演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SHBGABP

sex hormone binding globulin

SHBG 編碼 sex hormone binding globulin,是一種分泌型蛋白質,可運輸特定類固醇荷爾蒙,並調節其在血漿中的濃度。

Homo sapiens17p13.1UniProt P04278
OFFICIAL SYMBOL
SHBG
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P04278
PDB / ALPHAFOLD
1F5F
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SHBG 是蛋白質編碼基因,產物為 sex hormone binding globulin。此蛋白質具有分泌訊號序列,並含有兩個 Laminin G-like 結構域。其基本角色與類固醇荷爾蒙的運輸及血漿濃度調節相關;來源亦指出它可能參與受體介導的過程,但未進一步說明其方式。

Official symbol
SHBG
Gene name
sex hormone binding globulin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10839
UniProt
P04278
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ABPTEBGMGC126834MGC138391

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSHBGpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:7,613,946–7,633,469
Gene span
19,524 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000380450 ★7,630,135–7,633,3728
ENST000005705477,614,064–7,633,4696
ENST000005721827,614,064–7,633,4694
ENST000005722627,614,064–7,633,4697
ENST000005745397,614,064–7,633,4697
ENST000005753147,614,064–7,633,4698
ENST000005764787,614,064–7,633,4695
ENST000005767287,614,064–7,633,4696
ENST000008568627,627,546–7,633,4699
ENST000008568637,627,546–7,633,4699
ENST000008568647,627,546–7,633,4699
ENST000005757297,627,969–7,631,2604

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

sex hormone binding globulin 可作為 androgen 的運輸蛋白,也可能參與受體介導的過程。來源未說明此類受體相關作用的具體機制,因此其功能描述仍限於可能參與,不能視為已確定的作用途徑。

此蛋白質對 5-alpha-dihydrotestosterone、testosterone 與 17-beta-estradiol 具有特異性。每個二聚體可結合一個類固醇分子,顯示其結合量與二聚體形式相關;來源沒有提供不同類固醇之間的結合差異或結合後的其他分子事件。

SHBG 也透過控制類固醇荷爾蒙在血漿中的濃度,調節這些荷爾蒙在血漿中的代謝清除率。換言之,來源所述的功能不僅是運輸,也包括藉由影響血漿濃度來調控荷爾蒙清除;資料未進一步指出這種調節的方向或幅度。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 7630135 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SHBG ENST00000380450 GRCh38 chr17:7629135-7630235 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCTGAGGTGGGCGGATCATTTCAGGTCAGAGGTTCGAGATCAGCCTGGGCAACGTGGTGAAATCCCCGT
CTCTACTAAAAACACAAAAAAATTTGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCACCTGTAGTCCCAACTACTAAGGA
GGCTGAGACAGGAGGATCGCTTGAACTCGAGAGGCAGAGGCAGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCAC
TCCAGCCTGGGTGATAGAGCAAGACTCTGTCTAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAA
ATGGGTCAGGGAGTGGGTGATTTCTACTGCTAGACTGTTTAGGCCCTGTAATAAATGGATAAGGGAAGAT
AACTGAGAGGCGGGGGGCAGGTCCCTTCTTAATATTCACTGAATCATACACACAGACAATACCTTCTTGG
GAGACAGGCCTCAGAGGCCTGGGAAAAGACTGGGGGAGGAGTTCAGACCAGATGCCAGGCACTGTGCCTG
CATTTTCTCAATGAACCCTCTTTCACAGTCACCCCGTAAAGTATTATTTTCCTCATTTTACAGACAAGGA
CACTGAAGCACAGAGGTGAAGTGACTTGCCCAAGGTCACTCAGCTAGAAATTTAGGATTCCATTATCTCA
TTTCTAGTCCTGATACAGGATGCTACTTGGGACGCAGGGGAGGACTGTTTCTAGACCTCAGGCCTGTGAA
TGCAGGCTCCCCGAGTGGACAGAAATCTTGGAGGACCTAGATCAGGCCCTAGAGGAGGAGAGGGGAGATG
GAATATCCTCTCCCAGTTCAGAAACTTTCTCGGCAGTGGAGGATGATAGTGGAGGGGACTCTGTCCTTCA
CCCCATTGATCCCCAGAGGGGTGATAGCTGAGTCTTGTGACTGGGCCCCTGGGCAGGGGTCAAGGGTCAG
TGCCCCTGTTTCCTTTACCCCCTCCTCCCCGGGCAACCTTTAACCCTCCACCGCCCACACGCAAGGCTGC
CTGCCTCTACACATTCTCCCAAGAGTTGTCTGAGCCGCCGAGTGGACAGTGGCTGATTATGGAGAGCAGA
GGCCCACTGGCTACCTCGCGCCTGCTGCTGTTGCTGCTGTTGCTACTACTG
SHBG 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SHBG_2 ↗17:7,614,032正股7,613,983–7,614,042
SHBG_3 ↗17:7,627,994正股7,627,945–7,628,004
SHBG_1 ↗17:7,630,135正股7,630,086–7,630,145

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_883H9 · promoter · 7627795–7627979 · regulatory

ENSR17_53RFX9 · CTCF_binding_site · 7627876–7627897 · regulatory

ENSR17_952Q7 · enhancer · 7627980–7628262 · regulatory

ENSR17_53RFZS · CTCF_binding_site · 7628213–7628234 · regulatory

ENSR17_53RGQ9 · CTCF_binding_site · 7632628–7632649 · regulatory

ENSR17_952S4 · enhancer · 7634352–7634856 · regulatory

ENSR17_53RH43 · CTCF_binding_site · 7634523–7634544 · regulatory

· motif · 7625845–7625859 · motif

· motif · 7625846–7625859 · motif

· motif · 7625862–7625875 · motif

· motif · 7625911–7625926 · motif

· motif · 7625911–7625926 · motif

· motif · 7627653–7627668 · motif

· motif · 7627705–7627720 · motif

· motif · 7627857–7627867 · motif

· motif · 7627878–7627894 · motif

· motif · 7627944–7627954 · motif

· motif · 7627988–7628001 · motif

· motif · 7628017–7628025 · motif

· motif · 7628022–7628035 · motif

· motif · 7628068–7628081 · motif

· motif · 7628215–7628231 · motif

· motif · 7630028–7630040 · motif

· motif · 7630029–7630044 · motif

· motif · 7630030–7630037 · motif

· motif · 7630030–7630043 · motif

· motif · 7630030–7630044 · motif

· motif · 7630030–7630045 · motif

· motif · 7630078–7630091 · motif

· motif · 7630473–7630486 · motif

· motif · 7630473–7630486 · motif

· motif · 7630476–7630488 · motif

· motif · 7630480–7630493 · motif

· motif · 7630483–7630495 · motif

· motif · 7630486–7630493 · motif

· motif · 7630522–7630535 · motif

· motif · 7630528–7630543 · motif

· motif · 7632405–7632418 · motif

· motif · 7632561–7632578 · motif

· motif · 7632570–7632578 · motif

· motif · 7632582–7632594 · motif

· motif · 7632584–7632591 · motif

· motif · 7632630–7632646 · motif

· motif · 7633178–7633192 · motif

· motif · 7633179–7633192 · motif

· motif · 7633249–7633262 · motif

· motif · 7634525–7634541 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:402 aa

1 aa402 aa結構域訊號胜肽
依 P04278 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

sex hormone binding globulin 長 402 個胺基酸。其 N 端第 1–29 位為訊號序列;蛋白質包含 Laminin G-like 1(第 45–217 位)與 Laminin G-like 2(第 224–390 位)兩個結構域。

訊號胜肽1–29 aa
結構域Laminin G-like 145–217 aa
結構域Laminin G-like 2224–390 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1F5F…

PDB · 1F5F

X-ray · 1.70 A · A=30-234

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SHBG 為分泌型蛋白質。 在睪丸中,它由 Sertoli cells 合成並分泌至 seminiferous tubule 腔內,之後運送至 epididymis。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ABPSHBG
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 SHBG 描述為同源二聚體(homodimer),指出其由相同亞基組成;未提供其他蛋白質結合夥伴或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SHBG 可作為 androgen 的運輸蛋白,也可能參與受體介導的過程。每個二聚體結合一個類固醇分子,且對 5-alpha-dihydrotestosterone、testosterone 與 17-beta-estradiol 具有特異性;它並藉由控制類固醇荷爾蒙的血漿濃度,調節其血漿代謝清除率。資料庫紀錄
證據與來源

Functions as an androgen transport protein, but may also be involved in receptor mediated processes. Each dimer binds one molecule of steroid. Specific for 5-alpha-dihydrotestosterone, testosterone, and 17-beta-estradiol. Regulates the plasma metabolic clearance rate of steroid hormones by controlling their plasma concentration

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer資料庫紀錄
證據與來源

Homodimer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SHBG 為分泌型蛋白質;在睪丸中由 Sertoli cells 合成,分泌至 seminiferous tubule 腔內,並運送至 epididymis。推論支持
證據與來源

Secreted; In testis, it is synthesized by the Sertoli cells, secreted into the lumen of the seminiferous tubule and transported to the epididymis

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000380450 · 1,267 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGAGTTGTCTGAGCCGCCGAGTGGACAGTGGCTGATTAT40
41GGAGAGCAGAGGCCCACTGGCTACCTCGCGCCTGCTGCTG80
81TTGCTGCTGTTGCTACTACTGCGTCACACCCGCCAGGGAT120
121GGGCCCTGAGACCTGTTCTCCCCACCCAGAGTGCCCACGA160
161CCCTCCGGCTGTCCACCTCAGCAATGGCCCAGGACAAGAG200
201CCTATCGCTGTCATGACCTTTGACCTCACCAAGATCACAA240
241AAACCTCCTCCTCCTTTGAGGTTCGAACCTGGGACCCAGA280
281GGGAGTGATTTTTTATGGGGATACCAACCCTAAGGATGAC320
321TGGTTTATGCTGGGACTTCGAGACGGCAGGCCTGAGATCC360
361AACTGCACAATCACTGGGCCCAGCTTACGGTGGGTGCTGG400
401ACCACGGCTGGATGATGGGAGATGGCACCAGGTGGAAGTC440
441AAGATGGAGGGGGACTCTGTGCTGCTGGAGGTGGATGGGG480
481AGGAGGTGCTGCGCCTGAGACAGGTCTCTGGGCCCCTGAC520
521CAGCAAACGCCATCCCATCATGAGGATTGCGCTTGGGGGG560
561CTGCTCTTCCCCGCTTCCAACCTTCGGTTGCCGCTGGTTC600
601CTGCCCTGGATGGCTGCCTGCGCCGGGATTCCTGGCTGGA640
641CAAACAGGCCGAGATCTCAGCATCTGCCCCCACTAGCCTC680
681AGAAGCTGTGATGTAGAATCAAATCCCGGGATATTTCTCC720
721CTCCAGGGACTCAGGCAGAATTCAATCTCCGAGACATTCC760
761CCAGCCTCATGCAGAGCCCTGGGCCTTCTCTTTGGACCTG800
801GGACTCAAGCAGGCAGCAGGCTCAGGCCACCTCCTTGCTC840
841TTGGGACACCAGAGAACCCATCTTGGCTCAGTCTCCACCT880
881CCAAGATCAAAAGGTGGTGTTGTCTTCTGGGTCGGGGCCA920
921GGGCTGGATCTGCCCCTGGTCTTGGGACTCCCTCTTCAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。