演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SH3GLB1CGI-61

SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1

SH3GLB1 編碼 Endophilin-B1,屬於 endophilin 家族,具有 BAR 與 SH3 結構域,參與膜動態、自噬及細胞凋亡等過程。

Homo sapiens1p22.3UniProt Q9Y371
OFFICIAL SYMBOL
SH3GLB1
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9Y371
PDB / ALPHAFOLD
6UP6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SH3GLB1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1,其產物 Endophilin-B1 亦稱 Bax-interacting factor 1。此蛋白屬於 endophilin 家族,全長 365 個胺基酸,包含 BAR 結構域與位於羧基端的 SH3 結構域;其胺基端另有與膜結合相關的區域。這些結構特色構成其基本分子性質,並與其參與細胞膜相關活動的角色相符。

Official symbol
SH3GLB1
Gene name
SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10833
UniProt
Q9Y371
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CGI-61KIAA0491Bif-1PPP1R70

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p22.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSH3GLB1pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:86,704,510–86,748,184
Gene span
43,675 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000370558 ★86,704,576–86,748,1849
ENST0000061617086,704,510–86,748,18410
ENST0000070551986,704,510–86,748,18410
ENST0000048250486,704,510–86,748,18411
ENST0000089733486,704,510–86,748,18410
ENST0000089733586,704,510–86,748,18411
ENST0000089733686,704,510–86,748,1849
ENST0000089733786,704,510–86,748,1845
ENST0000089733886,704,510–86,743,5859
ENST0000089733986,704,510–86,748,1849
ENST0000096140486,704,510–86,748,1848
ENST0000096140586,704,510–86,748,1849

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SH3GLB1 產物參與多種膜相關過程。資料指出,它可能是維持粒線體外膜正常動態所需的因子,也可能在特定細胞中參與 coatomer 介導的逆向運輸;此外,它可能將其他蛋白質募集至高曲率膜面,並促進膜融合。這些功能涉及膜形態與膜性囊泡運輸,但來源未將各作用限定於同一細胞情境。

在細胞凋亡方面,Endophilin-B1 參與 caspase 依賴性凋亡,並藉由促進 BAX/BAK1 活化而發揮作用。此作用具有異構型與細胞類型差異:Isoform 1 在纖維母細胞中具有促凋亡作用;相較之下,Isoform 2 在神經元細胞中具有抗凋亡作用,並與維持粒線體形態及促進神經元存活有關。來源亦指出,營養缺乏時它參與 caspase 非依賴性凋亡。

SH3GLB1 也參與自噬調控。它可能透過與 PI3K complex II(PI3KC3-C2)結合,活化 PIK3C3 的脂質激酶活性。與該複合體相關時,它可能藉由誘導 Golgi 膜形成管狀結構並碎裂,調節 ATG9A 從 Golgi complex 移至周邊細胞質,進而參與自噬體形成。此處的運輸與膜重塑作用,是來源提出的可能途徑,而非不帶限制的普遍結論。

此外,SH3GLB1 可能在 PI3KC3-C2 的脈絡下調節降解性內吞運輸與細胞質分裂。整體資料顯示,它連結膜重塑、胞器動態、囊泡運輸與細胞命運相關過程;但不同作用的細胞情境與異構型差異應分開理解,不能視為所有細胞中均以相同方式發生。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 86704576 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SH3GLB1 ENST00000370558 GRCh38 chr1:86703576-86704676 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGCTGGGAGAGATCATTATATTGGAGTTACCTTAGAAAGAGGGGGCTGTTTCTGCCACCACAACAAAGA
ATGAAACAACACAAATATTTACGTTTTCTTCTTGTCCTCATAATGCTTTTACTGCACTCGTCTTTCAACC
TTTAACATCTACTGCATCTGTGACTGTTGTTTCAGTAAAACACGGAAGCTTGAATGTAAGCTCATTTCAT
TGCCTGCTGCACAACCACACAAAACAGCATTTTCTTATTCTTGAAATATGATAGCAACGTCTCCTTCCAT
GCTTGTACCTGTTTTAATTCCTTTCAAGCAGAGGCTGTATCGTGAAAGATGCTTAAGAAGTTACTTGGAA
CGACAGGATTTGGAACGGATGTCACATCATATTCTCATTTGTTATTAAAATTAGTCACGCTTAATTGTTA
AGGACTATCCTGTGTCGCTCGCCATCTTTGTGTCCTCCACCTGGCACTTTGCTTTCACACAGTAGGCACA
TAGCGTTGAGGTCCCGGAAGGTTGTCAAGTAACCGGCCAGGAGCTTGAGGGCAGGACATTGTCTCCGACA
CTTGATTCAGTGCCTGGCACACAGGAGGTATTCAATTATGCTGAATGAATGAGCAACCGGCTCGGTGGGG
GACAGTAAACCCAACCCTATTCCGCGAACGTTTGCTGAGCGGCATCCAGGCCTCAGGGACCAAGTGTGTC
GCGCGGTGCCATACCGTGACCGGGACCTGTTATTTCTAATGTCCAGATATTGTAATTCTATGCTGTAACT
CCTATATTTCCTCTTAAAACAAAAAGAGAAATGTGGGTCGTGTTCGCTCTGGGTTCTCGTTAAGTGCAAG
CATACAGAGGCGCCGAGACCCCGCGGCTCGCCCTCGCCGCTTCCTCCACAGGAGCCGGGCGGAGCTCCCG
GCGCGCCCCGGGGCTGCGCCGCCGCAATCCTCAAGGGGTCGCTGTTCCCGCGATAACCTCGAGAAAGGCT
CCGCCCCGCGGCCCGCGCTTGTTTTTCCCTTGGGACCCGGGTCCACACGGCGGGGTCGCCCGTCCATCTC
CGGCTCGCCCGCGGGGCCCATCGTCGACGTTAGCGGCCGTTCTCCGAGCCG
SH3GLB1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SH3GLB1_1 ↗1:86,704,576正股86,704,527–86,704,586
SH3GLB1_2 ↗1:86,704,833正股86,704,784–86,704,843

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_939F6W · enhancer · 86703566–86704022 · regulatory

ENSR1_BM7L3 · promoter · 86704023–86704905 · regulatory

ENSR1_5QDM2S · CTCF_binding_site · 86704510–86704531 · regulatory

ENSR1_CBLB5 · enhancer · 86704906–86706474 · regulatory

ENSR1_5QDM7G · CTCF_binding_site · 86705516–86705537 · regulatory

ENSR1_84JSGT · enhancer · 86709019–86709204 · regulatory

· motif · 86704012–86704022 · motif

· motif · 86704148–86704170 · motif

· motif · 86704148–86704170 · motif

· motif · 86704504–86704519 · motif

· motif · 86704512–86704528 · motif

· motif · 86704530–86704547 · motif

· motif · 86704579–86704592 · motif

· motif · 86704579–86704592 · motif

· motif · 86705218–86705231 · motif

· motif · 86705218–86705231 · motif

· motif · 86705321–86705329 · motif

· motif · 86705518–86705534 · motif

· motif · 86705547–86705555 · motif

· motif · 86706355–86706377 · motif

· motif · 86706355–86706377 · motif

· motif · 86706578–86706590 · motif

· motif · 86707537–86707548 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:365 aa

1 aa365 aa結構域功能區域
依 Q9Y371 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Endophilin-B1 長 365 個胺基酸,屬於 endophilin 家族。蛋白質含有第 27–261 位胺基酸的 BAR 結構域,以及第 305–365 位的 SH3 結構域。胺基端第 1–37 位區域與膜結合所需特性相關,其中第 1–30 位被註解為膜結合兩親性螺旋。

結構域BAR27–261 aa
結構域SH3305–365 aa
功能區域Required for membrane binding1–37 aa
功能區域Membrane-binding amphipathic helix1–30 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6UP6…

PDB · 6UP6

EM · 9.00 A · A/B/C/D/E/F/G/H/I/J/K/L/M/N/O/P/Q/R/S/T/V/W/a/b/c/d/e/f/g/h=1-365

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Golgi apparatus membrane;Mitochondrion outer membrane;Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane;Midbody

Endophilin-B1 可位於細胞質、Golgi 膜、粒線體外膜、自噬體膜及中體;在 Golgi 膜與粒線體外膜上為周邊膜蛋白。 其與 Golgi apparatus 的關聯依細胞類型而異。 營養缺乏後,Endophilin-B1 會與自噬相關蛋白 ATG5 及 LC3 共定位於自噬體膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Midbody。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CGI-61SH3GLB1ABCG1ABHD12BABHD5ACSF2AGR2AGTRAPAK8AKR1C8ALKBH3ANKEF1APOA1APOA4APOHARFIP2ATF4ATG12ATP5MGBAATBSNDC1DC4orf33CACFD1CAPN3CCNCCCNL1CD4CETN3CIDEBCLTACMTM5COQ8ACRCT1CYBRD1CYP2C8DESI2DHRS1DNAJC1DOCK10EIF3FELL2EPM2AFAM114A2FAM177A1FAM9AFASTKD2FERRY3FGAFLT3LGFUNDC1FUT6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 143 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Endophilin-B1 可形成同源二聚體,亦可與 SH3GLB2 形成異源二聚體;它與 BAX 結合,而誘導細胞凋亡會增加此結合。來源亦記載其與 DNM1、HTT、AMPH、BIN1 及 ARFGAP1 結合。另有資料指出它與 UVRAG 互作,UVRAG 可橋接至 BECN1,顯示 Endophilin-B1 與 PI3K complex II(PI3KC3-C2)相關;這項複合體關聯不同於單純列出的結合對象。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SH3GLB1 可能參與粒線體外膜正常動態,並在特定細胞中參與 coatomer 介導的逆向運輸;它可能募集蛋白質至高曲率膜面並促進膜融合。此蛋白參與 caspase 依賴性凋亡及營養缺乏時的 caspase 非依賴性凋亡,也調節自噬。Isoform 1 在纖維母細胞中促凋亡;Isoform 2 在神經元細胞中抗凋亡,並與維持粒線體形態及神經元存活相關。自噬時它可能透過 PI3KC3-C2 活化 PIK3C3,並調節 ATG9A 運輸及自噬體形成;它也可能參與降解性內吞運輸與細胞質分裂。含實驗來源
證據與來源

May be required for normal outer mitochondrial membrane dynamics. Required for coatomer-mediated retrograde transport in certain cells (By similarity). May recruit other proteins to membranes with high curvature. May promote membrane fusion. Involved in activation of caspase-dependent apoptosis by promoting BAX/BAK1 activation. Isoform 1 acts proapoptotic in fibroblasts (By similarity). Involved in caspase-independent apoptosis during nutrition starvation and involved in the regulation of autophagy. Activates lipid kinase activity of PIK3C3 during autophagy probably by associating with the PI3K complex II (PI3KC3-C2). Associated with PI3KC3-C2 during autophagy may regulate the trafficking of ATG9A from the Golgi complex to the peripheral cytoplasm for the formation of autophagosomes by inducing Golgi membrane tubulation and fragmentation. Involved in regulation of degradative endocytic trafficking and cytokinesis, probably in the context of PI3KC3-C2. Isoform 2 acts antiapoptotic in neuronal cells; involved in maintenance of mitochondrial morphology and promotes neuronal viability (By similarity)

PMID 11604418 ↗ · PMID 15452144 ↗ · PMID 17891140 ↗ · PMID 20643123 ↗ · PMID 21068542 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SH3GLB1 可形成同源二聚體,並與 SH3GLB2 形成異源二聚體;它會結合 BAX,且誘導凋亡會增加此結合。資料另列出它與 DNM1、HTT、AMPH、BIN1 及 ARFGAP1 的結合。SH3GLB1 也與 UVRAG 互作;UVRAG 可橋接此互作至 BECN1,顯示 SH3GLB1 與 PI3K complex II(PI3KC3-C2)相關。含實驗來源
證據與來源

Homodimer, and heterodimer with SH3GLB2. Binds BAX; induction of apoptosis augments BAX binding. Binds DNM1, HTT, AMPH, BIN1 and ARFGAP1 (By similarity). Interacts with UVRAG; UVRAG bridges the interaction to BECN1 indicative for an association with the PI3K complex II (PI3KC3-C2)

PMID 11161816 ↗ · PMID 11259440 ↗ · PMID 17891140 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SH3GLB1 位於細胞質、Golgi apparatus 膜、粒線體外膜、自噬體膜及中體,並以周邊膜蛋白形式關聯 Golgi 膜與粒線體外膜;其與 Golgi apparatus 的關聯依細胞類型而異。營養缺乏後,SH3GLB1 會與自噬相關蛋白 ATG5 及 LC3 共定位於自噬體膜。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Golgi apparatus membrane / Peripheral membrane protein; Mitochondrion outer membrane / Peripheral membrane protein; Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane; Midbody; Association with the Golgi apparatus depends on the cell type (By similarity). Following starvation colocalizes with ATG5 and LC3 autophagy-related protein(s)on autophagosomal membranes

PMID 15452144 ↗ · PMID 21068542 ↗ · PMID 17891140 ↗ · PMID 20643123 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000370558 · 6,371 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTTTTTCCCTTGGGACCCGGGTCCACACGGCGGGGTCGCC40
41CGTCCATCTCCGGCTCGCCCGCGGGGCCCATCGTCGACGT80
81TAGCGGCCGTTCTCCGAGCCGACTGACCCATCCTTGGCGC120
121TGCCGCCGCGCGCTTGTTCTCCTCCCTCGCCCCGCCTTCA160
161TCCTCCCCGTTCACGGAAACGACAGCTGCGGCTGCGGGGC200
201TGGCGCCGCCTCCCTCCACCTACCACGTCTGCCCTCGCCG240
241CTCTAGCCCTGCGCCCCAGCCCGGCCGCGGCACCTCCGCC280
281TCGCCGCCGCTAGGTCGGCCGGCTCCGCCCGGCTGCCGCC320
321TAGGATGAATATCATGGACTTCAACGTGAAGAAGCTGGCG360
361GCCGACGCAGGCACCTTCCTCAGTCGCGCCGTGCAGTTCA400
401CAGAAGAAAAGCTTGGCCAGGCTGAGAAGACAGAATTGGA440
441TGCTCACTTAGAGAACCTCCTTAGCAAAGCTGAATGTACC480
481AAAATATGGACAGAAAAAATAATGAAACAAACTGAAGTGT520
521TATTGCAGCCAAATCCAAATGCCAGGATAGAAGAATTTGT560
561TTATGAGAAACTGGATAGAAAAGCTCCAAGTCGTATAAAC600
601AACCCAGAACTTTTGGGACAATATATGATTGATGCAGGGA640
641CTGAGTTTGGCCCAGGAACAGCTTATGGTAATGCCCTTAT680
681TAAATGTGGAGAAACCCAAAAAAGAATTGGAACAGCAGAC720
721AGAGAACTGATTCAAACGTCAGCCTTAAATTTTCTTACTC760
761CTTTAAGAAACTTTATAGAAGGAGATTACAAAACAATTGC800
801TAAAGAAAGGAAACTATTGCAAAATAAGAGACTGGATTTG840
841GATGCTGCAAAAACGAGACTAAAAAAGGCAAAAGCTGCAG880
881AAACTAGAAATTCATCTGAACAGGAATTAAGAATAACTCA920
921AAGTGAATTTGATCGTCAAGCAGAGATTACCAGACTTCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。