演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SHB

SH2 domain containing adaptor protein B

SHB 是一種接頭蛋白,透過連結活化受體與下游訊號成分,參與多條訊號傳遞路徑。

Homo sapiens9p13.1UniProt Q15464
OFFICIAL SYMBOL
SHB
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q15464
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SHB 是蛋白質編碼基因,產物為 SH2 domain containing adaptor protein B。這種接頭蛋白的主要特性,是連結已活化的受體與下游訊號成分,因而可參與多種訊號傳遞路徑的調節。其來源所列的功能涉及血管新生、T 細胞受體訊號、介白素-2 訊號、細胞凋亡、神經細胞分化,以及胰島素生成細胞中的訊號調節;相關作用多以「可能參與」描述,應保留其不確定性。

Official symbol
SHB
Gene name
SH2 domain containing adaptor protein B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10838
UniProt
Q15464
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.1
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegSHBpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:37,915,349–38,069,270
Gene span
153,922 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000377707 ★37,915,898–38,069,2276
ENST0000085489637,915,349–38,069,2705
ENST0000113390637,915,349–38,069,2706
ENST0000092083837,919,143–38,069,2706

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SHB 作為接頭蛋白,藉由連結活化受體與下游訊號成分,調節多條訊號傳遞路徑。這項角色使它能參與不同受體所啟動的訊號,而非只對應單一途徑;來源指出的具體功能包含多種生物學過程,但部分作用以可能性描述。

在血管新生方面,SHB 可能透過調節 FGFR1、VEGFR2 與 PDGFR 訊號而參與其中。來源並未將這些關聯描述為 SHB 單獨造成血管新生,而是指出它可能藉由調節相關受體訊號發揮作用。

在免疫訊號方面,SHB 可能參與 T 細胞抗原受體(TCR)訊號,也可能涉及 interleukin-2 訊號。這些作用符合其連結受體與下游訊號成分的接頭角色;來源未進一步界定各途徑中的完整分子步驟。

SHB 也可能透過傳遞 basic-FGF 與 NGF 誘發的訊號,參與細胞凋亡及神經細胞分化。這表示其可能作用於由生長因子引發的訊號反應,並與上述細胞過程相關;來源未提供可將這些作用擴大為特定因果機制的細節。

此外,SHB 可能調節胰島素生成細胞中的 IRS1 與 IRS2 訊號。這項描述將 SHB 的可能功能延伸至胰島素生成細胞相關訊號,但未說明其對細胞或胰島素生成的具體結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 38069227 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SHB ENST00000377707 GRCh38 chr9:38069127-38070227 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TACAGGTACCCGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGGC
CAGGCTGGTATTAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC
GTGAGACACCGCACCCGGCCGAGGTCCTGTATTAAATGGATCCTTGCCAGCTCCTACAACATAAGGCATT
AAATGTTCCCACAACTTGCTCCCCGCCGGCTGGCAGCGAACAGGGCTAAAGCCTCGACTTCCTCAGAGGT
GAAAAGGTAAGCAAACATTCCGACCTCCCCTAGCCTTGCTCTCGGATTGGTGCTGGGCCCGGCTCCCACC
GCCTATCCCGACCACATCCGTCATCTGGACTGCTAATACACTCATTAGCATAAAGATTCCTCCGAAGACC
TGGCGCACGGGGCTGAACCGGAGTCTGTCCCTTTAAGGAAGAGGGACAGCCACTCTGTCCCTAAGGGCAC
TAGGCACTGCATTTCCTCCACACGGGCCACGCTGTAAACTAGACAGGTTCCGTGTTAATCCACTCTCCCT
CCTCAACCCCGACAGGGGGATCCCTGGAGTGAACAACGCGCGGGGTCCCGGGGGACTGCGGAAAGGTTTG
GCCTCTGCGCGTAGCAGGCTCCGCCAGGCAACCTCTCGCCCGAGGCGGCGGCGAGCTGCAAGCTAGGTGG
AGCCGGCTGCGCGGCGGGACCCCAGCGCCCTGGGGCAAGACCCTGGTGCTGGCGCCAGGGCAGCCGCGGG
AGGTGGCGTGTGCAGGAGCGGAGAGGTGCGCCCACCCCGGCCCCGGGCGCGAGGGGGGCGGGGCTTGGGC
CGCGGCCCGGGGCCAGGCTCGCGGGGATGGGCGGTGCTGGGTCTGCGGGAGCGGGCGGGGGGCGGGGCGC
GCGAGCGGGCTCCGGGGGGGCGGGGCGGCGGCGCGGGGCGGGCTCTGGCGGCCTGAGTGTCACACACGCG
GCGGCTCGGGAGGCGGCGGCAGTGGCAGCGACAGGCGCCGCCGGGACGGGCACGGGCGCGCGGGCTCCGG
CGGGCGCCGGCTGCCTTCCTCCGTCGCTCGCTGTCTCTCCCGGCCGCATTC
SHB 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 10 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SHB_6 ↗9:37,919,486負股37,919,476–37,919,535
SHB_3 ↗9:37,919,938負股37,919,928–37,919,987
SHB_5 ↗9:37,921,902負股37,921,892–37,921,951
SHB_2 ↗9:37,955,970負股37,955,960–37,956,019
SHB_9 ↗9:37,964,480負股37,964,470–37,964,529
SHB_8 ↗9:38,016,059負股38,016,049–38,016,108
SHB_4 ↗9:38,016,574負股38,016,564–38,016,623
SHB_7 ↗9:38,059,457負股38,059,447–38,059,506
SHB_1 ↗9:38,069,227負股38,069,217–38,069,276
SHB_10 ↗9:38,074,433負股38,074,423–38,074,482

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_5BXQ85 · CTCF_binding_site · 38066774–38066795 · regulatory

ENSR9_5BXQKH · CTCF_binding_site · 38068799–38068820 · regulatory

ENSR9_9K4ZG · promoter · 38069217–38069717 · regulatory

ENSR9_5BXQNS · CTCF_binding_site · 38069522–38069543 · regulatory

ENSR9_8357ZT · enhancer · 38071003–38071132 · regulatory

ENSR9_83583L · enhancer · 38073975–38074206 · regulatory

· motif · 38065394–38065411 · motif

· motif · 38065655–38065668 · motif

· motif · 38065687–38065702 · motif

· motif · 38065835–38065848 · motif

· motif · 38066776–38066792 · motif

· motif · 38067534–38067545 · motif

· motif · 38067909–38067922 · motif

· motif · 38068801–38068817 · motif

· motif · 38069524–38069540 · motif

· motif · 38069611–38069624 · motif

· motif · 38069611–38069624 · motif

· motif · 38069937–38069952 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:509 aa

1 aa509 aa結構域功能區域
依 Q15464 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SH2 domain containing adaptor protein B 長 509 個胺基酸。其 C 端第 410–504 位含有 SH2 結構域;第 1–410 位為可介導與 LAT、PTK2/FAK1、JAK1 和 JAK3 互作的區域。序列註解另指出第 1–103、144–178 與 229–385 位為無序區。

結構域SH2410–504 aa
功能區域Mediates interaction with LAT, PTK2/FAK1, JAK1 and JAK31–410 aa
功能區域Disordered1–103 aa
功能區域Disordered144–178 aa
功能區域Disordered229–385 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q15464…

AlphaFold · Q15464

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cell membrane

SHB 位於細胞質,也可作為周邊膜蛋白分布於細胞膜的細胞質側。 TCR 受到刺激時,SHB 會與膜脂筏相關聯,顯示其膜相關定位會隨刺激條件改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SHBSHBABL1KITMET
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SHB 的 SH2 domain 可與配體活化且 Tyr-720 已磷酸化的 PDGFRA 互作;它也與 PDGFRB、FGFR1、KDR/VEGFR2、IL2RB、IL2RG 等配體活化受體互作。TCR 活化後,SHB 與酪胺酸磷酸化的 LAT 互作,並與 CD3Z、PLCG1、ZAP70、LCP2/SLP-76、VAV1 及 GRAP2 等分子互作。其他互作對象包括 EPS8、V-SRC、GRB2、GRAP、JAK1、JAK3、PTK2/FAK1、CRK/CrKII 與 IRS2;與 PTPN11 的互作則標示為依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SHB 是接頭蛋白,透過連結活化受體與下游訊號成分調節多條訊號傳遞路徑。它可能藉由調節 FGFR1、VEGFR2 與 PDGFR 訊號參與血管新生,也可能參與 T 細胞抗原受體/TCR 訊號、介白素-2 訊號、細胞凋亡及神經細胞分化;後兩項作用與傳遞 basic-FGF 和 NGF 誘發的訊號有關。此外,它可能調節胰島素生成細胞中的 IRS1 與 IRS2 訊號。含實驗來源
證據與來源

Adapter protein which regulates several signal transduction cascades by linking activated receptors to downstream signaling components. May play a role in angiogenesis by regulating FGFR1, VEGFR2 and PDGFR signaling. May also play a role in T-cell antigen receptor/TCR signaling, interleukin-2 signaling, apoptosis and neuronal cells differentiation by mediating basic-FGF and NGF-induced signaling cascades. May also regulate IRS1 and IRS2 signaling in insulin-producing cells

PMID 10828022 ↗ · PMID 10837138 ↗ · PMID 12084069 ↗ · PMID 12464388 ↗ · PMID 12520086 ↗ · PMID 15026417 ↗ · PMID 15919073 ↗ · PMID 8806685 ↗ · PMID 9484780 ↗ · PMID 9751119 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SHB 與多種受體及訊號蛋白互作,包括配體活化的 PDGFRA、PDGFRB、FGFR1、KDR/VEGFR2、IL2RB 與 IL2RG。其 SH2 domain 可辨識 PDGFRA 上磷酸化的 Tyr-720;TCR 活化時則與酪胺酸磷酸化的 LAT 互作。其他互作對象包括 PTPN11(依相似性)、EPS8、V-SRC、GRB2、GRAP、CD3Z、PLCG1、ZAP70、LCP2/SLP-76、VAV1、GRAP2、JAK1、JAK3、PTK2/FAK1、CRK/CrKII 與 IRS2。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PTPN11 (By similarity). Interacts with phosphorylated 'Tyr-720' of the ligand-activated receptor PDGFRA via its SH2 domain. Interacts with the ligand-activated receptors PDGFRB, FGFR1, KDR/VEGFR2, IL2RB and IL2RG. Interacts with EPS8 and V-SRC. Interacts with GRB2 and GRAP. Interacts with CD3Z. Interacts with tyrosine-phosphorylated LAT upon T-cell antigen receptor activation. Interacts with PLCG1. Interacts with ZAP70, LCP2/SLP-76, VAV1 and GRAP2. Interacts with JAK1 and JAK3. Interacts with PTK2/FAK1. Interacts with CRK/CrKII. Interacts with IRS2

PMID 10488157 ↗ · PMID 10837138 ↗ · PMID 10964504 ↗ · PMID 12084069 ↗ · PMID 12181353 ↗ · PMID 12200137 ↗ · PMID 12464388 ↗ · PMID 12520086 ↗ · PMID 15026417 ↗ · PMID 7537362 ↗ · PMID 8302579 ↗ · PMID 9484780 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SHB 位於細胞質,也分布於細胞膜的細胞質側,屬於周邊膜蛋白。TCR 受到刺激時,SHB 會與膜脂筏相關聯,表示其膜脂筏關聯具有刺激條件性。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm; Cell membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Associates with membrane lipid rafts upon TCR stimulation

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000377707 · 6,035 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGGCAGCGACAGGCGCCGCCGGGACGGGCACGGGCGCG40
41CGGGCTCCGGCGGGCGCCGGCTGCCTTCCTCCGTCGCTCG80
81CTGTCTCTCCCGGCCGCATTCTCCTCCGCTGCGGGGCCGA120
121GCTCTCCCCAGCGCTCGCAGGAAGGAAGAAGGGAGCCGAG160
161GACGCCGAGAAGTTCCCGCGGCAGCCGCGGATCCCGGCCA200
201AGGCGGAGGCTGCGGCTCCGACGGGGCAGGAGCGCGATCC240
241ACGGCGAGGGGCGTACGGCCAAAGGGTCCGCGGCGTGGAG280
281CGCTCGGACCTTCCGCTCTCCCCCGGGCGTGGGCCGGGAC320
321CCCATGAGACGCGCCCACGAGGGGCGCGAGATTCCTAGCT360
361TGGGCGGCGCTAGGCGGAGGGAGGTGTTGCAGCCGCCGGA400
401GCCAGAGAGCTGCCGGCAGGAGGCGGCGGCGGCAAGAACT440
441TGAACTTGGCGTCGGGAGCGGGCGCCCCGGACGCCCCCCG480
481CCGGGGCCGGGGCGCCGAGGGACCTGCGCCGCAGCGCTGC520
521CCCCCGAATGGCCGCGGCGGCGGACCGGGCTCCCGCGCCG560
561CGGCCCTAGGCGGCCTCTCGCCATGGCCAAGTGGCTAAAC600
601AAGTACTTCAGCTTGGGCAACAGCAAGACCAAGAGCCCCC640
641CGCAGCCGCCGCGGCCAGACTACCGCGAGCAGCGGCGCCG680
681AGGCGAGCGGCCTTCGCAGCCCCCCCAGGCCGTGCCGCAG720
721GCCTCCTCCGCCGCCTCGGCGTCCTGCGGTCCGGCCACCG760
761CCTCCTGCTTCTCAGCCTCTTCGGGCTCGCTGCCCGACGA800
801CAGCGGCAGCACCAGCGACCTCATCCGCGCCTACCGCGCG840
841CAGAAGGAGCGAGACTTCGAGGACCCCTACAACGGGCCTG880
881GCTCGTCGCTGCGCAAACTGCGCGCCATGTGCCGCCTGGA920
921CTACTGCGGCGGCAGCGGGGAGCCAGGCGGGGTCCAGCGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。