,3- and alpha-2,6-linked sialic acid. Also binds disialogangliosides (disialogalactosyl globoside, disialyl lactotetraosylceramide and disialyl GalNAc lactotetraoslylceramide). The sialic acid recognition site may be masked by cis interactions with sialic acids on the same cell surface. In the immune response, may act as an inhibitory receptor upon ligand induced tyrosine phosphorylation by recruiting cytoplasmic phosphatase(s) via their SH2 domain(s) that block signal transduction through dephosphorylation of signaling molecules. Mediates inhibition of natural killer cells cytotoxicity. May play a role in hemopoiesis. Inhibits differentiation of CD34+ cell precursors towards myelomonocytic cell lineage and proliferation of leukemic myeloid cells (in vitro)

PMID 10611343 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SIGLEC7 在磷酸化後與 PTPN6(SHP-1)發生交互作用;此敘述限定於磷酸化狀態,未提供其他交互作用條件或複合體資訊。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PTPN6/SHP-1 upon phosphorylation

PMID 10499918 ↗ · PMID 16623661 ↗ · PMID 16895906 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SIGLEC7 定位於膜上,為單次跨膜的第一型膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000317643 · 1,754 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGTTCCTGAGAGAAGAACCCTGAGGAACAGACGTTCCC40
41TCGCGGCCCTGGCACCTCCAACCCCAGATATGCTGCTGCT80
81GCTGCTGCTGCCCCTGCTCTGGGGGAGGGAGAGGGTGGAA120
121GGACAGAAGAGTAACCGGAAGGATTACTCGCTGACGATGC160
161AGAGTTCCGTGACCGTGCAAGAGGGCATGTGTGTCCATGT200
201GCGCTGCTCCTTCTCCTACCCAGTGGACAGCCAGACTGAC240
241TCTGACCCAGTTCATGGCTACTGGTTCCGGGCAGGGAATG280
281ATATAAGCTGGAAGGCTCCAGTGGCCACAAACAACCCAGC320
321TTGGGCAGTGCAGGAGGAAACTCGGGACCGATTCCACCTC360
361CTTGGGGACCCACAGACCAAAAATTGCACCCTGAGCATCA400
401GAGATGCCAGAATGAGTGATGCGGGGAGATACTTCTTTCG440
441TATGGAGAAAGGAAATATAAAATGGAATTATAAATATGAC480
481CAGCTCTCTGTGAACGTGACAGCCTTGACCCACAGGCCCA520
521ACATCCTTATCCCCGGTACCCTGGAGTCTGGCTGCTTCCA560
561GAATCTGACCTGCTCTGTGCCCTGGGCCTGTGAGCAGGGG600
601ACGCCCCCTATGATCTCCTGGATGGGGACCTCTGTGTCCC640
641CCCTGCACCCCTCCACCACCCGCTCCTCAGTGCTCACCCT680
681CATCCCACAGCCCCAGCACCACGGCACCAGCCTCACCTGT720
721CAGGTGACCTTGCCTGGGGCCGGCGTGACCACGAACAGGA760
761CCATCCAACTCAATGTGTCCTACCCTCCTCAGAACTTGAC800
801TGTGACTGTCTTCCAAGGAGAAGGCACAGCATCCACAGCT840
841CTGGGGAACAGCTCATCTCTTTCAGTCCTAGAGGGCCAGT880
881CTCTGCGCTTGGTCTGTGCTGTTGACAGCAATCCCCCTGC920
921CAGGCTGAGCTGGACCTGGAGGAGTCTGACCCTGTACCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。