基因總覽
SH3GLB2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q34.11。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372564 ★ | 129,007,036–129,028,331 | 11 |
| ENST00001044679 | 128,992,788–129,028,369 | 12 |
| ENST00001112963 | 128,996,865–129,028,369 | 10 |
| ENST00001133623 | 129,007,036–129,028,369 | 11 |
| ENST00000940981 | 129,007,039–129,028,369 | 11 |
| ENST00001044680 | 129,007,039–129,028,369 | 11 |
| ENST00000935419 | 129,007,043–129,028,369 | 12 |
| ENST00000935420 | 129,007,786–129,028,369 | 10 |
| ENST00000940982 | 129,007,788–129,028,369 | 12 |
| ENST00000940983 | 129,007,789–129,028,369 | 12 |
| ENST00000940984 | 129,007,795–129,028,369 | 12 |
| ENST00001044682 | 129,008,030–129,028,369 | 10 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SH3GLB2 ENST00000372564 GRCh38 chr9:129028231-129029331 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGGGGTGTGAATAAAGAGCGGAGATGAAGAGGCACAAACAGGGGAGAGGCAGCAGGCCTGGGTGGTGGG AGGAGAAAGCAAGAGAGGCCCATTTTAGAGATCTGTTGCACATATTGGTGACTACTCAGTCACTTAGTGA CTTTGGGAGACTGAGGCAGGCAGATTGCCTGAGATCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGGCAACATGGCAAA ACCTTGTCTCTCCTAAAGTACAAAAAATTAGCGGGGCATGTTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCG GGAGGCTGAATGAAGCAGGAGAATCGCTTGAGCCCGGCAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCC ACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTACAAAAAAAAAAAAAAAGTATTGCATATTTC AAAATTGCTAAAAGAGTACATTTGAAATGTTCTAACCACAAAAAAAGTAGGTGAGGTGATGGATATGTCA ATTAACTTGATTTCATCATTCCACAATTTCATCACCTTGTAGGCCGTAAATATATATTTATCAATTAAAA CTTTTGAAAAGCATTGGTAAGATGGCAAATAATATGTAATTATGGCGTGTACCTGCAATCATCTAAGAGC ACATGTGTTCCAGTTTTAATAATTTTAGTAAAAGGAAAAAAAGAGGCCGGCCCAATCCGCGGCGGCAGGC GCATGGGGGCAGCAGCGAGCACTGCCCAGCAGCGAGCCCTGCCCAGCACAACCTGCTCCCCAGACCAACC CCCGCTCTGGCCGCGCCAAGGCCTCGCCCCCACCCATGTAGCTCCGCCCCACTGCCCTCTCGCTCCGCCC CTGTCCCGCCAGTCCCGCCCCCTCCGACTCCGCCCGGCTTCCGCCAACCAGCCCGGCCCCCGCCCCTCTA GCTCCGCCCCACTGCCGTCCCGTCCCGCCCCGGCACCGCCAGCTCCGCCCCCGCCCCTCTGGCTCCGACC CGCGGCCTCCGCGCCCCGCCCTGCGCGCTCGGGCTGGCTCGGCGGCTGCGGCGGGCGGGCAGGCGGGCAG GCCGGCAGGCGGGTGCGCGGAGGGCTGGTGCCCCGCAGCAGGTGGGCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SH3GLB2_1 ↗ | 9:129,028,331 | 負股 | 129,028,321–129,028,380 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BXLCL · enhancer · 129023173–129024164 · regulatory
ENSR9_D8DSR · enhancer · 129026071–129028174 · regulatory
ENSR9_BXLDB · promoter · 129028175–129028821 · regulatory
ENSR9_BXLDG · enhancer · 129029172–129029772 · regulatory
· motif · 129023489–129023495 · motif
· motif · 129024745–129024760 · motif
· motif · 129024751–129024763 · motif
· motif · 129024753–129024760 · motif
· motif · 129024753–129024768 · motif
· motif · 129027190–129027202 · motif
· motif · 129027371–129027383 · motif
· motif · 129027402–129027414 · motif
· motif · 129027593–129027602 · motif
· motif · 129027602–129027624 · motif
· motif · 129027602–129027624 · motif
· motif · 129027614–129027626 · motif
· motif · 129027929–129027938 · motif
· motif · 129028050–129028059 · motif
· motif · 129028216–129028231 · motif
· motif · 129028223–129028238 · motif
· motif · 129028232–129028245 · motif
· motif · 129028236–129028245 · motif
· motif · 129028364–129028374 · motif
· motif · 129028365–129028378 · motif
· motif · 129028370–129028380 · motif
· motif · 129028425–129028435 · motif
· motif · 129028426–129028439 · motif
· motif · 129028431–129028441 · motif
· motif · 129028465–129028478 · motif
· motif · 129028470–129028480 · motif
· motif · 129028490–129028500 · motif
· motif · 129028525–129028535 · motif
· motif · 129028559–129028569 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：395 aa
Endophilin-B2 屬於 endophilin family，蛋白質長 395 個胺基酸。其 BAR domain 位於第 24–287 位，SH3 domain 位於第 335–395 位；序列第 1–27 位另註記為膜結合兩親性螺旋。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- CASP6P55212 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC1Q5JVL4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTRA2O43464 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-5Q9BYR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-11Q6L8G4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-3Q9BYQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LGALS14Q8TCE9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGEA1P43355 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NXF1Q9UBU9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 25 experiments
- TBC1D7Q9P0N9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YES1P07947 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SH3GLB2 可形成同源二聚體，也可與 SH3GLB1 形成異源二聚體。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | SH3GLB2 可與自身形成同源二聚體，也可與 SH3GLB1 形成異源二聚體；此敘述指出兩種二聚體組成，但未提供其形成條件或功能影響。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | SH3GLB2 蛋白質定位於細胞質；此項定位資訊未進一步說明特定細胞條件、變化情形或其他亞細胞位置。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTGCGCGCTCGGGCTGGCTCGGCGGCTGCGGCGGGCGGGC40AGGCGGGCAGGCCGGCAGGCGGGTGCGCGGAGGGCTGGTG80CCCCGCAGCAGGTGGGCGGGGTGCGGTTGGCGGCGGCGGC120TGGGCCGGGGGCTGCCGGCTGCGCTCGGGCCGTGCGCGGC160GGCCGTGCGGGCACGCCATGGACTTCAACATGAAGAAGCT200GGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAG240TTCACGGAGGAGAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGC280TTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAG320CACCAAGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAG360GTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAGT400TCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGT440CACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGCAGACGCG480GCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACAC520TGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGCAACTGGGAGCCGC560GGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTC600ACACCCTTGCGCAACTTCCTGGAGGGGGACTGGAAGACCA640TCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGA680CTTGGATGCCTGCAAAGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCT720GCAGAAGCCAAAGCCACGACGGTGCCTGACTTTCAGGAGA760CTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGC800GCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAGCAGGAGCTC840CGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGA880CCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAGTAGCACTCACGTGAA920CCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。