基因總覽
SHC1 是蛋白質編碼基因，產物為 SHC adaptor protein 1，也稱 SHC-transforming protein 1。它屬於訊號接頭蛋白，主要角色是協助已活化的生長因子受體連結至細胞內訊號路徑。來源描述 p46Shc、p52Shc 與 p66Shc 等異構型，並指出它們的功能並不完全相同：前兩者與 Ras 訊號傳遞相關，p66Shc 則參與氧化壓力反應。蛋白質註解包含 PID、CH1 與 SH2 區域，另有被註記為無序的區段；這些結構資訊勾勒出其作為接頭蛋白的基本特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000448116 ★ | 154,962,298–154,970,747 | 12 |
| ENST00000875560 | 154,962,284–154,971,129 | 12 |
| ENST00000916210 | 154,962,286–154,971,129 | 12 |
| ENST00000875563 | 154,962,288–154,971,129 | 13 |
| ENST00001066080 | 154,962,297–154,971,129 | 11 |
| ENST00000368445 | 154,962,298–154,971,129 | 12 |
| ENST00000368449 | 154,962,298–154,970,747 | 10 |
| ENST00000368450 | 154,962,298–154,974,452 | 13 |
| ENST00000368453 | 154,962,298–154,974,452 | 13 |
| ENST00000875561 | 154,962,298–154,971,129 | 11 |
| ENST00000875562 | 154,962,298–154,971,129 | 12 |
| ENST00000875565 | 154,962,298–154,971,129 | 11 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SHC adaptor protein 1 可將已活化的生長因子受體訊號接續至細胞內路徑。它參與由活化 KIT 與 KITLG/SCF 啟動的訊號級聯。在不同非神經系統中，p46Shc 與 p52Shc 經磷酸化後，可連結活化的受體酪胺酸激酶與 Ras；其方式涉及招募 GRB2/SOS 複合體，並促進有絲分裂訊號在細胞質中的傳遞，因此可能作為 Ras 訊號級聯的啟動者。
p66Shc 的作用有所不同：來源指出它不負責介導 Ras 活化，而是參與調節細胞對氧化壓力的反應及壽命的訊號路徑。p66Shc 是腫瘤抑制因子 p53 的下游目標，且對壓力活化的 p53 引發細胞內氧化物增加、cytochrome c 釋出及細胞凋亡不可或缺。p66Shc 的表現量與壽命相關，此關聯標示為 By similarity，並非在此處作為已確立的因果關係。
SHC1 也參與血管生成素受體 TEK/TIE2 下游訊號，並在調節內皮細胞遷移與出芽型血管生成中具有作用。此外，它參與 oncostatin-M 介導的訊號：在由 OSMR 與 IL6ST 異源二聚體構成的第二型 OSM 受體複合體中，JAK1 依賴的招募使 SHC1 連結至 OSMR 次單元；SHC1 再與 GRB2 結合，促進 Ras/Raf/MAPK 路徑活化。
Promoter 與基因調控
>SHC1 ENST00000448116 GRCh38 chr1:154970647-154971747 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTCCTGGCCTGTAGTTTCTACTTCTCTTGGAGAACTGTTTCTTCCACCTCCTCCAGCCAGGCTCCTTCC CTGGTGTGAAGGATGCTGTGCTCTTTGGTGGGGCTTAGGGCCCTGTAAGAGGAGGGATGTGAATTGGGGT GGTTTGGAGTGGGAGTGGGGACCTGATTGCCTCATTCTCACCCTTGACAGTGTGCTGTGTTAACAAGCCC TGTGGAAAGGGGAGACAGGACAGTGCTTGGCTATGAGCCATCGGTCTTGGTGTGGTAGATGGCATACGTA GAGAACAAGCCGTGACCAGCATGTCCTCTTGTTCCCTTCTTGCCTGGTAGCTTCCTGATGTATCATCCAG GTTGAACTTTATTCCCCTTTTTTCACCAGCTTTGCTCTTCCTCTTGGCCCTGCTCTGCATCCATTGGGAC CACTTACTTCCCATCCCCACTTCGCTAGCTCCAGTCCACAGCTGCTGTAGCAGAGGATGCTAATGGCCCA GGCTTACTGTATGGGGTAGCGGTTGGGGGTGGCCTGGGCTGGGGCCAGCCAGCTTTCGGGCATAGAGAGG GTGGGGGAATTCGAGTGTCCAACCAGGACAGGAAGGGAAATGCTGAGCTCTGAGATCTCCTCCCTTTTCC ACCCCCAGCTGCCTCTGTTTCCTCCCTCATTCCCCTGTACTCCTGCCTGGCTTCCTGCCCCCTTTGGCCT GCGTGTGTCCGGTTTTGAGTGACCCAGACCTCCTATCTCCTTCCTTTCCGTCCCACTCTTCCATCCTTCC CTCCCACCCCCACTTTACTTCTCCCCAGATTACTAGTTGTTTGTATAGGGCAGGGGAGAGGGGCTTGGAT AGCCCTACCCCCTGCTCCAGTTCGAGGTTGGGGCGGGGTGGGGGCTCAGCCCCTCTGAGCCTGTGAGTCA GCACTGTCCTCACGATTGGTCTCTCCCCTTAGCTCCCCGCCCCTGGGGAGGAGCCAGAAGCGCTGGGTCC AGCCTGTTCTCTTCTCAGCCAGAGAAGAGGCTCCACGTTGGGCGGGGATGGGGCCTGAAACTGTCTGGGT CTGAGCTGGGGAGCGGAAGCCACTTGTCCCTCTCCCTCCCCAGGACTTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SHC1_2 ↗ | 1:154,970,747 | 負股 | 154,970,737–154,970,796 |
| SHC1_1 ↗ | 1:154,974,376 | 負股 | 154,974,366–154,974,425 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_949HR5 · promoter · 154970731–154971237 · regulatory
ENSR1_D9NL8 · enhancer · 154972307–154974365 · regulatory
ENSR1_949HS6 · promoter · 154974366–154974693 · regulatory
ENSR1_CKD7L · enhancer · 154974694–154976534 · regulatory
· motif · 154970794–154970804 · motif
· motif · 154970869–154970879 · motif
· motif · 154970896–154970906 · motif
· motif · 154970909–154970919 · motif
· motif · 154970965–154970975 · motif
· motif · 154970967–154970977 · motif
· motif · 154971141–154971152 · motif
· motif · 154971181–154971191 · motif
· motif · 154972519–154972529 · motif
· motif · 154972731–154972746 · motif
· motif · 154972785–154972795 · motif
· motif · 154972871–154972881 · motif
· motif · 154973003–154973015 · motif
· motif · 154973003–154973019 · motif
· motif · 154973003–154973019 · motif
· motif · 154973006–154973016 · motif
· motif · 154973258–154973280 · motif
· motif · 154973258–154973280 · motif
· motif · 154973592–154973607 · motif
· motif · 154973594–154973607 · motif
· motif · 154973718–154973731 · motif
· motif · 154973757–154973767 · motif
· motif · 154973779–154973793 · motif
· motif · 154973837–154973847 · motif
· motif · 154973853–154973863 · motif
· motif · 154974023–154974033 · motif
· motif · 154974126–154974135 · motif
· motif · 154974126–154974137 · motif
· motif · 154974148–154974158 · motif
· motif · 154974169–154974180 · motif
· motif · 154974169–154974180 · motif
· motif · 154974171–154974180 · motif
· motif · 154974290–154974305 · motif
· motif · 154974376–154974385 · motif
· motif · 154974376–154974387 · motif
· motif · 154974376–154974387 · motif
· motif · 154974391–154974404 · motif
· motif · 154974394–154974406 · motif
· motif · 154974398–154974411 · motif
· motif · 154974516–154974538 · motif
· motif · 154974516–154974538 · motif
· motif · 154974870–154974883 · motif
· motif · 154974897–154974908 · motif
· motif · 154974897–154974908 · motif
· motif · 154974910–154974922 · motif
· motif · 154974926–154974938 · motif
· motif · 154974952–154974963 · motif
· motif · 154974952–154974963 · motif
· motif · 154975296–154975309 · motif
· motif · 154975296–154975309 · motif
· motif · 154975404–154975426 · motif
· motif · 154975442–154975451 · motif
· motif · 154975723–154975730 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：583 aa
SHC adaptor protein 1 長 583 個胺基酸。註解標示 PID 結構域位於第 156–339 位、CH1 區域位於第 340–487 位，SH2 結構域位於第 488–579 位。第 1–92 位及第 372–415 位另被註記為無序區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SHC adaptor protein 1 被記錄於細胞質及細胞連接處的 focal adhesion。 定位具有異構型差異：p46Shc 位於粒線體基質，其前 32 個胺基酸可作為粒線體標的序列；p52Shc 與 p66Shc 雖含有相同序列，但因序列位置較內部而呈現不同定位。 氧化條件下，p66Shc 在 Ser-36 的磷酸化會促使其累積於粒線體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
- ALKQ9UM73 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ARP10275 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBLCQ9ULV8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 37 experiments · 2 筆來源紀錄
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- ERBB3P21860 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ERBB4Q15303 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ESR1P03372-4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GAB1Q13480 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 34 experiments · 2 筆來源紀錄
- INSRP06213 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KITP10721 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- METP08581 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PTPN12Q05209 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SMAD4Q13485 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SOS1Q07889 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Jak2Q62120 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NSP03495 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IGF1RP08069 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAPK1P28482 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CAMK2AQ9UQM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYKP43405-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SHC1 可與多種受體及訊號蛋白實體互作，包括 GRB2、KIT、TEK/TIE2、磷酸化的 IGF1R 與 INSR，以及 Trk 受體；與受體的部分互作具有磷酸化依賴性。SHC1 也被發現於含 FGFR4、NCAM1、CDH2 等蛋白的複合體，並與 PPP1CA、PPP1CC 及 PEAK1 共處一個複合體。功能關係方面，SHC1 與 EPHB1、GRB2 的互作可活化 MAPK/ERK 級聯並調節細胞遷移；另有資料指出，CEACAM1 磷酸化依賴的互作會降低 SHC1 連結至 MAPK3/ERK1-MAPK1/ERK2 路徑。微生物感染情境下，SHC1 也與 herpes simplex virus 1 UL46 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SHC1 是連結已活化生長因子受體與下游訊號路徑的接頭，並參與 KIT/KITLG/SCF 訊號。磷酸化的 p46Shc、p52Shc 招募 GRB2/SOS，連結受體酪胺酸激酶與 Ras；p66Shc 不介導 Ras 活化，而參與氧化壓力反應、p53 下游反應及細胞凋亡。SHC1 亦參與 TEK/TIE2、內皮細胞遷移與血管生成，以及 OSMR/IL6ST、JAK1、GRB2 相關的 Ras/Raf/MAPK 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Signaling adapter that couples activated growth factor receptors to signaling pathways. Participates in a signaling cascade initiated by activated KIT and KITLG/SCF. Isoform p46Shc and isoform p52Shc, once phosphorylated, couple activated receptor tyrosine kinases to Ras via the recruitment of the GRB2/SOS complex and are implicated in the cytoplasmic propagation of mitogenic signals. Isoform p46Shc and isoform p52Shc may thus function as initiators of the Ras signaling cascade in various non-neuronal systems. Isoform p66Shc does not mediate Ras activation, but is involved in signal transduction pathways that regulate the cellular response to oxidative stress and life span. Isoform p66Shc acts as a downstream target of the tumor suppressor p53 and is indispensable for the ability of stress-activated p53 to induce elevation of intracellular oxidants, cytochrome c release and apoptosis. The expression of isoform p66Shc has been correlated with life span (By similarity). Participates in signaling downstream of the angiopoietin receptor TEK/TIE2, and plays a role in the regulation of endothelial cell migration and sprouting angiogenesis. Involved in the oncostatin-M-mediated signaling pathway through type II OSM receptor complex (heterodimers composed of OSMR and IL6ST) where it contributes to activation of the Ras/Raf/MAPK pathway through JAK1-dependent recruitment to OSMR subunit of OSMR complex and SHC1 association with GRB2 PMID 11016927 ↗ · PMID 14665640 ↗ |
| 交互作用 | SHC1 與多種受體及訊號蛋白互作，包括 GRB2、KIT、TEK/TIE2、IGF1R、INSR、Trk 受體及 PEAK1；部分互作依賴酪胺酸磷酸化，與 IGF1R、INSR 的 NPXY motif 互作則在體外經 PID 結構域進行。SHC1 亦出現在多蛋白複合體中；與 EPHB1、GRB2 的互作可活化 MAPK/ERK 並調節細胞遷移，而 CEACAM1 相關互作會降低其連結 MAPK3/ERK1-MAPK1/ERK2 路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CPNE3; this interaction may mediate the binding of CPNE3 with ERBB2. Interacts with the NPXY motif of tyrosine-phosphorylated IGF1R and INSR in vitro via the PID domain. Once activated, binds to GRB2. Interacts with tyrosine-phosphorylated CD3T and DDR2. Interacts with the N-terminal region of SH2B2. Interacts with phosphorylated LRP1 and IRS4. Interacts with INPP5D/SHIP1 and INPPL1/SHIP2. Interacts with TRIM31. Interacts with PTPN6/SHP (tyrosine phosphorylated). Identified in a complex containing FGFR4, NCAM1, CDH2, PLCG1, FRS2, SRC, SHC1, GAP43 and CTT (By similarity). Interacts with ALK, GAB2, GRB7 and KIT. Interacts with FLT4 (tyrosine-phosphorylated). Interacts with EPHB1 and GRB2; activates the MAPK/ERK cascade to regulate cell migration. Interacts with PDGFRB (tyrosine-phosphorylated). Interacts with ERBB4. Interacts with TEK/TIE2 (tyrosine-phosphorylated). Interacts with the Trk receptors NTRK1, NTRK2 and NTRK3; in a phosphotyrosine-dependent manner. Interacts with PTK2/FAK1. Interacts with CEACAM1; this interaction is CEACAM1-phosphorylation-dependent and mediates interaction with EGFR or INSR resulting in decrease coupling of SHC1 to the MAPK3/ERK1-MAPK1/ERK2 pathway (By similarity). Interacts (via PID domain) with PEAK1 (when phosphorylated at 'Tyr-1188'). Found in a complex with PPP1CA, PPP1CC, SHC1 and PEAK1 PMID 10194451 ↗ · PMID 10867024 ↗ · PMID 11016927 ↗ · PMID 11349134 ↗ · PMID 11980671 ↗ · PMID 12925710 ↗ · PMID 14665640 ↗ · PMID 15102829 ↗ · PMID 15272003 ↗ · PMID 15316024 ↗ · PMID 15488758 ↗ · PMID 17274988 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 20010870 ↗ · PMID 23846654 ↗ · PMID 35687021 ↗ · PMID 7537849 ↗ · PMID 7541045 ↗ · PMID 7544002 ↗ · PMID 7559478 ↗ · PMID 8155326 ↗ · PMID 8195171 ↗ · PMID 8874179 ↗ · PMID 8940081 ↗ · PMID 9038210 ↗ · PMID 9233773 ↗ · PMID 9488479 ↗ · PMID 9660833 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，SHC1 與 herpes simplex virus 1 的 UL46 蛋白互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SHC1 被記錄於細胞質，以及細胞連接處的 focal adhesion。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | p46Shc 位於粒線體基質，其前 32 個胺基酸可作為粒線體標的序列。p52Shc 與 p66Shc 雖含有相同序列，但該序列位於蛋白質內部，因此呈現不同的亞細胞定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform p46Shc; Mitochondrion matrix; Localized to the mitochondria matrix. Targeting of isoform p46Shc to mitochondria is mediated by its first 32 amino acids, which behave as a bona fide mitochondrial targeting sequence. Isoform p52Shc and isoform p66Shc, that contain the same sequence but more internally located, display a different subcellular localization PMID 14573619 ↗ |
| 細胞定位 | 在氧化條件下，p66Shc 的 Ser-36 磷酸化會導致其累積於粒線體。 | 推論支持 | 證據與來源Isoform p66Shc; Mitochondrion; In case of oxidative conditions, phosphorylation at 'Ser-36' of isoform p66Shc, leads to mitochondrial accumulation |
核酸與蛋白質序列
AGAGAAGAGGCTCCACGTTGGGCGGGGATGGGGCCTGAAA40CTGTCTGGGTCTGAGCTGGGGAGCGGAAGCCACTTGTCCC80TCTCCCTCCCCAGGACTTCTGTGACTCCTGGGCCACAGAG120GTCCAACCAGGCTAAGGGCCTGGGGATACCCCCTGCCTGG160CCCCCTTGCCCAAACTGGCAGGGGGGCCAGGCTGGGCAGC200AGCCCCTCTTTCACCTCAACTATGGATCTCCTGCCCCCCA240AGCCCAAGTACAATCCACTCCGGAATGAGTCTCTGTCATC280GCTGGAGGAAGGGGCTTCTGGGTCCACCCCCCCGGAGGAG320CTGCCTTCCCCATCAGCTTCATCCCTGGGGCCCATCCTGC360CTCCTCTGCCTGGGGACGATAGTCCCACTACCCTGTGCTC400CTTCTTCCCCCGGATGAGCAACCTGAGGCTGGCCAACCCG440GCTGGGGGGCGCCCAGGGTCTAAGGGGGAGCCAGGAAGGG480CAGCTGATGATGGGGAGGGGATCGTAGGGGCAGCCATGCC520AGACTCAGGCCCCCTACCCCTCCTCCAGGACATGAACAAG560CTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGGTGGAAGGGG600GCCAGCTTGGGGGCGAGGAGTGGACCCGCCACGGGAGCTT640TGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGGCTGCATCCCAACGAC680AAAGTCATGGGACCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACA720TGGGTTGTGTGGAGGTCCTCCAGTCAATGCGTGCCCTGGA760CTTCAACACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGT800CTGGTGTGTGAGGCTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAA840GGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCT880GGGGAGGAGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCAATCACT920CTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。