基因總覽
SIGLEC6（sialic acid binding Ig like lectin 6）是蛋白質編碼基因，產物屬於免疫球蛋白超家族中的 SIGLEC 家族。來源將其描述為可能的黏附分子，能辨識細胞表面的 α-2,6 連結唾液酸；其辨識位點可能受同一細胞表面的唾液酸遮蔽。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000425629 ★ | 51,517,819–51,531,670 | 8 |
| ENST00000346477 | 51,516,902–51,531,856 | 7 |
| ENST00000359982 | 51,516,902–51,531,856 | 7 |
| ENST00000436458 | 51,516,902–51,531,856 | 7 |
| ENST00000343300 | 51,516,902–51,531,856 | 6 |
| ENST00000391797 | 51,516,902–51,531,856 | 6 |
| ENST00001090697 | 51,516,902–51,531,856 | 5 |
| ENST00001090698 | 51,516,902–51,531,856 | 4 |
| ENST00001090699 | 51,516,902–51,531,856 | 8 |
| ENST00001090701 | 51,516,902–51,531,856 | 5 |
| ENST00001090702 | 51,516,902–51,531,856 | 8 |
| ENST00001090703 | 51,516,902–51,531,856 | 4 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SIGLEC6 的產物被描述為可能的黏附分子，能介導依賴唾液酸的細胞結合。其辨識對象為 α-2,6 連結的唾液酸，顯示此分子具有特定的唾液酸辨識能力。
這項辨識可能受到順式作用影響：同一細胞表面的唾液酸可與 SIGLEC6 的辨識位點發生作用，使該位點受到遮蔽。因此，來源所述的細胞結合能力可能受細胞自身表面唾液酸影響；資料未進一步說明此遮蔽在何種條件下發生，或其對細胞黏附的具體影響。
Promoter 與基因調控
>SIGLEC6 ENST00000425629 GRCh38 chr19:51531570-51532670 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCTGCTCACGTTGTCCAGAAATATGTCTTTTGTGCCACATTTAACTGTGAGAAGCAGATTTTTCACAGG AAAGAAATTGCTAATCTCTATGATGAGGACCTAAAAAAAAATCTCTCCAGTCCACACTGCACTGAGTGGC AACATTAATTCAAAAGAAGTTTCTTCTGCACTGCAGTTCATAAAATATGTGTCCTTTTTGATTTACATGA AGATGTTGCATGGTTCTTATTTTGGAGATGTCATTGAAATTTTGTAAATCAGCGTACTAGCTGTCAAGGA AAAACCTCCATACTCATGTTTTAAAAAATATCTGGCATTCTACTGTGTCACTTGGCAAACTCACCAGTGT CCACAGCTCTAAAGCTAGATAGTGAGGGTGTGTGCTGAGGATGGGAAGCTATGGATGGGGATCATCTCAA GGGTAGGGACCAGGTCCCTGGCATCTCTTCTCCAGCCCGACCTACATACAGATGCTCACTATGTCTTTGG TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAGTGAATGAATGAGTGGCTATCACCCACACTGCACCTGGGACCC TTCTTCCTTTCACTGTCCCAGACACTCCCACAGACCCTACAGAATCCTATATCCTGCAGGACTGACTTTC TCATGGCGTGGGATGAGGCTGTGACTCTCTGGGGCCAGGAGTGACCAGCTCCCAGGTGTAAACAGTGGTG CACAGAAAAGCACCTCAGGTGGGCAGGGCCTTGGACACAGGTTTCGCATTCCTCAGATGCCCCGGGAGGC CCTGGTCCGGGCTCTGTTGCTCACAGGAAGCCCCGAGGTGGGAGGCGGGACACAGTCTCTTCTCCTCTGC TCTTCTTTGGGCAGGTCTCTGGGTCTCAAAGTTTCCGTCTGCTCTGTGCAGAGGGAGTGGAGCTCCGAGG GCTTGTGGCTTCGCAGTTCCTCTTCTGTGAACAGCCGAGATCACGCGCTCCTCCCCAGCCACCCGTTCCT CCCCGCAGTCCTTCCCCTCCACTCCCTTCCCCTTCTCTGCTCATGCAGGGAGCCCAGGAAGCCTCCGCCT CAGAGATGCTACCGCTGCTGCTGCCCCTGCTGTGGGCAGGTGAGTGGGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SIGLEC6_1 ↗ | 19:51,531,670 | 負股 | 51,531,660–51,531,719 |
| SIGLEC6_2 ↗ | 19:51,531,803 | 負股 | 51,531,793–51,531,852 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：453 aa
來源註解的蛋白質長度為 453 個胺基酸。其 N 端包含訊號序列（第 1–26 位），胞外區域位於第 27–347 位，包含一個 Ig-like V-type domain 與兩個 Ig-like C2-type domain；第 348–368 位為螺旋型跨膜區，後接第 369–453 位的細胞質區。細胞質區另註有 ITIM 與 SLAM-like motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1 位於細胞膜，屬單次跨膜的 I 型膜蛋白；Isoform 2 則為分泌型。 來源未提供兩種異構型定位差異的形成條件或動態變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MALLQ13021 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR4O00206 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZNF655Q8N720 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
來源記載 SIGLEC6 與 LEP 有交互作用，但未在此資料中說明交互作用的性質、發生條件或其功能後果，因此不進一步推定為直接結合或特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SIGLEC6 產物被認為可能是黏附分子，可介導依賴唾液酸的細胞結合，並辨識 α-2,6 連結的唾液酸。其唾液酸辨識位點可能受到同一細胞表面唾液酸的順式作用遮蔽。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Putative adhesion molecule that mediates sialic-acid dependent binding to cells. Binds to alpha-2,6-linked sialic acid. The sialic acid recognition site may be masked by cis interactions with sialic acids on the same cell surface |
| 交互作用 | SIGLEC6 與 LEP 有交互作用；此敘述未進一步界定交互作用的性質。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 1 位於細胞膜，並屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 2; Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTCCCTTCCCCTTCTCTGCTCATGCAGGGAGCCCAGGAA40GCCTCCGCCTCAGAGATGCTACCGCTGCTGCTGCCCCTGC80TGTGGGCAGGGGCCCTGGCTCAGGAGCGGAGATTCCAGCT120GGAGGGGCCAGAGTCACTGACGGTGCAGGAGGGTCTGTGC160GTCCTCGTACCCTGCAGATTGCCCACTACCCTTCCAGCCT200CGTACTATGGTTATGGCTACTGGTTCCTGGAAGGGGCTGA240TGTTCCAGTGGCCACAAACGACCCAGACGAAGAAGTGCAG280GAGGAGACCCGGGGCCGATTCCACCTCCTCTGGGATCCCA320GAAGGAAGAACTGCTCCCTGAGCATCAGAGATGCCCGGAG360GAGGGACAATGCTGCATACTTCTTTCGGTTGAAGTCCAAA400TGGATGAAATACGGTTATACATCTTCCAAGCTCTCTGTGC440GTGTGATGGCCCTGACCCACAGGCCCAACATCTCCATCCC480AGGGACCCTGGAGTCTGGCCATCCCAGCAATCTGACCTGC520TCTGTGCCCTGGGTCTGTGAGCAGGGGACGCCCCCCATCT560TCTCCTGGATGTCAGCTGCCCCCACCTCCCTGGGCCCCAG600GACCACCCAGTCCTCGGTGCTCACAATCACCCCACGGCCC640CAGGACCACAGCACCAACCTCACCTGTCAGGTGACGTTCC680CTGGAGCCGGTGTGACCATGGAGAGAACCATCCAGCTCAA720TGTCTCCTATGCTCCACAGAAAGTGGCCATCAGCATCTTC760CAAGGAAACAGCGCAGCCTTCAAAATCCTGCAAAACACCT800CGTCCCTCCCTGTCCTGGAGGGCCAGGCTCTGCGGCTGCT840CTGTGATGCTGACGGCAACCCCCCTGCACACCTGAGCTGG880TTCCAGGGCTTCCCCGCCCTGAACGCCACCCCCATCTCCA920ATACCGGGGTCCTGGAGCTGCCTCAAGTAGGGTCTGCAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。