基因總覽
SHBG 是蛋白質編碼基因,產物為 sex hormone binding globulin。此蛋白質具有分泌訊號序列,並含有兩個 Laminin G-like 結構域。其基本角色與類固醇荷爾蒙的運輸及血漿濃度調節相關;來源亦指出它可能參與受體介導的過程,但未進一步說明其方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380450 ★ | 7,630,135–7,633,372 | 8 |
| ENST00000570547 | 7,614,064–7,633,469 | 6 |
| ENST00000572182 | 7,614,064–7,633,469 | 4 |
| ENST00000572262 | 7,614,064–7,633,469 | 7 |
| ENST00000574539 | 7,614,064–7,633,469 | 7 |
| ENST00000575314 | 7,614,064–7,633,469 | 8 |
| ENST00000576478 | 7,614,064–7,633,469 | 5 |
| ENST00000576728 | 7,614,064–7,633,469 | 6 |
| ENST00000856862 | 7,627,546–7,633,469 | 9 |
| ENST00000856863 | 7,627,546–7,633,469 | 9 |
| ENST00000856864 | 7,627,546–7,633,469 | 9 |
| ENST00000575729 | 7,627,969–7,631,260 | 4 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
sex hormone binding globulin 可作為 androgen 的運輸蛋白,也可能參與受體介導的過程。來源未說明此類受體相關作用的具體機制,因此其功能描述仍限於可能參與,不能視為已確定的作用途徑。
此蛋白質對 5-alpha-dihydrotestosterone、testosterone 與 17-beta-estradiol 具有特異性。每個二聚體可結合一個類固醇分子,顯示其結合量與二聚體形式相關;來源沒有提供不同類固醇之間的結合差異或結合後的其他分子事件。
SHBG 也透過控制類固醇荷爾蒙在血漿中的濃度,調節這些荷爾蒙在血漿中的代謝清除率。換言之,來源所述的功能不僅是運輸,也包括藉由影響血漿濃度來調控荷爾蒙清除;資料未進一步指出這種調節的方向或幅度。
Promoter 與基因調控
>SHBG ENST00000380450 GRCh38 chr17:7629135-7630235 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCTGAGGTGGGCGGATCATTTCAGGTCAGAGGTTCGAGATCAGCCTGGGCAACGTGGTGAAATCCCCGT CTCTACTAAAAACACAAAAAAATTTGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCACCTGTAGTCCCAACTACTAAGGA GGCTGAGACAGGAGGATCGCTTGAACTCGAGAGGCAGAGGCAGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCAC TCCAGCCTGGGTGATAGAGCAAGACTCTGTCTAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAA ATGGGTCAGGGAGTGGGTGATTTCTACTGCTAGACTGTTTAGGCCCTGTAATAAATGGATAAGGGAAGAT AACTGAGAGGCGGGGGGCAGGTCCCTTCTTAATATTCACTGAATCATACACACAGACAATACCTTCTTGG GAGACAGGCCTCAGAGGCCTGGGAAAAGACTGGGGGAGGAGTTCAGACCAGATGCCAGGCACTGTGCCTG CATTTTCTCAATGAACCCTCTTTCACAGTCACCCCGTAAAGTATTATTTTCCTCATTTTACAGACAAGGA CACTGAAGCACAGAGGTGAAGTGACTTGCCCAAGGTCACTCAGCTAGAAATTTAGGATTCCATTATCTCA TTTCTAGTCCTGATACAGGATGCTACTTGGGACGCAGGGGAGGACTGTTTCTAGACCTCAGGCCTGTGAA TGCAGGCTCCCCGAGTGGACAGAAATCTTGGAGGACCTAGATCAGGCCCTAGAGGAGGAGAGGGGAGATG GAATATCCTCTCCCAGTTCAGAAACTTTCTCGGCAGTGGAGGATGATAGTGGAGGGGACTCTGTCCTTCA CCCCATTGATCCCCAGAGGGGTGATAGCTGAGTCTTGTGACTGGGCCCCTGGGCAGGGGTCAAGGGTCAG TGCCCCTGTTTCCTTTACCCCCTCCTCCCCGGGCAACCTTTAACCCTCCACCGCCCACACGCAAGGCTGC CTGCCTCTACACATTCTCCCAAGAGTTGTCTGAGCCGCCGAGTGGACAGTGGCTGATTATGGAGAGCAGA GGCCCACTGGCTACCTCGCGCCTGCTGCTGTTGCTGCTGTTGCTACTACTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SHBG_2 ↗ | 17:7,614,032 | 正股 | 7,613,983–7,614,042 |
| SHBG_3 ↗ | 17:7,627,994 | 正股 | 7,627,945–7,628,004 |
| SHBG_1 ↗ | 17:7,630,135 | 正股 | 7,630,086–7,630,145 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_883H9 · promoter · 7627795–7627979 · regulatory
ENSR17_53RFX9 · CTCF_binding_site · 7627876–7627897 · regulatory
ENSR17_952Q7 · enhancer · 7627980–7628262 · regulatory
ENSR17_53RFZS · CTCF_binding_site · 7628213–7628234 · regulatory
ENSR17_53RGQ9 · CTCF_binding_site · 7632628–7632649 · regulatory
ENSR17_952S4 · enhancer · 7634352–7634856 · regulatory
ENSR17_53RH43 · CTCF_binding_site · 7634523–7634544 · regulatory
· motif · 7625845–7625859 · motif
· motif · 7625846–7625859 · motif
· motif · 7625862–7625875 · motif
· motif · 7625911–7625926 · motif
· motif · 7625911–7625926 · motif
· motif · 7627653–7627668 · motif
· motif · 7627705–7627720 · motif
· motif · 7627857–7627867 · motif
· motif · 7627878–7627894 · motif
· motif · 7627944–7627954 · motif
· motif · 7627988–7628001 · motif
· motif · 7628017–7628025 · motif
· motif · 7628022–7628035 · motif
· motif · 7628068–7628081 · motif
· motif · 7628215–7628231 · motif
· motif · 7630028–7630040 · motif
· motif · 7630029–7630044 · motif
· motif · 7630030–7630037 · motif
· motif · 7630030–7630043 · motif
· motif · 7630030–7630044 · motif
· motif · 7630030–7630045 · motif
· motif · 7630078–7630091 · motif
· motif · 7630473–7630486 · motif
· motif · 7630473–7630486 · motif
· motif · 7630476–7630488 · motif
· motif · 7630480–7630493 · motif
· motif · 7630483–7630495 · motif
· motif · 7630486–7630493 · motif
· motif · 7630522–7630535 · motif
· motif · 7630528–7630543 · motif
· motif · 7632405–7632418 · motif
· motif · 7632561–7632578 · motif
· motif · 7632570–7632578 · motif
· motif · 7632582–7632594 · motif
· motif · 7632584–7632591 · motif
· motif · 7632630–7632646 · motif
· motif · 7633178–7633192 · motif
· motif · 7633179–7633192 · motif
· motif · 7633249–7633262 · motif
· motif · 7634525–7634541 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:402 aa
sex hormone binding globulin 長 402 個胺基酸。其 N 端第 1–29 位為訊號序列;蛋白質包含 Laminin G-like 1(第 45–217 位)與 Laminin G-like 2(第 224–390 位)兩個結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SHBG 為分泌型蛋白質。 在睪丸中,它由 Sertoli cells 合成並分泌至 seminiferous tubule 腔內,之後運送至 epididymis。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源將 SHBG 描述為同源二聚體(homodimer),指出其由相同亞基組成;未提供其他蛋白質結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SHBG 可作為 androgen 的運輸蛋白,也可能參與受體介導的過程。每個二聚體結合一個類固醇分子,且對 5-alpha-dihydrotestosterone、testosterone 與 17-beta-estradiol 具有特異性;它並藉由控制類固醇荷爾蒙的血漿濃度,調節其血漿代謝清除率。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Functions as an androgen transport protein, but may also be involved in receptor mediated processes. Each dimer binds one molecule of steroid. Specific for 5-alpha-dihydrotestosterone, testosterone, and 17-beta-estradiol. Regulates the plasma metabolic clearance rate of steroid hormones by controlling their plasma concentration |
| 交互作用 | Homodimer | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | SHBG 為分泌型蛋白質;在睪丸中由 Sertoli cells 合成,分泌至 seminiferous tubule 腔內,並運送至 epididymis。 | 推論支持 | 證據與來源Secreted; In testis, it is synthesized by the Sertoli cells, secreted into the lumen of the seminiferous tubule and transported to the epididymis |
核酸與蛋白質序列
AAGAGTTGTCTGAGCCGCCGAGTGGACAGTGGCTGATTAT40GGAGAGCAGAGGCCCACTGGCTACCTCGCGCCTGCTGCTG80TTGCTGCTGTTGCTACTACTGCGTCACACCCGCCAGGGAT120GGGCCCTGAGACCTGTTCTCCCCACCCAGAGTGCCCACGA160CCCTCCGGCTGTCCACCTCAGCAATGGCCCAGGACAAGAG200CCTATCGCTGTCATGACCTTTGACCTCACCAAGATCACAA240AAACCTCCTCCTCCTTTGAGGTTCGAACCTGGGACCCAGA280GGGAGTGATTTTTTATGGGGATACCAACCCTAAGGATGAC320TGGTTTATGCTGGGACTTCGAGACGGCAGGCCTGAGATCC360AACTGCACAATCACTGGGCCCAGCTTACGGTGGGTGCTGG400ACCACGGCTGGATGATGGGAGATGGCACCAGGTGGAAGTC440AAGATGGAGGGGGACTCTGTGCTGCTGGAGGTGGATGGGG480AGGAGGTGCTGCGCCTGAGACAGGTCTCTGGGCCCCTGAC520CAGCAAACGCCATCCCATCATGAGGATTGCGCTTGGGGGG560CTGCTCTTCCCCGCTTCCAACCTTCGGTTGCCGCTGGTTC600CTGCCCTGGATGGCTGCCTGCGCCGGGATTCCTGGCTGGA640CAAACAGGCCGAGATCTCAGCATCTGCCCCCACTAGCCTC680AGAAGCTGTGATGTAGAATCAAATCCCGGGATATTTCTCC720CTCCAGGGACTCAGGCAGAATTCAATCTCCGAGACATTCC760CCAGCCTCATGCAGAGCCCTGGGCCTTCTCTTTGGACCTG800GGACTCAAGCAGGCAGCAGGCTCAGGCCACCTCCTTGCTC840TTGGGACACCAGAGAACCCATCTTGGCTCAGTCTCCACCT880CCAAGATCAAAAGGTGGTGTTGTCTTCTGGGTCGGGGCCA920GGGCTGGATCTGCCCCTGGTCTTGGGACTCCCTCTTCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。