基因總覽
SIGLEC5 是蛋白質編碼基因,其產物 sialic acid binding Ig like lectin 5 屬於免疫球蛋白超家族中的 SIGLEC 家族。蛋白質長 551 個胺基酸,具有免疫球蛋白樣結構域,並以單次跨膜方式嵌入細胞膜。其結構包含細胞外區、跨膜區與細胞質區;這些區域共同構成一種位於細胞表面的受體樣分子。來源將其主要角色描述為可能參與細胞黏附,並指出它可辨識細胞表面的唾液酸。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|
顯示 0/0 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SIGLEC5 的產物被描述為可能參與細胞黏附的分子,能介導依賴唾液酸的細胞結合;此功能屬於推定性描述。其唾液酸辨識不只限於一種連結形式:對 α-2,3 連結與 α-2,6 連結的唾液酸,來源指出其結合能力相同。
唾液酸辨識位點是否可用,可能受到同一細胞表面分子間作用的調節。當辨識位點與同一細胞表面的唾液酸發生順式作用時,該位點可能被遮蔽。這表示 SIGLEC5 對細胞的結合能力,可能取決於其辨識位點是否受到同一細胞表面唾液酸的遮擋;來源未進一步說明此遮蔽對細胞黏附的具體影響,也未提供其發生條件或調控方式。
因此,現有資料支持的功能重點,是 SIGLEC5 可能透過辨識不同連結型態的唾液酸介導細胞結合,而自身細胞表面的唾液酸可能以順式作用限制辨識位點。來源未提供更廣泛的生物學過程或功能結果,故不宜據此延伸推論其在特定細胞或生理情境中的作用。
Promoter 與基因調控
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 51646878–51646891 · motif
· motif · 51646898–51646911 · motif
· motif · 51647039–51647051 · motif
· motif · 51647041–51647056 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:551 aa
sialic acid binding Ig like lectin 5 長 551 個胺基酸,包含一個細胞外 Ig-like V-type 結構域與兩個 Ig-like C2-type 結構域,後接螺旋型跨膜區及細胞質區。細胞質端註有 ITIM motif 與 SLAM-like motif;另有一段細胞外區及細胞質端被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SIGLEC5 是單次跨膜的第一型膜蛋白。 其細胞外區與細胞質區分處膜的兩側;可用資料未描述定位隨條件改變或異構型之間的差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CD33P20138 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IFNGR1P15260 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NAPBQ9H115 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC7A8Q9UHI5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLR4O00206 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TRIP13Q15645 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VAC14Q08AM6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SIGLEC5 被描述為可能參與細胞黏附的分子,可介導依賴唾液酸的細胞結合;對 α-2,3 連結與 α-2,6 連結的唾液酸具有相同結合能力。唾液酸辨識位點可能因與同一細胞表面的唾液酸發生順式作用而被遮蔽。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Putative adhesion molecule that mediates sialic-acid dependent binding to cells. Binds equally to alpha-2,3-linked and alpha-2,6-linked sialic acid. The sialic acid recognition site may be masked by cis interactions with sialic acids on the same cell surface |
| 細胞定位 | SIGLEC5 是膜蛋白,具有單次跨膜的第一型膜蛋白拓樸。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATCTTTCTATCCCAGATGCTCCACAGAACCTCGCCATCAG40CATCTTCTTCAGAAATGGCACAGGCACAGCCCCCTGAGGA80TCTCACTCATGACTGAAACATCATTTGAGGGGTGATCACC120TCCAGATCCTCAGCTGGACAAGCCTCACATCGTCTGGGGG160CCTCAGTATCTTCACCTGCGGCGTCCAGTCGGGGTGGGAG200CAGAATGGCTTCCCAGCCCCCGCCTCACCCCAACAGCACG240TGATGCCCAAGTTCCCCTTCTGTGCGCGTCCACAGCTCTC280ACTCACCCTCCGGCTTCCTGTCGGGGCTTTCTCAGCCCCA320CCCCACGTTTGGACATTTGGAGCATTTCCTTCCCTGACAG360CCGGACCTGGGACTGGGCTGGGGCCCTGGCGGATGGAGAC400ATGCTGCCCCTGCTGCTGCTGCCCCTGCTGTGGGGGGGGT440CCCTGCAGGAGAAGCCAGTGTACGAGCTGCAAGTGCAGAA480GTCGGTGACGGTGCAGGAGGGCCTGTGCGTCCTTGTGCCC520TGCTCCTTCTCTTACCCCTGGAGATCCTGGTAT553cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。