01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
SH3GL1P1 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2 pseudogene 1。登錄類型為 pseudogene。此基因座位於 17q11.2。
Official symbol
SH3GL1P1
Gene name
SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2 pseudogene 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:10835
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
CNSA-P1SH3GLP1
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 1717q11.2
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:32,040,437–32,041,524
Gene span
1,088 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000583601 ★ | 32,040,437–32,041,524 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
已知功能與來源註解
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SH3GL1P1 ENST00000583601 GRCh38 chr17:32039437-32040537 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGAACCTGCCTAAAAATATATATATATATATATATATATATA TATATATATATATATATGTATGTATTTTTATATATATTTCTATATATATATTCTATATATATATTTCTAT ATATATTTTATATATTTATATATATTATATATATATATATATTTCTGCAAGGCCCTATTGTGAGTTTGTT ACACAACTTACTGCAACTTAAATTGTGCCACCACCACCCCCCACAATATGGCAAGCTAAATAGAAACTCA GTTATGCTAAGGCTGGTTGAGGGCATTATGCAAGATTAGCATGGAAAGGGCCCTTCATTTGGCACTCTGC TCCGTTCATTTTTGTCAGGTCACTTTCTTATCTTCACCGGGCTGTCAGATCTGTTTTACTGCTCTAGCCT CACTTTCCTCAGCCTCCTACAGCATCTTCCCTGTAAGCTACATCCCTTCCTCTCTGGATGAAGTCCTCTT CATTGACCAACTTTCTCACTTAGTTCTCTAAGATAGTGAGGATCTGTCTGCTTTCTTCTTGACCATTAGT GGATAGGAAAAAAATGCTCTGATTTTCTGTAACCATTTGTCACCAAGGCCATAAAGACATTGAACTAATT TCCTTATTGGAGTTCATTATTGGAAGTCTTGAGGAGTTTACACATTTATCTACAAAGTAAGTAGGCCAGC TCATTTGTCTTGGCTCATGTGTAATCTTTAAAGCATATTGAAAAATTACTATTCTCAAGTAAGGATAATG TATATCTCAGGTCACTTACAGTCTCAAAGTTTTGTCAGTATACTTTAAAACAATCCTGCGAACAGATCTA GATTGAAGGAGACTAAAGAATCATGAACTCGAGGTGGCCCCGGGGCAGGCGCAGAGCTGGCAAGCACGTG GTGGGGCCCCTGAGGCGTGCAGAGGGTCACGCACCTGGGAGCCTGTTGCTGGCACGGTCCGGGCGGAGGT TCTGCGGCGGGAGGCAGCCTGTCGGTTGCAGGGCTGAAAAAGCAGTTCTACAAGGCAAGCCAGCTGGTCA GTGAGAAGGTCGGAGGGGCTGAGGGGACCAAGCTGGACGATGACTTCAAAG
SH3GL1P1 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY
基因座與轉錄註解
pseudogene
SH3GL1P1 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000583601 ★ | transcribed_processed_pseudogene | 1,088 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
0 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
DNA 與 RNA 序列
完整非編碼轉錄本 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
GTCGGTTGCAGGGCTGAAAAAGCAGTTCTACAAGGCAAGC4041
CAGCTGGTCAGTGAGAAGGTCGGAGGGGCTGAGGGGACCA8081
AGCTGGACGATGACTTCAAAGAGATGGAGATGTCATCAGC120121
AAGGCGGTGACGGAAATGCTGGCAAGGACCATCAAGTACC160161
TGCAGCCCAACCCAGCCTCACAGGCTAAGCTGACCATGCT200201
CAACACAGTGTGCAAGATCCAGGGCCAGGTGAAGAACCCC240241
GGCTACCCGCAGTTGGAGGGGCTCCTGAGCGAGTGCCTGA280281
TCCGCCACCAGAAGGAGCTGGGCAACGAGTCCAACTTCAG320321
TGACGCACTGCTGGATGCCGGCGAGTCCATGAAGCACCTG360361
GCAGAGGTGAAGGACTCCCTGGACATAGAGGTCAAGCAGA400401
ACTTCATTGACCTCCTCCAGAACCTGTGTGAGAAAGACCT440441
GAAGGGGATCCAGCACCACCTGCAGAAGCTGGAGGGCCGC480481
CGCCTGGACTTTGACTAAAAGAAGCGGCAGGGCAAGATCC520521
CCGATGAGGAGCTGCGTCAGGCGCTGGAGAAGTTTGAGGA560561
CTCCAAGGAGGTAGCAGAAACCAGCATGCACAACCTCCTG600601
GAGACCAACATTGAGCAGGTGAGTCAACTCCGGGCCCTGG640641
CGGAGGCGCAGCTGAACTACCACTGGCAGGCCATGCAGAT680681
CCTGGACGAGCTGGCAGAGAAGCTCAAGCGCAGGATGCGG720721
GAAGCTTCCTCACGCCCCAAGCGGGAGTATAAGCCCAAGT760761
TCTGGGAGCCCTTTGACCTCGGAGAGCCTGAGCAGTCCAA800801
TGGGGGCTTCCCCTGCACCACAGTCCCCAAGATTGCAGCT840841
TCATCCCCTTTCCGATCTTCCGACAAGTCCATCTGGACTC880881
CTAGCAGGAGCATGCCGCCCCTAGACCAGCCAAGCTGCAA920921
GGTGCTGTATGACTTCCAGCCTGAGAACCATGGGGAGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE