基因總覽
SH2D1A 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，其產物為 128 個胺基酸的 SH2 domain-containing protein 1A。這種細胞質接頭蛋白以 SH2 結構域為主要特徵，可與多種 SLAM 家族受體及訊號分子互作，協助連結受體與細胞內訊號。蛋白質另有一段與 FYN 的 SH3 domain 互作的區域，以及一段被註解為無序的末端區域。其主要生物學角色與免疫受體訊號及自然殺手細胞功能有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371139 ★ | 124,346,563–124,373,160 | 4 |
| ENST00000698113 | 124,339,504–124,373,160 | 5 |
| ENST00000360027 | 124,346,416–124,373,160 | 4 |
| ENST00000698116 | 124,346,416–124,373,160 | 5 |
| ENST00000494073 | 124,346,416–124,371,488 | 3 |
| ENST00000698118 | 124,346,416–124,372,839 | 5 |
| ENST00001132126 | 124,346,416–124,373,160 | 4 |
| ENST00000477673 | 124,346,589–124,371,488 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SH2D1A 的產物是細胞質接頭蛋白，可調節 signaling lymphocytic activation molecule（SLAM）家族受體，包括 SLAMF1、CD244、LY9、CD84、SLAMF6 與 SLAMF7。它在 SLAM 訊號中似乎會與 SH2D1B/EAT-2 協同作用；來源對此使用「似乎」的描述，表示協同關係並非在此處以確定語氣陳述。
對 SLAMF1 的調節涉及受體與細胞內效應分子的互作。早期曾提出，SH2D1A 與 SLAMF1 結合會阻止抑制性效應分子 INPP5D/SHIP1 和 PTPN11/SHP-2 與 SLAMF1 結合。後續描述則指出，SH2D1A 可同時進行互作並招募 FYN；FYN 隨後磷酸化並活化 SLAMF1。這些敘述呈現了從早期提出的抑制性效應分子排斥模型，到 FYN 參與受體活化的訊號方式。
在自然殺手（NK）細胞中，SH2D1A 正向調節由 CD244/2B4 與 CD84 介導的功能，也可促進 CD48、SLAMF6、LY9 和 SLAMF7 介導的 NK 細胞活化。當 NK 細胞執行細胞毒性作用時，SH2D1A 會增強其與目標細胞形成結合體；此項描述標示為依相似性推定，解讀時應保留這項證據限制。
此外，SH2D1A 可能調節神經營養因子受體 NTRK1、NTRK2 與 NTRK3 的活性。來源以「可能」表述此作用，因此不能視為已確立的調節結果。整體來看，資料支持 SH2D1A 參與多種 SLAM 家族受體訊號，並與 NK 細胞活化及目標細胞結合相關；其受體調節方式依不同互作情境而異。
Promoter 與基因調控
>SH2D1A ENST00000371139 GRCh38 chrX:124345563-124346663 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGAAATAGAAGCAATGTTTTATTTCAGAGAAGAAAATGAAGGTTGAAAGGTTTTAAAATATTAAAGACA GTTTAGCCTCAATCGAAGAAATAACATTTTCTAGAAACAACAGAGAATAAAAGTTACAACAAAATTATCA ACAACTTGCAAATGATTCAAAACAGATTTTATGGACAAAATGCTGAAAGGTGGGCCCTGTACACCAAAGG GCACATACAAATCCACATAAAGGCAAAGCACCAGTTAAATGATTCACAGTCTCATCTAAAGCCCATCAAA TAGATACATCTGGAACATCTTTGGATGTACATTGTGACTTTTGTATCTCAACTAGCACTTTGGGACCTTG GACAAGGTGTTAGGAAAGAAATCAATATTTGCTCAGGATCAAGACTTCTCAAGATGACTGCGTGAGGTAG AAGGAAGAGGGAGAAGAAGAACTTGCCCAGAGTTCACTGTTCATCTACTATGTCTGATTCTGTAGGAGTC TTCATGGCCATGTTCAGTAATGATTGCATACTGACAGTACTGATAAAACTATCAGTGTTTTGTTCTCAGA GCTCTTGGTCCTTTCATTTTGTCAGTGTGTTTTTGCCCTACGTAGTGGGTCCACATACCAACAGAGACAT GTACAACTTGCCTCTATCATCAACTCCTTATGGGCTAGTTGAGCTAAGTTATTCCTGGTGGCCTCTGAGT AAACCGCAAGAACAGAAGCATTACTAAGCATCCCCGTCTGAGTGCAAGGGTGTGTGTTGGCAGTACAGCC CCAATCTTGCAAAATCCTTCTTCCAATGTTCCTCCCCTCTCTGTATGAACCCTGTGTTGGGGGGCAGAAG ATGGAAGCCCTTGGCAAGCTCGATCGAACCAAGCTACTAAATTGCTGAGCTCGTTTTAACTGAAGTGTGA GAAGGAGGTTTAAGGCAAGTAGACAACATCCTGTTGTTGGGGTGCTTCTCTCTTTTTTGCACATCTGGCT GAACTGGGAGTCAGGTGGTTGACTTGTGCCTGGCTGCAGTAGCAGCGGCATCTCCCTTGCACAGTTCTCC TCCTCGGCCTGCCCAAGAGTCCACCAGGCCATGGACGCAGTGGCTGTGTAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SH2D1A_2 ↗ | X:124,346,282 | 正股 | 124,346,233–124,346,292 |
| SH2D1A_1 ↗ | X:124,346,563 | 正股 | 124,346,514–124,346,573 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_BWN9W · promoter · 124346062–124346618 · regulatory
ENSRX_93SCL6 · enhancer · 124347377–124347638 · regulatory
ENSRX_85MP7T · enhancer · 124348282–124348520 · regulatory
ENSRX_85MP8C · enhancer · 124349180–124349316 · regulatory
· motif · 124341745–124341758 · motif
· motif · 124341745–124341758 · motif
· motif · 124343183–124343198 · motif
· motif · 124343229–124343241 · motif
· motif · 124343275–124343287 · motif
· motif · 124343768–124343780 · motif
· motif · 124343778–124343790 · motif
· motif · 124343780–124343787 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：128 aa
SH2 domain-containing protein 1A 長 128 個胺基酸，SH2 domain 位於第 6 至 104 位胺基酸。第 67 至 92 位胺基酸區段註記為可與 FYN SH3 domain 互作；此區域互作的證據為依相似性推定。第 106 至 128 位胺基酸則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供不同刺激條件、異構型或定位變化的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- CD244Q9BZW8 · UniProt INTERACTION · 10 experiments · 2 筆來源紀錄
- CD247P20963 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOSP01100 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX3Q9UBR4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX4Q969G2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- METP08581 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLAMF1Q13291 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
- SLAMF6Q96DU3 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- SRCP12931 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNK2Q07912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ARHGEF6Q15052 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARHGEF7Q14155 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
SH2D1A 與 CD84、CD244、LY9、SLAMF1 及 FYN 有互作紀錄；來源未進一步說明這些互作是否構成特定複合體。它也與 NTRK1、NTRK2、NTRK3 互作，但此項依相似性推定。功能上，SH2D1A 可調節多種 SLAM 家族受體訊號，並招募 FYN；這些功能描述不等同於額外的實體結合證據。
疾病與遺傳關聯
SH2D1A 基因變異會造成 X-linked lymphoproliferative syndrome 1（XLP1），這是一種罕見免疫缺陷，患者對 Epstein-Barr virus（EBV）感染極度易感。臨床表現包括嚴重或致命的單核球增多症、後天性低丙種球蛋白血症、全血球減少及惡性淋巴瘤。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SH2D1A 是調節多種 SLAM 家族受體的細胞質接頭蛋白，並似乎與 SH2D1B/EAT-2 協同參與 SLAM 訊號。它可招募 FYN，促使 FYN 磷酸化並活化 SLAMF1；也正向調節 CD244/2B4 與 CD84 介導的 NK 細胞功能，並可促進其他受體所介導的 NK 細胞活化。依相似性推定，它在 NK 細胞細胞毒作用中增強與目標細胞的結合體形成；此外可能調節 NTRK1、NTRK2、NTRK3 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasmic adapter regulating receptors of the signaling lymphocytic activation molecule (SLAM) family such as SLAMF1, CD244, LY9, CD84, SLAMF6 and SLAMF7. In SLAM signaling seems to cooperate with SH2D1B/EAT-2. Initially it has been proposed that association with SLAMF1 prevents SLAMF1 binding to inhibitory effectors including INPP5D/SHIP1 and PTPN11/SHP-2. However, by simultaneous interactions, recruits FYN which subsequently phosphorylates and activates SLAMF1. Positively regulates CD244/2B4- and CD84-mediated natural killer (NK) cell functions. Can also promote CD48-, SLAMF6 -, LY9-, and SLAMF7-mediated NK cell activation. In the context of NK cell-mediated cytotoxicity enhances conjugate formation with target cells (By similarity). May also regulate the activity of the neurotrophin receptors NTRK1, NTRK2 and NTRK3 PMID 11806999 ↗ · PMID 12458214 ↗ · PMID 21219180 ↗ |
| 交互作用 | SH2D1A 與 CD84、CD244、LY9、SLAMF1 及 FYN 有互作紀錄；此外也與 NTRK1、NTRK2、NTRK3 互作，但後者的互作描述標示為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NTRK1, NTRK2 and NTRK3 (By similarity). Interacts with CD84, CD244, LY9, SLAMF1 and FYN PMID 11389028 ↗ · PMID 11477068 ↗ · PMID 11806999 ↗ · PMID 11823424 ↗ · PMID 12115647 ↗ · PMID 12458214 ↗ · PMID 12545174 ↗ |
| 細胞定位 | SH2D1A 蛋白質定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | SH2D1A 基因變異會造成 X-linked lymphoproliferative syndrome 1（XLP1），這是一種罕見免疫缺陷，患者對 Epstein-Barr virus（EBV）感染極度易感。其症狀包括嚴重或致命的單核球增多症、後天性低丙種球蛋白血症、全血球減少及惡性淋巴瘤。 | 含實驗來源 | 證據與來源Lymphoproliferative syndrome, X-linked, 1 XLP1 A rare immunodeficiency characterized by extreme susceptibility to infection with Epstein-Barr virus (EBV). Symptoms include severe or fatal mononucleosis, acquired hypogammaglobulinemia, pancytopenia and malignant lymphoma. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 308240 PMID 10598819 ↗ · PMID 11034354 ↗ · PMID 11049992 ↗ · PMID 11477068 ↗ · PMID 11493483 ↗ · PMID 11823424 ↗ · PMID 12458214 ↗ · PMID 14674764 ↗ · PMID 15841490 ↗ · PMID 16720617 ↗ · PMID 21119115 ↗ · PMID 9771704 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GACTTGTGCCTGGCTGCAGTAGCAGCGGCATCTCCCTTGC40ACAGTTCTCCTCCTCGGCCTGCCCAAGAGTCCACCAGGCC80ATGGACGCAGTGGCTGTGTATCATGGCAAAATCAGCAGGG120AAACCGGCGAGAAGCTCCTGCTTGCCACTGGGCTGGATGG160CAGCTATTTGCTGAGGGACAGCGAGAGCGTGCCAGGCGTG200TACTGCCTATGTGTGCTGTATCACGGTTACATTTATACAT240ACCGAGTGTCCCAGACAGAAACAGGTTCTTGGAGTGCTGA280GACAGCACCTGGGGTACATAAAAGATATTTCCGGAAAATA320AAAAATCTCATTTCAGCATTTCAGAAGCCAGATCAAGGCA360TTGTAATACCTCTGCAGTATCCAGTTGAGAAGAAGTCCTC400AGCTAGAAGTACACAAGGTACTACAGGGATAAGAGAAGAT440CCTGATGTCTGCCTGAAAGCCCCATGAAGAAAAATAAAAC480ACCTTGTACTTTATTTTCTATAATTTAAATATATGCTAAG520TCTTATATATTGTAGATAATACAGTTCGGTGAGCTACAAA560TGCATTTCTAAAGCCATTGTAGTCCTGTAATGGAAGCATC600TAGCATGTCGTCAAAGCTGAAATGGACTTTTGTACATAGT640GAGGAGCTTTGAAACGAGGATTGGGAAAAAGTAATTCCGT680AGGTTATTTTCAGTTATTATATTTACAAATGGGAAACAAA720AGGATAATGAATACTTTATAAAGGATTAATGTCAATTCTT760GCCAAATATAAATAAAAATAATCCTCAGTTTTTGTGAAAA800GCTCCATTTTTAGTGAAATATTATTTTATAGCTACTAATT840TTAAAATGTCTTGCTTGATTGTATGGTGGGAAGTTGGCTG880GTGTCCCTTGTCTTTGCCAAGTTCTCCACTAGCTATGGTG920TCATAGGCTCTTTTGGGATTTTTGAAGCTGTATACTGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。